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The map label for this gene is 148358284

Identifier: 148358284

GI number: 148358284

Start: 152018

End: 155329

Strand: Direct

Name: 148358284

Synonym: LPC_0146

Alternate gene names: NA

Gene position: 152018-155329 (Clockwise)

Preceding gene: 148358283

Following gene: 148358289

Centisome position: 4.25

GC content: 36.84

Gene sequence:

>3312_bases
ATGACACCTTTGTTCCCAACCCAAGGCCCTATTACCATCCGACAAGGTATTGGAGGTAGTTGCTATCTTTTGTCATCTCT
GGATTGCATTTTAAATCTTGGGAAGGATGGGGAGCAATTAATTAAATCGCTTTTTACCCAAACGGAAGATGGGAAGGTTA
TCGTAAGAATCAAACGCCATGAGGCACTAAAAAATAATTTGCAAAAGAATAAAATGACTGGGAAGTACACCCATTACGTG
GATGAACTTAACAATGAAGATGTGTTTGAGATTAGCCCGGAAAGGCTAAAGGAAATTGATAATCAATATGGCGGGGTAAA
AAGTAATTCGCTGGCAATAAAAATTTTGGAACGATTGGTTTCCTATTATTATGCGGGAGATTGGAGTAATACTAATCCTT
TGGCAAGCGTTATTGCTCATGATATACCGGACAGAATTGCCGGTTTTACTTCCACTGCTTTTTTGGGCAAATTCTTTGGT
ATTGAAGCGGAAGACATTCCATATTCAAAGCTTGACGATATCATCAAATTGAAACTAATGAATCCTGATGAACCTGTTTA
TATTAGTATGTCTTATGGAAAAGTCGATGGCTTTGGAAAATTTCATGGACGTCATGCTTTAAGAATAGACAAAATTATTC
CTAAAGGTCATGGAGATTATGATTTTGTTTTAATCAATCCGCACGATAATTCTAAAACAGAAACTTACAAGTTAGACGAT
CTCAACAAGCGAAACTGCCGATTTTGCCTTTTTAATACCAGTATCCATAGAGCCAGTTTGACAAAAAAATTATTGACACT
TTCCAACGATGAGGGGAGGTATGTTTTTTCTAATTCTGGGCTGCAGAAAAGGCTGATATCTTTGGAGGAAATGAATCTTC
TAACTGACAACAAAATTATTTCTTCTTGCATTAGTTTGCATAAACAAATCCCTTATCTTGAAAAACTTTTCCTAAAATTG
TCAGTGGAAGAAAAGAAAACATTAATTGCTTGCATAGCCAATGCGGATGGTTCTAAAAAAGAATTCCTAAAATTATTTTT
AACCCATATCCCTGCAATGGATTTGCTTGAACTGGTTCTGCGTGAAGAAACATCTCAAGAATTACTAGGTGAGGTTTTGG
CAGAGTTAGCCTTGTCAAGCCGAGTCGAAGAAAACAAATTAAGTCCCCAAGCAGGAATAAATTTTAATAGCGAGGCTTTT
CTCCATTTAATAGTGAAGTCTGCAATACAGCAAAAAATCAATCAATTTGCTTACACACCTGAAAAAGCCAAACAAGAAAT
TGAATCCGGTGTAATTAACTTTTACTTTGGTGGAGCATCTTCTAATTTAACAAGAGCATCAGGATTAAGAGCTTTGTTTA
TAGCCAATGTTTTCTCCAAAAAATCAATAGAGACTTTATTTCCACCAAAAGCTCTTTTTGCAAAAGCGATCGCCAACTAT
CTCACACTAAAAACTTTACCGGATTTATTGATTGAGTACTTAAAAAGCCAAGACACATCGCCAATTGATGAGGAGTTTTT
TGATATCGTTCTTACCAGCGCAACGTTTAAAGATCCGGATGAATTATTTGAAAACTTGTTCAGATTAAGCCAAATTAGTC
