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The map label for this gene is yfcC [C]

Identifier: 148379385

GI number: 148379385

Start: 1535500

End: 1537035

Strand: Direct

Name: yfcC [C]

Synonym: CBO1409

Alternate gene names: 148379385

Gene position: 1535500-1537035 (Clockwise)

Preceding gene: 148379384

Following gene: 148379387

Centisome position: 39.5

GC content: 31.64

Gene sequence:

>1536_bases
ATGGGGGGGATTGTTGTGACAAAAAAGAAAAAGAAAATAAGCTTTCCGACAGCTTTTACGGTATTGTTTATTGTATTAAT
TATTGCAGCTATACTTACTTATGTAGTTCCAGCTGGATCTTATTCAAAATTAAGTTATGATAACGATAGTAAAGTTTTTG
TTGTAACTAAACCAGATGAATCGACAAATGAATTACCAGCAACACAAAAGACTTTGGATAAACTTAAGATTAAAGTAAGT
GTAGAAAAATTTAAAGATGGTAGTATTAATAAGCCTGTAGCTATTCCAGATACTTATGAACAGGTAGAACAGAAACCTCA
AGGGTTTTTTGAAGTAATTGAAGCACCTATTAAAGGGGTGTATGATACTATCGATATTATAATGTTTGTACTTATTTTAG
GAGGAGTTATTGGTGTAGTAAATAGTAGTGGAGCATTTGATGCAGGTATTGCCAAACTTTCTGTAGCTACTAAGGGTAAA
GAATACCTATTAATAGTTATTATCACTACATTAATTGCTTTAGGTGGAACTACTTTTGGACTAGCAGAAGAAACCATTGC
ATTATATCCAATACTGGTTCCAGTTTTTATAGCAGCAGGATATGATGCTTTAGTTTGTATTGCAGCCTTGTATATGGGAT
CATCTATAGGTACTATGTTCGCTACGGTAAATCCTTTTTCTGTTGTTATAGCATCTAATACTTCAGGAATATCTATTGCT
TCAGGATTTATATTTAGAATTGTAGGACTTATTTTAGCAGTAGCTATAACTATTGTTTACATTGTAAAATATGGAGTTAA
GGTTAAAAAAGATCCAAGCAAATCTATAATATATGAACAAAGGAAAGAAATACAAGAGAAGTTTTTAAAAGATTATAGTA
AGGATGATGTTACTCTAAAATTTTCTTTAGGTCGTAAGCTAATGTTAATAATATTCGCATTAACATTCGTAGTTATGATT
TGGGGTGTAGCTTATAAAAAATGGTGGTTTACTGAGATGACAGCTCTGTTCCTTGTTGTAGGGATTATTTTAGGTGTAAT
CTCACGAATGGGAGAAAAGAATTTTGTAGATAAGTTTGTAGCTGGTTCAGCTGATTTGGTAGGAGTTGCATTAGTAATTG
GAGTTGCAAGATCTATTAATCTTGTTATGGAAAATGGAATGATTTCTGATACAATTTTGTATCATTCTTCAAATATGATA
TCAGGGATGAATTCTAGTGTATTTATAATATTTATGTTAATTGTATTTATAGGACTTGGATTTTTTATACCATCATCTTC
AGGACTTGCAGTGCTTTCAATGCCTATTATGGCACCTCTAGCAGACAGTGTAGGATTGCCAAGAGAGACTATAGTAAATG
CTTATATGTTTGGCCAGGGATTAATTTCATTCATAACTCCAACAGGGCTTATATTAGCTACATTAGCTATGGTAGATGTT
ACTTATGATAAATGGATTAAATTTATAATGCCACTTATGGGATATATAGCAGCCTTATCAGCTATAATGTTATTAATACA
AAGCTTTGTTGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTATAGAAGAGCGCGTTTTTGCTTAAAGCAATATCTATACACTTAAAATATTATGCTTTAAGTGTATAGATAAGAAGCG
ATGCTTGAAATATATTAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTAATAAAAAATTCAAAAGCTATGAATTGAAAAATTTTATTATATTTCAATTCATAGCTTTTATTGCTTATTATAAGTT
AAAAGGTAAAAATAAATTCA

Product: C4-dicarboxylate transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 511; Mature: 510

Protein sequence:

>511_residues
MGGIVVTKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDESTNELPATQKTLDKLKIKVS
VEKFKDGSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGVYDTIDIIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGK
EYLLIVIITTLIALGGTTFGLAEETIALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIA
SGFIFRIVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLKFSLGRKLMLIIFALTFVVMI
WGVAYKKWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFVAGSADLVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMI
SGMNSSVFIIFMLIVFIGLGFFIPSSSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDV
TYDKWIKFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA

Sequences:

>Translated_511_residues
MGGIVVTKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDESTNELPATQKTLDKLKIKVS
VEKFKDGSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGVYDTIDIIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGK
EYLLIVIITTLIALGGTTFGLAEETIALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIA
SGFIFRIVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLKFSLGRKLMLIIFALTFVVMI
WGVAYKKWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFVAGSADLVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMI
SGMNSSVFIIFMLIVFIGLGFFIPSSSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDV
TYDKWIKFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA
>Mature_510_residues
GGIVVTKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDESTNELPATQKTLDKLKIKVSV
EKFKDGSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGVYDTIDIIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGKE
YLLIVIITTLIALGGTTFGLAEETIALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIAS
GFIFRIVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLKFSLGRKLMLIIFALTFVVMIW
GVAYKKWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFVAGSADLVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMIS
GMNSSVFIIFMLIVFIGLGFFIPSSSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDVT
YDKWIKFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA

Specific function: Unknown

COG id: COG1288

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis ycgA [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87082082, Length=525, Percent_Identity=30.2857142857143, Blast_Score=237, Evalue=1e-63,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018387
- InterPro:   IPR018385 [H]

Pfam domain/function: PF03606 DcuC [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55345; Mature: 55214

Theoretical pI: Translated: 9.38; Mature: 9.38

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGGIVVTKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDE
CCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
STNELPATQKTLDKLKIKVSVEKFKDGSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGV
CCCCCCCHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
YDTIDIIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGKEYLLIVIITTLIALGGTTFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LAEETIALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEECCCEEEEEECCCCCCHHH
SGFIFRIVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEE
FSLGRKLMLIIFALTFVVMIWGVAYKKWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFV
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
AGSADLVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMISGMNSSVFIIFMLIVFIGLG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEECCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
FFIPSSSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDV
HHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH
TYDKWIKFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
GGIVVTKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDE
CCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
STNELPATQKTLDKLKIKVSVEKFKDGSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGV
CCCCCCCHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
YDTIDIIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGKEYLLIVIITTLIALGGTTFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LAEETIALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEECCCEEEEEECCCCCCHHH
SGFIFRIVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEE
FSLGRKLMLIIFALTFVVMIWGVAYKKWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFV
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
AGSADLVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMISGMNSSVFIIFMLIVFIGLG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEECCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
FFIPSSSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDV
HHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH
TYDKWIKFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]