| Definition | Haemophilus influenzae PittGG chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009567 |
| Length | 1,887,192 |
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The map label for this gene is pqqL [H]
Identifier: 148826838
GI number: 148826838
Start: 96122
End: 98701
Strand: Reverse
Name: pqqL [H]
Synonym: CGSHiGG_00500
Alternate gene names: 148826838
Gene position: 98701-96122 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148826839
Following gene: 148826836
Centisome position: 5.23
GC content: 32.79
Gene sequence:
>2580_bases ATGATCAAAAAAGGCATTGCCCATTTAGTTGAACATATGGCATTTAATGGCTCAAAGAAATATCCAGAAAATCAAATTAT TAATGCGTTAGAAAAACTTGGAATGAAATTTGCACGAGATATTAATGCTTTCACCGATTTTGAAAATACAGTCTATACTT TAAATTTAGATAGCAATAATCAGCAAAAATTAGAATTAGCTTTTGATGTCATCAATGAATGGATGAATAATATTACTTTT TTGCCTAAAGATGTAGATGGCGAACGTGGTGTAGTACAAGAAGAATGGCGGAGACGTTTAAGCCCAATGCTACGTATTGG CAATAAGAAAAGTGCTATTGAAATGGCAGGATCTCGTTATGTATTACGTGATCCTATTGGAGATATGGATATTATTAAAA CAATTTCAGCTAAACGCGTCGCTGATTTTTATCACAAATGGTATCGACCAGATAATATGTCAGTAATTATTGTAGGCGAT ATTGATACAAAACAAGTAGTAAAACTATTAAAACAAAACCTATCCCAAGAAAACCCAATTACTAAAACAACATTGGAAAA AATTGATTTTAATATTCCGCTTATCAACAAATGGCGATTAGATTCTATTTCAGAACAAGGCACAACAATTCCGAGTATTG AATTAAGTTTTTTTGAAAATACAATTGAAACCAATACATTAGCGAGTTATAAACAAGAATTAATTCAGCAAATTACCACT CGATTACTTAACTTACGTTTACAGCAATGGGAAAAGGAAACAGAAAATGGCGTAGATTCTGCAAATTTTTATCGTACTCA TTTAGGTAAAGAAACACTACAAAGCATTTTTTCTCTCCAGCTTATAGATACACAATATTCAAAAACGATAGATAAATTAT TTGCCTTTATTGCCAGTATAAAACAACAAGGTTTTACTCAAAATGAATTAAACGGCGAAATTAAACGCTTAACTCAACTC AATGAAAAACAATTAAATATTCGTTCTGGTAGCTTAAAAATTGCCGATGATCTCATTACTTCTGTGGCAAATAAGCAAGT GGTATTGAGCGTAAATGATCGTTATGAACTCAATAAACGTTTTTTATCTCAAATTACATTAGCTGATTTACAACGCACGT TAAATCAAACCTTAGCATTAAAAGCAAAATTATTATTAATCACTCAACCTTTGCCACAAAAAGCCTTGCCTTTTGATGTA GCAGAAATAGAAACTCGTTGGAACAATGCAATGGAAATGCAACAACACCAATGGGATGAAAAAAAACAAATCGAAAAATT ACCGCACTTAACATTTAACACGGGCTCACTTTCTCAAGAAAAATACTGGGATCGCGGCGATATTTATGAATTTCGTTTAA GTAATGGAAGTAAATTGATCTACCACTATAGTGACAAAACTCCAAATCAAGTACATTTTCGTGCTGTTACTCAAGGTGGT TTACGTTCTATCCCAAATAAGGACTATCACTTATTACGTGCTGCCGTCAGTGTAGTTGATGAAACAGGTGTTGGAGAACT TTCTCTTTCTGCGGTTAATCAAATTTTTTCGCGCGATCCATTGGTAATTGCAACTGTGATTGATGATGATAAACAAGGCT TTACTGGTGTATCTAAACCTAAGGATTTGGAAAATTTACTGACATTGTTCCGCTTAAAATTACGTTCTTCTCCTATATCC GATCTTGCCTTAGAAAAATATCGACGTGAAACCCGTGATTATTTCAAACAGATTGATTTAGAAACACAATTTATGCAAGC CGTTTCAAAACTACGTTTTCCAAATATTGAAACCGTCTATACTCAAAAACAAGCACAGCAATTAGCATTTGATAAAAACC AATTAAGTAACGCTTATCAACGTTATATTTTAGATAAAACAGATTTTACCTATTTTATTATTGGCGATATTGAACTTAAT CAAGTAAAGAAATTGGCAGAACGTTATTTAGCTTCTGTTGAATCGAAAACTCAGATCCGCCATTTTGTCCCGACTATTAT TCATACACCAACTCAATCATTTATTATGAATGGTTTGAAAGAACCGAGAGCTGATGTAGAAATATACCTTACCGCAGATA ATACTTGGCGAACAGAACAAAAATATTTATTCAATATTCTTGCGGATATTGTGCAAGAAAAATTACGCTTAATTCTACGT GAAAAAGTTTCTGGTATTTATTCTGTAAATAGTTGGTTTATACAAGATGTTCATGCACCACAAATTGAGGGAAAAATTGA ATTTAGTTGCGACCCTAAGCGCGTGGAGGAACTTACGCATCTTACAAATCAGGTACTAGATGACATTATAAAAAATGGCA TTGATGAAAACTTATTACGTAAAAAACTAGCGGAACAACATACTCAGATTCGACGTGAATTTGATTCTTTAGTTTCAATT GCTTCAATTATTGAAGAAAGTTACTGGCAACAAGATAATCCAGATGCCATTTATACCTATCAACATTTAGATCAGTTAGC GACAAAAGCCACAATAGATGCGTTGGCGCAAAAAGCCCTAAAAAAAATCAGGCAGATTTATCAGCGTATTAAAAGCAGCT GCTTATTAGAAAATAAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTATCAAATGGTTTGCAATACTTTGTATTAAAAAATACTGAACCCAAAGAACGCGTTTATATTCGATTAGTAATTAATGC AGGCTCAATGCACGAAGATG
Downstream 100 bases:
>100_bases AATCTCAACAGATCTGAAACAGATAAAAATAACGGTGATCGCTTAAACGATCACCGTTAAATTAAAATCACTGTTGAAAC AATAAATTATATTGGTTATT
Product: putative zinc protease
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 859; Mature: 859
Protein sequence:
>859_residues MIKKGIAHLVEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFENTVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITF LPKDVDGERGVVQEEWRRRLSPMLRIGNKKSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGD IDTKQVVKLLKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLASYKQELIQQITT RLLNLRLQQWEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKTIDKLFAFIASIKQQGFTQNELNGEIKRLTQL NEKQLNIRSGSLKIADDLITSVANKQVVLSVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDV AEIETRWNNAMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPNQVHFRAVTQGG LRSIPNKDYHLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDDDKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPIS DLALEKYRRETRDYFKQIDLETQFMQAVSKLRFPNIETVYTQKQAQQLAFDKNQLSNAYQRYILDKTDFTYFIIGDIELN QVKKLAERYLASVESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILADIVQEKLRLILR EKVSGIYSVNSWFIQDVHAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTHLTNQVLDDIIKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSI ASIIEESYWQQDNPDAIYTYQHLDQLATKATIDALAQKALKKIRQIYQRIKSSCLLENK
Sequences:
>Translated_859_residues MIKKGIAHLVEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFENTVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITF LPKDVDGERGVVQEEWRRRLSPMLRIGNKKSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGD IDTKQVVKLLKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLASYKQELIQQITT RLLNLRLQQWEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKTIDKLFAFIASIKQQGFTQNELNGEIKRLTQL NEKQLNIRSGSLKIADDLITSVANKQVVLSVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDV AEIETRWNNAMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPNQVHFRAVTQGG LRSIPNKDYHLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDDDKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPIS DLALEKYRRETRDYFKQIDLETQFMQAVSKLRFPNIETVYTQKQAQQLAFDKNQLSNAYQRYILDKTDFTYFIIGDIELN QVKKLAERYLASVESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILADIVQEKLRLILR EKVSGIYSVNSWFIQDVHAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTHLTNQVLDDIIKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSI ASIIEESYWQQDNPDAIYTYQHLDQLATKATIDALAQKALKKIRQIYQRIKSSCLLENK >Mature_859_residues MIKKGIAHLVEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFENTVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITF LPKDVDGERGVVQEEWRRRLSPMLRIGNKKSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGD IDTKQVVKLLKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLASYKQELIQQITT RLLNLRLQQWEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKTIDKLFAFIASIKQQGFTQNELNGEIKRLTQL NEKQLNIRSGSLKIADDLITSVANKQVVLSVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDV AEIETRWNNAMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPNQVHFRAVTQGG LRSIPNKDYHLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDDDKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPIS DLALEKYRRETRDYFKQIDLETQFMQAVSKLRFPNIETVYTQKQAQQLAFDKNQLSNAYQRYILDKTDFTYFIIGDIELN QVKKLAERYLASVESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILADIVQEKLRLILR EKVSGIYSVNSWFIQDVHAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTHLTNQVLDDIIKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSI ASIIEESYWQQDNPDAIYTYQHLDQLATKATIDALAQKALKKIRQIYQRIKSSCLLENK
Specific function: Unknown
COG id: COG0612
COG function: function code R; Predicted Zn-dependent peptidases
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the peptidase M16 family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787770, Length=868, Percent_Identity=27.5345622119816, Blast_Score=270, Evalue=2e-73,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011249 - InterPro: IPR011237 - InterPro: IPR011765 - InterPro: IPR001431 - InterPro: IPR007863 [H]
Pfam domain/function: PF00675 Peptidase_M16; PF05193 Peptidase_M16_C [H]
EC number: 3.4.99.- [C]
Molecular weight: Translated: 99567; Mature: 99567
Theoretical pI: Translated: 8.42; Mature: 8.42
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIKKGIAHLVEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFENTVYTLNLDSNN CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCC QQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGERGVVQEEWRRRLSPMLRIGNKKSAIEMAGSRY CHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCEE VLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKLLKQNLSQENPI EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC TKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLASYKQELIQQITT HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLLNLRLQQWEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKTIDKLFAFIASI HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQQGFTQNELNGEIKRLTQLNEKQLNIRSGSLKIADDLITSVANKQVVLSVNDRYELNKR HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHH FLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNNAMEMQQHQWDE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH KKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPNQVHFRAVTQGG HHHHHHCCCCEECCCCCCHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCH LRSIPNKDYHLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDDDKQGFTGVSKP HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCC KDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRRETRDYFKQIDLETQFMQAVSKLRFPNIETVY HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH TQKQAQQLAFDKNQLSNAYQRYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERYLASVESKTQIR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILADIVQEKLRLILR HHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKVSGIYSVNSWFIQDVHAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTHLTNQVLDDIIKNGIDENLLR HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH KKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYWQQDNPDAIYTYQHLDQLATKATIDALAQKAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKIRQIYQRIKSSCLLENK HHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MIKKGIAHLVEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFENTVYTLNLDSNN CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCC QQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGERGVVQEEWRRRLSPMLRIGNKKSAIEMAGSRY CHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCEE VLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKLLKQNLSQENPI EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC TKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLASYKQELIQQITT HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLLNLRLQQWEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKTIDKLFAFIASI HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQQGFTQNELNGEIKRLTQLNEKQLNIRSGSLKIADDLITSVANKQVVLSVNDRYELNKR HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHH FLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNNAMEMQQHQWDE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH KKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPNQVHFRAVTQGG HHHHHHCCCCEECCCCCCHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCH LRSIPNKDYHLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDDDKQGFTGVSKP HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCC KDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRRETRDYFKQIDLETQFMQAVSKLRFPNIETVY HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH TQKQAQQLAFDKNQLSNAYQRYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERYLASVESKTQIR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILADIVQEKLRLILR HHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKVSGIYSVNSWFIQDVHAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTHLTNQVLDDIIKNGIDENLLR HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH KKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYWQQDNPDAIYTYQHLDQLATKATIDALAQKAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKIRQIYQRIKSSCLLENK HHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: Zn [C]
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: Hydrolase; Acting on peptide bonds (Peptidases); Endopeptidases of unknown catalytic mechanism [C]
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800 [H]