Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 148381090

Identifier: 148381090

GI number: 148381090

Start: 3342259

End: 3343830

Strand: Reverse

Name: 148381090

Synonym: CBO3141

Alternate gene names: NA

Gene position: 3343830-3342259 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148381091

Following gene: 148381088

Centisome position: 86.03

GC content: 25.25

Gene sequence:

>1572_bases
ATGGGATCACTTAGTTACATAGTTAGAAAAAGTATAAAAAATTATTTTAAACAACTAAAGAATAAACCGGCTAAAGCTAT
ATTGTATGTTCTTTTTATTGCCCTTTTAGTTTTTATCTTAATTGTATCTCCAGAATCAAGTGGTAATAAGAGGATAAAAG
ATGGTAAAGAATTTTTTAATGCTATAGTTACTATAGTAACTTTATATGCAGTATTTAGTGCTATTAATACAGGTACTAAA
AAGGGTAAAAGTTTTTTTAGATTAAGTGATGTGAATTTTTTGTTTACAGCTCCTATACCACCTCAAAGAGTATTGCTTTA
TGGATTCTTAAAAGAATTATATAAAAGTATGATGATGATAGTATTTCTTTTATTTCAAATACCTAATCTTTATAATTTAT
TTCCTATAAAGCAACACGGTGCCATACCTGTGGTAGTGGGTATATTCATGTTGATGTTTTCTTATTCAACTATAGCTGTA
TTAATATATTCTATAGCTGCTAAGGAAGATAAATATAGAAATTTTATAAAAAATATTCTTAATTTATTATTAGGATTATT
TGGAGCAGGTTTTTTATGGACGTTATTTAAAGTAAAATCTATAAAATTAGCTTTTATAACCTTTTTAGGGTTAGATATGT
TTTCCCAAATACCTTTTATAGGATGGAATATAAATATATTTAATGCCGCTATAGAGGGTATAAATAAGTTATTCTTTATA
AACCTACTAGGGGTACTCTTATCTATAATTTTTATAATATATATAGTGTATATTTTAAAAACAGATTATTATGAAGATGC
TATGTCAGTTACAGAGGTCAATGAAAGAAAGATAGAGAGAGCTAAAAAAGGTAAAGGAAATGTAGATTTAAATAAACCTA
TAAAAAGAAAAAATGTTATGGGGATATTAAAATCAAAGGGAGCAAAAAGTATATTTGAAAGACAAGTTTTAGAGTATAAA
AGAAGTGGATTTTTCTTTGTAGATAAGATGACCTTAGTAATGGGAGCAAGCTCCTTAGTTTTTGGATTTTTTATGAATGA
TAAAAATGGCAGTATAAATACAGTAATGTATTTTGCAATATATATGTTATTGATATTTACATTTCAAGGCAAATGGGCTG
AAGAACTATCTAAGCCTTATATATATTTAATTCCAGAGAGTTCAGAAATTAAAGTTTTCTATGCTACCCTTACCAACCAT
ATTAAAAATTTTGTGGATGGTTTCGTATTATTTTTAATTTGTGGTATTATATTTAAAACTAATCCTATGGTTATATTGTT
AGCTACATTAACCTATGTAAGTTTTGGTGCAATATTTGTATATGTGGATTTAGTTTTAAGAAGATTTTTTGGTGGTAATA
TTAGTAAAGCTGTAGAAGCTACATTAAAATTTATTTTATTAATAATAGCAGTATTACCAGGAATAATAATATCTGTACTA
ATTTCTTTTAAGTATAAAGGATTATTTGGAACAGTTTCTATGTATCTTGCTATGATTTTATATAATTGTCTTATTAGTTT
TATAGGGATATTATTATCTAAAAGTATATTTGAAAAAATAGAGATGAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGAAAGAAGGGAATATAGTCTTTGCTAGAACCAAGCAAGAATTAATAGATAAAAATGAGTCCTTAGAAGAAATATTCTT
TGAAGTAACGGAGGGATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACAAAGTAGAGCATTTGAAAATAAAATATATTTAATTTAAACAGGAATAACAAAAAAATACACATTATATGTTTATGATG
TGTATTTTTTATATTTACTA

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 523; Mature: 522

Protein sequence:

>523_residues
MGSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFNAIVTIVTLYAVFSAINTGTK
KGKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMIVFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAV
LIYSIAAKEDKYRNFIKNILNLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSQIPFIGWNINIFNAAIEGINKLFFI
NLLGVLLSIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVMGILKSKGAKSIFERQVLEYK
RSGFFFVDKMTLVMGASSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAIYMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNH
IKNFVDGFVLFLICGIIFKTNPMVILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKAVEATLKFILLIIAVLPGIIISVL
ISFKYKGLFGTVSMYLAMILYNCLISFIGILLSKSIFEKIEMK

Sequences:

>Translated_523_residues
MGSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFNAIVTIVTLYAVFSAINTGTK
KGKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMIVFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAV
LIYSIAAKEDKYRNFIKNILNLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSQIPFIGWNINIFNAAIEGINKLFFI
NLLGVLLSIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVMGILKSKGAKSIFERQVLEYK
RSGFFFVDKMTLVMGASSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAIYMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNH
IKNFVDGFVLFLICGIIFKTNPMVILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKAVEATLKFILLIIAVLPGIIISVL
ISFKYKGLFGTVSMYLAMILYNCLISFIGILLSKSIFEKIEMK
>Mature_522_residues
GSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFNAIVTIVTLYAVFSAINTGTKK
GKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMIVFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAVL
IYSIAAKEDKYRNFIKNILNLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSQIPFIGWNINIFNAAIEGINKLFFIN
LLGVLLSIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVMGILKSKGAKSIFERQVLEYKR
SGFFFVDKMTLVMGASSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAIYMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNHI
KNFVDGFVLFLICGIIFKTNPMVILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKAVEATLKFILLIIAVLPGIIISVLI
SFKYKGLFGTVSMYLAMILYNCLISFIGILLSKSIFEKIEMK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59554; Mature: 59423

Theoretical pI: Translated: 10.33; Mature: 10.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
AIVTIVTLYAVFSAINTGTKKGKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAVLIYSIAAKEDKYRNFIKNIL
HHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSQIPFIGWNINIFNAAIEGINKLFFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLLGVLLSIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHH
GILKSKGAKSIFERQVLEYKRSGFFFVDKMTLVMGASSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAI
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHH
YMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNHIKNFVDGFVLFLICGIIFKT
HHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NPMVILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKAVEATLKFILLIIAVLPGIIISVL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISFKYKGLFGTVSMYLAMILYNCLISFIGILLSKSIFEKIEMK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
GSLSYIVRKSIKNYFKQLKNKPAKAILYVLFIALLVFILIVSPESSGNKRIKDGKEFFN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
AIVTIVTLYAVFSAINTGTKKGKSFFRLSDVNFLFTAPIPPQRVLLYGFLKELYKSMMMI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFLLFQIPNLYNLFPIKQHGAIPVVVGIFMLMFSYSTIAVLIYSIAAKEDKYRNFIKNIL
HHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLLLGLFGAGFLWTLFKVKSIKLAFITFLGLDMFSQIPFIGWNINIFNAAIEGINKLFFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLLGVLLSIIFIIYIVYILKTDYYEDAMSVTEVNERKIERAKKGKGNVDLNKPIKRKNVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHH
GILKSKGAKSIFERQVLEYKRSGFFFVDKMTLVMGASSLVFGFFMNDKNGSINTVMYFAI
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHH
YMLLIFTFQGKWAEELSKPYIYLIPESSEIKVFYATLTNHIKNFVDGFVLFLICGIIFKT
HHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NPMVILLATLTYVSFGAIFVYVDLVLRRFFGGNISKAVEATLKFILLIIAVLPGIIISVL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISFKYKGLFGTVSMYLAMILYNCLISFIGILLSKSIFEKIEMK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA