| Definition | Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009515 |
| Length | 1,853,160 |
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The map label for this gene is feoB [C]
Identifier: 148642649
GI number: 148642649
Start: 561509
End: 563524
Strand: Reverse
Name: feoB [C]
Synonym: Msm_0589
Alternate gene names: 148642649
Gene position: 563524-561509 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148642650
Following gene: 148642648
Centisome position: 30.41
GC content: 34.77
Gene sequence:
>2016_bases ATGAAAGAATGTATTGTAGGATTAGCAGGAAACCCTAATGTGGGTAAAACTACAGTATTCAATCAATTAACAGGTATGCA TCAGCATGTAGGTAATTGGCCAGGTAAAACTGTTGAAAGAGCAGAAGGCCATTTTGATCATGATGATACTCGCTTTGATG TTGTTGATTTGCCTGGTAATTATGCATTAAGTGCTCATTCTATTGAAGAAATCGTTTCAAGAGATTTCATTGTAGATGAT GATTCTGATGTGATTGTTAATGTAGTAGATGCTGCTAATTTAGAACGTAATTTGTATCTGACTGTTCAAATGATGGAATT AGGTGCAAACTTAGTAATGGCTCTTAATATGAATGATTTTGCAAAGAAAAAAGAACATATTATTGATATTAAATTAATGG CTGAATTATTAGGTTTTCCGGTTGTTGAAATTAATGCTAAAAATAAGGACGGGTTTGATGAATTATTATCTACAGTTAAA AAAGTAGCTAATAAACATATTGATACTACTCAAAAATTGGTTTACGGTCCTGAATTAAGAGAACATTTGGGGGATCTTCA GGCATTAATTGAAAAGGACGTTAATTTAACTGATGTTCCAGCAATGTGGACAGCAATAAAATTATTGGAAAAGGATGCTA TTGTAATAGAAAAAGTTCAAAAATCCAAATATTCTTCTCAAATATTAAGGGAAACTGATAAAGTAGCTGCACATTTAGCA GATATTTATAATGAAGGTGCAGAAGAAGTAATAGCTAATGCAAGGTATGCATTTATTGATGGACTTATGAATGAAGCAGT AAGTAAACCTGCTGTGGAAAAACCAACAGTATCTGATAAAATTGATAAATATTTGACTAACAGAATTTTAGGAATTCCTA TATTTTTAGTTATCATGTATATTATGTTCCAGCTTACCTTTACAATTGGAGCACCTTTCCAGGATCTGATTGATGAAGGT TTTGGTTTGTTAGGTGAAGCTATTGGTGGTCTGTTAGGTGATTCAGTACTTTCATCTTTTATTGTTGACGGTATTATTGG AGGAGTAGGTGGAGTATTGACCTTTTTACCGATTATTATAATCATGTTTTTATTCATAAGTATCCTGGAAGACAGCGGTT ACTTGGCTAGAGCTGCTTTTGTTATGGATAAAGTTATGCATAAGTTAGTTGGTCTTCATGGTAAATCATTTATTCCAATG ATTTTGGGATTCGGTTGTGGTGTGCCTGCTATTATGGCTACCAGAACAATGGAAAACGAATCTGACCGTTTGCTTTCAAT GATGCTTGTTCCGTTTATGTCATGTACTGCAAGATTGCCTGTATATGCATTGTTGATTTCAGCATTTTTCGCTGCAAATC AGGGCGAAGTATTATTTTCAATTTATTTGTTAGGAATTGTTGTTGCACTTGTTGTTGCAGCTATTCTTAAAAGAACTATG TTTAAAGGAATGTCTTCCCCATTTGTTATGGAGCTTCCGACATATAAAGTTCCATCATTAAAAGGTGTATTATTACATAC TTGGGATAAAACTAAAGGATTCCTTAGAAAAGCAGGAACTATTATTCTTGTAGCATCTATCATTGTATGGGTTTTAAGTA GTGTGCCATTTGGTGTTGAATACGGATCTCAGGAAAGTGCAATTGGTCAAATAGGTACTGCAATAGCACCAATTTTCGCT CCTCTCGGTTTCGGAGAATGGCAACCTGCAGTAGCAATATTATTTGGTTTAGTTGCTAAGGAGGTTGTTGTATCTACATT CAGTTCACTGTTCGGTGTAGAAGAAGAGGGTTCGGGTATTGAAGCTGCTGTTCATGATTTATTCACTCCACTTTCAGCAT ATGCATTTATGGCATTTGTGCTGCTGTATGTTCCTTGTTTCGCAGCTATCGGTACAATCAAACAGGAAACCAACAGTTGG AAATGGCCGTTAACTATGTCTGTTATCACATTAGCAACCGGTTATATTGTAGCTCTTATAATATATCAAGGCGGTTCGTT ACTGGGTTTTGCTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TCATAAATTTTTAAACTTTAATTTAGGCACGCCTAAATTCAAATTTTTATTTAATTAATATAAATAAAAATTCTTTCTAA AGAAAATAGGAGAATGGTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases GTGATGATTTTGCGTAGTAAAAGTGGTATTAGGGGCATTAAGATCCCTAAAAATAAAAAAGTGGAAGGAAAATCTCCTTC CAAATAATTTTTTTATATTA
Product: ferrous iron transport protein B, FeoB
Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 671; Mature: 671
Protein sequence:
>671_residues MKECIVGLAGNPNVGKTTVFNQLTGMHQHVGNWPGKTVERAEGHFDHDDTRFDVVDLPGNYALSAHSIEEIVSRDFIVDD DSDVIVNVVDAANLERNLYLTVQMMELGANLVMALNMNDFAKKKEHIIDIKLMAELLGFPVVEINAKNKDGFDELLSTVK KVANKHIDTTQKLVYGPELREHLGDLQALIEKDVNLTDVPAMWTAIKLLEKDAIVIEKVQKSKYSSQILRETDKVAAHLA DIYNEGAEEVIANARYAFIDGLMNEAVSKPAVEKPTVSDKIDKYLTNRILGIPIFLVIMYIMFQLTFTIGAPFQDLIDEG FGLLGEAIGGLLGDSVLSSFIVDGIIGGVGGVLTFLPIIIIMFLFISILEDSGYLARAAFVMDKVMHKLVGLHGKSFIPM ILGFGCGVPAIMATRTMENESDRLLSMMLVPFMSCTARLPVYALLISAFFAANQGEVLFSIYLLGIVVALVVAAILKRTM FKGMSSPFVMELPTYKVPSLKGVLLHTWDKTKGFLRKAGTIILVASIIVWVLSSVPFGVEYGSQESAIGQIGTAIAPIFA PLGFGEWQPAVAILFGLVAKEVVVSTFSSLFGVEEEGSGIEAAVHDLFTPLSAYAFMAFVLLYVPCFAAIGTIKQETNSW KWPLTMSVITLATGYIVALIIYQGGSLLGFA
Sequences:
>Translated_671_residues MKECIVGLAGNPNVGKTTVFNQLTGMHQHVGNWPGKTVERAEGHFDHDDTRFDVVDLPGNYALSAHSIEEIVSRDFIVDD DSDVIVNVVDAANLERNLYLTVQMMELGANLVMALNMNDFAKKKEHIIDIKLMAELLGFPVVEINAKNKDGFDELLSTVK KVANKHIDTTQKLVYGPELREHLGDLQALIEKDVNLTDVPAMWTAIKLLEKDAIVIEKVQKSKYSSQILRETDKVAAHLA DIYNEGAEEVIANARYAFIDGLMNEAVSKPAVEKPTVSDKIDKYLTNRILGIPIFLVIMYIMFQLTFTIGAPFQDLIDEG FGLLGEAIGGLLGDSVLSSFIVDGIIGGVGGVLTFLPIIIIMFLFISILEDSGYLARAAFVMDKVMHKLVGLHGKSFIPM ILGFGCGVPAIMATRTMENESDRLLSMMLVPFMSCTARLPVYALLISAFFAANQGEVLFSIYLLGIVVALVVAAILKRTM FKGMSSPFVMELPTYKVPSLKGVLLHTWDKTKGFLRKAGTIILVASIIVWVLSSVPFGVEYGSQESAIGQIGTAIAPIFA PLGFGEWQPAVAILFGLVAKEVVVSTFSSLFGVEEEGSGIEAAVHDLFTPLSAYAFMAFVLLYVPCFAAIGTIKQETNSW KWPLTMSVITLATGYIVALIIYQGGSLLGFA >Mature_671_residues MKECIVGLAGNPNVGKTTVFNQLTGMHQHVGNWPGKTVERAEGHFDHDDTRFDVVDLPGNYALSAHSIEEIVSRDFIVDD DSDVIVNVVDAANLERNLYLTVQMMELGANLVMALNMNDFAKKKEHIIDIKLMAELLGFPVVEINAKNKDGFDELLSTVK KVANKHIDTTQKLVYGPELREHLGDLQALIEKDVNLTDVPAMWTAIKLLEKDAIVIEKVQKSKYSSQILRETDKVAAHLA DIYNEGAEEVIANARYAFIDGLMNEAVSKPAVEKPTVSDKIDKYLTNRILGIPIFLVIMYIMFQLTFTIGAPFQDLIDEG FGLLGEAIGGLLGDSVLSSFIVDGIIGGVGGVLTFLPIIIIMFLFISILEDSGYLARAAFVMDKVMHKLVGLHGKSFIPM ILGFGCGVPAIMATRTMENESDRLLSMMLVPFMSCTARLPVYALLISAFFAANQGEVLFSIYLLGIVVALVVAAILKRTM FKGMSSPFVMELPTYKVPSLKGVLLHTWDKTKGFLRKAGTIILVASIIVWVLSSVPFGVEYGSQESAIGQIGTAIAPIFA PLGFGEWQPAVAILFGLVAKEVVVSTFSSLFGVEEEGSGIEAAVHDLFTPLSAYAFMAFVLLYVPCFAAIGTIKQETNSW KWPLTMSVITLATGYIVALIIYQGGSLLGFA
Specific function: Probable GTP-driven transporter of Fe(2+) ion [H]
COG id: COG0370
COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=730, Percent_Identity=36.8493150684931, Blast_Score=422, Evalue=1e-119,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003373 - InterPro: IPR011640 - InterPro: IPR011619 - InterPro: IPR011642 - InterPro: IPR006073 - InterPro: IPR002917 - InterPro: IPR005225 [H]
Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 73171; Mature: 73171
Theoretical pI: Translated: 4.90; Mature: 4.90
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 3.7 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 3.7 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKECIVGLAGNPNVGKTTVFNQLTGMHQHVGNWPGKTVERAEGHFDHDDTRFDVVDLPGN CCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCC YALSAHSIEEIVSRDFIVDDDSDVIVNVVDAANLERNLYLTVQMMELGANLVMALNMNDF CEECHHHHHHHHHCCCEECCCCCCEEEEHHHHCCCCCEEEEEEHHHHCCCEEEEECCHHH AKKKEHIIDIKLMAELLGFPVVEINAKNKDGFDELLSTVKKVANKHIDTTQKLVYGPELR HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHH EHLGDLQALIEKDVNLTDVPAMWTAIKLLEKDAIVIEKVQKSKYSSQILRETDKVAAHLA HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DIYNEGAEEVIANARYAFIDGLMNEAVSKPAVEKPTVSDKIDKYLTNRILGIPIFLVIMY HHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMFQLTFTIGAPFQDLIDEGFGLLGEAIGGLLGDSVLSSFIVDGIIGGVGGVLTFLPIII HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMFLFISILEDSGYLARAAFVMDKVMHKLVGLHGKSFIPMILGFGCGVPAIMATRTMENE HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCH SDRLLSMMLVPFMSCTARLPVYALLISAFFAANQGEVLFSIYLLGIVVALVVAAILKRTM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKGMSSPFVMELPTYKVPSLKGVLLHTWDKTKGFLRKAGTIILVASIIVWVLSSVPFGVE HHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC YGSQESAIGQIGTAIAPIFAPLGFGEWQPAVAILFGLVAKEVVVSTFSSLFGVEEEGSGI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH EAAVHDLFTPLSAYAFMAFVLLYVPCFAAIGTIKQETNSWKWPLTMSVITLATGYIVALI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH IYQGGSLLGFA HHCCCCEECCC >Mature Secondary Structure MKECIVGLAGNPNVGKTTVFNQLTGMHQHVGNWPGKTVERAEGHFDHDDTRFDVVDLPGN CCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCC YALSAHSIEEIVSRDFIVDDDSDVIVNVVDAANLERNLYLTVQMMELGANLVMALNMNDF CEECHHHHHHHHHCCCEECCCCCCEEEEHHHHCCCCCEEEEEEHHHHCCCEEEEECCHHH AKKKEHIIDIKLMAELLGFPVVEINAKNKDGFDELLSTVKKVANKHIDTTQKLVYGPELR HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHH EHLGDLQALIEKDVNLTDVPAMWTAIKLLEKDAIVIEKVQKSKYSSQILRETDKVAAHLA HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DIYNEGAEEVIANARYAFIDGLMNEAVSKPAVEKPTVSDKIDKYLTNRILGIPIFLVIMY HHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMFQLTFTIGAPFQDLIDEGFGLLGEAIGGLLGDSVLSSFIVDGIIGGVGGVLTFLPIII HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMFLFISILEDSGYLARAAFVMDKVMHKLVGLHGKSFIPMILGFGCGVPAIMATRTMENE HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCH SDRLLSMMLVPFMSCTARLPVYALLISAFFAANQGEVLFSIYLLGIVVALVVAAILKRTM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKGMSSPFVMELPTYKVPSLKGVLLHTWDKTKGFLRKAGTIILVASIIVWVLSSVPFGVE HHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC YGSQESAIGQIGTAIAPIFAPLGFGEWQPAVAILFGLVAKEVVVSTFSSLFGVEEEGSGI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH EAAVHDLFTPLSAYAFMAFVLLYVPCFAAIGTIKQETNSWKWPLTMSVITLATGYIVALI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH IYQGGSLLGFA HHCCCCEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]