| Definition | Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009515 |
| Length | 1,853,160 |
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The map label for this gene is 148643174
Identifier: 148643174
GI number: 148643174
Start: 1082110
End: 1087749
Strand: Reverse
Name: 148643174
Synonym: Msm_1114
Alternate gene names: NA
Gene position: 1087749-1082110 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148643176
Following gene: 148643173
Centisome position: 58.7
GC content: 29.24
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: adhesin-like protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1879; Mature: 1879
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_1879_residues MLILVMICCFILSLSAVSAIDDTDNSTIVLEQNDNVIINHESNNLDIGNQDIVLSPIIGGKTIEITQNNYDNYFYKFNGQ IKNESGIVAGDTLKIGNISDRGFVIDRQLTLMPLDNTSKISNGFIHLVKGSDGSTVSGLTINNTKGALSINGIYVGQLHG IWITKSNNNTIVNNTIRIANAAGVYAMPMGWSSYNRIIGNDMSTYITCVMVMGQCHYNIISKNKLETLDYNDLIVSNLIY FNPFGHADYGGSPLCLGNVISDNYLKAFCNGAMSIVLQLVYENHINTTIANNTIIRGSYGISLYSDNATVYNNTIIESSI SVSAMGKNISVTYNNVTGTSQGNGILVNGEKGYSAIVAHNNVTFTDIYCAIGLSNYTEAFNNTVNIKNYGVGISITDNCS YVHDNKIKVNHDNAITFIGCNNTISNNMVDTHAVGISVTSTSNVMRYYYNNILNNVIRSESYGISIKGLIYKTTISGNVI ETNASVGIYKEITDELADNNSDNMINGVIYDATALVINDDNFYKYFDERGYLNYTFEANKTKVIFFTFLSNKDVFITEKI NIISNKQSNLLFNVTISLSGDASGSLIRDFNFYNMNKEAIVLNGVDDVSLSNNNITLMLKDKSPANSAISVVDVCNGIIL KNNNIYINSKAAYAYGISMPAYNPIRLTYNKVMSSGFRISGNTIIMIGTGVTEAIYADVLTESEIMGNNINIISDGAAYG IASCNVIGSPHDLNISNNNIVIHSKDMAYLIELHKNYNVTFVNNYLYGNSNGVYGIGTYMSDNISIINNTFNIFGGNLSK ITEIHDILGIGQGAIGLIKFTNNTNITGNLIYANVTNPIFVENNTSIVELGVTYYVIDDNNCGIYFNDTINSKIIKNNDV LLLNNLTKGQTLSIDIPVNITYYKENVSSIVNLILNSGASSVNITNLTLINSTLTLNNVSKVYIKNNNLTNSSVIVVGGM GNYVINNSLSGGKSNVMIKLLDTSSNHIISNNMTFSNLENVVIIKNSKDNEIAYNNMSGIADKVVYSVDSGYTNFNHNNL TISGFSIFGYYAYNSAYDSIKYNDIIITGNSSVTNQSAVFFTGKSVSNTVAHNNIFSYSLKGDDYAVMIITNENLFNKVI NNYLISGNGSKRANAAVYALHDLVIDNTPFALYVAIGGSDTAGDGSKERPYASLAFALGKSLNHCVIYLLDGTFNDSNLV IDKNITILAINPGKVFIDANNSQLFTILTNGTLTINGLIVSNGHNVNGGSLFVNNGTLYINNSIICNSSAYFDNSNPDFI NKTVDDRGKEYWYTVDCKNTGLGGAILNYGNLVINLTELSGNYAHRGGAIADFGKTTILSSVIRDNKGVHGGAIYTDSSK SFTINNTVFYMNVAVLNLDHCMLERYSTGWSIDEGVRYEHRSVCEVPLGTGGAIFNKNTVLEVANSIFDHNNAYKGGAIG TISNYGEYSTYKPKASLNLTNCSFTNNVANSTIEGNNSNLNSYVYRNYGDGGAIYGTFDKFTLKDSIVRYNKAVVNGGAL SVQANDGRIDGCIITDNRAGSKGGALDISNNFLITNTIISNNSASYGGAISYGSYVYYGHTQNNLNIFNSTISNNLGLES GGAFYLGSANMVIHNSNIVNNKAPKAESFSVYDSSHLYVDARYNYWESNGKKGVPDDSPFNLGDKIVFKPLVRSIINWAP TVVPDKPNGNGTVTPGGNDKPASGPTVITKTNPIWHTGPQIGGQGKPGGNTGPGPSGPGGGIPGPGSNLGPGGGGQYGPN GGPAQGGNPTSNQGVNGSSNANSLSQIDGGNANENLLTVGLTANAASSASAGGSSSSDAGESSSSSSSSDDVKAYEIDEE DVTKQLDNPNTIFTFIGLIIILIICLFIGYKRRKDRENE >Mature_1879_residues MLILVMICCFILSLSAVSAIDDTDNSTIVLEQNDNVIINHESNNLDIGNQDIVLSPIIGGKTIEITQNNYDNYFYKFNGQ IKNESGIVAGDTLKIGNISDRGFVIDRQLTLMPLDNTSKISNGFIHLVKGSDGSTVSGLTINNTKGALSINGIYVGQLHG IWITKSNNNTIVNNTIRIANAAGVYAMPMGWSSYNRIIGNDMSTYITCVMVMGQCHYNIISKNKLETLDYNDLIVSNLIY FNPFGHADYGGSPLCLGNVISDNYLKAFCNGAMSIVLQLVYENHINTTIANNTIIRGSYGISLYSDNATVYNNTIIESSI SVSAMGKNISVTYNNVTGTSQGNGILVNGEKGYSAIVAHNNVTFTDIYCAIGLSNYTEAFNNTVNIKNYGVGISITDNCS YVHDNKIKVNHDNAITFIGCNNTISNNMVDTHAVGISVTSTSNVMRYYYNNILNNVIRSESYGISIKGLIYKTTISGNVI ETNASVGIYKEITDELADNNSDNMINGVIYDATALVINDDNFYKYFDERGYLNYTFEANKTKVIFFTFLSNKDVFITEKI NIISNKQSNLLFNVTISLSGDASGSLIRDFNFYNMNKEAIVLNGVDDVSLSNNNITLMLKDKSPANSAISVVDVCNGIIL KNNNIYINSKAAYAYGISMPAYNPIRLTYNKVMSSGFRISGNTIIMIGTGVTEAIYADVLTESEIMGNNINIISDGAAYG IASCNVIGSPHDLNISNNNIVIHSKDMAYLIELHKNYNVTFVNNYLYGNSNGVYGIGTYMSDNISIINNTFNIFGGNLSK ITEIHDILGIGQGAIGLIKFTNNTNITGNLIYANVTNPIFVENNTSIVELGVTYYVIDDNNCGIYFNDTINSKIIKNNDV LLLNNLTKGQTLSIDIPVNITYYKENVSSIVNLILNSGASSVNITNLTLINSTLTLNNVSKVYIKNNNLTNSSVIVVGGM GNYVINNSLSGGKSNVMIKLLDTSSNHIISNNMTFSNLENVVIIKNSKDNEIAYNNMSGIADKVVYSVDSGYTNFNHNNL TISGFSIFGYYAYNSAYDSIKYNDIIITGNSSVTNQSAVFFTGKSVSNTVAHNNIFSYSLKGDDYAVMIITNENLFNKVI NNYLISGNGSKRANAAVYALHDLVIDNTPFALYVAIGGSDTAGDGSKERPYASLAFALGKSLNHCVIYLLDGTFNDSNLV IDKNITILAINPGKVFIDANNSQLFTILTNGTLTINGLIVSNGHNVNGGSLFVNNGTLYINNSIICNSSAYFDNSNPDFI NKTVDDRGKEYWYTVDCKNTGLGGAILNYGNLVINLTELSGNYAHRGGAIADFGKTTILSSVIRDNKGVHGGAIYTDSSK SFTINNTVFYMNVAVLNLDHCMLERYSTGWSIDEGVRYEHRSVCEVPLGTGGAIFNKNTVLEVANSIFDHNNAYKGGAIG TISNYGEYSTYKPKASLNLTNCSFTNNVANSTIEGNNSNLNSYVYRNYGDGGAIYGTFDKFTLKDSIVRYNKAVVNGGAL SVQANDGRIDGCIITDNRAGSKGGALDISNNFLITNTIISNNSASYGGAISYGSYVYYGHTQNNLNIFNSTISNNLGLES GGAFYLGSANMVIHNSNIVNNKAPKAESFSVYDSSHLYVDARYNYWESNGKKGVPDDSPFNLGDKIVFKPLVRSIINWAP TVVPDKPNGNGTVTPGGNDKPASGPTVITKTNPIWHTGPQIGGQGKPGGNTGPGPSGPGGGIPGPGSNLGPGGGGQYGPN GGPAQGGNPTSNQGVNGSSNANSLSQIDGGNANENLLTVGLTANAASSASAGGSSSSDAGESSSSSSSSDDVKAYEIDEE DVTKQLDNPNTIFTFIGLIIILIICLFIGYKRRKDRENE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 202298; Mature: 202298
Theoretical pI: Translated: 5.29; Mature: 5.29
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLILVMICCFILSLSAVSAIDDTDNSTIVLEQNDNVIINHESNNLDIGNQDIVLSPIIGG CCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCC KTIEITQNNYDNYFYKFNGQIKNESGIVAGDTLKIGNISDRGFVIDRQLTLMPLDNTSKI EEEEEECCCCCCEEEEECCEEECCCCEEECCEEEECCCCCCCEEEECEEEEEECCCCCCC SNGFIHLVKGSDGSTVSGLTINNTKGALSINGIYVGQLHGIWITKSNNNTIVNNTIRIAN CCCEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCEEEECEEEEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEEEEEE AAGVYAMPMGWSSYNRIIGNDMSTYITCVMVMGQCHYNIISKNKLETLDYNDLIVSNLIY CCCEEEEECCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEECCCCHHEEEEEEE FNPFGHADYGGSPLCLGNVISDNYLKAFCNGAMSIVLQLVYENHINTTIANNTIIRGSYG ECCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCEEEEECCE ISLYSDNATVYNNTIIESSISVSAMGKNISVTYNNVTGTSQGNGILVNGEKGYSAIVAHN EEEEECCCEEEECEEEECCEEEEECCCEEEEEECCEECCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEC NVTFTDIYCAIGLSNYTEAFNNTVNIKNYGVGISITDNCSYVHDNKIKVNHDNAITFIGC CEEEEEEEEEECCCHHHHHHCCEEEEEEECEEEEEECCCCEEECCEEEEECCCEEEEEEC NNTISNNMVDTHAVGISVTSTSNVMRYYYNNILNNVIRSESYGISIKGLIYKTTISGNVI 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