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The map label for this gene is nrfE [H]

Identifier: 148826414

GI number: 148826414

Start: 1447981

End: 1449888

Strand: Direct

Name: nrfE [H]

Synonym: CGSHiEE_07285

Alternate gene names: 148826414

Gene position: 1447981-1449888 (Clockwise)

Preceding gene: 148826413

Following gene: 148826415

Centisome position: 79.87

GC content: 41.19

Gene sequence:

>1908_bases
ATGCTTCCAGAACTTGGCTTTTTCCTTCTTTTACTCGCAACAGCTAGCGCGTTTTTTCTTGCGTTAGTGCCTCAATTTGG
GTTATTCAAAAAAAATTCGACTTTAATTAATGCTGCTTGGCCGCTTAGTTATATTTTTACCCTTGCGACGACGTTCTCAA
TTGGTTTGCTTGCTTATTCTTTTGCGGTGGATGATTTCACCCTTGAATATGTAGCGGCACATTCTAATTCCCAATTACCT
ACATTTTTTAAAATGGCTGCCACTTGGGGAGGACATGAAGGTTCAATGTTGTTTTGGTTATTTTCATTGAGTTTATGGCT
TGCTGCTTTTGCTTTTTTTAATCGAAAAAATGACCGCACTTTTTCCGCTCAATCTTTATCTTTATTGGGGTTGATTTGCT
TTGGTTTTGCGGTGTTTATTTTATTTTATTCCAATCCATTTGGACGCATTTTCCCTGCTCCCGCAGAAGGGCGCGATCTC
AATCCAATGTTGCAAGATGTGGGATTAATTTTCCATCCGCCCTTATTATATGTTGGCTATGTGGGCTTTGCGGTAAATTT
TGCAATGAGTTTGAGTGCGTTGATTTATAACCAGTCAGCACGACAAATTGCCCGCTCAATGCGTGGTTGGGTGTTGGTTT
CTTGGTTGTTTTTAACCATTGGTATTGTGCTTGGTGCGTGGTGGGCATATTACGAACTTGGCTGGGGCGGTTGGTGGTTC
TGGGATCCCGTAGAAAATGCGTCTTTAATGCCTTGGTTGCTTGGTTTGGCGTTATTACACAGTTTAATGGCGACGGAAAA
ACAAGGCGTATTTAGTTATTGGACAACGCTTTTTTCTCTGCTTGCTTTTGCCTTTAGCGTATTAGGTACGTTTATTGTTC
GTTCTGGTGCGCTCACTTCTGTGCACGCCTTTGCATTGGATAACACGCGCGGTTATGTGTTGTTATTAATTTTCTTTGTT
TTGACAGCGTTAGCCTTTGGTTTATTCGCTTTACGAGCGGGAAGTTCATCAGAAAGTGCGGTGAAATTTCAGTTCATTTC
TAAATCGGGTGGCATTTTATTACTGAATATTTTGCTGACCATTGCGACGGTTTCTACCTTTTTAGGCACCTTTTATCCCA
TGTTATTCCAAGCGATGAATTGGGGCTCAATTTCGGTGGGAAGTCCTTATTTTAATAGTATTTTCTTCCCCATTATTACG
GCGATTTTAATCTTAATGGTAATTGTGCTTAGCATACGTAAGGGGCAATTTGATCGCACATTATTGATACGTTGTGGGTG
GTTGCTTATTCCGTCTTTGATTCTTGCAGGCCTAATGATTTGGCAACAGCTACGCCATAATTCTGCGTTGAATTTTCACG
CTTTCGCCTTTGTGTTATTAACTCTTGCGGTTTGGCTTTTATTCGTCACGTTATGGCAAAATTGGCGACAAATTCGTTTG
TCTCAATTTGGGATGATTTTGGCACACTGTGGCGTGGCGATTGTGACTATTGGTGCGGTGATGAGTGGGTATTTTGGCAG
TGAAATTGGTGTGCGTTTAGCACCGCAACAAAGTCAAACACTGGGGCAATATGAATTTCACTATCGCCAATTTTCTAATG
AAATTGGGCCAAATTTTACGGCAGAAATCGCCTTTTTTGACGTAACTAAAAATGGTAAACCTTATGCAGAAATTATCCCA
GAACGCCGTTATTACGATGTTCGTACAATGACAATGAGTGAAGTGGGGCTTGATGGTGGTTTTTGGGGCGATTTATATAT
TGTGATGGGCGATTCTCTTGGCAAAGGGGAATTTACTTTCCGCTTACATTATAAACCACTGATTCGTTGGCTTTGGGCGG
GCGGTATTTTAATGGCCGTTGGTGCACTTTTTAGCGTCTTCGGATTACGCAGAAAACAGGAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGCACAATAGCACCTATTAAGGTGCTATTTTTAATTTTATTAATGAAACATACTTGATTAGCGACTTTATCTGCGCATCA
ACGAAAAAAACGACGACATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAACAAAAAACTTATCTTTTTTACACCGCTCTTTGTGCTTTTAGGCGTGTGTATATTATTAATTGCAGGGTTAAATCAA
GATCCGAAAAAAATTGCTTC

Product: cytochrome c-type biogenesis protein NrfE

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 635; Mature: 635

Protein sequence:

>635_residues
MLPELGFFLLLLATASAFFLALVPQFGLFKKNSTLINAAWPLSYIFTLATTFSIGLLAYSFAVDDFTLEYVAAHSNSQLP
TFFKMAATWGGHEGSMLFWLFSLSLWLAAFAFFNRKNDRTFSAQSLSLLGLICFGFAVFILFYSNPFGRIFPAPAEGRDL
NPMLQDVGLIFHPPLLYVGYVGFAVNFAMSLSALIYNQSARQIARSMRGWVLVSWLFLTIGIVLGAWWAYYELGWGGWWF
WDPVENASLMPWLLGLALLHSLMATEKQGVFSYWTTLFSLLAFAFSVLGTFIVRSGALTSVHAFALDNTRGYVLLLIFFV
LTALAFGLFALRAGSSSESAVKFQFISKSGGILLLNILLTIATVSTFLGTFYPMLFQAMNWGSISVGSPYFNSIFFPIIT
AILILMVIVLSIRKGQFDRTLLIRCGWLLIPSLILAGLMIWQQLRHNSALNFHAFAFVLLTLAVWLLFVTLWQNWRQIRL
SQFGMILAHCGVAIVTIGAVMSGYFGSEIGVRLAPQQSQTLGQYEFHYRQFSNEIGPNFTAEIAFFDVTKNGKPYAEIIP
ERRYYDVRTMTMSEVGLDGGFWGDLYIVMGDSLGKGEFTFRLHYKPLIRWLWAGGILMAVGALFSVFGLRRKQEK

Sequences:

>Translated_635_residues
MLPELGFFLLLLATASAFFLALVPQFGLFKKNSTLINAAWPLSYIFTLATTFSIGLLAYSFAVDDFTLEYVAAHSNSQLP
TFFKMAATWGGHEGSMLFWLFSLSLWLAAFAFFNRKNDRTFSAQSLSLLGLICFGFAVFILFYSNPFGRIFPAPAEGRDL
NPMLQDVGLIFHPPLLYVGYVGFAVNFAMSLSALIYNQSARQIARSMRGWVLVSWLFLTIGIVLGAWWAYYELGWGGWWF
WDPVENASLMPWLLGLALLHSLMATEKQGVFSYWTTLFSLLAFAFSVLGTFIVRSGALTSVHAFALDNTRGYVLLLIFFV
LTALAFGLFALRAGSSSESAVKFQFISKSGGILLLNILLTIATVSTFLGTFYPMLFQAMNWGSISVGSPYFNSIFFPIIT
AILILMVIVLSIRKGQFDRTLLIRCGWLLIPSLILAGLMIWQQLRHNSALNFHAFAFVLLTLAVWLLFVTLWQNWRQIRL
SQFGMILAHCGVAIVTIGAVMSGYFGSEIGVRLAPQQSQTLGQYEFHYRQFSNEIGPNFTAEIAFFDVTKNGKPYAEIIP
ERRYYDVRTMTMSEVGLDGGFWGDLYIVMGDSLGKGEFTFRLHYKPLIRWLWAGGILMAVGALFSVFGLRRKQEK
>Mature_635_residues
MLPELGFFLLLLATASAFFLALVPQFGLFKKNSTLINAAWPLSYIFTLATTFSIGLLAYSFAVDDFTLEYVAAHSNSQLP
TFFKMAATWGGHEGSMLFWLFSLSLWLAAFAFFNRKNDRTFSAQSLSLLGLICFGFAVFILFYSNPFGRIFPAPAEGRDL
NPMLQDVGLIFHPPLLYVGYVGFAVNFAMSLSALIYNQSARQIARSMRGWVLVSWLFLTIGIVLGAWWAYYELGWGGWWF
WDPVENASLMPWLLGLALLHSLMATEKQGVFSYWTTLFSLLAFAFSVLGTFIVRSGALTSVHAFALDNTRGYVLLLIFFV
LTALAFGLFALRAGSSSESAVKFQFISKSGGILLLNILLTIATVSTFLGTFYPMLFQAMNWGSISVGSPYFNSIFFPIIT
AILILMVIVLSIRKGQFDRTLLIRCGWLLIPSLILAGLMIWQQLRHNSALNFHAFAFVLLTLAVWLLFVTLWQNWRQIRL
SQFGMILAHCGVAIVTIGAVMSGYFGSEIGVRLAPQQSQTLGQYEFHYRQFSNEIGPNFTAEIAFFDVTKNGKPYAEIIP
ERRYYDVRTMTMSEVGLDGGFWGDLYIVMGDSLGKGEFTFRLHYKPLIRWLWAGGILMAVGALFSVFGLRRKQEK

Specific function: Required for the biogenesis of c-type cytochromes. Possible subunit of a heme lyase [H]

COG id: COG1138

COG function: function code O; Cytochrome c biogenesis factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ccmF/cycK/ccl1/nrfE/ccsA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788524, Length=641, Percent_Identity=40.2496099843994, Blast_Score=467, Evalue=1e-132,
Organism=Escherichia coli, GI1790511, Length=584, Percent_Identity=36.472602739726, Blast_Score=318, Evalue=6e-88,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002541
- InterPro:   IPR003567
- InterPro:   IPR003568
- InterPro:   IPR003570
- InterPro:   IPR017563 [H]

Pfam domain/function: PF01578 Cytochrom_C_asm [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71283; Mature: 71283

Theoretical pI: Translated: 9.55; Mature: 9.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLPELGFFLLLLATASAFFLALVPQFGLFKKNSTLINAAWPLSYIFTLATTFSIGLLAYS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAVDDFTLEYVAAHSNSQLPTFFKMAATWGGHEGSMLFWLFSLSLWLAAFAFFNRKNDRT
HHHCCHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
FSAQSLSLLGLICFGFAVFILFYSNPFGRIFPAPAEGRDLNPMLQDVGLIFHPPLLYVGY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHCCHHHHHHH
VGFAVNFAMSLSALIYNQSARQIARSMRGWVLVSWLFLTIGIVLGAWWAYYELGWGGWWF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
WDPVENASLMPWLLGLALLHSLMATEKQGVFSYWTTLFSLLAFAFSVLGTFIVRSGALTS
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
VHAFALDNTRGYVLLLIFFVLTALAFGLFALRAGSSSESAVKFQFISKSGGILLLNILLT
EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHH
IATVSTFLGTFYPMLFQAMNWGSISVGSPYFNSIFFPIITAILILMVIVLSIRKGQFDRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
LLIRCGWLLIPSLILAGLMIWQQLRHNSALNFHAFAFVLLTLAVWLLFVTLWQNWRQIRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SQFGMILAHCGVAIVTIGAVMSGYFGSEIGVRLAPQQSQTLGQYEFHYRQFSNEIGPNFT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
AEIAFFDVTKNGKPYAEIIPERRYYDVRTMTMSEVGLDGGFWGDLYIVMGDSLGKGEFTF
EEEEEEEECCCCCCHHHHCCCCCEEEEHEEEHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEE
RLHYKPLIRWLWAGGILMAVGALFSVFGLRRKQEK
EEEHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MLPELGFFLLLLATASAFFLALVPQFGLFKKNSTLINAAWPLSYIFTLATTFSIGLLAYS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAVDDFTLEYVAAHSNSQLPTFFKMAATWGGHEGSMLFWLFSLSLWLAAFAFFNRKNDRT
HHHCCHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
FSAQSLSLLGLICFGFAVFILFYSNPFGRIFPAPAEGRDLNPMLQDVGLIFHPPLLYVGY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHCCHHHHHHH
VGFAVNFAMSLSALIYNQSARQIARSMRGWVLVSWLFLTIGIVLGAWWAYYELGWGGWWF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
WDPVENASLMPWLLGLALLHSLMATEKQGVFSYWTTLFSLLAFAFSVLGTFIVRSGALTS
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
VHAFALDNTRGYVLLLIFFVLTALAFGLFALRAGSSSESAVKFQFISKSGGILLLNILLT
EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHH
IATVSTFLGTFYPMLFQAMNWGSISVGSPYFNSIFFPIITAILILMVIVLSIRKGQFDRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
LLIRCGWLLIPSLILAGLMIWQQLRHNSALNFHAFAFVLLTLAVWLLFVTLWQNWRQIRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SQFGMILAHCGVAIVTIGAVMSGYFGSEIGVRLAPQQSQTLGQYEFHYRQFSNEIGPNFT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
AEIAFFDVTKNGKPYAEIIPERRYYDVRTMTMSEVGLDGGFWGDLYIVMGDSLGKGEFTF
EEEEEEEECCCCCCHHHHCCCCCEEEEHEEEHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEE
RLHYKPLIRWLWAGGILMAVGALFSVFGLRRKQEK
EEEHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]