CTGAAGTGGCAAAAGCTTTACTTGTTTTCGCATCTCAAAAAATTAATGTTCTATTTGGCATATCTTTAGAAGAATACGCA
AAAAAAATCGCTTTAAAAGATTCAGGCGAATTCAAATCATGGTTTGAGTCCTTATCCAACCCACAGCCAGCGATACAAAT
TCCTGAAATTGATAAAGTATTAAGGCAACAACGAGTCGAAGATGCTAAAAGAGTGATTTCAGATATCGTTCAACGCATCA
ATTCTTTTTCATTTAGTTTTGAGGGCTTTAAAACCGTTGCACACCTTAATCTTAATGCAGAAGAGTTAAGAAGCCAACTT
AAGAAAATAGTTCACTCTGGCGAATTGCAAAATGCGTTGCAAATACTGGATTTACCTGATGGACATCCGGAAGTCCAGAA
GGCTTTAGAACGTAAGCTCCGAATGATAGACGTTGCAGCTAATCGACGCTTAGATTTTCTCAAGAAGTATGAAGCGGATA
TAGATGAGCATGTCAGGCGAATAAAAGACTTCCCAATCGACTTTAATGGTGCGGGTACCATAGTAGCTATTGAATCCCAA
CGTATTCTGTTAAACAAAAGGCTTCACACACTGGTCAAGGCTGAAGATCTTTTGGGCGAACGCTTAATCGCCAATCCCAA
AATAAAAATGGTCTATTTTGCTCAGGTTGAAAAGATTAATTTGCGGGCTGAATTATTGCAAAAACAGCTTCTTGATGAGG
CACAAAAGGTTATCGATTCTGTTGAAAAAAGAATTGATAATTTTGTAATTCGTTTTAATGATATAAGCACTTCTTCCGCA
GTAGAATGGCAGCGTAATAATTTATTACAGCAACTTGATAATCTGGTTAAACCTAATCAAGCTTTGTTAGGTGCTGAAAA
AGTTCTGGATTGTAATGACTTGCAACCATCCATAGTAAGAGCACTGCAAGCGAAAAAACAAGAAATAAATGAAACAGCTG
ATCAATTGATCATTAAAATAAATGCTGAAGAAGTAGTAAAAAGCTATGAAAAACAAATCAGGGAATTTCCGATAAGTTTT
AACAGATGCCAAACAGTTGAAGAAGTGATTACCAGAAAACAGGATTTAATTCAATCGGTTCGAAATTTGGTGGGCAACAA
ACCAGATTTGCTTAAGGCTCAGGAACAGCTTCAACTTTTATCTGGTGAGTATCATAGTGATATCAAAATGGCTCTGACAG
ATAAAGTTCGTGAAATTAACAGGCAAGCTGATGCGGTGAGCAAGCGTATTACTGACCAAATCGCTGCAACAAAAGAAACT
TTGAATATTCTTGCCGAAATTAAATTTTCCGACCACTTAAAAATTATTGAAAGTATGGTTAAAACACTGGAAGCCAAAGC
AGTTGGGGATAAAAATTATAAACGCGCGGCGCCCATAGCGAGAGCATTTTATAATAATTTATTAATGGCCGAAGAGCGTT
TCAAAAATTCTCAGCTGCCCAAGAATGTGAAATGCAAGGATTTTCATCAAGCTTGCGCCCGTGCCATTAATGCAGTCATA
CCTGTTTTAGAAATACATCGTGGCTGGAAACAAGTGTTTGCTGATTTAGCGAGTGCTTTAGTCACTTTATGCACTTTGGG
TGGAGCCAATTTATACGCGGGGAGATGGCGATTATTTCCTGTACCCACCGAATCTGAAAAAATTGTCAAAGATTTTTCAG
TGTCAATGCAACCGCTTGCTGTCAGAGCCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTTTCCCGATTGATTACAGACCAATTTTTTTAATGATTATCCAATATTTTGCTGTTATAATGTCCTCTTTATGTACTTT
ATGATTTTAAGAGGACCACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAAATTGATTTGATATGGTTTGAAATGGTTGTCAGGCTTCACATAGTTTATTTGTTTGCTAACAGAATAAACTTTGTGA
AGTCCGACAGTTCTTTTTAC

