| Definition | Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009515 |
| Length | 1,853,160 |
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The map label for this gene is 148642916
Identifier: 148642916
GI number: 148642916
Start: 812416
End: 814683
Strand: Reverse
Name: 148642916
Synonym: Msm_0856
Alternate gene names: NA
Gene position: 814683-812416 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148642917
Following gene: 148642915
Centisome position: 43.96
GC content: 32.8
Gene sequence:
>2268_bases ATGTTGTCTAAAAAGATGATTAGGGATATTAAAAATCATAAATCTCAATTTCTTTCAATCTTTTTAATGGCTTTTTTAGG AGTATTTGTATTTGCAGGAATCGGTGGGGAATACACTGGTTTTGAGCAAAGTGTAAATGATTATTATGATGCTACAAATT TAGCGGATGGATGGATTTATAGCAGTCATCTGGATAATTCTACTGTAGATAAAGTTGATAATCTAAGTGCAACTACAGCC AGTGAAAGACAGCTGGTTATTAATTCGGTAGGTGATTTTGATAATGACCCTGATGTGACGCTGCACTTTGTAGAAAATAA TGATATTTCTAAATTTTATCTTGTTGAAGGAAAAGATGTTGATATTGATGATGAAGATGGTGTGTGGTTAGATAAACGTT TTGCCGATGCTAAACATTTAAATGTTGGGGATAACATTTCATTTTCAGTTAATGGATTAACCATTAATAAAGAAATTAAA GGTCTTGGTTATTCTCCTGAAAATGTTTATACTCCTTCAGATACTTCAATTATTACAGATTTCAATAAAACAGGTTATGC TTACCTGTCTTATAAGGCATTTCCAGCACAAATACAGTATAATGTATTGCTTGTTGATTTTAATGGAAATCCGAATGATT ATGTAGCTGATTTGGATTCAGTTATTGGTGGAAATTACAGTTCATTTGTAAAACAGGCAGATCATCAAAGTGTTTCTCAA TTTAATGAGGAACTGGATCAGCATAAAATGATGGGTGATATTTTCCCGGTTGTTTTCATATTGATTGCTGTTTTAACTCT GTTAACTACAATGGCAAGGATAATTAATCATCAGAGAACTCAGATTGGTGTTTTAAAAGCGGTAGGTTTTAAAGACAGAA CTATAATGCTCCACTATATTTCGTACGGTTTCTGGCTAGTTTTGGCAGGAAGTATTTTGGGATTAATATTGGGGCCATTG ACTATTCCAAAATTGTTTTTAGAATCAATGCAGGCTGTTTATACATTACCTGGATGGAGTGTTGGATACAGTATTAGTTT TGTCATAGTTGCAGCATTAATGGTTGGTGTATCATTAATAGCTTCTTACTGGGCAACAAGAAGTATTTCTAAAGAAAATC CTGCAAATTCAATCAGGCCAAAATCTCCTAAAGTTGCAGTTTCAGGATTGCTGGAAAAGTCAAAGATATGGAAAAAATTC AGCTTTAATGCACGCTGGAATTATAGGGATGCAAAAAGAAATAGAACAAGGTCACTAATGACAATTGTAGGTGTTGCAGG ATGTACTGCACTGCTTGTTTCAGCATTTGGAATGTATGACGGAATGAATGACTTGCGTGACTGGGAATATGAAGACATTA ATCATTATTCCTCTAAATTAATTGTTGATAATGATGCATCAATTAGTCAAATCAACAGCATAACTGATGAGGTTAAAGGT ACTCAATTAATGGAAGGCAGAATAGAATTTGATGTTAATGACCATAGGGATTCAGGTTCGCTGCTGGTTTTAAATAAAAG CAGTTTGGTAACTCCAACAGATAAACATAGAAATCCGACAGAAATTCCTGATGACGGTGTTTCCATTTCCATGAAGATGG CTGATAATTTGGGTGTTGAAAAAGGAGACACAATCAAATGGCATATTGTAGGAAATGACAAATGGGTATCTACCAAAGTA AGCTCTATTCATGCAGACCCTATATCTCAGGGATTAATAATGACTCCTGATTATTTTGAAGATTTGGGATTGAATTATAC TCCAACAAGTATTGTTACATCTCAGAATGTAACTTCAGATTATAATGGAATCAAAGCAGTAAATACTTTAGATACAGCTG TTTCAAATTGGAATGAGATATCTGAATCAATGCTTTCAATGGTATCTATTTTAATATTCTTTGCAGCATTATTGGCTGTT ATTGTCCTTTATAATTTGGGATTGTTGTCATTTACAGAAATTGAGCGGGAAATAGCTACCTTAAAAGTTATAGGATTTGA AACAAATAATTTGAGAAAGTTATTATTGACGCAAAATTTATGGTTTACTTCAATGGGTTTTGTTTTGGGAATTCCATTCG GTTATCTCTTAATGAAATCAATGACGGATTCTGCAGGACCTTCATTCCAATTTCCTATAACCTTAAGTCCTGGAAACTTA ATGTTAAGTTTTATAATAACATTTTCATTATCCATAGTGGTTAACTTAATGTTTTCAGGAAAAATTAGAAAATTAAATAT GGTTGAATCATTAAAAGGTGTTGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GAAGCTGCAGACAAGGTTATAAGAATTAAAAATGGTAAAATTGAAAGCATAACAATTAATGAAAACCCTAAAAAAGTAAC TGATTTGGAATGGTGATTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases CCTTTTACTTTTTTTTATTTTTGCAAAATTTATTTTAATTAATATTTATAATAATATATTATTATGAAGAGGACAGCTTT AAAAATTGGCTATATCGGAA
Product: peptide ABC transporter permease
Products: NA
Alternate protein names: Permease; Peptide ABC Transporter Permease; ABC Transporter Permease; Efflux ABC Transporter Permease Protein; ABC Transporter; Permease Domain Protein; Antimicrobial Peptide ABC Transporter Permease; Permease Domain-Containing Protein; Efflux ABC Transporter Permease; ABC-Type Antimicrobial Peptide Transport System Protein; Large Transmembrane Protein Possibly Involved In Transport; ABC-Type Transport System Permease; ABC-Type Transport System
Number of amino acids: Translated: 755; Mature: 755
Protein sequence:
>755_residues MLSKKMIRDIKNHKSQFLSIFLMAFLGVFVFAGIGGEYTGFEQSVNDYYDATNLADGWIYSSHLDNSTVDKVDNLSATTA SERQLVINSVGDFDNDPDVTLHFVENNDISKFYLVEGKDVDIDDEDGVWLDKRFADAKHLNVGDNISFSVNGLTINKEIK GLGYSPENVYTPSDTSIITDFNKTGYAYLSYKAFPAQIQYNVLLVDFNGNPNDYVADLDSVIGGNYSSFVKQADHQSVSQ FNEELDQHKMMGDIFPVVFILIAVLTLLTTMARIINHQRTQIGVLKAVGFKDRTIMLHYISYGFWLVLAGSILGLILGPL TIPKLFLESMQAVYTLPGWSVGYSISFVIVAALMVGVSLIASYWATRSISKENPANSIRPKSPKVAVSGLLEKSKIWKKF SFNARWNYRDAKRNRTRSLMTIVGVAGCTALLVSAFGMYDGMNDLRDWEYEDINHYSSKLIVDNDASISQINSITDEVKG TQLMEGRIEFDVNDHRDSGSLLVLNKSSLVTPTDKHRNPTEIPDDGVSISMKMADNLGVEKGDTIKWHIVGNDKWVSTKV SSIHADPISQGLIMTPDYFEDLGLNYTPTSIVTSQNVTSDYNGIKAVNTLDTAVSNWNEISESMLSMVSILIFFAALLAV IVLYNLGLLSFTEIEREIATLKVIGFETNNLRKLLLTQNLWFTSMGFVLGIPFGYLLMKSMTDSAGPSFQFPITLSPGNL MLSFIITFSLSIVVNLMFSGKIRKLNMVESLKGVE
Sequences:
>Translated_755_residues MLSKKMIRDIKNHKSQFLSIFLMAFLGVFVFAGIGGEYTGFEQSVNDYYDATNLADGWIYSSHLDNSTVDKVDNLSATTA SERQLVINSVGDFDNDPDVTLHFVENNDISKFYLVEGKDVDIDDEDGVWLDKRFADAKHLNVGDNISFSVNGLTINKEIK GLGYSPENVYTPSDTSIITDFNKTGYAYLSYKAFPAQIQYNVLLVDFNGNPNDYVADLDSVIGGNYSSFVKQADHQSVSQ FNEELDQHKMMGDIFPVVFILIAVLTLLTTMARIINHQRTQIGVLKAVGFKDRTIMLHYISYGFWLVLAGSILGLILGPL TIPKLFLESMQAVYTLPGWSVGYSISFVIVAALMVGVSLIASYWATRSISKENPANSIRPKSPKVAVSGLLEKSKIWKKF SFNARWNYRDAKRNRTRSLMTIVGVAGCTALLVSAFGMYDGMNDLRDWEYEDINHYSSKLIVDNDASISQINSITDEVKG TQLMEGRIEFDVNDHRDSGSLLVLNKSSLVTPTDKHRNPTEIPDDGVSISMKMADNLGVEKGDTIKWHIVGNDKWVSTKV SSIHADPISQGLIMTPDYFEDLGLNYTPTSIVTSQNVTSDYNGIKAVNTLDTAVSNWNEISESMLSMVSILIFFAALLAV IVLYNLGLLSFTEIEREIATLKVIGFETNNLRKLLLTQNLWFTSMGFVLGIPFGYLLMKSMTDSAGPSFQFPITLSPGNL MLSFIITFSLSIVVNLMFSGKIRKLNMVESLKGVE >Mature_755_residues MLSKKMIRDIKNHKSQFLSIFLMAFLGVFVFAGIGGEYTGFEQSVNDYYDATNLADGWIYSSHLDNSTVDKVDNLSATTA SERQLVINSVGDFDNDPDVTLHFVENNDISKFYLVEGKDVDIDDEDGVWLDKRFADAKHLNVGDNISFSVNGLTINKEIK GLGYSPENVYTPSDTSIITDFNKTGYAYLSYKAFPAQIQYNVLLVDFNGNPNDYVADLDSVIGGNYSSFVKQADHQSVSQ FNEELDQHKMMGDIFPVVFILIAVLTLLTTMARIINHQRTQIGVLKAVGFKDRTIMLHYISYGFWLVLAGSILGLILGPL TIPKLFLESMQAVYTLPGWSVGYSISFVIVAALMVGVSLIASYWATRSISKENPANSIRPKSPKVAVSGLLEKSKIWKKF SFNARWNYRDAKRNRTRSLMTIVGVAGCTALLVSAFGMYDGMNDLRDWEYEDINHYSSKLIVDNDASISQINSITDEVKG TQLMEGRIEFDVNDHRDSGSLLVLNKSSLVTPTDKHRNPTEIPDDGVSISMKMADNLGVEKGDTIKWHIVGNDKWVSTKV SSIHADPISQGLIMTPDYFEDLGLNYTPTSIVTSQNVTSDYNGIKAVNTLDTAVSNWNEISESMLSMVSILIFFAALLAV IVLYNLGLLSFTEIEREIATLKVIGFETNNLRKLLLTQNLWFTSMGFVLGIPFGYLLMKSMTDSAGPSFQFPITLSPGNL MLSFIITFSLSIVVNLMFSGKIRKLNMVESLKGVE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 83969; Mature: 83969
Theoretical pI: Translated: 4.99; Mature: 4.99
Prosite motif: PS00589 PTS_HPR_SER
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLSKKMIRDIKNHKSQFLSIFLMAFLGVFVFAGIGGEYTGFEQSVNDYYDATNLADGWIY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEE SSHLDNSTVDKVDNLSATTASERQLVINSVGDFDNDPDVTLHFVENNDISKFYLVEGKDV ECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCC DIDDEDGVWLDKRFADAKHLNVGDNISFSVNGLTINKEIKGLGYSPENVYTPSDTSIITD CCCCCCCCEEEHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEE FNKTGYAYLSYKAFPAQIQYNVLLVDFNGNPNDYVADLDSVIGGNYSSFVKQADHQSVSQ CCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH FNEELDQHKMMGDIFPVVFILIAVLTLLTTMARIINHQRTQIGVLKAVGFKDRTIMLHYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHH SYGFWLVLAGSILGLILGPLTIPKLFLESMQAVYTLPGWSVGYSISFVIVAALMVGVSLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASYWATRSISKENPANSIRPKSPKVAVSGLLEKSKIWKKFSFNARWNYRDAKRNRTRSLM HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH TIVGVAGCTALLVSAFGMYDGMNDLRDWEYEDINHYSSKLIVDNDASISQINSITDEVKG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC TQLMEGRIEFDVNDHRDSGSLLVLNKSSLVTPTDKHRNPTEIPDDGVSISMKMADNLGVE CEEECCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCC KGDTIKWHIVGNDKWVSTKVSSIHADPISQGLIMTPDYFEDLGLNYTPTSIVTSQNVTSD CCCEEEEEEECCCCEEEEEHHHEECCHHCCCEEECCCHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCC YNGIKAVNTLDTAVSNWNEISESMLSMVSILIFFAALLAVIVLYNLGLLSFTEIEREIAT CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHE LKVIGFETNNLRKLLLTQNLWFTSMGFVLGIPFGYLLMKSMTDSAGPSFQFPITLSPGNL EEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHH MLSFIITFSLSIVVNLMFSGKIRKLNMVESLKGVE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MLSKKMIRDIKNHKSQFLSIFLMAFLGVFVFAGIGGEYTGFEQSVNDYYDATNLADGWIY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEE SSHLDNSTVDKVDNLSATTASERQLVINSVGDFDNDPDVTLHFVENNDISKFYLVEGKDV ECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCC DIDDEDGVWLDKRFADAKHLNVGDNISFSVNGLTINKEIKGLGYSPENVYTPSDTSIITD CCCCCCCCEEEHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEE FNKTGYAYLSYKAFPAQIQYNVLLVDFNGNPNDYVADLDSVIGGNYSSFVKQADHQSVSQ CCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH FNEELDQHKMMGDIFPVVFILIAVLTLLTTMARIINHQRTQIGVLKAVGFKDRTIMLHYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHH SYGFWLVLAGSILGLILGPLTIPKLFLESMQAVYTLPGWSVGYSISFVIVAALMVGVSLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASYWATRSISKENPANSIRPKSPKVAVSGLLEKSKIWKKFSFNARWNYRDAKRNRTRSLM HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH TIVGVAGCTALLVSAFGMYDGMNDLRDWEYEDINHYSSKLIVDNDASISQINSITDEVKG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC TQLMEGRIEFDVNDHRDSGSLLVLNKSSLVTPTDKHRNPTEIPDDGVSISMKMADNLGVE CEEECCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCC KGDTIKWHIVGNDKWVSTKVSSIHADPISQGLIMTPDYFEDLGLNYTPTSIVTSQNVTSD CCCEEEEEEECCCCEEEEEHHHEECCHHCCCEEECCCHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCC YNGIKAVNTLDTAVSNWNEISESMLSMVSILIFFAALLAVIVLYNLGLLSFTEIEREIAT CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHE LKVIGFETNNLRKLLLTQNLWFTSMGFVLGIPFGYLLMKSMTDSAGPSFQFPITLSPGNL EEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHH MLSFIITFSLSIVVNLMFSGKIRKLNMVESLKGVE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA