| Definition | Clostridium botulinum A str. ATCC 3502, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009495 |
| Length | 3,886,916 |
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The map label for this gene is 148380924
Identifier: 148380924
GI number: 148380924
Start: 3165491
End: 3167005
Strand: Reverse
Name: 148380924
Synonym: CBO2972
Alternate gene names: NA
Gene position: 3167005-3165491 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148380925
Following gene: 148380923
Centisome position: 81.48
GC content: 31.35
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 504; Mature: 504
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_504_residues MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLFGVDIGITPIGNFMGSIIAKTNKIW KIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSIVIVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILA IFTSKEFLAISFDASGATTGAMTVPFILALAMGVAMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGEAFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFTFIGLILFLVGVNAGFMDVGS AIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQIEEVTSGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLW HYLLPGYLISVIMTYFVPNLFVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG FIFKIKSEKEDAKNIESSQECISS >Mature_504_residues MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLFGVDIGITPIGNFMGSIIAKTNKIW KIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSIVIVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILA IFTSKEFLAISFDASGATTGAMTVPFILALAMGVAMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGEAFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFTFIGLILFLVGVNAGFMDVGS AIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQIEEVTSGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLW HYLLPGYLISVIMTYFVPNLFVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG FIFKIKSEKEDAKNIESSQECISS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 53845; Mature: 53845
Theoretical pI: Translated: 6.69; Mature: 6.69
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 4.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.6 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLFGVDI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GITPIGNFMGSIIAKTNKIWKIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH VIVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILAIFTSKEFLAISFDASGATTG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC AMTVPFILALAMGVAMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGEAFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH FIGLILFLVGVNAGFMDVGSAIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQI HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH EEVTSGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLWHYLLPGYLISVIMTYFVPNL HHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG HEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIFKIKSEKEDAKNIESSQECISS HHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLFGVDI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GITPIGNFMGSIIAKTNKIWKIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH VIVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILAIFTSKEFLAISFDASGATTG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC AMTVPFILALAMGVAMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGEAFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH FIGLILFLVGVNAGFMDVGSAIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQI HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH EEVTSGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLWHYLLPGYLISVIMTYFVPNL HHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG HEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIFKIKSEKEDAKNIESSQECISS HHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA