| Definition | Vibrio cholerae O395 chromosome 2, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_009457 |
| Length | 3,024,069 |
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The map label for this gene is 147673633
Identifier: 147673633
GI number: 147673633
Start: 723871
End: 725472
Strand: Direct
Name: 147673633
Synonym: VC0395_A0701
Alternate gene names: NA
Gene position: 723871-725472 (Clockwise)
Preceding gene: 147673801
Following gene: 147674443
Centisome position: 23.94
GC content: 48.0
Gene sequence:
>1602_bases ATGAATTTAATCGATTTTGCTTCTTCGCCACTCTCTGTTTTACCACCGCTGGTGGCATTGAGTTTGGCTATTGTGACTCG CCGTGTACTCCTTTCTCTTGGCGTGGGGATTTTTTTAGGTGCTTTACTGCTGGCTGATTATTCTATTGGTCAGTCGTTGC AATATATCGCCACACAAGTGGGTAGCGTGTTTGTCAAAGAGGGCGCGATCAATGCTTGGAATATGAGTATTGTCGGCTTT TTACTGTTACTGGGTATGATGACTGCGCTACTGACGTTGTCGGGCGGCACTCGCGCTTTTGCTCAGTGGGCACAAGTCCG GGTGAAAAGTAAACGTGGCTCTAAATTACTGGCGGCATTTTTAGGCGTATTCATTTTTGTTGACGACTATTTTAATAGCC TCGCTGTCGGTTCTATTTCTCGCCCAGTGACCGATCGTTTTTACGTTTCGCGTGCCAAACTCGCTTACATTCTGGATTCC ACTGCTGCGCCTATGTGTGTGGTCATGCCCGCCTCAAGTTGGGGTGCGTATATCATGACCATTATCGGTGGCATTTTAGT TTCGCACGGTATCGAGGAGTATTCCGCATTAGGTGCTTATCTGCGTTTAGTGCCGATGAACTTCTATGCGATCTTTGCGT TGCTGATGGTATTTGCGGTGGTGTGGTTCCAAATGGATATCGGCCAGATGCGCAAGCATGAAATTGCCGCTTCTCAAGGG CGTGGTTTTGATGAAGACCCGAGTACAGATACACAAGAGGCCCACGAACTCAATGAAGAGCTTGATATTCGTGAAAGTGA ACGCGGTACAGTACTCGATCTCGTGTTGCCGATTGTGTTTTTAGTCGTTGCGACCATTGGTGCGATGATTTGGACTGGCG CAAGTGCATTAGCGGAAAGTGGTCAGTCGTTTGATATTTTTGGGGCGTTTGAAAATACCAATGTTGGTACTTCATTGGTA TATGGTGGATTAGTTGGTCTGGCGATGGCTTTTGTGACCGTGTTGCGCCAAAAACTACCGACGGCTGAAATCGCAAAAAC CTTATGGATTGGTGCGAAATCGATGTTTGGTGCAATTTTGATCCTGATTTTTGCGTGGACCATAGGTTCTGTCATCGGTG ACATGAAGACCGGTGCTTATCTCTCTTCTCTCGTACAAGGCAATATTGACCCACATTGGCTTCCGGTCATTCTGTTTGTG CTGTCTGGTGCGATGGCGTTTTCTACCGGTACATCATGGGGCACTTTTGGCATCATGCTGCCGATTGCGGGTGACATGGC TGGCGCTACAGATATTGCACTTATGCTGCCGATGCTCGGTGCGGTACTTGCCGGTTCCGTATTTGGCGATCACTGTTCGC CGATTTCAGATACCACGATTCTCTCTTCGACGGGAGCACGTTGTCATCATATTGACCATGTTGCGACTCAACTGCCTTAC GCATTGGCGGTTGCGTTAGTGTCAGCGATTGGTTACGTGGTGCTGGGAATTTTTGCTTCACTCGGGCTGGCTTTAGCTGC CGCATCCGTGAGTTTTGTGGTGGTTTGCTTAATTTTTGCAGCACTATCAAAAGCCAAAGTGAGCAAACAGGTGTCTGCCT AA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCTTCCCTTTCGCTTAGTTCAACATAAATTAAGTTGACATGATGTCGCTTGATTTGTCTGCAGTAGATCTCTAACCATTT TTTACTGGTTTAGGAAGATC
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTGCATCGCTATAGAGATAAGAGGCCAGTCGGCCTCTTTTTTTATCGCTAACCTTAATTGCAGCTTTGAGTGGTGGTGA TGAGCTCTTAAAGCCGTCAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 533; Mature: 533
Protein sequence:
>533_residues MNLIDFASSPLSVLPPLVALSLAIVTRRVLLSLGVGIFLGALLLADYSIGQSLQYIATQVGSVFVKEGAINAWNMSIVGF LLLLGMMTALLTLSGGTRAFAQWAQVRVKSKRGSKLLAAFLGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDS TAAPMCVVMPASSWGAYIMTIIGGILVSHGIEEYSALGAYLRLVPMNFYAIFALLMVFAVVWFQMDIGQMRKHEIAASQG RGFDEDPSTDTQEAHELNEELDIRESERGTVLDLVLPIVFLVVATIGAMIWTGASALAESGQSFDIFGAFENTNVGTSLV YGGLVGLAMAFVTVLRQKLPTAEIAKTLWIGAKSMFGAILILIFAWTIGSVIGDMKTGAYLSSLVQGNIDPHWLPVILFV LSGAMAFSTGTSWGTFGIMLPIAGDMAGATDIALMLPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCHHIDHVATQLPY ALAVALVSAIGYVVLGIFASLGLALAAASVSFVVVCLIFAALSKAKVSKQVSA
Sequences:
>Translated_533_residues MNLIDFASSPLSVLPPLVALSLAIVTRRVLLSLGVGIFLGALLLADYSIGQSLQYIATQVGSVFVKEGAINAWNMSIVGF LLLLGMMTALLTLSGGTRAFAQWAQVRVKSKRGSKLLAAFLGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDS TAAPMCVVMPASSWGAYIMTIIGGILVSHGIEEYSALGAYLRLVPMNFYAIFALLMVFAVVWFQMDIGQMRKHEIAASQG RGFDEDPSTDTQEAHELNEELDIRESERGTVLDLVLPIVFLVVATIGAMIWTGASALAESGQSFDIFGAFENTNVGTSLV YGGLVGLAMAFVTVLRQKLPTAEIAKTLWIGAKSMFGAILILIFAWTIGSVIGDMKTGAYLSSLVQGNIDPHWLPVILFV LSGAMAFSTGTSWGTFGIMLPIAGDMAGATDIALMLPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCHHIDHVATQLPY ALAVALVSAIGYVVLGIFASLGLALAAASVSFVVVCLIFAALSKAKVSKQVSA >Mature_533_residues MNLIDFASSPLSVLPPLVALSLAIVTRRVLLSLGVGIFLGALLLADYSIGQSLQYIATQVGSVFVKEGAINAWNMSIVGF LLLLGMMTALLTLSGGTRAFAQWAQVRVKSKRGSKLLAAFLGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDS TAAPMCVVMPASSWGAYIMTIIGGILVSHGIEEYSALGAYLRLVPMNFYAIFALLMVFAVVWFQMDIGQMRKHEIAASQG RGFDEDPSTDTQEAHELNEELDIRESERGTVLDLVLPIVFLVVATIGAMIWTGASALAESGQSFDIFGAFENTNVGTSLV YGGLVGLAMAFVTVLRQKLPTAEIAKTLWIGAKSMFGAILILIFAWTIGSVIGDMKTGAYLSSLVQGNIDPHWLPVILFV LSGAMAFSTGTSWGTFGIMLPIAGDMAGATDIALMLPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCHHIDHVATQLPY ALAVALVSAIGYVVLGIFASLGLALAAASVSFVVVCLIFAALSKAKVSKQVSA
Specific function: Unknown
COG id: COG1757
COG function: function code C; Na+/H+ antiporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR018461 [H]
Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56412; Mature: 56412
Theoretical pI: Translated: 6.09; Mature: 6.09
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 3.8 %Met (Translated Protein) 4.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 3.8 %Met (Mature Protein) 4.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNLIDFASSPLSVLPPLVALSLAIVTRRVLLSLGVGIFLGALLLADYSIGQSLQYIATQV CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH GSVFVKEGAINAWNMSIVGFLLLLGMMTALLTLSGGTRAFAQWAQVRVKSKRGSKLLAAF HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH LGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDSTAAPMCVVMPASSWGAYIMT HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH IIGGILVSHGIEEYSALGAYLRLVPMNFYAIFALLMVFAVVWFQMDIGQMRKHEIAASQG HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC RGFDEDPSTDTQEAHELNEELDIRESERGTVLDLVLPIVFLVVATIGAMIWTGASALAES CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHC GQSFDIFGAFENTNVGTSLVYGGLVGLAMAFVTVLRQKLPTAEIAKTLWIGAKSMFGAIL CCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILIFAWTIGSVIGDMKTGAYLSSLVQGNIDPHWLPVILFVLSGAMAFSTGTSWGTFGIML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCHHHEEE PIAGDMAGATDIALMLPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCHHIDHVATQLPY ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH ALAVALVSAIGYVVLGIFASLGLALAAASVSFVVVCLIFAALSKAKVSKQVSA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MNLIDFASSPLSVLPPLVALSLAIVTRRVLLSLGVGIFLGALLLADYSIGQSLQYIATQV CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH GSVFVKEGAINAWNMSIVGFLLLLGMMTALLTLSGGTRAFAQWAQVRVKSKRGSKLLAAF HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH LGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDSTAAPMCVVMPASSWGAYIMT HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH IIGGILVSHGIEEYSALGAYLRLVPMNFYAIFALLMVFAVVWFQMDIGQMRKHEIAASQG HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC RGFDEDPSTDTQEAHELNEELDIRESERGTVLDLVLPIVFLVVATIGAMIWTGASALAES CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHC GQSFDIFGAFENTNVGTSLVYGGLVGLAMAFVTVLRQKLPTAEIAKTLWIGAKSMFGAIL CCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILIFAWTIGSVIGDMKTGAYLSSLVQGNIDPHWLPVILFVLSGAMAFSTGTSWGTFGIML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCHHHEEE PIAGDMAGATDIALMLPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCHHIDHVATQLPY ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH ALAVALVSAIGYVVLGIFASLGLALAAASVSFVVVCLIFAALSKAKVSKQVSA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800 [H]