| Definition | Haemophilus influenzae PittEE chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009566 |
| Length | 1,813,033 |
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The map label for this gene is 148825163
Identifier: 148825163
GI number: 148825163
Start: 33666
End: 35654
Strand: Direct
Name: 148825163
Synonym: CGSHiEE_00175
Alternate gene names: NA
Gene position: 33666-35654 (Clockwise)
Preceding gene: 148825161
Following gene: 148825164
Centisome position: 1.86
GC content: 40.67
Gene sequence:
>1989_bases ATGTATAACGAAAACTTAAAAGAATTGACCGTTCGAGGAATTATCCTCGGTGCATTGATTACGGTAATTTTCACTGCATC CAATGTGTATCTCGGTCTAAAAGTGGGGGTGACATTTGCGTCATCTATTCCAGCGGCCGTCATTTCTATGGCAGTACTCA AATTTTTCAAAGATTCTAGCATTCTTGAAAATAATATGGTGCAAACTCAAGCATCTTCAGCAGGTACGCTTTCTTCTGTG ATCTTCGTCTTGCCTGGTTTATTAATGATGGGCTACTGGCAAGATTTCCCATTCTGGCAAACGATGTTGATTTGTGCAGC TGGTGGTACATTGGGCGTGTTATTCACTATTCCATTACGCCGTGCAATGGTGGTAAATAGTAATTTACCTTATCCTGAAG GGGTAGCCGCTGCAGAAATTTTGAAAGCAGGTAATCATGCAGATGGCGACAGCGGTGTGAAAGATATTGCTTACGGTGGT GTTTTAGCAGGATTAGTTGCATTTTTAACTAACGGTTTACGCGTGATGGCTGATGGTGCAAGTGCTTGGATTCAAACAGG AAAAGCGGCGTTCCAATTACCAATGGGCTTTTCACTTGCCTTACTCGGTGCTGGTTATTTAATTGGTATTGTCGGCGGTA TCGCAATGTTGATCGGTGTTATTTTGACTTGGGGTGTGGCAGTGCCATATTTCACAATGTCAGAAGATATTGCCGCGGAT GCAAGTTTAATTGATTCTGCGATGACTGTTTGGAAAACCAAAGTGCGTTATATTGGTGTGGGTACAATTGGCATTGCTGC GATTTGGACATTGCTGATTTTAATGAAACCAATGATTGAAGGAATGGTTCATTCTTTCCGTATGCTGAAAGGTGGGCAAG AGGCATCAGAACATCGTATTGATATTGACCTTTCTCCAAAAACAATGATTTATATCTTAATAGCGACGGTTGCGTTAATT GTTATTTCATTACATCACTTTATTGCGGCGGCACCAATTTCGCCTGAGCTTTCCATTTTATTAGTGGTAGTTTGTACTTT CTTAGCGGTATTTATCGGCTTCTTTGTGGCAGCGGCTTCTGGTTATATGGCTGGTTTAGTGGGTTCATCTTCAAGCCCAA TTTCTGGTATCGGAATTATTTCTGTTATCGTGATTTCATTAGTATTGGTGTCAATCGGTAATGCCTCGGGCTTATTTGAA ACTGTAGATGGTCAGAAATTTTTAACCGCACTTACATTGTTTACGGCATCTATCGTAATCACTACAGCCTGTATTTCTAA TGATAATCTACAAGATTTAAAAACGGGTTTATTAGTTGAAGCAACACCTTGGCGACAACAAGTTGCATTAATTATCGGCT GCTTTGTCGGTGCACTTGTTATCGCGCCAGTATTAGAAATCTTATATCATGCGTATGGTTTCAGCGGTGCGTTGCCACGT CCAGATATGGATCCTTCACAAGCCTTATCTGCACCACAAGCAACGTTAATGACCGCCATTTCTCAAGGTATTTTCACAAA TAAATTGGAATGGACTTACATCTTAACTGGTGTGGGTTTAGGTGCTGTGTTAATTACGATTGATGCATTTTTGAAAAAAG TCAGCAACAAAGTCTTTAGCTTGCCAGTTATTGCTGTGGGGATTGGTATTTACTTACCACCATCAATTAATACGCCTGTG ATTGTTGGTGCATTCCTAGCGTGGATTATGGCTCGCCATATTGCAAAACTTGGTAACAAAGAAGTGTCAGCTAAAGCAGA ACGTTTCGGTACGCTTTTCTCTGCAGGTTTAATTGTAGGCGAAAGTTTAATGGGGGTAATTTTAGCATTCATTATTGCGG CTTCTGTTACCACTGGCGGTTCTGAAGCACCATTATCCTTAAATCTTGAAAATTGGGATACAATTGGCGAGTGGTTAGGT TTAATCGTATTTATCGTGGGCATTGTGATTTTTGCATCTCGCGTATTACGTGCGAAAAAATCTGATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCAATAAAACAAATTTTATGTTAAAAAAACTTAGAAAAATAGTCTAAATTTTTGACAAGGTTGAGTCGGTTTTCTTTTT TTAAGCTCAAGGAACAATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCCTTAAATTTATTTTAGAATAGGTTATCTTCTGGATAACCTATTTTTCACTATGAAATCTTACTTAAAAACACTTATTT TTTTCCCTCTGATTTTACAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 662; Mature: 662
Protein sequence:
>662_residues MYNENLKELTVRGIILGALITVIFTASNVYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSSILENNMVQTQASSAGTLSSV IFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLRRAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGG VLAGLVAFLTNGLRVMADGASAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAAD ASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAIWTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRIDIDLSPKTMIYILIATVALI VISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFE TVDGQKFLTALTLFTASIVITTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPR PDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNKLEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFSLPVIAVGIGIYLPPSINTPV IVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVGESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWLG LIVFIVGIVIFASRVLRAKKSD
Sequences:
>Translated_662_residues MYNENLKELTVRGIILGALITVIFTASNVYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSSILENNMVQTQASSAGTLSSV IFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLRRAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGG VLAGLVAFLTNGLRVMADGASAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAAD ASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAIWTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRIDIDLSPKTMIYILIATVALI VISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFE TVDGQKFLTALTLFTASIVITTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPR PDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNKLEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFSLPVIAVGIGIYLPPSINTPV IVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVGESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWLG LIVFIVGIVIFASRVLRAKKSD >Mature_662_residues MYNENLKELTVRGIILGALITVIFTASNVYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSSILENNMVQTQASSAGTLSSV IFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLRRAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGG VLAGLVAFLTNGLRVMADGASAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAAD ASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAIWTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRIDIDLSPKTMIYILIATVALI VISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFE TVDGQKFLTALTLFTASIVITTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPR PDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNKLEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFSLPVIAVGIGIYLPPSINTPV IVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVGESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWLG LIVFIVGIVIFASRVLRAKKSD
Specific function: Unknown
COG id: COG1297
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the oligopeptide OPT transporter family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004814 - InterPro: IPR004813 [H]
Pfam domain/function: PF03169 OPT [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69717; Mature: 69717
Theoretical pI: Translated: 6.63; Mature: 6.63
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYNENLKELTVRGIILGALITVIFTASNVYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSS CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH ILENNMVQTQASSAGTLSSVIFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLR HHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHH RAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGGVLAGLVAFLTNGLRVMADGA HHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCH SAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAAD HHHHHCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHH ASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAIWTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRI HHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEE DIDLSPKTMIYILIATVALIVISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAAS EEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFETVDGQKFLTALTLFTASIVI CHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH TTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPR HHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC PDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNKLEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFS CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC LPVIAVGIGIYLPPSINTPVIVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVG CHHHHHHHCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWLGLIVFIVGIVIFASRVLRAKK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SD CC >Mature Secondary Structure MYNENLKELTVRGIILGALITVIFTASNVYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSS CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH ILENNMVQTQASSAGTLSSVIFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLR HHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHH RAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGGVLAGLVAFLTNGLRVMADGA HHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCH SAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAAD HHHHHCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHH ASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAIWTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRI HHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEE DIDLSPKTMIYILIATVALIVISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAAS EEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFETVDGQKFLTALTLFTASIVI CHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH TTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPR HHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC PDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNKLEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFS CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC LPVIAVGIGIYLPPSINTPVIVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVG CHHHHHHHCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWLGLIVFIVGIVIFASRVLRAKK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SD CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800 [H]