Definition Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome, complete genome.
Accession NC_009515
Length 1,853,160

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The map label for this gene is 148642916

Identifier: 148642916

GI number: 148642916

Start: 812416

End: 814683

Strand: Reverse

Name: 148642916

Synonym: Msm_0856

Alternate gene names: NA

Gene position: 814683-812416 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148642917

Following gene: 148642915

Centisome position: 43.96

GC content: 32.8

Gene sequence:

>2268_bases
ATGTTGTCTAAAAAGATGATTAGGGATATTAAAAATCATAAATCTCAATTTCTTTCAATCTTTTTAATGGCTTTTTTAGG
AGTATTTGTATTTGCAGGAATCGGTGGGGAATACACTGGTTTTGAGCAAAGTGTAAATGATTATTATGATGCTACAAATT
TAGCGGATGGATGGATTTATAGCAGTCATCTGGATAATTCTACTGTAGATAAAGTTGATAATCTAAGTGCAACTACAGCC
AGTGAAAGACAGCTGGTTATTAATTCGGTAGGTGATTTTGATAATGACCCTGATGTGACGCTGCACTTTGTAGAAAATAA
TGATATTTCTAAATTTTATCTTGTTGAAGGAAAAGATGTTGATATTGATGATGAAGATGGTGTGTGGTTAGATAAACGTT
TTGCCGATGCTAAACATTTAAATGTTGGGGATAACATTTCATTTTCAGTTAATGGATTAACCATTAATAAAGAAATTAAA
GGTCTTGGTTATTCTCCTGAAAATGTTTATACTCCTTCAGATACTTCAATTATTACAGATTTCAATAAAACAGGTTATGC
TTACCTGTCTTATAAGGCATTTCCAGCACAAATACAGTATAATGTATTGCTTGTTGATTTTAATGGAAATCCGAATGATT
ATGTAGCTGATTTGGATTCAGTTATTGGTGGAAATTACAGTTCATTTGTAAAACAGGCAGATCATCAAAGTGTTTCTCAA
TTTAATGAGGAACTGGATCAGCATAAAATGATGGGTGATATTTTCCCGGTTGTTTTCATATTGATTGCTGTTTTAACTCT
GTTAACTACAATGGCAAGGATAATTAATCATCAGAGAACTCAGATTGGTGTTTTAAAAGCGGTAGGTTTTAAAGACAGAA
CTATAATGCTCCACTATATTTCGTACGGTTTCTGGCTAGTTTTGGCAGGAAGTATTTTGGGATTAATATTGGGGCCATTG
ACTATTCCAAAATTGTTTTTAGAATCAATGCAGGCTGTTTATACATTACCTGGATGGAGTGTTGGATACAGTATTAGTTT
TGTCATAGTTGCAGCATTAATGGTTGGTGTATCATTAATAGCTTCTTACTGGGCAACAAGAAGTATTTCTAAAGAAAATC
CTGCAAATTCAATCAGGCCAAAATCTCCTAAAGTTGCAGTTTCAGGATTGCTGGAAAAGTCAAAGATATGGAAAAAATTC
AGCTTTAATGCACGCTGGAATTATAGGGATGCAAAAAGAAATAGAACAAGGTCACTAATGACAATTGTAGGTGTTGCAGG
ATGTACTGCACTGCTTGTTTCAGCATTTGGAATGTATGACGGAATGAATGACTTGCGTGACTGGGAATATGAAGACATTA
ATCATTATTCCTCTAAATTAATTGTTGATAATGATGCATCAATTAGTCAAATCAACAGCATAACTGATGAGGTTAAAGGT
ACTCAATTAATGGAAGGCAGAATAGAATTTGATGTTAATGACCATAGGGATTCAGGTTCGCTGCTGGTTTTAAATAAAAG
CAGTTTGGTAACTCCAACAGATAAACATAGAAATCCGACAGAAATTCCTGATGACGGTGTTTCCATTTCCATGAAGATGG
CTGATAATTTGGGTGTTGAAAAAGGAGACACAATCAAATGGCATATTGTAGGAAATGACAAATGGGTATCTACCAAAGTA
AGCTCTATTCATGCAGACCCTATATCTCAGGGATTAATAATGACTCCTGATTATTTTGAAGATTTGGGATTGAATTATAC
TCCAACAAGTATTGTTACATCTCAGAATGTAACTTCAGATTATAATGGAATCAAAGCAGTAAATACTTTAGATACAGCTG
TTTCAAATTGGAATGAGATATCTGAATCAATGCTTTCAATGGTATCTATTTTAATATTCTTTGCAGCATTATTGGCTGTT
ATTGTCCTTTATAATTTGGGATTGTTGTCATTTACAGAAATTGAGCGGGAAATAGCTACCTTAAAAGTTATAGGATTTGA
AACAAATAATTTGAGAAAGTTATTATTGACGCAAAATTTATGGTTTACTTCAATGGGTTTTGTTTTGGGAATTCCATTCG
GTTATCTCTTAATGAAATCAATGACGGATTCTGCAGGACCTTCATTCCAATTTCCTATAACCTTAAGTCCTGGAAACTTA
ATGTTAAGTTTTATAATAACATTTTCATTATCCATAGTGGTTAACTTAATGTTTTCAGGAAAAATTAGAAAATTAAATAT
GGTTGAATCATTAAAAGGTGTTGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAGCTGCAGACAAGGTTATAAGAATTAAAAATGGTAAAATTGAAAGCATAACAATTAATGAAAACCCTAAAAAAGTAAC
TGATTTGGAATGGTGATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCTTTTACTTTTTTTTATTTTTGCAAAATTTATTTTAATTAATATTTATAATAATATATTATTATGAAGAGGACAGCTTT
AAAAATTGGCTATATCGGAA

