Definition Orientia tsutsugamushi Boryong, complete genome.
Accession NC_009488
Length 2,127,051

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The map label for this gene is rhp2

Identifier: 148284840

GI number: 148284840

Start: 1522052

End: 1524043

Strand: Direct

Name: rhp2

Synonym: OTBS_1559

Alternate gene names: NA

Gene position: 1522052-1524043 (Clockwise)

Preceding gene: 148284839

Following gene: 148284843

Centisome position: 71.56

GC content: 28.56

Gene sequence:

>1992_bases
ATGAAGGTTCTGATGTACAAGAAAGAAATTACAGAAAGTATATTAGCTAAGCAACTTTTTGAATCTTTAGCTCTGGTAGG
GCTATCAAAAACTACAGATGAAACTATTTTATCTTTAAGTCAAAGTCTTGCTAAAACATTAAATAGTATTTCTAAAAGTT
TTTCTACATCTAGTCTAGAAGAATACCAAAAATGTTTTTCTAATTTAAATGATCATGATTTACACAAAGTATTGAAAGTA
CTAAAAGATACGTTTGCAGAAGATGAGTATAAAGAGTTAAGAAATATTATTGAGTTACCACTTTTAGATAGACTAACTAC
AAAATTTAAAATAGAACGTGAAAAAGAATTAAGCATTCAACAAGCACCAAATTTTAACAATAGTAGTATTGAGGAACTGC
TGCGTGATAAAAATGTTTCTAAACAGAGTGAATTTTTTCAAACAGGAGATAAGCAAGATGGTGTCTCTGCAGGATATGTT
GCTAATGAAAAGTTAAGTAATAATACTTTTCTTCTTAAAAAATTTTATAAAAACAATGATAGTGTTTTAGCTATAATGGA
TCCAGCAGAGAGGCAAAAAGCTCAGAATGATGTAAGAGATGCTGTACAAGAATTGCTAACTTCTTCTATGTACAAGTTAT
TATTATATGGACGTGCTCCAAAAGAAGAATTAGTAACACCAGATGAAGTTAATTCAGATTTGCTGTATATAAGATCTAAA
TTTTTTGAGAATGCAGTACCACTTTCAGAATTTTCTGGATCAAAAAATTCTATTCATATTAAAGCAGATGCAAAAAACCT
ACAAGGATTAGAAGGATTTGAGAAAATAATTGCATCTTGTCATATTTTAGGTGAAGCTGATTATCATCCAGGAAATTTAA
TGGTACAAGATGGTAAAACTGTTGTTAAAATAGATCACGGTAGATCTATGATGCAGTTTCATAAAGATTTTGAAAGTATG
GTTAAGTCAACGTATAACATTTTTAACCACAATCAAATAGGTTACAATTCAGCGATTGAAGCAGGCAACCTATCGTTTAG
TATTGAAAAATATAACGCTGCATTAAACCAAATGCTTGCCCAACTTGATGAATACCAAATAGATACTGTAGTAGAAAAAA
AAACGTCTGAGCTACAAAAAGTTGGATTTAATCCAAAAGGATTAATGGCTAAGGTTAGGTTTGATGATAAAACGTTTATG
CATACTACCATTAATAATTATCAAGATTTTACAGCATTTTACAAAGATAATGTAAAAGAAAATCTTCAGAATATGAGAAG
AATAGCACAAACAACTGACATAATAAGTAAATTTAGTAATGTATCACCTGAATTTAAAAATGGTAGATGGTTAAAGGATT
TTGCTATTTCTGATATTAAAGAGCCAGTTATATATGCATCCTTTCATAATATCAAAATTGAAGGGAAAAGTGCTTTAGAA
TGGGCTATTTCAAATAAGTATCATGCTGTAGAAAATGTTATTAAAGTAGAAAAAGTTCTAAAAGGTATTGAAGATGAGTT
ATTTCCTTTAGTCCAAAGATTGCAAGATACCCCAATGAAAAAATTAACCTTAAAAGAGGTAAAGCAGTTTTATGACTCAG
TGTTAACCACCTTTGAACAAAAACAATATTTAACTCAACAAGAAGTTAAGGATATACAAGAATGCTTAGACTATAAAAAA
CACATTAAAAATACTACTGCATTTATAAAATTAAATATAGAATCTATATCAATGGTTGATAAAATGCGTTATAAACTAGC
AACATTTTGCAATATACTATCTTTGCCTAGTAAAGCAAAATATTTTATGGATAGAATCACTCCTGAAAGTTTAAATATAA
TACAACAGCTAAAAAAAGACATTTCAAATAGCTCAGGATTTAAAAAAGTTTTGTTAAAATCTAGCACAAATTACAAGTCA
AATACTCACAGCACATACTCAATATCCAAATCTAAAAATGATAGCAATAATCAAAAGGGTATACTCATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATCAGTTTAGAAAAAATACTAATGGCTGCTCTATATTCAACTTAAGCTTGTAACTTTTTTATACACATGTATTATTAA
TAATTAAGGTTATTCTATTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTTTAGATTTATTACCGTTGAATAGACCTCGTTCGAAACTGGTTAAGGTAGATCAAAATTATAAATGCCAGAGATCAAA
TTAAATCTATATGAGTAGAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 663; Mature: 663

Protein sequence:

>663_residues
MKVLMYKKEITESILAKQLFESLALVGLSKTTDETILSLSQSLAKTLNSISKSFSTSSLEEYQKCFSNLNDHDLHKVLKV
LKDTFAEDEYKELRNIIELPLLDRLTTKFKIEREKELSIQQAPNFNNSSIEELLRDKNVSKQSEFFQTGDKQDGVSAGYV
ANEKLSNNTFLLKKFYKNNDSVLAIMDPAERQKAQNDVRDAVQELLTSSMYKLLLYGRAPKEELVTPDEVNSDLLYIRSK
FFENAVPLSEFSGSKNSIHIKADAKNLQGLEGFEKIIASCHILGEADYHPGNLMVQDGKTVVKIDHGRSMMQFHKDFESM
VKSTYNIFNHNQIGYNSAIEAGNLSFSIEKYNAALNQMLAQLDEYQIDTVVEKKTSELQKVGFNPKGLMAKVRFDDKTFM
HTTINNYQDFTAFYKDNVKENLQNMRRIAQTTDIISKFSNVSPEFKNGRWLKDFAISDIKEPVIYASFHNIKIEGKSALE
WAISNKYHAVENVIKVEKVLKGIEDELFPLVQRLQDTPMKKLTLKEVKQFYDSVLTTFEQKQYLTQQEVKDIQECLDYKK
HIKNTTAFIKLNIESISMVDKMRYKLATFCNILSLPSKAKYFMDRITPESLNIIQQLKKDISNSSGFKKVLLKSSTNYKS
NTHSTYSISKSKNDSNNQKGILM

Sequences:

>Translated_663_residues
MKVLMYKKEITESILAKQLFESLALVGLSKTTDETILSLSQSLAKTLNSISKSFSTSSLEEYQKCFSNLNDHDLHKVLKV
LKDTFAEDEYKELRNIIELPLLDRLTTKFKIEREKELSIQQAPNFNNSSIEELLRDKNVSKQSEFFQTGDKQDGVSAGYV
ANEKLSNNTFLLKKFYKNNDSVLAIMDPAERQKAQNDVRDAVQELLTSSMYKLLLYGRAPKEELVTPDEVNSDLLYIRSK
FFENAVPLSEFSGSKNSIHIKADAKNLQGLEGFEKIIASCHILGEADYHPGNLMVQDGKTVVKIDHGRSMMQFHKDFESM
VKSTYNIFNHNQIGYNSAIEAGNLSFSIEKYNAALNQMLAQLDEYQIDTVVEKKTSELQKVGFNPKGLMAKVRFDDKTFM
HTTINNYQDFTAFYKDNVKENLQNMRRIAQTTDIISKFSNVSPEFKNGRWLKDFAISDIKEPVIYASFHNIKIEGKSALE
WAISNKYHAVENVIKVEKVLKGIEDELFPLVQRLQDTPMKKLTLKEVKQFYDSVLTTFEQKQYLTQQEVKDIQECLDYKK
HIKNTTAFIKLNIESISMVDKMRYKLATFCNILSLPSKAKYFMDRITPESLNIIQQLKKDISNSSGFKKVLLKSSTNYKS
NTHSTYSISKSKNDSNNQKGILM
>Mature_663_residues
MKVLMYKKEITESILAKQLFESLALVGLSKTTDETILSLSQSLAKTLNSISKSFSTSSLEEYQKCFSNLNDHDLHKVLKV
LKDTFAEDEYKELRNIIELPLLDRLTTKFKIEREKELSIQQAPNFNNSSIEELLRDKNVSKQSEFFQTGDKQDGVSAGYV
ANEKLSNNTFLLKKFYKNNDSVLAIMDPAERQKAQNDVRDAVQELLTSSMYKLLLYGRAPKEELVTPDEVNSDLLYIRSK
FFENAVPLSEFSGSKNSIHIKADAKNLQGLEGFEKIIASCHILGEADYHPGNLMVQDGKTVVKIDHGRSMMQFHKDFESM
VKSTYNIFNHNQIGYNSAIEAGNLSFSIEKYNAALNQMLAQLDEYQIDTVVEKKTSELQKVGFNPKGLMAKVRFDDKTFM
HTTINNYQDFTAFYKDNVKENLQNMRRIAQTTDIISKFSNVSPEFKNGRWLKDFAISDIKEPVIYASFHNIKIEGKSALE
WAISNKYHAVENVIKVEKVLKGIEDELFPLVQRLQDTPMKKLTLKEVKQFYDSVLTTFEQKQYLTQQEVKDIQECLDYKK
HIKNTTAFIKLNIESISMVDKMRYKLATFCNILSLPSKAKYFMDRITPESLNIIQQLKKDISNSSGFKKVLLKSSTNYKS
NTHSTYSISKSKNDSNNQKGILM

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76051; Mature: 76051

Theoretical pI: Translated: 8.92; Mature: 8.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKVLMYKKEITESILAKQLFESLALVGLSKTTDETILSLSQSLAKTLNSISKSFSTSSLE
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
EYQKCFSNLNDHDLHKVLKVLKDTFAEDEYKELRNIIELPLLDRLTTKFKIEREKELSIQ
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHEECHHHHCCHH
QAPNFNNSSIEELLRDKNVSKQSEFFQTGDKQDGVSAGYVANEKLSNNTFLLKKFYKNND
CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHCCCC
SVLAIMDPAERQKAQNDVRDAVQELLTSSMYKLLLYGRAPKEELVTPDEVNSDLLYIRSK
CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH
FFENAVPLSEFSGSKNSIHIKADAKNLQGLEGFEKIIASCHILGEADYHPGNLMVQDGKT
HHHCCCCHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCE
VVKIDHGRSMMQFHKDFESMVKSTYNIFNHNQIGYNSAIEAGNLSFSIEKYNAALNQMLA
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
QLDEYQIDTVVEKKTSELQKVGFNPKGLMAKVRFDDKTFMHTTINNYQDFTAFYKDNVKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
NLQNMRRIAQTTDIISKFSNVSPEFKNGRWLKDFAISDIKEPVIYASFHNIKIEGKSALE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEECCCHHHH
WAISNKYHAVENVIKVEKVLKGIEDELFPLVQRLQDTPMKKLTLKEVKQFYDSVLTTFEQ
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KQYLTQQEVKDIQECLDYKKHIKNTTAFIKLNIESISMVDKMRYKLATFCNILSLPSKAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
YFMDRITPESLNIIQQLKKDISNSSGFKKVLLKSSTNYKSNTHSTYSISKSKNDSNNQKG
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCC
ILM
CCC
>Mature Secondary Structure
MKVLMYKKEITESILAKQLFESLALVGLSKTTDETILSLSQSLAKTLNSISKSFSTSSLE
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
EYQKCFSNLNDHDLHKVLKVLKDTFAEDEYKELRNIIELPLLDRLTTKFKIEREKELSIQ
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHEECHHHHCCHH
QAPNFNNSSIEELLRDKNVSKQSEFFQTGDKQDGVSAGYVANEKLSNNTFLLKKFYKNND
CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHCCCC
SVLAIMDPAERQKAQNDVRDAVQELLTSSMYKLLLYGRAPKEELVTPDEVNSDLLYIRSK
CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH
FFENAVPLSEFSGSKNSIHIKADAKNLQGLEGFEKIIASCHILGEADYHPGNLMVQDGKT
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VVKIDHGRSMMQFHKDFESMVKSTYNIFNHNQIGYNSAIEAGNLSFSIEKYNAALNQMLA
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
QLDEYQIDTVVEKKTSELQKVGFNPKGLMAKVRFDDKTFMHTTINNYQDFTAFYKDNVKE
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YFMDRITPESLNIIQQLKKDISNSSGFKKVLLKSSTNYKSNTHSTYSISKSKNDSNNQKG
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCC
ILM
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11557893 [H]