Product: ninein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1103; Mature: 1102

Protein sequence:

>1103_residues
MTPLFPTQGPITIRQGIGGSCYLLSSLDCILNLGKDGEQLIKSLFTQTEDGKVIVRIKRHEALKNNLQKNKMTGKYTHYV
DELNNEDVFEISPERLKEIDNQYGGVKSNSLAIKILERLVSYYYAGDWSNTNPLASVIAHDIPDRIAGFTSTAFLGKFFG
IEAEDIPYSKLDDIIKLKLMNPDEPVYISMSYGKVDGFGKFHGRHALRIDKIIPKGHGDYDFVLINPHDNSKTETYKLDD
LNKRNCRFCLFNTSIHRASLTKKLLTLSNDEGRYVFSNSGLQKRLISLEEMNLLTDNKIISSCISLHKQIPYLEKLFLKL
SVEEKKTLIACIANADGSKKEFLKLFLTHIPAMDLLELVLREETSQELLGEVLAELALSSRVEENKLSPQAGINFNSEAF
LHLIVKSAIQQKINQFAYTPEKAKQEIESGVINFYFGGASSNLTRASGLRALFIANVFSKKSIETLFPPKALFAKAIANY
LTLKTLPDLLIEYLKSQDTSPIDEEFFDIVLTSATFKDPDELFENLFRLSQISPEVAKALLVFASQKINVLFGISLEEYA
KKIALKDSGEFKSWFESLSNPQPAIQIPEIDKVLRQQRVEDAKRVISDIVQRINSFSFSFEGFKTVAHLNLNAEELRSQL
KKIVHSGELQNALQILDLPDGHPEVQKALERKLRMIDVAANRRLDFLKKYEADIDEHVRRIKDFPIDFNGAGTIVAIESQ
RILLNKRLHTLVKAEDLLGERLIANPKIKMVYFAQVEKINLRAELLQKQLLDEAQKVIDSVEKRIDNFVIRFNDISTSSA
VEWQRNNLLQQLDNLVKPNQALLGAEKVLDCNDLQPSIVRALQAKKQEINETADQLIIKINAEEVVKSYEKQIREFPISF
NRCQTVEEVITRKQDLIQSVRNLVGNKPDLLKAQEQLQLLSGEYHSDIKMALTDKVREINRQADAVSKRITDQIAATKET
LNILAEIKFSDHLKIIESMVKTLEAKAVGDKNYKRAAPIARAFYNNLLMAEERFKNSQLPKNVKCKDFHQACARAINAVI
PVLEIHRGWKQVFADLASALVTLCTLGGANLYAGRWRLFPVPTESEKIVKDFSVSMQPLAVRA

Sequences:

>Translated_1103_residues
MTPLFPTQGPITIRQGIGGSCYLLSSLDCILNLGKDGEQLIKSLFTQTEDGKVIVRIKRHEALKNNLQKNKMTGKYTHYV
DELNNEDVFEISPERLKEIDNQYGGVKSNSLAIKILERLVSYYYAGDWSNTNPLASVIAHDIPDRIAGFTSTAFLGKFFG
IEAEDIPYSKLDDIIKLKLMNPDEPVYISMSYGKVDGFGKFHGRHALRIDKIIPKGHGDYDFVLINPHDNSKTETYKLDD
LNKRNCRFCLFNTSIHRASLTKKLLTLSNDEGRYVFSNSGLQKRLISLEEMNLLTDNKIISSCISLHKQIPYLEKLFLKL
SVEEKKTLIACIANADGSKKEFLKLFLTHIPAMDLLELVLREETSQELLGEVLAELALSSRVEENKLSPQAGINFNSEAF
LHLIVKSAIQQKINQFAYTPEKAKQEIESGVINFYFGGASSNLTRASGLRALFIANVFSKKSIETLFPPKALFAKAIANY
LTLKTLPDLLIEYLKSQDTSPIDEEFFDIVLTSATFKDPDELFENLFRLSQISPEVAKALLVFASQKINVLFGISLEEYA
KKIALKDSGEFKSWFESLSNPQPAIQIPEIDKVLRQQRVEDAKRVISDIVQRINSFSFSFEGFKTVAHLNLNAEELRSQL
KKIVHSGELQNALQILDLPDGHPEVQKALERKLRMIDVAANRRLDFLKKYEADIDEHVRRIKDFPIDFNGAGTIVAIESQ
RILLNKRLHTLVKAEDLLGERLIANPKIKMVYFAQVEKINLRAELLQKQLLDEAQKVIDSVEKRIDNFVIRFNDISTSSA
VEWQRNNLLQQLDNLVKPNQALLGAEKVLDCNDLQPSIVRALQAKKQEINETADQLIIKINAEEVVKSYEKQIREFPISF
NRCQTVEEVITRKQDLIQSVRNLVGNKPDLLKAQEQLQLLSGEYHSDIKMALTDKVREINRQADAVSKRITDQIAATKET
LNILAEIKFSDHLKIIESMVKTLEAKAVGDKNYKRAAPIARAFYNNLLMAEERFKNSQLPKNVKCKDFHQACARAINAVI
PVLEIHRGWKQVFADLASALVTLCTLGGANLYAGRWRLFPVPTESEKIVKDFSVSMQPLAVRA
>Mature_1102_residues
TPLFPTQGPITIRQGIGGSCYLLSSLDCILNLGKDGEQLIKSLFTQTEDGKVIVRIKRHEALKNNLQKNKMTGKYTHYVD
ELNNEDVFEISPERLKEIDNQYGGVKSNSLAIKILERLVSYYYAGDWSNTNPLASVIAHDIPDRIAGFTSTAFLGKFFGI
EAEDIPYSKLDDIIKLKLMNPDEPVYISMSYGKVDGFGKFHGRHALRIDKIIPKGHGDYDFVLINPHDNSKTETYKLDDL
NKRNCRFCLFNTSIHRASLTKKLLTLSNDEGRYVFSNSGLQKRLISLEEMNLLTDNKIISSCISLHKQIPYLEKLFLKLS
VEEKKTLIACIANADGSKKEFLKLFLTHIPAMDLLELVLREETSQELLGEVLAELALSSRVEENKLSPQAGINFNSEAFL
HLIVKSAIQQKINQFAYTPEKAKQEIESGVINFYFGGASSNLTRASGLRALFIANVFSKKSIETLFPPKALFAKAIANYL
TLKTLPDLLIEYLKSQDTSPIDEEFFDIVLTSATFKDPDELFENLFRLSQISPEVAKALLVFASQKINVLFGISLEEYAK
KIALKDSGEFKSWFESLSNPQPAIQIPEIDKVLRQQRVEDAKRVISDIVQRINSFSFSFEGFKTVAHLNLNAEELRSQLK
KIVHSGELQNALQILDLPDGHPEVQKALERKLRMIDVAANRRLDFLKKYEADIDEHVRRIKDFPIDFNGAGTIVAIESQR
ILLNKRLHTLVKAEDLLGERLIANPKIKMVYFAQVEKINLRAELLQKQLLDEAQKVIDSVEKRIDNFVIRFNDISTSSAV
EWQRNNLLQQLDNLVKPNQALLGAEKVLDCNDLQPSIVRALQAKKQEINETADQLIIKINAEEVVKSYEKQIREFPISFN
RCQTVEEVITRKQDLIQSVRNLVGNKPDLLKAQEQLQLLSGEYHSDIKMALTDKVREINRQADAVSKRITDQIAATKETL
NILAEIKFSDHLKIIESMVKTLEAKAVGDKNYKRAAPIARAFYNNLLMAEERFKNSQLPKNVKCKDFHQACARAINAVIP
VLEIHRGWKQVFADLASALVTLCTLGGANLYAGRWRLFPVPTESEKIVKDFSVSMQPLAVRA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 124929; Mature: 124797

Theoretical pI: Translated: 8.30; Mature: 8.30

Prosite motif: PS00139 THIOL_PROTEASE_CYS ; PS00878 ODR_DC_2_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTPLFPTQGPITIRQGIGGSCYLLSSLDCILNLGKDGEQLIKSLFTQTEDGKVIVRIKRH
CCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHH
EALKNNLQKNKMTGKYTHYVDELNNEDVFEISPERLKEIDNQYGGVKSNSLAIKILERLV
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
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NPDEPVYISMSYGKVDGFGKFHGRHALRIDKIIPKGHGDYDFVLINPHDNSKTETYKLDD
CCCCCEEEEEECCCCCCCHHHCCCCCEEEHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCEEECCC
LNKRNCRFCLFNTSIHRASLTKKLLTLSNDEGRYVFSNSGLQKRLISLEEMNLLTDNKII
CCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SSCISLHKQIPYLEKLFLKLSVEEKKTLIACIANADGSKKEFLKLFLTHIPAMDLLELVL
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HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
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HHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC
GHPEVQKALERKLRMIDVAANRRLDFLKKYEADIDEHVRRIKDFPIDFNGAGTIVAIESQ
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECC
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VEKRIDNFVIRFNDISTSSAVEWQRNNLLQQLDNLVKPNQALLGAEKVLDCNDLQPSIVR
HHHHHHCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH
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VPTESEKIVKDFSVSMQPLAVRA
CCCCHHHHHHHHCCCCCCCEECC
>Mature Secondary Structure 
TPLFPTQGPITIRQGIGGSCYLLSSLDCILNLGKDGEQLIKSLFTQTEDGKVIVRIKRH
CCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHH
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HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
EKAKQEIESGVINFYFGGASSNLTRASGLRALFIANVFSKKSIETLFPPKALFAKAIANY
HHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHH
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DAKRVISDIVQRINSFSFSFEGFKTVAHLNLNAEELRSQLKKIVHSGELQNALQILDLPD
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC
GHPEVQKALERKLRMIDVAANRRLDFLKKYEADIDEHVRRIKDFPIDFNGAGTIVAIESQ
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECC
RILLNKRLHTLVKAEDLLGERLIANPKIKMVYFAQVEKINLRAELLQKQLLDEAQKVIDS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNILAEIKFSDHLKIIESMVKTLEAKAVGDKNYKRAAPIARAFYNNLLMAEERFKNSQLP
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
KNVKCKDFHQACARAINAVIPVLEIHRGWKQVFADLASALVTLCTLGGANLYAGRWRLFP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCEEEEC
VPTESEKIVKDFSVSMQPLAVRA
CCCCHHHHHHHHCCCCCCCEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA