Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 148827529

Identifier: 148827529

GI number: 148827529

Start: 888532

End: 890862

Strand: Reverse

Name: 148827529

Synonym: CGSHiGG_04770

Alternate gene names: NA

Gene position: 890862-888532 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148827530

Following gene: 148827528

Centisome position: 47.21

GC content: 45.3

Gene sequence:

>2331_bases
ATGAATGCTATACGTGAGCTGGTAACGTTATTGCGTTATAAAGTCGATAATTCCGGTTTAAAGGCTTATGTTGTTCAAAC
TCAACAGGCGGCAAAAGGCATTCGTAGCAACCTGAATAATGCAGTCGATGGATTACGCGCTAAATTCTCAGGGGCTGCCG
TGAGCGTGAAAGAGGTCGGTAATAATCTGAAAGACGCTAAAAATCAAATGCTTTCTCTACGTAACCTTGTTGCTGGTTAT
TTTGCGATGATTGCTGGCGGCAATGTGATTAAGATTGCGGACGATTGGGCTGCGGTGGATAGTCGTGTGAAATTGGCGAC
AAAATCTGTTGAAGAACATAAATATGCATTGAGTCAGATTTTCGACCTTTCACAACGTTCCGGACAAGACTATCTCGCCA
GTGCGGATTTATTTTCAAAAGTGAATCGAAGTGCGGGGGATTTGGGGTTAAGTCTTGATGATACGTTAAATTTAACGGAA
ATCATTGGGCAAACGATGACGATTGGCGGCGGCGATCAGGGGGCGCAGCAAGCCGCCTTGATGCAGCTTGGTCAAGCCTT
AGGCTCGGGTGCATTACGTGGCGATGAGCTGAACTCAATTATTGAACAAGCCCCACGTTTAGCGAATGCCATTGCTGATA
GTTTTGGCGTGCCGATTGGGCAATTAAAAGATCTAGGTAAAGAAGGTAAGCTCACATCAAAAGAACTCGCACAAGGTCTG
CTAAAACAAGCGGATAAAATCCAAAAAGAATTCGATCAGATGCCGAAAACTTTTGGGCGCGGTATGACGATTCTGAAAAA
TAAAGCCGGTCAATTGATTGATGTGGCGGTCAATAAAGTCTCTAAACTCGGCGCGGCTTTCTATAATGCTGCTGAATGGG
TGACAGAAAACATTCGTTTAGTGGGCTTTTTAGCTGGTACGGTAATCGGTGGTAAGCTGATGTTTGCGCTGGCAGCGGCG
AAAAAGAGCTTGCGTCAATTGTTAATGATGGGCGCACGTGCGGTGGCACCTTACTTAGCGATGGCTGCGGCGGCGGGTGT
CGTTGCCTTGGTGTTAGAAGACATTTATGGTTGGACGCAGGGAGATTTATCCTTTACTGGGGCATTAGTTGGACGCTATG
AAGTTTGGGCGGATAAATTCGCCGCGCTAGGTAAACTGGCGGATAAGCTCTGGATCAATGTTCGTGGTTTATTAAAAGAT
TTAAGCCGAATGGCGGGCGTTGAGATTAATTTTGACTCTTGGCAGGCTTTTGCTACTGACGTTTTAGAATATATTATTGC
CGCCGTGAGAAATCTCATTAATACGGTAAGCGGTATGGTGCGGATTATTCGCGCATTAATTAATGGGGATTATGCCGGTG
CTTGGTCTAGTGCGGGCGATATGATTGATGGATTAAGCTTGAAATTCCTACCGCTTTATTCTGTTGGGCTAATGGTGCTG
GGCGGTATTCTCTCCGCTGTATGGGCGTTATTTTCCCCATTCCGTGCATTTTTCGGATTGTTGAAAGGTGGATTTAGATC
CGTAATGTTTGTAGCCAAACCTTTTATTAAGGTAGCGAAAGGGATTGCATCTCCATTTATCTGGGCGCAAAAACATTTTA
AATTATTTTCCCGTGTCGGCAGTGGCGCATTCTCGCTTTTGAAACGTGGGGCGGTCAAATTTGGCGTGATATTTAAATCT
GTCGTTGGCACTGTGGTAAAAGGTATTTTTGCGATCGGTCGCGCGATGTTTATGGCGGTAGCAAGTAACCCAATTTTGCT
TGCGATTAGTGCGGTAATTGGCTTGGTTATCTTGCTTGTTGTGTATTGGGATGAAGTGAAAGCCTTTGCCATTGCTGCGT
GGGAAGCCATTTCCACAAAAGCGGCGGAGATTTGGCAAAGTATCATCACTGGTGCAAGCGAAATGTGGGATAACATCACA
AATAAAGCAGCGGAGAGCTGGGATAATGTAAAGAAAGATGCTGGCGAAAAATGGAATAGCGTGACGACGATGTTTAAAAA
TGCGTGGCAAAAATCTATCGATACTGTGGTAGGCTGGTTTAATTCGCTTATTCCGAGCTGGATTAGAGATTTGTTTTCTG
ACGGGGCGAAAGCAGAAGTTAAGCTGAGCGGCGAAGCCTTAACTACACCAGTAAGCGGTCACGTATCGCCACAGCGGTTA
GGCTATGGCGGTCGTCCTATTTTTGCACCTAATCAGAATATGACGCAAACCAATAACTTCAATATTCAAGGTTCCGCTAA
TCCTAGCGGTGTGGCTAATGCGGTATCAGACAAATTAAGCCGTGGTTCATCTACATCGTTTGGAATGGGGGCGATTGAAT
ATGCTGGGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATACGGCAGGATTGACGGATATGGGCGAGCTTTTGAAGATTAATCGCTTACTAGATGCGGTAGATGCGATGGAAGCA
AAACAAATGGAGAAAAACCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAGTGCGGTTGATTTTAACCGTACTTTAAAAAACAAACCCCGAACATTGCGAGTGTTCGGGGTTTTTATTTAGGCTTA
AAAGTAAATTATGAGCATAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Phage-Related Minor Tail Protein; Tail Length Tape Measure Protein; Tail Tape Measure Protein; Tape Measure Domain Protein; Lambda Family Phage Tail Tape Measure Protein; Bacteriophage Tail Tape Meausure Protein; Tail Tape Meausure Protein; Tape Measure Domain-Containing Protein; Tail Component; Bacteriophage-Related Protein; Phage Tail Tape Measure Protein; Phage Protein; Bacteriophage-Related Protein Tape Measure Domain; Bacteriophage-Related Transmembrane Protein; Prophage; Bacteriophage Protein; Bacteriophage Tail Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Lambda Family

Number of amino acids: Translated: 776; Mature: 776

Protein sequence:

>776_residues
MNAIRELVTLLRYKVDNSGLKAYVVQTQQAAKGIRSNLNNAVDGLRAKFSGAAVSVKEVGNNLKDAKNQMLSLRNLVAGY
FAMIAGGNVIKIADDWAAVDSRVKLATKSVEEHKYALSQIFDLSQRSGQDYLASADLFSKVNRSAGDLGLSLDDTLNLTE
IIGQTMTIGGGDQGAQQAALMQLGQALGSGALRGDELNSIIEQAPRLANAIADSFGVPIGQLKDLGKEGKLTSKELAQGL
LKQADKIQKEFDQMPKTFGRGMTILKNKAGQLIDVAVNKVSKLGAAFYNAAEWVTENIRLVGFLAGTVIGGKLMFALAAA
KKSLRQLLMMGARAVAPYLAMAAAAGVVALVLEDIYGWTQGDLSFTGALVGRYEVWADKFAALGKLADKLWINVRGLLKD
LSRMAGVEINFDSWQAFATDVLEYIIAAVRNLINTVSGMVRIIRALINGDYAGAWSSAGDMIDGLSLKFLPLYSVGLMVL
GGILSAVWALFSPFRAFFGLLKGGFRSVMFVAKPFIKVAKGIASPFIWAQKHFKLFSRVGSGAFSLLKRGAVKFGVIFKS
VVGTVVKGIFAIGRAMFMAVASNPILLAISAVIGLVILLVVYWDEVKAFAIAAWEAISTKAAEIWQSIITGASEMWDNIT
NKAAESWDNVKKDAGEKWNSVTTMFKNAWQKSIDTVVGWFNSLIPSWIRDLFSDGAKAEVKLSGEALTTPVSGHVSPQRL
GYGGRPIFAPNQNMTQTNNFNIQGSANPSGVANAVSDKLSRGSSTSFGMGAIEYAG

Sequences:

>Translated_776_residues
MNAIRELVTLLRYKVDNSGLKAYVVQTQQAAKGIRSNLNNAVDGLRAKFSGAAVSVKEVGNNLKDAKNQMLSLRNLVAGY
FAMIAGGNVIKIADDWAAVDSRVKLATKSVEEHKYALSQIFDLSQRSGQDYLASADLFSKVNRSAGDLGLSLDDTLNLTE
IIGQTMTIGGGDQGAQQAALMQLGQALGSGALRGDELNSIIEQAPRLANAIADSFGVPIGQLKDLGKEGKLTSKELAQGL
LKQADKIQKEFDQMPKTFGRGMTILKNKAGQLIDVAVNKVSKLGAAFYNAAEWVTENIRLVGFLAGTVIGGKLMFALAAA
KKSLRQLLMMGARAVAPYLAMAAAAGVVALVLEDIYGWTQGDLSFTGALVGRYEVWADKFAALGKLADKLWINVRGLLKD
LSRMAGVEINFDSWQAFATDVLEYIIAAVRNLINTVSGMVRIIRALINGDYAGAWSSAGDMIDGLSLKFLPLYSVGLMVL
GGILSAVWALFSPFRAFFGLLKGGFRSVMFVAKPFIKVAKGIASPFIWAQKHFKLFSRVGSGAFSLLKRGAVKFGVIFKS
VVGTVVKGIFAIGRAMFMAVASNPILLAISAVIGLVILLVVYWDEVKAFAIAAWEAISTKAAEIWQSIITGASEMWDNIT
NKAAESWDNVKKDAGEKWNSVTTMFKNAWQKSIDTVVGWFNSLIPSWIRDLFSDGAKAEVKLSGEALTTPVSGHVSPQRL
GYGGRPIFAPNQNMTQTNNFNIQGSANPSGVANAVSDKLSRGSSTSFGMGAIEYAG
>Mature_776_residues
MNAIRELVTLLRYKVDNSGLKAYVVQTQQAAKGIRSNLNNAVDGLRAKFSGAAVSVKEVGNNLKDAKNQMLSLRNLVAGY
FAMIAGGNVIKIADDWAAVDSRVKLATKSVEEHKYALSQIFDLSQRSGQDYLASADLFSKVNRSAGDLGLSLDDTLNLTE
IIGQTMTIGGGDQGAQQAALMQLGQALGSGALRGDELNSIIEQAPRLANAIADSFGVPIGQLKDLGKEGKLTSKELAQGL
LKQADKIQKEFDQMPKTFGRGMTILKNKAGQLIDVAVNKVSKLGAAFYNAAEWVTENIRLVGFLAGTVIGGKLMFALAAA
KKSLRQLLMMGARAVAPYLAMAAAAGVVALVLEDIYGWTQGDLSFTGALVGRYEVWADKFAALGKLADKLWINVRGLLKD
LSRMAGVEINFDSWQAFATDVLEYIIAAVRNLINTVSGMVRIIRALINGDYAGAWSSAGDMIDGLSLKFLPLYSVGLMVL
GGILSAVWALFSPFRAFFGLLKGGFRSVMFVAKPFIKVAKGIASPFIWAQKHFKLFSRVGSGAFSLLKRGAVKFGVIFKS
VVGTVVKGIFAIGRAMFMAVASNPILLAISAVIGLVILLVVYWDEVKAFAIAAWEAISTKAAEIWQSIITGASEMWDNIT
NKAAESWDNVKKDAGEKWNSVTTMFKNAWQKSIDTVVGWFNSLIPSWIRDLFSDGAKAEVKLSGEALTTPVSGHVSPQRL
GYGGRPIFAPNQNMTQTNNFNIQGSANPSGVANAVSDKLSRGSSTSFGMGAIEYAG

Specific function: Unknown

COG id: COG5281

COG function: function code S; Phage-related minor tail protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83130; Mature: 83130

Theoretical pI: Translated: 10.20; Mature: 10.20

Prosite motif: PS00107 PROTEIN_KINASE_ATP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNAIRELVTLLRYKVDNSGLKAYVVQTQQAAKGIRSNLNNAVDGLRAKFSGAAVSVKEVG
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHC
NNLKDAKNQMLSLRNLVAGYFAMIAGGNVIKIADDWAAVDSRVKLATKSVEEHKYALSQI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FDLSQRSGQDYLASADLFSKVNRSAGDLGLSLDDTLNLTEIIGQTMTIGGGDQGAQQAAL
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHH
MQLGQALGSGALRGDELNSIIEQAPRLANAIADSFGVPIGQLKDLGKEGKLTSKELAQGL
HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
LKQADKIQKEFDQMPKTFGRGMTILKNKAGQLIDVAVNKVSKLGAAFYNAAEWVTENIRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGFLAGTVIGGKLMFALAAAKKSLRQLLMMGARAVAPYLAMAAAAGVVALVLEDIYGWTQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GDLSFTGALVGRYEVWADKFAALGKLADKLWINVRGLLKDLSRMAGVEINFDSWQAFATD
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
VLEYIIAAVRNLINTVSGMVRIIRALINGDYAGAWSSAGDMIDGLSLKFLPLYSVGLMVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
GGILSAVWALFSPFRAFFGLLKGGFRSVMFVAKPFIKVAKGIASPFIWAQKHFKLFSRVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHC
SGAFSLLKRGAVKFGVIFKSVVGTVVKGIFAIGRAMFMAVASNPILLAISAVIGLVILLV
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VYWDEVKAFAIAAWEAISTKAAEIWQSIITGASEMWDNITNKAAESWDNVKKDAGEKWNS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTTMFKNAWQKSIDTVVGWFNSLIPSWIRDLFSDGAKAEVKLSGEALTTPVSGHVSPQRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEECCCCCCCCHHHC
GYGGRPIFAPNQNMTQTNNFNIQGSANPSGVANAVSDKLSRGSSTSFGMGAIEYAG
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNAIRELVTLLRYKVDNSGLKAYVVQTQQAAKGIRSNLNNAVDGLRAKFSGAAVSVKEVG
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHC
NNLKDAKNQMLSLRNLVAGYFAMIAGGNVIKIADDWAAVDSRVKLATKSVEEHKYALSQI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FDLSQRSGQDYLASADLFSKVNRSAGDLGLSLDDTLNLTEIIGQTMTIGGGDQGAQQAAL
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHH
MQLGQALGSGALRGDELNSIIEQAPRLANAIADSFGVPIGQLKDLGKEGKLTSKELAQGL
HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
LKQADKIQKEFDQMPKTFGRGMTILKNKAGQLIDVAVNKVSKLGAAFYNAAEWVTENIRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGFLAGTVIGGKLMFALAAAKKSLRQLLMMGARAVAPYLAMAAAAGVVALVLEDIYGWTQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GDLSFTGALVGRYEVWADKFAALGKLADKLWINVRGLLKDLSRMAGVEINFDSWQAFATD
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
VLEYIIAAVRNLINTVSGMVRIIRALINGDYAGAWSSAGDMIDGLSLKFLPLYSVGLMVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
GGILSAVWALFSPFRAFFGLLKGGFRSVMFVAKPFIKVAKGIASPFIWAQKHFKLFSRVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHC
SGAFSLLKRGAVKFGVIFKSVVGTVVKGIFAIGRAMFMAVASNPILLAISAVIGLVILLV
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VYWDEVKAFAIAAWEAISTKAAEIWQSIITGASEMWDNITNKAAESWDNVKKDAGEKWNS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTTMFKNAWQKSIDTVVGWFNSLIPSWIRDLFSDGAKAEVKLSGEALTTPVSGHVSPQRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEECCCCCCCCHHHC
GYGGRPIFAPNQNMTQTNNFNIQGSANPSGVANAVSDKLSRGSSTSFGMGAIEYAG
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA