| Definition | Orientia tsutsugamushi Boryong, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009488 |
| Length | 2,127,051 |
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The map label for this gene is rhp2
Identifier: 148284840
GI number: 148284840
Start: 1522052
End: 1524043
Strand: Direct
Name: rhp2
Synonym: OTBS_1559
Alternate gene names: NA
Gene position: 1522052-1524043 (Clockwise)
Preceding gene: 148284839
Following gene: 148284843
Centisome position: 71.56
GC content: 28.56
Gene sequence:
>1992_bases ATGAAGGTTCTGATGTACAAGAAAGAAATTACAGAAAGTATATTAGCTAAGCAACTTTTTGAATCTTTAGCTCTGGTAGG GCTATCAAAAACTACAGATGAAACTATTTTATCTTTAAGTCAAAGTCTTGCTAAAACATTAAATAGTATTTCTAAAAGTT TTTCTACATCTAGTCTAGAAGAATACCAAAAATGTTTTTCTAATTTAAATGATCATGATTTACACAAAGTATTGAAAGTA CTAAAAGATACGTTTGCAGAAGATGAGTATAAAGAGTTAAGAAATATTATTGAGTTACCACTTTTAGATAGACTAACTAC AAAATTTAAAATAGAACGTGAAAAAGAATTAAGCATTCAACAAGCACCAAATTTTAACAATAGTAGTATTGAGGAACTGC TGCGTGATAAAAATGTTTCTAAACAGAGTGAATTTTTTCAAACAGGAGATAAGCAAGATGGTGTCTCTGCAGGATATGTT GCTAATGAAAAGTTAAGTAATAATACTTTTCTTCTTAAAAAATTTTATAAAAACAATGATAGTGTTTTAGCTATAATGGA TCCAGCAGAGAGGCAAAAAGCTCAGAATGATGTAAGAGATGCTGTACAAGAATTGCTAACTTCTTCTATGTACAAGTTAT TATTATATGGACGTGCTCCAAAAGAAGAATTAGTAACACCAGATGAAGTTAATTCAGATTTGCTGTATATAAGATCTAAA TTTTTTGAGAATGCAGTACCACTTTCAGAATTTTCTGGATCAAAAAATTCTATTCATATTAAAGCAGATGCAAAAAACCT ACAAGGATTAGAAGGATTTGAGAAAATAATTGCATCTTGTCATATTTTAGGTGAAGCTGATTATCATCCAGGAAATTTAA TGGTACAAGATGGTAAAACTGTTGTTAAAATAGATCACGGTAGATCTATGATGCAGTTTCATAAAGATTTTGAAAGTATG GTTAAGTCAACGTATAACATTTTTAACCACAATCAAATAGGTTACAATTCAGCGATTGAAGCAGGCAACCTATCGTTTAG TATTGAAAAATATAACGCTGCATTAAACCAAATGCTTGCCCAACTTGATGAATACCAAATAGATACTGTAGTAGAAAAAA AAACGTCTGAGCTACAAAAAGTTGGATTTAATCCAAAAGGATTAATGGCTAAGGTTAGGTTTGATGATAAAACGTTTATG CATACTACCATTAATAATTATCAAGATTTTACAGCATTTTACAAAGATAATGTAAAAGAAAATCTTCAGAATATGAGAAG AATAGCACAAACAACTGACATAATAAGTAAATTTAGTAATGTATCACCTGAATTTAAAAATGGTAGATGGTTAAAGGATT TTGCTATTTCTGATATTAAAGAGCCAGTTATATATGCATCCTTTCATAATATCAAAATTGAAGGGAAAAGTGCTTTAGAA TGGGCTATTTCAAATAAGTATCATGCTGTAGAAAATGTTATTAAAGTAGAAAAAGTTCTAAAAGGTATTGAAGATGAGTT ATTTCCTTTAGTCCAAAGATTGCAAGATACCCCAATGAAAAAATTAACCTTAAAAGAGGTAAAGCAGTTTTATGACTCAG TGTTAACCACCTTTGAACAAAAACAATATTTAACTCAACAAGAAGTTAAGGATATACAAGAATGCTTAGACTATAAAAAA CACATTAAAAATACTACTGCATTTATAAAATTAAATATAGAATCTATATCAATGGTTGATAAAATGCGTTATAAACTAGC AACATTTTGCAATATACTATCTTTGCCTAGTAAAGCAAAATATTTTATGGATAGAATCACTCCTGAAAGTTTAAATATAA TACAACAGCTAAAAAAAGACATTTCAAATAGCTCAGGATTTAAAAAAGTTTTGTTAAAATCTAGCACAAATTACAAGTCA AATACTCACAGCACATACTCAATATCCAAATCTAAAAATGATAGCAATAATCAAAAGGGTATACTCATGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAATCAGTTTAGAAAAAATACTAATGGCTGCTCTATATTCAACTTAAGCTTGTAACTTTTTTATACACATGTATTATTAA TAATTAAGGTTATTCTATTC
Downstream 100 bases:
>100_bases CTTTTAGATTTATTACCGTTGAATAGACCTCGTTCGAAACTGGTTAAGGTAGATCAAAATTATAAATGCCAGAGATCAAA TTAAATCTATATGAGTAGAC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 663; Mature: 663
Protein sequence:
>663_residues MKVLMYKKEITESILAKQLFESLALVGLSKTTDETILSLSQSLAKTLNSISKSFSTSSLEEYQKCFSNLNDHDLHKVLKV LKDTFAEDEYKELRNIIELPLLDRLTTKFKIEREKELSIQQAPNFNNSSIEELLRDKNVSKQSEFFQTGDKQDGVSAGYV ANEKLSNNTFLLKKFYKNNDSVLAIMDPAERQKAQNDVRDAVQELLTSSMYKLLLYGRAPKEELVTPDEVNSDLLYIRSK FFENAVPLSEFSGSKNSIHIKADAKNLQGLEGFEKIIASCHILGEADYHPGNLMVQDGKTVVKIDHGRSMMQFHKDFESM VKSTYNIFNHNQIGYNSAIEAGNLSFSIEKYNAALNQMLAQLDEYQIDTVVEKKTSELQKVGFNPKGLMAKVRFDDKTFM HTTINNYQDFTAFYKDNVKENLQNMRRIAQTTDIISKFSNVSPEFKNGRWLKDFAISDIKEPVIYASFHNIKIEGKSALE WAISNKYHAVENVIKVEKVLKGIEDELFPLVQRLQDTPMKKLTLKEVKQFYDSVLTTFEQKQYLTQQEVKDIQECLDYKK HIKNTTAFIKLNIESISMVDKMRYKLATFCNILSLPSKAKYFMDRITPESLNIIQQLKKDISNSSGFKKVLLKSSTNYKS NTHSTYSISKSKNDSNNQKGILM
Sequences:
>Translated_663_residues MKVLMYKKEITESILAKQLFESLALVGLSKTTDETILSLSQSLAKTLNSISKSFSTSSLEEYQKCFSNLNDHDLHKVLKV LKDTFAEDEYKELRNIIELPLLDRLTTKFKIEREKELSIQQAPNFNNSSIEELLRDKNVSKQSEFFQTGDKQDGVSAGYV ANEKLSNNTFLLKKFYKNNDSVLAIMDPAERQKAQNDVRDAVQELLTSSMYKLLLYGRAPKEELVTPDEVNSDLLYIRSK FFENAVPLSEFSGSKNSIHIKADAKNLQGLEGFEKIIASCHILGEADYHPGNLMVQDGKTVVKIDHGRSMMQFHKDFESM VKSTYNIFNHNQIGYNSAIEAGNLSFSIEKYNAALNQMLAQLDEYQIDTVVEKKTSELQKVGFNPKGLMAKVRFDDKTFM HTTINNYQDFTAFYKDNVKENLQNMRRIAQTTDIISKFSNVSPEFKNGRWLKDFAISDIKEPVIYASFHNIKIEGKSALE WAISNKYHAVENVIKVEKVLKGIEDELFPLVQRLQDTPMKKLTLKEVKQFYDSVLTTFEQKQYLTQQEVKDIQECLDYKK HIKNTTAFIKLNIESISMVDKMRYKLATFCNILSLPSKAKYFMDRITPESLNIIQQLKKDISNSSGFKKVLLKSSTNYKS NTHSTYSISKSKNDSNNQKGILM >Mature_663_residues MKVLMYKKEITESILAKQLFESLALVGLSKTTDETILSLSQSLAKTLNSISKSFSTSSLEEYQKCFSNLNDHDLHKVLKV LKDTFAEDEYKELRNIIELPLLDRLTTKFKIEREKELSIQQAPNFNNSSIEELLRDKNVSKQSEFFQTGDKQDGVSAGYV ANEKLSNNTFLLKKFYKNNDSVLAIMDPAERQKAQNDVRDAVQELLTSSMYKLLLYGRAPKEELVTPDEVNSDLLYIRSK FFENAVPLSEFSGSKNSIHIKADAKNLQGLEGFEKIIASCHILGEADYHPGNLMVQDGKTVVKIDHGRSMMQFHKDFESM VKSTYNIFNHNQIGYNSAIEAGNLSFSIEKYNAALNQMLAQLDEYQIDTVVEKKTSELQKVGFNPKGLMAKVRFDDKTFM HTTINNYQDFTAFYKDNVKENLQNMRRIAQTTDIISKFSNVSPEFKNGRWLKDFAISDIKEPVIYASFHNIKIEGKSALE WAISNKYHAVENVIKVEKVLKGIEDELFPLVQRLQDTPMKKLTLKEVKQFYDSVLTTFEQKQYLTQQEVKDIQECLDYKK HIKNTTAFIKLNIESISMVDKMRYKLATFCNILSLPSKAKYFMDRITPESLNIIQQLKKDISNSSGFKKVLLKSSTNYKS NTHSTYSISKSKNDSNNQKGILM
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76051; Mature: 76051
Theoretical pI: Translated: 8.92; Mature: 8.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKVLMYKKEITESILAKQLFESLALVGLSKTTDETILSLSQSLAKTLNSISKSFSTSSLE CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH EYQKCFSNLNDHDLHKVLKVLKDTFAEDEYKELRNIIELPLLDRLTTKFKIEREKELSIQ HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHEECHHHHCCHH QAPNFNNSSIEELLRDKNVSKQSEFFQTGDKQDGVSAGYVANEKLSNNTFLLKKFYKNND CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHCCCC SVLAIMDPAERQKAQNDVRDAVQELLTSSMYKLLLYGRAPKEELVTPDEVNSDLLYIRSK CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH FFENAVPLSEFSGSKNSIHIKADAKNLQGLEGFEKIIASCHILGEADYHPGNLMVQDGKT HHHCCCCHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCE VVKIDHGRSMMQFHKDFESMVKSTYNIFNHNQIGYNSAIEAGNLSFSIEKYNAALNQMLA EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH QLDEYQIDTVVEKKTSELQKVGFNPKGLMAKVRFDDKTFMHTTINNYQDFTAFYKDNVKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH NLQNMRRIAQTTDIISKFSNVSPEFKNGRWLKDFAISDIKEPVIYASFHNIKIEGKSALE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEECCCHHHH WAISNKYHAVENVIKVEKVLKGIEDELFPLVQRLQDTPMKKLTLKEVKQFYDSVLTTFEQ HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQYLTQQEVKDIQECLDYKKHIKNTTAFIKLNIESISMVDKMRYKLATFCNILSLPSKAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH YFMDRITPESLNIIQQLKKDISNSSGFKKVLLKSSTNYKSNTHSTYSISKSKNDSNNQKG HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCC ILM CCC >Mature Secondary Structure MKVLMYKKEITESILAKQLFESLALVGLSKTTDETILSLSQSLAKTLNSISKSFSTSSLE CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH EYQKCFSNLNDHDLHKVLKVLKDTFAEDEYKELRNIIELPLLDRLTTKFKIEREKELSIQ HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHEECHHHHCCHH QAPNFNNSSIEELLRDKNVSKQSEFFQTGDKQDGVSAGYVANEKLSNNTFLLKKFYKNND CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHCCCC SVLAIMDPAERQKAQNDVRDAVQELLTSSMYKLLLYGRAPKEELVTPDEVNSDLLYIRSK CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH FFENAVPLSEFSGSKNSIHIKADAKNLQGLEGFEKIIASCHILGEADYHPGNLMVQDGKT HHHCCCCHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCE VVKIDHGRSMMQFHKDFESMVKSTYNIFNHNQIGYNSAIEAGNLSFSIEKYNAALNQMLA EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH QLDEYQIDTVVEKKTSELQKVGFNPKGLMAKVRFDDKTFMHTTINNYQDFTAFYKDNVKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH NLQNMRRIAQTTDIISKFSNVSPEFKNGRWLKDFAISDIKEPVIYASFHNIKIEGKSALE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEECCCHHHH WAISNKYHAVENVIKVEKVLKGIEDELFPLVQRLQDTPMKKLTLKEVKQFYDSVLTTFEQ HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KQYLTQQEVKDIQECLDYKKHIKNTTAFIKLNIESISMVDKMRYKLATFCNILSLPSKAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH YFMDRITPESLNIIQQLKKDISNSSGFKKVLLKSSTNYKSNTHSTYSISKSKNDSNNQKG HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCC ILM CCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11557893 [H]