| Definition | Orientia tsutsugamushi Boryong, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009488 |
| Length | 2,127,051 |
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The map label for this gene is 148284069
Identifier: 148284069
GI number: 148284069
Start: 141101
End: 143929
Strand: Direct
Name: 148284069
Synonym: OTBS_0148
Alternate gene names: NA
Gene position: 141101-143929 (Clockwise)
Preceding gene: 148284068
Following gene: 148284077
Centisome position: 6.63
GC content: 27.11
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TAATCTACCTACTATTAAGCTTTATTGCAACGAATGCATATATGAAGTTTTATTTAAAAAATTAATTATTGAAAATAATA TGTTACTTAATATTTAGCAC
Downstream 100 bases:
>100_bases ATGTAATTACAAATATTAAACTAATAGTAATACAAGAAGTTAATAATAGCATAAATCAAAAAGATAGCTGTTGTGTATTT TTCAAATTTTCTAGAGCAGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 942; Mature: 941
Protein sequence:
>942_residues MSIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTAQKEAMLLPDVLTLKQFITSFIAASNYSL SICCQLSSYEQEAVLSKIIQQHNQQQIRLGDALKLSGKLLHLFQQLESQQINLTQLKDFVDQMDSSEYWQNTYKFLSLAY IEWSKLYSNSSYDSKSDIFSQLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELIIFKEVLSLEFGNVIFPPIYLEELCYSVKNSS NTLYDFQYFVKSCNISLDDVTYLAKEIALPTKNKPIQLSEFLDLPKLNLVASDTKFNSDIPIDIEYVKVNSQYDEAKLVA AMIHNYLIKANAKHNKILVVTTTSSFTTLLTMHLSKYQINYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKT PLLTSSSSNKFENLILKNKFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDNLWIYYNCNTILCDQLIIDLLQAAEKL TEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVVITGADSAILLSADYIIIPEF NNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILYTILQKAHVSLTNSQFTASGKTNDSQFILKLQLLAFKNPLI RIRVNDLKLQHNQNYTSVDNKSTTFQISSGMLLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLTQAKF GDFIHTVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMVWLTKLHQLAEEFVRFDMERRNEGFKIFSEQLGQ ISLNINNHALNIMAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNKKEVQHGIATQLIIESIILYKGGFKDLPTIMPNKIIYIKIT STKPLLEFTEITVDQEMLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI
Sequences:
>Translated_942_residues MSIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTAQKEAMLLPDVLTLKQFITSFIAASNYSL SICCQLSSYEQEAVLSKIIQQHNQQQIRLGDALKLSGKLLHLFQQLESQQINLTQLKDFVDQMDSSEYWQNTYKFLSLAY IEWSKLYSNSSYDSKSDIFSQLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELIIFKEVLSLEFGNVIFPPIYLEELCYSVKNSS NTLYDFQYFVKSCNISLDDVTYLAKEIALPTKNKPIQLSEFLDLPKLNLVASDTKFNSDIPIDIEYVKVNSQYDEAKLVA AMIHNYLIKANAKHNKILVVTTTSSFTTLLTMHLSKYQINYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKT PLLTSSSSNKFENLILKNKFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDNLWIYYNCNTILCDQLIIDLLQAAEKL TEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVVITGADSAILLSADYIIIPEF NNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILYTILQKAHVSLTNSQFTASGKTNDSQFILKLQLLAFKNPLI RIRVNDLKLQHNQNYTSVDNKSTTFQISSGMLLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLTQAKF GDFIHTVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMVWLTKLHQLAEEFVRFDMERRNEGFKIFSEQLGQ ISLNINNHALNIMAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNKKEVQHGIATQLIIESIILYKGGFKDLPTIMPNKIIYIKIT STKPLLEFTEITVDQEMLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI >Mature_941_residues SIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTAQKEAMLLPDVLTLKQFITSFIAASNYSLS ICCQLSSYEQEAVLSKIIQQHNQQQIRLGDALKLSGKLLHLFQQLESQQINLTQLKDFVDQMDSSEYWQNTYKFLSLAYI EWSKLYSNSSYDSKSDIFSQLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELIIFKEVLSLEFGNVIFPPIYLEELCYSVKNSSN TLYDFQYFVKSCNISLDDVTYLAKEIALPTKNKPIQLSEFLDLPKLNLVASDTKFNSDIPIDIEYVKVNSQYDEAKLVAA MIHNYLIKANAKHNKILVVTTTSSFTTLLTMHLSKYQINYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKTP LLTSSSSNKFENLILKNKFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDNLWIYYNCNTILCDQLIIDLLQAAEKLT EGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVVITGADSAILLSADYIIIPEFN NDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILYTILQKAHVSLTNSQFTASGKTNDSQFILKLQLLAFKNPLIR IRVNDLKLQHNQNYTSVDNKSTTFQISSGMLLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLTQAKFG DFIHTVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMVWLTKLHQLAEEFVRFDMERRNEGFKIFSEQLGQI SLNINNHALNIMAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNKKEVQHGIATQLIIESIILYKGGFKDLPTIMPNKIIYIKITS TKPLLEFTEITVDQEMLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI
Specific function: Unknown
COG id: COG2887
COG function: function code L; RecB family exonuclease
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011335 - InterPro: IPR022436 [H]
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 108361; Mature: 108229
Theoretical pI: Translated: 6.79; Mature: 6.79
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTAQKEAMLLP CEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCH DVLTLKQFITSFIAASNYSLSICCQLSSYEQEAVLSKIIQQHNQQQIRLGDALKLSGKLL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHH HLFQQLESQQINLTQLKDFVDQMDSSEYWQNTYKFLSLAYIEWSKLYSNSSYDSKSDIFS HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH QLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELIIFKEVLSLEFGNVIFPPIYLEELCYSVKNSS HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHCCC NTLYDFQYFVKSCNISLDDVTYLAKEIALPTKNKPIQLSEFLDLPKLNLVASDTKFNSDI CCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCC PIDIEYVKVNSQYDEAKLVAAMIHNYLIKANAKHNKILVVTTTSSFTTLLTMHLSKYQIN CEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHEEEE YANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKTPLLTSSSSNKFENLILKNKF ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC QQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDNLWIYYNCNTILCDQLIIDLLQAAEKL CHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH TEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVV CCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEE ITGADSAILLSADYIIIPEFNNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILY EECCCCEEEEEECEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH TILQKAHVSLTNSQFTASGKTNDSQFILKLQLLAFKNPLIRIRVNDLKLQHNQNYTSVDN HHHHHHHHEECCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCC KSTTFQISSGMLLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLTQAKF CCEEEEEECCCEEECCHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHEECCEEECCCCHHHHHH GDFIHTVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMVWLTKLHQLAEEFV HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RFDMERRNEGFKIFSEQLGQISLNINNHALNIMAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNK HHHHHHCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCH KEVQHGIATQLIIESIILYKGGFKDLPTIMPNKIIYIKITSTKPLLEFTEITVDQEMLDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHH HELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI HCCCHHHHHHHHHHCCCEECCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTAQKEAMLLP EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCH DVLTLKQFITSFIAASNYSLSICCQLSSYEQEAVLSKIIQQHNQQQIRLGDALKLSGKLL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHH HLFQQLESQQINLTQLKDFVDQMDSSEYWQNTYKFLSLAYIEWSKLYSNSSYDSKSDIFS HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH QLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELIIFKEVLSLEFGNVIFPPIYLEELCYSVKNSS HHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHCCC NTLYDFQYFVKSCNISLDDVTYLAKEIALPTKNKPIQLSEFLDLPKLNLVASDTKFNSDI CCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCC PIDIEYVKVNSQYDEAKLVAAMIHNYLIKANAKHNKILVVTTTSSFTTLLTMHLSKYQIN CEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHEEEE YANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKTPLLTSSSSNKFENLILKNKF ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC QQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDNLWIYYNCNTILCDQLIIDLLQAAEKL CHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH TEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNANVV CCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEE ITGADSAILLSADYIIIPEFNNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYILY EECCCCEEEEEECEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH TILQKAHVSLTNSQFTASGKTNDSQFILKLQLLAFKNPLIRIRVNDLKLQHNQNYTSVDN HHHHHHHHEECCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCC KSTTFQISSGMLLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLTQAKF CCEEEEEECCCEEECCHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHEECCEEECCCCHHHHHH GDFIHTVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMVWLTKLHQLAEEFV HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RFDMERRNEGFKIFSEQLGQISLNINNHALNIMAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGTVPNK HHHHHHCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCH KEVQHGIATQLIIESIILYKGGFKDLPTIMPNKIIYIKITSTKPLLEFTEITVDQEMLDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHH HELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI HCCCHHHHHHHHHHCCCEECCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA