| Definition | Clostridium botulinum A str. ATCC 3502, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009495 |
| Length | 3,886,916 |
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The map label for this gene is bceB [H]
Identifier: 148380096
GI number: 148380096
Start: 2280230
End: 2282233
Strand: Reverse
Name: bceB [H]
Synonym: CBO2140
Alternate gene names: 148380096
Gene position: 2282233-2280230 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148380097
Following gene: 148380095
Centisome position: 58.72
GC content: 24.05
Gene sequence:
>2004_bases ATGATAATAATGTATTCTAAGATAGCTCTTAAAAATATAAAAAAAAGTTATAAAGATTATACTATATATTTTTTAACATT AATATTAGCTGTTTGTATATTTTATAGCTTTAATTCAATAGAATCACAAAAGGTGCTTATTGAAATAGAATTCATGTCTG CGATAATGAAGGCTATTTCAGGTGTTTCAGTGCTAGTATCCATAATATTAGGTGGATTAATAGTGTATGCAAATAATTTT TTAATAAAAAGACGTAAAAAAGAGTTAGGAATGTATATGATTTTGGGTATGGGAAAAAGAAAAATATCTAGAATTTTAGT AACGGAAACCTTTATAGTGGGAGTTATATCTTTAGTTGGTGGACTTATATTAGGAATTGGAGCATCACAAGGGTTATCTA CATTTACTTTAAAGTTATTTAATGTGGGGATGGATGAATATAAGTTTATAATTTCAACAAGTGCTATAGGTAAGACTATA TTATACTTTGGAACAATGTTTTTGCTTGTTATGATATTTAATGTATTTGTTATTTCTAAATATAAGGTAATTGATCTATT AATAGCAAACATAAAAAATGAAGACATAAAATTTAAAAATCCATTTATATATTTATTAACATTTGTTTTATGTGTAATAT CACTTGGATTTTCATATAAATCCTTGCTAGAGATACCTTTTGATTTAGAACGTAATTTAGAACGTAATATGTCTATACCA ATAGCTCTTGCAATAGTTGGTACAGTATTATTTTTCTTTAGCTTAGCTGGAGTTATATTATATGTAACAAATAAAAACAA AAAGATATATTTTAAAGGGTTAAATATGTTTGTATTAAAACAAATGAACAGTAAAGTTAATACAAACTTTACATCAATGT CTTTAATATGTTTAATGCTATTTATTACAATAGTAGTATTATCTACAGGAATAAATTTTAAAAAAGTTGAAGAAGAAGGA CGTAGAAAAATTACTCCCTTTGATGCCAGTGTAACGTTATATAATAAAGATGAAAACAAAAATCAAAAGAATCATATAGA AGATATGCTAAATAAAATTGATTTTAAAAAGAGTAAAAATGAAAAATATGCAATTTACAATGATTATTATGCAGGATTAA AGGCAAGTGAATTATTAAAGATTAAGGAAAGAAACTTTGCACGTTACAATGTATATTTTAGTAAAATATCTGATTATAAT AAAATTTTAAAATTAAAGGGTGAAAAAGAAATAACTTTAAATAAGAGTGAAGTTTTAATTTTATCAAGTTCAGGTGGTGC CATTAATCTAATTAATGAAAAATTAAAAAGTAATAGAAGAATTAATATAAAAGGAAAAGAATATTTGATTAAAAATGATA AAGTTATAGAAGAAAATCTTAAAACATCTTCCCGTGCGGATAACCCTTGCACAGTAGTTATAAATGATGAGCTTGTGTCT GATTATAAAATTAGCTCCTCAGTACTTAATGTAATGTATTTAGATAAAAATAGAGAAGAGAATAATAAAAAATATAATAA AATTAATGATAATTATATTAAAGATGAGTATAAGAATTTAGATATTTCTATAGATGCCATTACCAAGGATGAGGTGTATT CTAAAAGTAATGGAATAACAAGTATGATGCTATTTATTGCAATATATTTAGGTATAGTATTTTTAATAACTAGTATGGCA GTACTCGCTCTTCAACAATTATCAGAGGCTAGTGATAGCATAAAAAGATATAAAGCTTTAAAGAGAATTGGGGCAAACAA AAAAATGATAGACAAAACAATTTTCATTCAAACCTTGATGTATTTTAGTCTTCCAGTGATTCTTGCATTAATTCATTCAA TGGTCGTAATTAAGATAATTAATGATCTTACCAGCATGATTATTAATACAGCTAATTTTAGGTATTCAATTTTAATAACT GTTTTAATATTTGTTATAGTTTATTTGGAATATTTCTATATAACCTATGCAGGATATAAAAATATAGTAAAAAGGAATAT TTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAAATAAGTTACATGAGATGAGGTTAAAAAATCTACTTTAAGTTATGCGCATAGAATTCTTTAGTAGAATTATAGAAGT TATATCTCTTCTTGGAGGTG
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTGTTATATGTAAAATATGAAGATATTAAATAAGGCATATGAAAGGATGATAAAACTATGAAAATTTCAGTTGAAAAT TTAAATATGATATATAAAGC
Product: ABC transporter, permease protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 667; Mature: 667
Protein sequence:
>667_residues MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVSVLVSIILGGLIVYANNF LIKRRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLILGIGASQGLSTFTLKLFNVGMDEYKFIISTSAIGKTI LYFGTMFLLVMIFNVFVISKYKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCVISLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIP IALAIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFTSMSLICLMLFITIVVLSTGINFKKVEEEG RRKITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKYAIYNDYYAGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYN KILKLKGEKEITLNKSEVLILSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVS DYKISSSVLNVMYLDKNREENNKKYNKINDNYIKDEYKNLDISIDAITKDEVYSKSNGITSMMLFIAIYLGIVFLITSMA VLALQQLSEASDSIKRYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILIT VLIFVIVYLEYFYITYAGYKNIVKRNI
Sequences:
>Translated_667_residues MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVSVLVSIILGGLIVYANNF LIKRRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLILGIGASQGLSTFTLKLFNVGMDEYKFIISTSAIGKTI LYFGTMFLLVMIFNVFVISKYKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCVISLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIP IALAIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFTSMSLICLMLFITIVVLSTGINFKKVEEEG RRKITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKYAIYNDYYAGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYN KILKLKGEKEITLNKSEVLILSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVS DYKISSSVLNVMYLDKNREENNKKYNKINDNYIKDEYKNLDISIDAITKDEVYSKSNGITSMMLFIAIYLGIVFLITSMA VLALQQLSEASDSIKRYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILIT VLIFVIVYLEYFYITYAGYKNIVKRNI >Mature_667_residues MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVSVLVSIILGGLIVYANNF LIKRRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLILGIGASQGLSTFTLKLFNVGMDEYKFIISTSAIGKTI LYFGTMFLLVMIFNVFVISKYKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCVISLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIP IALAIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFTSMSLICLMLFITIVVLSTGINFKKVEEEG RRKITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKYAIYNDYYAGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYN KILKLKGEKEITLNKSEVLILSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVS DYKISSSVLNVMYLDKNREENNKKYNKINDNYIKDEYKNLDISIDAITKDEVYSKSNGITSMMLFIAIYLGIVFLITSMA VLALQQLSEASDSIKRYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILIT VLIFVIVYLEYFYITYAGYKNIVKRNI
Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]
COG id: COG0577
COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76330; Mature: 76330
Theoretical pI: Translated: 10.06; Mature: 10.06
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 3.6 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAIS CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHH GVSVLVSIILGGLIVYANNFLIKRRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLILGIGASQGLSTFTLKLFNVGMDEYKFIISTSAIGKTILYFGTMFLLVMIFNVFVISK HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCVISLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIP HHHHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCHHCCHHCCCCCC IALAIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFTSMSLICLML HHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHHHHH FITIVVLSTGINFKKVEEEGRRKITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKN HHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC EKYAIYNDYYAGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKILKLKGEKEITLNKSEVLI CCEEEEECHHCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHEECCCCEEEECCCEEEE LSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVS EECCCCEEEHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHC DYKISSSVLNVMYLDKNREENNKKYNKINDNYIKDEYKNLDISIDAITKDEVYSKSNGIT CHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHCCCCHH SMMLFIAIYLGIVFLITSMAVLALQQLSEASDSIKRYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH YFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLIFVIVYLEYFYITYAGYK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIVKRNI HHHHCCC >Mature Secondary Structure MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAIS CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHH GVSVLVSIILGGLIVYANNFLIKRRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLILGIGASQGLSTFTLKLFNVGMDEYKFIISTSAIGKTILYFGTMFLLVMIFNVFVISK HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCVISLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIP HHHHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCHHCCHHCCCCCC IALAIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFTSMSLICLML HHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHHHHH FITIVVLSTGINFKKVEEEGRRKITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKN HHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC EKYAIYNDYYAGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKILKLKGEKEITLNKSEVLI CCEEEEECHHCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHEECCCCEEEECCCEEEE LSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVS EECCCCEEEHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHC DYKISSSVLNVMYLDKNREENNKKYNKINDNYIKDEYKNLDISIDAITKDEVYSKSNGIT CHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHCCCCHH SMMLFIAIYLGIVFLITSMAVLALQQLSEASDSIKRYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH YFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLIFVIVYLEYFYITYAGYK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIVKRNI HHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9387221; 9384377; 14612242; 12890034 [H]