Product: peptide ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: Permease; Peptide ABC Transporter Permease; ABC Transporter Permease; Efflux ABC Transporter Permease Protein; ABC Transporter; Permease Domain Protein; Antimicrobial Peptide ABC Transporter Permease; Permease Domain-Containing Protein; Efflux ABC Transporter Permease; ABC-Type Antimicrobial Peptide Transport System Protein; Large Transmembrane Protein Possibly Involved In Transport; ABC-Type Transport System Permease; ABC-Type Transport System

Number of amino acids: Translated: 755; Mature: 755

Protein sequence:

>755_residues
MLSKKMIRDIKNHKSQFLSIFLMAFLGVFVFAGIGGEYTGFEQSVNDYYDATNLADGWIYSSHLDNSTVDKVDNLSATTA
SERQLVINSVGDFDNDPDVTLHFVENNDISKFYLVEGKDVDIDDEDGVWLDKRFADAKHLNVGDNISFSVNGLTINKEIK
GLGYSPENVYTPSDTSIITDFNKTGYAYLSYKAFPAQIQYNVLLVDFNGNPNDYVADLDSVIGGNYSSFVKQADHQSVSQ
FNEELDQHKMMGDIFPVVFILIAVLTLLTTMARIINHQRTQIGVLKAVGFKDRTIMLHYISYGFWLVLAGSILGLILGPL
TIPKLFLESMQAVYTLPGWSVGYSISFVIVAALMVGVSLIASYWATRSISKENPANSIRPKSPKVAVSGLLEKSKIWKKF
SFNARWNYRDAKRNRTRSLMTIVGVAGCTALLVSAFGMYDGMNDLRDWEYEDINHYSSKLIVDNDASISQINSITDEVKG
TQLMEGRIEFDVNDHRDSGSLLVLNKSSLVTPTDKHRNPTEIPDDGVSISMKMADNLGVEKGDTIKWHIVGNDKWVSTKV
SSIHADPISQGLIMTPDYFEDLGLNYTPTSIVTSQNVTSDYNGIKAVNTLDTAVSNWNEISESMLSMVSILIFFAALLAV
IVLYNLGLLSFTEIEREIATLKVIGFETNNLRKLLLTQNLWFTSMGFVLGIPFGYLLMKSMTDSAGPSFQFPITLSPGNL
MLSFIITFSLSIVVNLMFSGKIRKLNMVESLKGVE

Sequences:

>Translated_755_residues
MLSKKMIRDIKNHKSQFLSIFLMAFLGVFVFAGIGGEYTGFEQSVNDYYDATNLADGWIYSSHLDNSTVDKVDNLSATTA
SERQLVINSVGDFDNDPDVTLHFVENNDISKFYLVEGKDVDIDDEDGVWLDKRFADAKHLNVGDNISFSVNGLTINKEIK
GLGYSPENVYTPSDTSIITDFNKTGYAYLSYKAFPAQIQYNVLLVDFNGNPNDYVADLDSVIGGNYSSFVKQADHQSVSQ
FNEELDQHKMMGDIFPVVFILIAVLTLLTTMARIINHQRTQIGVLKAVGFKDRTIMLHYISYGFWLVLAGSILGLILGPL
TIPKLFLESMQAVYTLPGWSVGYSISFVIVAALMVGVSLIASYWATRSISKENPANSIRPKSPKVAVSGLLEKSKIWKKF
SFNARWNYRDAKRNRTRSLMTIVGVAGCTALLVSAFGMYDGMNDLRDWEYEDINHYSSKLIVDNDASISQINSITDEVKG
TQLMEGRIEFDVNDHRDSGSLLVLNKSSLVTPTDKHRNPTEIPDDGVSISMKMADNLGVEKGDTIKWHIVGNDKWVSTKV
SSIHADPISQGLIMTPDYFEDLGLNYTPTSIVTSQNVTSDYNGIKAVNTLDTAVSNWNEISESMLSMVSILIFFAALLAV
IVLYNLGLLSFTEIEREIATLKVIGFETNNLRKLLLTQNLWFTSMGFVLGIPFGYLLMKSMTDSAGPSFQFPITLSPGNL
MLSFIITFSLSIVVNLMFSGKIRKLNMVESLKGVE
>Mature_755_residues
MLSKKMIRDIKNHKSQFLSIFLMAFLGVFVFAGIGGEYTGFEQSVNDYYDATNLADGWIYSSHLDNSTVDKVDNLSATTA
SERQLVINSVGDFDNDPDVTLHFVENNDISKFYLVEGKDVDIDDEDGVWLDKRFADAKHLNVGDNISFSVNGLTINKEIK
GLGYSPENVYTPSDTSIITDFNKTGYAYLSYKAFPAQIQYNVLLVDFNGNPNDYVADLDSVIGGNYSSFVKQADHQSVSQ
FNEELDQHKMMGDIFPVVFILIAVLTLLTTMARIINHQRTQIGVLKAVGFKDRTIMLHYISYGFWLVLAGSILGLILGPL
TIPKLFLESMQAVYTLPGWSVGYSISFVIVAALMVGVSLIASYWATRSISKENPANSIRPKSPKVAVSGLLEKSKIWKKF
SFNARWNYRDAKRNRTRSLMTIVGVAGCTALLVSAFGMYDGMNDLRDWEYEDINHYSSKLIVDNDASISQINSITDEVKG
TQLMEGRIEFDVNDHRDSGSLLVLNKSSLVTPTDKHRNPTEIPDDGVSISMKMADNLGVEKGDTIKWHIVGNDKWVSTKV
SSIHADPISQGLIMTPDYFEDLGLNYTPTSIVTSQNVTSDYNGIKAVNTLDTAVSNWNEISESMLSMVSILIFFAALLAV
IVLYNLGLLSFTEIEREIATLKVIGFETNNLRKLLLTQNLWFTSMGFVLGIPFGYLLMKSMTDSAGPSFQFPITLSPGNL
MLSFIITFSLSIVVNLMFSGKIRKLNMVESLKGVE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83969; Mature: 83969

Theoretical pI: Translated: 4.99; Mature: 4.99

Prosite motif: PS00589 PTS_HPR_SER

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLSKKMIRDIKNHKSQFLSIFLMAFLGVFVFAGIGGEYTGFEQSVNDYYDATNLADGWIY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEE
SSHLDNSTVDKVDNLSATTASERQLVINSVGDFDNDPDVTLHFVENNDISKFYLVEGKDV
ECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCC
DIDDEDGVWLDKRFADAKHLNVGDNISFSVNGLTINKEIKGLGYSPENVYTPSDTSIITD
CCCCCCCCEEEHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEE
FNKTGYAYLSYKAFPAQIQYNVLLVDFNGNPNDYVADLDSVIGGNYSSFVKQADHQSVSQ
CCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
FNEELDQHKMMGDIFPVVFILIAVLTLLTTMARIINHQRTQIGVLKAVGFKDRTIMLHYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHH
SYGFWLVLAGSILGLILGPLTIPKLFLESMQAVYTLPGWSVGYSISFVIVAALMVGVSLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASYWATRSISKENPANSIRPKSPKVAVSGLLEKSKIWKKFSFNARWNYRDAKRNRTRSLM
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
TIVGVAGCTALLVSAFGMYDGMNDLRDWEYEDINHYSSKLIVDNDASISQINSITDEVKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC
TQLMEGRIEFDVNDHRDSGSLLVLNKSSLVTPTDKHRNPTEIPDDGVSISMKMADNLGVE
CEEECCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCC
KGDTIKWHIVGNDKWVSTKVSSIHADPISQGLIMTPDYFEDLGLNYTPTSIVTSQNVTSD
CCCEEEEEEECCCCEEEEEHHHEECCHHCCCEEECCCHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCC
YNGIKAVNTLDTAVSNWNEISESMLSMVSILIFFAALLAVIVLYNLGLLSFTEIEREIAT
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHE
LKVIGFETNNLRKLLLTQNLWFTSMGFVLGIPFGYLLMKSMTDSAGPSFQFPITLSPGNL
EEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHH
MLSFIITFSLSIVVNLMFSGKIRKLNMVESLKGVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MLSKKMIRDIKNHKSQFLSIFLMAFLGVFVFAGIGGEYTGFEQSVNDYYDATNLADGWIY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEE
SSHLDNSTVDKVDNLSATTASERQLVINSVGDFDNDPDVTLHFVENNDISKFYLVEGKDV
ECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCC
DIDDEDGVWLDKRFADAKHLNVGDNISFSVNGLTINKEIKGLGYSPENVYTPSDTSIITD
CCCCCCCCEEEHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEE
FNKTGYAYLSYKAFPAQIQYNVLLVDFNGNPNDYVADLDSVIGGNYSSFVKQADHQSVSQ
CCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
FNEELDQHKMMGDIFPVVFILIAVLTLLTTMARIINHQRTQIGVLKAVGFKDRTIMLHYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHH
SYGFWLVLAGSILGLILGPLTIPKLFLESMQAVYTLPGWSVGYSISFVIVAALMVGVSLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASYWATRSISKENPANSIRPKSPKVAVSGLLEKSKIWKKFSFNARWNYRDAKRNRTRSLM
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
TIVGVAGCTALLVSAFGMYDGMNDLRDWEYEDINHYSSKLIVDNDASISQINSITDEVKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC
TQLMEGRIEFDVNDHRDSGSLLVLNKSSLVTPTDKHRNPTEIPDDGVSISMKMADNLGVE
CEEECCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCC
KGDTIKWHIVGNDKWVSTKVSSIHADPISQGLIMTPDYFEDLGLNYTPTSIVTSQNVTSD
CCCEEEEEEECCCCEEEEEHHHEECCHHCCCEEECCCHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCC
YNGIKAVNTLDTAVSNWNEISESMLSMVSILIFFAALLAVIVLYNLGLLSFTEIEREIAT
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHE
LKVIGFETNNLRKLLLTQNLWFTSMGFVLGIPFGYLLMKSMTDSAGPSFQFPITLSPGNL
EEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHH
MLSFIITFSLSIVVNLMFSGKIRKLNMVESLKGVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA