The gene/protein map for NC_009488 is currently unavailable.
Definition Orientia tsutsugamushi Boryong, complete genome.
Accession NC_009488
Length 2,127,051

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 148284069

Identifier: 148284069

GI number: 148284069

Start: 141101

End: 143929

Strand: Direct

Name: 148284069

Synonym: OTBS_0148

Alternate gene names: NA

Gene position: 141101-143929 (Clockwise)

Preceding gene: 148284068

Following gene: 148284077

Centisome position: 6.63

GC content: 27.11

Gene sequence:

>2829_bases
ATGAGTATATACTATGTTAAGCCAAATGATGATTTTCTATTTTTACTAGCTAATTTTTTATTAAAAAATTATACATCATC
ACTTGATAAGGTTAAGGTTATATTACCTTATAGTCAACAATGTCAGGAACTCAAAAAAATAATAATGCTTACAGCTCAAA
AAGAAGCTATGTTATTACCAGATGTGTTAACATTAAAACAATTTATTACTTCTTTTATTGCTGCTAGTAACTACTCGTTA
TCTATTTGTTGCCAGTTAAGTTCTTATGAACAAGAAGCAGTACTTTCTAAAATTATTCAACAACATAATCAACAACAGAT
TCGTTTAGGTGATGCTCTTAAGTTAAGTGGAAAATTATTACATCTTTTTCAACAACTAGAAAGTCAACAAATCAATCTAA
CTCAATTAAAAGATTTTGTTGATCAAATGGATAGTTCAGAATACTGGCAAAATACATATAAATTCTTAAGCTTGGCATAT
ATTGAGTGGAGTAAATTATATAGTAACAGCAGTTATGATAGTAAAAGCGATATTTTTTCACAACTACAAGATTTATTAAA
ATCTAACCTAAGTTCGAATATAGTTATCTTAGCAGGGTTATTACCAACTAGTAAGCTAGAGCTGATAATTTTTAAGGAAG
TACTTTCTTTGGAGTTTGGAAATGTAATTTTTCCACCAATTTATTTAGAAGAATTGTGTTATAGTGTAAAAAATTCAAGT
AATACTTTATATGATTTTCAGTATTTTGTTAAATCATGCAATATTTCACTAGATGATGTAACATATCTAGCTAAAGAAAT
AGCATTACCAACAAAAAATAAACCTATACAATTATCAGAGTTTTTAGATTTGCCAAAGTTAAACTTAGTAGCATCAGATA
CTAAGTTTAACAGTGATATTCCTATTGATATTGAATATGTTAAGGTTAACAGCCAATATGATGAAGCTAAGTTAGTTGCA
GCTATGATTCATAACTATTTAATCAAAGCTAATGCTAAACATAATAAAATTTTAGTTGTTACTACTACTTCAAGCTTTAC
TACTTTGTTGACAATGCACTTAAGCAAGTATCAGATAAACTATGCTAATCTTACAAATGTTGATATTAAGCAATTATTAG
AAATAAATTTTATACTAGTATTAGCAGATTTAGTATCTAGCAATTTTAGCATTAGTAAATTTATTAATTTAATTAAAACT
CCATTACTTACTAGTAGTAGCAGTAATAAATTTGAAAATCTGATTTTAAAAAATAAGTTTCAACAATCAGAACTTAAACA
AATTTTACTTGATTTAACTATTAGTAAAGATGATAGCGAATTGCAAAAATGGGCTACTTTTATTCTTAGCGCTTTAGATA
ATTTATGGATATATTATAATTGTAATACTATTTTGTGTGATCAGCTGATTATAGATTTATTGCAAGCAGCTGAAAAATTG
ACAGAAGGAAAAATTTGGCAATTTCAATTCAGTAAAAGAATATCTGATGTTCTAAAAGAAGTTATTCATATTGCTAAGCA
GTTTGGGAATATTGATATTAGAGATTTTAGCAATGTTCTTACAGAATTGGTTACTATGATTAAATTTAACTATGAACATG
ATTATAATGCTAATGTTGTTATTACAGGCGCAGATAGCGCTATATTATTAAGTGCAGATTATATTATTATACCAGAATTT
AATAATGATCATTGGCCTGGTAACTCAATTCAAAATCCATGGCTTAACCAAGCTATATACAGTAAGTTAGGATTAATTGA
ACGTAATGCTCATTATGATAGAAAACAATATATATTATATACTATATTACAGAAAGCTCATGTTAGTTTGACCAATTCTC
AATTTACTGCATCAGGTAAGACTAACGATTCTCAATTTATCTTAAAATTACAACTTCTTGCTTTTAAAAATCCTTTAATT
CGCATTAGAGTAAATGACTTAAAGCTTCAACATAATCAAAATTATACTTCTGTGGATAATAAATCTACAACATTCCAAAT
ATCGTCTGGCATGTTACTGTCTAGTGCTGATATAGTCAAAACGATATCTGCAACAGATATTGAAATGCTAATTAGAAATC
CTTATGGATTTTACGCTAAAAATATATTAAGACTAAAACCAGTAATACTAAATGATGATCAATTAACACAAGCGAAATTT
GGCGACTTTATTCATACTGTAATTCATAGGTATACTATTTGCTACAAGGATATGGAGGAAAGTAAATTAATAAACTATTT
TATTGATATAGGTAAACAATTAATAGATTGTTACAACTGTAGTTCATTTGCTAAAATGGTATGGCTAACTAAGCTGCATC
AATTAGCTGAGGAATTTGTGAGATTTGATATGGAGAGGAGAAATGAAGGATTTAAGATTTTTTCGGAACAGTTAGGACAA
ATTTCACTAAATATTAATAATCATGCGCTAAATATTATGGCTATAGCAGATAGAATAGAATATTCACAAAATGGTGAATG
CTACATTATCGATTTTAAAACTGGTACAGTTCCTAATAAAAAAGAAGTACAGCATGGAATAGCAACTCAATTAATTATTG
AAAGTATTATACTATATAAAGGTGGGTTTAAAGACTTACCTACAATTATGCCTAATAAAATAATTTATATTAAAATTACT
TCTACTAAGCCATTACTTGAGTTTACAGAAATAACAGTAGATCAAGAAATGTTAGATAAACATGAGTTAGGCTTAGTAGA
GTTACTGCAATATTACATTAAAGACGGAGGAGTATTTTTTCCTTCTCCTGTTGATAAGTTAGCTCCAAAATATAATAACT
ATAAGCATTTAGCACGTTATTTAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATCTACCTACTATTAAGCTTTATTGCAACGAATGCATATATGAAGTTTTATTTAAAAAATTAATTATTGAAAATAATA
TGTTACTTAATATTTAGCAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGTAATTACAAATATTAAACTAATAGTAATACAAGAAGTTAATAATAGCATAAATCAAAAAGATAGCTGTTGTGTATTT
TTCAAATTTTCTAGAGCAGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 942; Mature: 941

Protein sequence:

>942_residues
MSIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTAQKEAMLLPDVLTLKQFITSFIAASNYSL
SICCQLSSYEQEAVLSKIIQQHNQQQIRLGDALKLSGKLLHLFQQLESQQINLTQLKDFVDQMDSSEYWQNTYKFLSLAY
IEWSKLYSNSSYDSKSDIFSQLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELIIFKEVLSLEFGNVIFPPIYLEELCYSVKNSS
NTLYDFQYFVKSCNISLDDVTYLAKEIALPTKNKPIQLSEFLDLPKLNLVASDTKFNSDIPIDIEYVKVNSQYDEAKLVA
AMIHNYLIKANAKHNKILVVTTTSSFTTLLTMHLSKYQINYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKT
PLLTSSSSNKFENLILKNKFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDNLWIYYNCNTILCDQLIIDLLQAAEKL
TEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVVITGADSAILLSADYIIIPEF
NNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILYTILQKAHVSLTNSQFTASGKTNDSQFILKLQLLAFKNPLI
RIRVNDLKLQHNQNYTSVDNKSTTFQISSGMLLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLTQAKF
GDFIHTVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMVWLTKLHQLAEEFVRFDMERRNEGFKIFSEQLGQ
ISLNINNHALNIMAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNKKEVQHGIATQLIIESIILYKGGFKDLPTIMPNKIIYIKIT
STKPLLEFTEITVDQEMLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI

Sequences:

>Translated_942_residues
MSIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTAQKEAMLLPDVLTLKQFITSFIAASNYSL
SICCQLSSYEQEAVLSKIIQQHNQQQIRLGDALKLSGKLLHLFQQLESQQINLTQLKDFVDQMDSSEYWQNTYKFLSLAY
IEWSKLYSNSSYDSKSDIFSQLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELIIFKEVLSLEFGNVIFPPIYLEELCYSVKNSS
NTLYDFQYFVKSCNISLDDVTYLAKEIALPTKNKPIQLSEFLDLPKLNLVASDTKFNSDIPIDIEYVKVNSQYDEAKLVA
AMIHNYLIKANAKHNKILVVTTTSSFTTLLTMHLSKYQINYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKT
PLLTSSSSNKFENLILKNKFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDNLWIYYNCNTILCDQLIIDLLQAAEKL
TEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVVITGADSAILLSADYIIIPEF
NNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILYTILQKAHVSLTNSQFTASGKTNDSQFILKLQLLAFKNPLI
RIRVNDLKLQHNQNYTSVDNKSTTFQISSGMLLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLTQAKF
GDFIHTVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMVWLTKLHQLAEEFVRFDMERRNEGFKIFSEQLGQ
ISLNINNHALNIMAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNKKEVQHGIATQLIIESIILYKGGFKDLPTIMPNKIIYIKIT
STKPLLEFTEITVDQEMLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI
>Mature_941_residues
SIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTAQKEAMLLPDVLTLKQFITSFIAASNYSLS
ICCQLSSYEQEAVLSKIIQQHNQQQIRLGDALKLSGKLLHLFQQLESQQINLTQLKDFVDQMDSSEYWQNTYKFLSLAYI
EWSKLYSNSSYDSKSDIFSQLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELIIFKEVLSLEFGNVIFPPIYLEELCYSVKNSSN
TLYDFQYFVKSCNISLDDVTYLAKEIALPTKNKPIQLSEFLDLPKLNLVASDTKFNSDIPIDIEYVKVNSQYDEAKLVAA
MIHNYLIKANAKHNKILVVTTTSSFTTLLTMHLSKYQINYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKTP
LLTSSSSNKFENLILKNKFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDNLWIYYNCNTILCDQLIIDLLQAAEKLT
EGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVVITGADSAILLSADYIIIPEFN
NDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILYTILQKAHVSLTNSQFTASGKTNDSQFILKLQLLAFKNPLIR
IRVNDLKLQHNQNYTSVDNKSTTFQISSGMLLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLTQAKFG
DFIHTVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMVWLTKLHQLAEEFVRFDMERRNEGFKIFSEQLGQI
SLNINNHALNIMAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNKKEVQHGIATQLIIESIILYKGGFKDLPTIMPNKIIYIKITS
TKPLLEFTEITVDQEMLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI

Specific function: Unknown

COG id: COG2887

COG function: function code L; RecB family exonuclease

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011335
- InterPro:   IPR022436 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 108361; Mature: 108229

Theoretical pI: Translated: 6.79; Mature: 6.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTAQKEAMLLP
CEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCH
DVLTLKQFITSFIAASNYSLSICCQLSSYEQEAVLSKIIQQHNQQQIRLGDALKLSGKLL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHH
HLFQQLESQQINLTQLKDFVDQMDSSEYWQNTYKFLSLAYIEWSKLYSNSSYDSKSDIFS
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
QLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELIIFKEVLSLEFGNVIFPPIYLEELCYSVKNSS
HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHCCC
NTLYDFQYFVKSCNISLDDVTYLAKEIALPTKNKPIQLSEFLDLPKLNLVASDTKFNSDI
CCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCC
PIDIEYVKVNSQYDEAKLVAAMIHNYLIKANAKHNKILVVTTTSSFTTLLTMHLSKYQIN
CEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHEEEE
YANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKTPLLTSSSSNKFENLILKNKF
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC
QQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDNLWIYYNCNTILCDQLIIDLLQAAEKL
CHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVV
CCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEE
ITGADSAILLSADYIIIPEFNNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILY
EECCCCEEEEEECEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH
TILQKAHVSLTNSQFTASGKTNDSQFILKLQLLAFKNPLIRIRVNDLKLQHNQNYTSVDN
HHHHHHHHEECCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCC
KSTTFQISSGMLLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLTQAKF
CCEEEEEECCCEEECCHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHEECCEEECCCCHHHHHH
GDFIHTVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMVWLTKLHQLAEEFV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RFDMERRNEGFKIFSEQLGQISLNINNHALNIMAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNK
HHHHHHCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCH
KEVQHGIATQLIIESIILYKGGFKDLPTIMPNKIIYIKITSTKPLLEFTEITVDQEMLDK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHH
HELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI
HCCCHHHHHHHHHHCCCEECCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTAQKEAMLLP
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCH
DVLTLKQFITSFIAASNYSLSICCQLSSYEQEAVLSKIIQQHNQQQIRLGDALKLSGKLL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHH
HLFQQLESQQINLTQLKDFVDQMDSSEYWQNTYKFLSLAYIEWSKLYSNSSYDSKSDIFS
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
QLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELIIFKEVLSLEFGNVIFPPIYLEELCYSVKNSS
HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHCCC
NTLYDFQYFVKSCNISLDDVTYLAKEIALPTKNKPIQLSEFLDLPKLNLVASDTKFNSDI
CCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCC
PIDIEYVKVNSQYDEAKLVAAMIHNYLIKANAKHNKILVVTTTSSFTTLLTMHLSKYQIN
CEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHEEEE
YANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKTPLLTSSSSNKFENLILKNKF
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC
QQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDNLWIYYNCNTILCDQLIIDLLQAAEKL
CHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVV
CCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEE
ITGADSAILLSADYIIIPEFNNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILY
EECCCCEEEEEECEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH
TILQKAHVSLTNSQFTASGKTNDSQFILKLQLLAFKNPLIRIRVNDLKLQHNQNYTSVDN
HHHHHHHHEECCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCC
KSTTFQISSGMLLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLTQAKF
CCEEEEEECCCEEECCHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHEECCEEECCCCHHHHHH
GDFIHTVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMVWLTKLHQLAEEFV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RFDMERRNEGFKIFSEQLGQISLNINNHALNIMAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNK
HHHHHHCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCH
KEVQHGIATQLIIESIILYKGGFKDLPTIMPNKIIYIKITSTKPLLEFTEITVDQEMLDK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHH
HELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI
HCCCHHHHHHHHHHCCCEECCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA