| Definition | Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009515 |
| Length | 1,853,160 |
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The map label for this gene is 148643807
Identifier: 148643807
GI number: 148643807
Start: 1802791
End: 1806309
Strand: Reverse
Name: 148643807
Synonym: Msm_1747
Alternate gene names: NA
Gene position: 1806309-1802791 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148643824
Following gene: 148643803
Centisome position: 97.47
GC content: 24.58
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TCAAAATATTATTTGACTGTTTTGAATTTCCCGATAAACATAGCAACAATTTAATATCACCAAATAGATATATATAGTTT TAATTAAACTTGGTGAAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTATATCTTTTTAAGCAAATTTAATTTTTTAGATTTTTTACCTTCTTTTTTAATTTCTATATTCTGGAATAATTCATA ATTAAATTTAACCCCGTTAT
Product: type II restriction enzyme, methylase subunit
Products: NA
Alternate protein names: Type II Restriction Methylase Subunit; Type IIS Restriction; Type II Restriction; Eco57I Restriction Endonuclease; Type II Restriction Methylase Subunits; Restriction Family Protein; Type II Restriction 12I; Type II Restriction Methyltransferase; LOW QUALITY PROTEIN Type IIS Restriction
Number of amino acids: Translated: 1172; Mature: 1172
Protein sequence:
>1172_residues MDKTAIKTFAINSRKKLMEDVEYKMSLVGIDKDNIYEPISSANGIETYQLGGSTNSIYDNDISKRERLVKEVKQKGFENV VEEVAYTWFNRIIAIRFMEINNFLPTKTRVLSSETAGKIEPDIITEAFDVDLDYTQEDKELIFKLKDENKLDELFRFLFI KQCNKLNEILPGLFEKTDDYLELLLNISFTNEDGVVRQLIDTIPEKDFESQVEVIGWLYQFYNTELKDETFANLKKRIKI SKERIPAATQLFTPDWIVKYMVENSVGRLWLEGHPNNELKSKWKYYVDEAKQEPEVEQQLITIRKESEILKPEDITVIDP CMGSGHILVYVFEVLMDIYVSEGFTEKDACESILKNNIYGLDIDKRAYQLAYFAVLMKARKYNRRILTKGISPLLCSIEE TNSISKEFIEELISQDRTIEDAFNYLISSFKNGKEFGSILTIKPIDFEKINNLISKFESNNNLTKLKYLDEINLLKNIIN QSILLSKKYDVVVTNPPYMGNNGMNPNLKDYIKSKFPLTKTDLFAVFLEKGLEMIKDYGFNCMVTMQSWMFLSSFEKFRK KLIETTTISNLLHMDNMVMKIAFGTSATVFRKINLMNYNSTFYHVKLSDVENDIVNPLFFNDKNKYIIKQFNFDKIPGSP IAYWIDDNLIACFNNTNLSSLGDIKVGLQTGENTRFLRYWWEVDFNNIGFSSINCEDSKNTNKKWFPYNKGGSFRKWWGN QEFIINWENDGEELRNFKKSVLRNSQFYFHQSLSWSKISSGKIAFRYYPNGFLFDVAGCSVFVDDYLNYIFGFLNSNVCG NILDLISPTLNYEIGHIASLPIIIDENKVEEINNIVLENIKICKDDWDDYETSWNFKKHPLLKFNENNLKNSFKSWESYK KEQFNQLKSNETKLNNIFSEIYDIDSNYNVEDKHVSINSSNYEMDIKSFVSYAIGCMFGRYSLDDDCLISTNSNFNIENY SRFIPDDDNIIPILDTEYFEDDMVGRFVEFVKICFGEETLEENLEFIANALIKNNKTSREKIREYLLKHFFNDHKKLYKK CPIYWQFSSGSNNAFNCLIYSHRIDSQIIARIRTEYLHKTQKAIEQRLLDCENLLNTSDSSSEKAIITKEKNKLIKQLEE TIGYDEALNHVSNLNLSFNLDDGIKENYSMLQDIIISREGMKNKKINLLKKI
Sequences:
>Translated_1172_residues MDKTAIKTFAINSRKKLMEDVEYKMSLVGIDKDNIYEPISSANGIETYQLGGSTNSIYDNDISKRERLVKEVKQKGFENV VEEVAYTWFNRIIAIRFMEINNFLPTKTRVLSSETAGKIEPDIITEAFDVDLDYTQEDKELIFKLKDENKLDELFRFLFI KQCNKLNEILPGLFEKTDDYLELLLNISFTNEDGVVRQLIDTIPEKDFESQVEVIGWLYQFYNTELKDETFANLKKRIKI SKERIPAATQLFTPDWIVKYMVENSVGRLWLEGHPNNELKSKWKYYVDEAKQEPEVEQQLITIRKESEILKPEDITVIDP CMGSGHILVYVFEVLMDIYVSEGFTEKDACESILKNNIYGLDIDKRAYQLAYFAVLMKARKYNRRILTKGISPLLCSIEE TNSISKEFIEELISQDRTIEDAFNYLISSFKNGKEFGSILTIKPIDFEKINNLISKFESNNNLTKLKYLDEINLLKNIIN QSILLSKKYDVVVTNPPYMGNNGMNPNLKDYIKSKFPLTKTDLFAVFLEKGLEMIKDYGFNCMVTMQSWMFLSSFEKFRK KLIETTTISNLLHMDNMVMKIAFGTSATVFRKINLMNYNSTFYHVKLSDVENDIVNPLFFNDKNKYIIKQFNFDKIPGSP IAYWIDDNLIACFNNTNLSSLGDIKVGLQTGENTRFLRYWWEVDFNNIGFSSINCEDSKNTNKKWFPYNKGGSFRKWWGN QEFIINWENDGEELRNFKKSVLRNSQFYFHQSLSWSKISSGKIAFRYYPNGFLFDVAGCSVFVDDYLNYIFGFLNSNVCG NILDLISPTLNYEIGHIASLPIIIDENKVEEINNIVLENIKICKDDWDDYETSWNFKKHPLLKFNENNLKNSFKSWESYK KEQFNQLKSNETKLNNIFSEIYDIDSNYNVEDKHVSINSSNYEMDIKSFVSYAIGCMFGRYSLDDDCLISTNSNFNIENY SRFIPDDDNIIPILDTEYFEDDMVGRFVEFVKICFGEETLEENLEFIANALIKNNKTSREKIREYLLKHFFNDHKKLYKK CPIYWQFSSGSNNAFNCLIYSHRIDSQIIARIRTEYLHKTQKAIEQRLLDCENLLNTSDSSSEKAIITKEKNKLIKQLEE TIGYDEALNHVSNLNLSFNLDDGIKENYSMLQDIIISREGMKNKKINLLKKI >Mature_1172_residues MDKTAIKTFAINSRKKLMEDVEYKMSLVGIDKDNIYEPISSANGIETYQLGGSTNSIYDNDISKRERLVKEVKQKGFENV VEEVAYTWFNRIIAIRFMEINNFLPTKTRVLSSETAGKIEPDIITEAFDVDLDYTQEDKELIFKLKDENKLDELFRFLFI KQCNKLNEILPGLFEKTDDYLELLLNISFTNEDGVVRQLIDTIPEKDFESQVEVIGWLYQFYNTELKDETFANLKKRIKI SKERIPAATQLFTPDWIVKYMVENSVGRLWLEGHPNNELKSKWKYYVDEAKQEPEVEQQLITIRKESEILKPEDITVIDP CMGSGHILVYVFEVLMDIYVSEGFTEKDACESILKNNIYGLDIDKRAYQLAYFAVLMKARKYNRRILTKGISPLLCSIEE TNSISKEFIEELISQDRTIEDAFNYLISSFKNGKEFGSILTIKPIDFEKINNLISKFESNNNLTKLKYLDEINLLKNIIN QSILLSKKYDVVVTNPPYMGNNGMNPNLKDYIKSKFPLTKTDLFAVFLEKGLEMIKDYGFNCMVTMQSWMFLSSFEKFRK KLIETTTISNLLHMDNMVMKIAFGTSATVFRKINLMNYNSTFYHVKLSDVENDIVNPLFFNDKNKYIIKQFNFDKIPGSP IAYWIDDNLIACFNNTNLSSLGDIKVGLQTGENTRFLRYWWEVDFNNIGFSSINCEDSKNTNKKWFPYNKGGSFRKWWGN QEFIINWENDGEELRNFKKSVLRNSQFYFHQSLSWSKISSGKIAFRYYPNGFLFDVAGCSVFVDDYLNYIFGFLNSNVCG NILDLISPTLNYEIGHIASLPIIIDENKVEEINNIVLENIKICKDDWDDYETSWNFKKHPLLKFNENNLKNSFKSWESYK KEQFNQLKSNETKLNNIFSEIYDIDSNYNVEDKHVSINSSNYEMDIKSFVSYAIGCMFGRYSLDDDCLISTNSNFNIENY SRFIPDDDNIIPILDTEYFEDDMVGRFVEFVKICFGEETLEENLEFIANALIKNNKTSREKIREYLLKHFFNDHKKLYKK CPIYWQFSSGSNNAFNCLIYSHRIDSQIIARIRTEYLHKTQKAIEQRLLDCENLLNTSDSSSEKAIITKEKNKLIKQLEE TIGYDEALNHVSNLNLSFNLDDGIKENYSMLQDIIISREGMKNKKINLLKKI
Specific function: Unknown
COG id: COG1002
COG function: function code V; Type II restriction enzyme, methylase subunits
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 137055; Mature: 137055
Theoretical pI: Translated: 5.06; Mature: 5.06
Prosite motif: PS00092 N6_MTASE
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDKTAIKTFAINSRKKLMEDVEYKMSLVGIDKDNIYEPISSANGIETYQLGGSTNSIYDN CCCHHEEEEEECHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCC DISKRERLVKEVKQKGFENVVEEVAYTWFNRIIAIRFMEINNFLPTKTRVLSSETAGKIE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCCCCCC PDIITEAFDVDLDYTQEDKELIFKLKDENKLDELFRFLFIKQCNKLNEILPGLFEKTDDY HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH LELLLNISFTNEDGVVRQLIDTIPEKDFESQVEVIGWLYQFYNTELKDETFANLKKRIKI HHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH SKERIPAATQLFTPDWIVKYMVENSVGRLWLEGHPNNELKSKWKYYVDEAKQEPEVEQQL HHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH ITIRKESEILKPEDITVIDPCMGSGHILVYVFEVLMDIYVSEGFTEKDACESILKNNIYG HHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCEE LDIDKRAYQLAYFAVLMKARKYNRRILTKGISPLLCSIEETNSISKEFIEELISQDRTIE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEECCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHH DAFNYLISSFKNGKEFGSILTIKPIDFEKINNLISKFESNNNLTKLKYLDEINLLKNIIN HHHHHHHHHHCCCHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHC QSILLSKKYDVVVTNPPYMGNNGMNPNLKDYIKSKFPLTKTDLFAVFLEKGLEMIKDYGF HHHEEECCCCEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NCMVTMQSWMFLSSFEKFRKKLIETTTISNLLHMDNMVMKIAFGTSATVFRKINLMNYNS EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCEEEHEEEEEEECCC TFYHVKLSDVENDIVNPLFFNDKNKYIIKQFNFDKIPGSPIAYWIDDNLIACFNNTNLSS EEEEEEECCCCCHHCCCEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCEEEEECCCCCCC LGDIKVGLQTGENTRFLRYWWEVDFNNIGFSSINCEDSKNTNKKWFPYNKGGSFRKWWGN CCCEEEEEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCC QEFIINWENDGEELRNFKKSVLRNSQFYFHQSLSWSKISSGKIAFRYYPNGFLFDVAGCS CEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCHH VFVDDYLNYIFGFLNSNVCGNILDLISPTLNYEIGHIASLPIIIDENKVEEINNIVLENI HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHCCCCCCCEEECCEEECCCHHHHHHHHHHHHH KICKDDWDDYETSWNFKKHPLLKFNENNLKNSFKSWESYKKEQFNQLKSNETKLNNIFSE HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH IYDIDSNYNVEDKHVSINSSNYEMDIKSFVSYAIGCMFGRYSLDDDCLISTNSNFNIENY HHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHH SRFIPDDDNIIPILDTEYFEDDMVGRFVEFVKICFGEETLEENLEFIANALIKNNKTSRE HCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH KIREYLLKHFFNDHKKLYKKCPIYWQFSSGSNNAFNCLIYSHRIDSQIIARIRTEYLHKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH QKAIEQRLLDCENLLNTSDSSSEKAIITKEKNKLIKQLEETIGYDEALNHVSNLNLSFNL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEC DDGIKENYSMLQDIIISREGMKNKKINLLKKI CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MDKTAIKTFAINSRKKLMEDVEYKMSLVGIDKDNIYEPISSANGIETYQLGGSTNSIYDN CCCHHEEEEEECHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCC DISKRERLVKEVKQKGFENVVEEVAYTWFNRIIAIRFMEINNFLPTKTRVLSSETAGKIE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCCCCCC PDIITEAFDVDLDYTQEDKELIFKLKDENKLDELFRFLFIKQCNKLNEILPGLFEKTDDY HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH LELLLNISFTNEDGVVRQLIDTIPEKDFESQVEVIGWLYQFYNTELKDETFANLKKRIKI HHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH SKERIPAATQLFTPDWIVKYMVENSVGRLWLEGHPNNELKSKWKYYVDEAKQEPEVEQQL HHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH ITIRKESEILKPEDITVIDPCMGSGHILVYVFEVLMDIYVSEGFTEKDACESILKNNIYG HHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCEE LDIDKRAYQLAYFAVLMKARKYNRRILTKGISPLLCSIEETNSISKEFIEELISQDRTIE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEECCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHH DAFNYLISSFKNGKEFGSILTIKPIDFEKINNLISKFESNNNLTKLKYLDEINLLKNIIN HHHHHHHHHHCCCHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHC QSILLSKKYDVVVTNPPYMGNNGMNPNLKDYIKSKFPLTKTDLFAVFLEKGLEMIKDYGF HHHEEECCCCEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NCMVTMQSWMFLSSFEKFRKKLIETTTISNLLHMDNMVMKIAFGTSATVFRKINLMNYNS EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCEEEHEEEEEEECCC TFYHVKLSDVENDIVNPLFFNDKNKYIIKQFNFDKIPGSPIAYWIDDNLIACFNNTNLSS EEEEEEECCCCCHHCCCEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCEEEEECCCCCCC LGDIKVGLQTGENTRFLRYWWEVDFNNIGFSSINCEDSKNTNKKWFPYNKGGSFRKWWGN CCCEEEEEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCC QEFIINWENDGEELRNFKKSVLRNSQFYFHQSLSWSKISSGKIAFRYYPNGFLFDVAGCS CEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCHH VFVDDYLNYIFGFLNSNVCGNILDLISPTLNYEIGHIASLPIIIDENKVEEINNIVLENI HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHCCCCCCCEEECCEEECCCHHHHHHHHHHHHH KICKDDWDDYETSWNFKKHPLLKFNENNLKNSFKSWESYKKEQFNQLKSNETKLNNIFSE HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH IYDIDSNYNVEDKHVSINSSNYEMDIKSFVSYAIGCMFGRYSLDDDCLISTNSNFNIENY HHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHH SRFIPDDDNIIPILDTEYFEDDMVGRFVEFVKICFGEETLEENLEFIANALIKNNKTSRE HCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH KIREYLLKHFFNDHKKLYKKCPIYWQFSSGSNNAFNCLIYSHRIDSQIIARIRTEYLHKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH QKAIEQRLLDCENLLNTSDSSSEKAIITKEKNKLIKQLEETIGYDEALNHVSNLNLSFNL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEC DDGIKENYSMLQDIIISREGMKNKKINLLKKI CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
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General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA