Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 146302654

Identifier: 146302654

GI number: 146302654

Start: 5946657

End: 5949026

Strand: Direct

Name: 146302654

Synonym: Fjoh_4927

Alternate gene names: NA

Gene position: 5946657-5949026 (Clockwise)

Preceding gene: 146302651

Following gene: 146302656

Centisome position: 97.54

GC content: 30.97

Gene sequence:

>2370_bases
ATGGATCGACACGTACCTAAAGAAAGTCCTTTCGAAACGATAATCTCATTTCATAAACTAATTGAATCTTTTGAAGAAAT
TGCTTTATCTGATGTTGATTACCGATCTAACTATGCCAAAGCCATTTTAAAAGAAATTGAAGCTTTTCCGGAATTTAGAA
CCGGAATTCGTGATCTTAATTCTATTCGAAACAATGAAGCTTTAATTAAAAATATAGCTGCTGATTTATTTCCAACGGCT
CTGACTCACAACGAAATAAAAGCAATTACAATTCCGTTTCAAAACATCTCGTTTAATTATACAGAACGTTTCAAAAAAAT
TCTGCGTAATGCGGGAGATGAATTTTATATGGAAATTCGTGATTTTGATGATCATCAGTTTTATGTAAACAACTGTTGTT
TGATTTTGGCATATCATTACAATCAAAATGTAGATTTCAGTAAACCTTTTTTCTATGATATTCCTGATGAAGAAGGTGTA
GAAAGACATTATAGAATCATGTACAATGCTGATTTCATGGAAATTATTCCTACCGAAAAATCAGTAGAGCTTTCACAAGA
TGACATCGATCAATTAATAGACAATTACAATGATATTGATTTATGGAAATCTAAATTTCCTCCGGGAAGCTGGATTTTAA
AAGGTTTTGGAATTGTTTCTTTATTTGATGCTACTACAGAAAGTGCTATTTCGACTTTAAAAAGTAATTTATTAAAACCA
GATAATACAAGAGTAACTTCTACAGATATTGTAGAAAATATCTTTAGATCTATTTTTAAAATTCCAAGTTTAAAAGTGGG
TTTTATAATTTACAATCCTGAAGAAGAAAAGTTTATCAGACCAATGAAGTTTGATAATCATATGGAAAGTTATCTTTTGA
AATCAGATCAGGAAATGGATTGCAAAAATGCTTTCTTTGGCTGTTCATTCGAGAATCTTCTGGATAACAAAGAACCTTTT
GTAATTTCGAACGTTAAAAAATTCATTGAAGAATCCAGTAATAAAAAACTTGGCGAGCATTTGCTTAAACAAGGTATTCA
AAGCTGTGTTTTTGCTCCGGTAATTAAAGACGATCATTTATTAGGAATTGTCGAATTGGTTTCTGAAAACCCTAGAGATT
TAAACAGTGTAAATGCAATAAAATTAGATTTGGTTTTACCGTATTTAACTGATACCATCGATCGTTACAATACTGATATG
CAGCATCAGATTGAAGCGATTATTCAGCGTGAGTACACAACAATTCACCCAAGTGTGTATTGGAAATTTAGAAAAGAGTC
ACAAAATTACTTTCAAAATATAAGCCATACTAAAGATTACATTTTTAAGGAAATCGTATTTAAAAATGTATTCCCTTTAT
ATGGTCAAATAGATATTAAAGGTTCTTCTGAACATAGAAATGAAACGGTTAAAATTGATTTAAAAAATCAATTGACTGCC
TTGTTGGAAATTTTCGACAATCAGGACCCAAATTCTAATCTGGTACTTTTAGAACAAAGAAAATTTGAATTAGAATCGCT
TAGAAGTGAATTAGATTTTCCGCTGAAAGCAGATATGGAACAACATATTCAGCGTTATATTGAAGAAGAAATTCACCCGA
TCCTGAAAAACACAAAAAGCAATGCTAAAAACGAAAAGTTAGAGGAATTGTATTTTGAAAGTCTGGATGAAAAAACGGGA
ATGTTCTATCAGGAAAGAAAGAAATTTGACAATGCAATGTCAATTATCAATAAAAAACTGGCTTCGGTTTTAGATAAAAA
ACAAGTTGAAGCACAGCAGATTTATCCGCATTATTACGAGCGTTTTAAAACTGATGGTGTTGAACATAATTTATACATTG
GGGCATCGATTTCGCCAACAAAACCATTTGACATTATGTACCTGCATAATCTGCGTTTATGGCAGTTACAGACTTTATGC
GAAATGGAATTAGAACATCATCAGCTTAAAGAATCGCTTCCGTATGAATTGGATGTTACGTCGCTGATTTTAGTTTTTAG
TTCTCCGCTTTCTATTCGTTTTAGAATGGATGAAAAACGTTTTGATGTTGACGGAACGTATAATGCCAGATATGAAGTTG
TAAAAAAACGTATCGATAAATCGCATATTAAAGGAACTAACGAACGTATTACTGAAAAAGAGAAAATTACAATTGTTTAT
TCTCAAAATAGTGAAGAAGCTGAGTATTTAAAATACATTAAATATTTACAGCACAAAAAGATTCTTGAACCTTCAATAGA
ACAATTTGAAGTAGAAGATCTTCAGGGAGTTTCTGGTTTAAAAGCAATTCGTGTAAAGGTGATTAACAACACCAATGCTT
CAAAAATGAAAAAAATCACCTATCAGGATTTATTAGATGAGCTCAACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACAAGGGTTTGTGTCTATGAAGCTATAAGCGAAACAAATTGTAAAATGCTGTTGATTCTTAATTTATGCTTAATTTTGTA
TTTCAAAAAAAAATTATCAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAGTTGGGCTTCGTTTGTTTAAATAAACATAGCAGTTTCTATCTAATATTAAAAAAGCTTTGTCAAAGTTTTAAACTTC
GACAAAGCTTTCTGTATTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 789; Mature: 789

Protein sequence:

>789_residues
MDRHVPKESPFETIISFHKLIESFEEIALSDVDYRSNYAKAILKEIEAFPEFRTGIRDLNSIRNNEALIKNIAADLFPTA
LTHNEIKAITIPFQNISFNYTERFKKILRNAGDEFYMEIRDFDDHQFYVNNCCLILAYHYNQNVDFSKPFFYDIPDEEGV
ERHYRIMYNADFMEIIPTEKSVELSQDDIDQLIDNYNDIDLWKSKFPPGSWILKGFGIVSLFDATTESAISTLKSNLLKP
DNTRVTSTDIVENIFRSIFKIPSLKVGFIIYNPEEEKFIRPMKFDNHMESYLLKSDQEMDCKNAFFGCSFENLLDNKEPF
VISNVKKFIEESSNKKLGEHLLKQGIQSCVFAPVIKDDHLLGIVELVSENPRDLNSVNAIKLDLVLPYLTDTIDRYNTDM
QHQIEAIIQREYTTIHPSVYWKFRKESQNYFQNISHTKDYIFKEIVFKNVFPLYGQIDIKGSSEHRNETVKIDLKNQLTA
LLEIFDNQDPNSNLVLLEQRKFELESLRSELDFPLKADMEQHIQRYIEEEIHPILKNTKSNAKNEKLEELYFESLDEKTG
MFYQERKKFDNAMSIINKKLASVLDKKQVEAQQIYPHYYERFKTDGVEHNLYIGASISPTKPFDIMYLHNLRLWQLQTLC
EMELEHHQLKESLPYELDVTSLILVFSSPLSIRFRMDEKRFDVDGTYNARYEVVKKRIDKSHIKGTNERITEKEKITIVY
SQNSEEAEYLKYIKYLQHKKILEPSIEQFEVEDLQGVSGLKAIRVKVINNTNASKMKKITYQDLLDELN

Sequences:

>Translated_789_residues
MDRHVPKESPFETIISFHKLIESFEEIALSDVDYRSNYAKAILKEIEAFPEFRTGIRDLNSIRNNEALIKNIAADLFPTA
LTHNEIKAITIPFQNISFNYTERFKKILRNAGDEFYMEIRDFDDHQFYVNNCCLILAYHYNQNVDFSKPFFYDIPDEEGV
ERHYRIMYNADFMEIIPTEKSVELSQDDIDQLIDNYNDIDLWKSKFPPGSWILKGFGIVSLFDATTESAISTLKSNLLKP
DNTRVTSTDIVENIFRSIFKIPSLKVGFIIYNPEEEKFIRPMKFDNHMESYLLKSDQEMDCKNAFFGCSFENLLDNKEPF
VISNVKKFIEESSNKKLGEHLLKQGIQSCVFAPVIKDDHLLGIVELVSENPRDLNSVNAIKLDLVLPYLTDTIDRYNTDM
QHQIEAIIQREYTTIHPSVYWKFRKESQNYFQNISHTKDYIFKEIVFKNVFPLYGQIDIKGSSEHRNETVKIDLKNQLTA
LLEIFDNQDPNSNLVLLEQRKFELESLRSELDFPLKADMEQHIQRYIEEEIHPILKNTKSNAKNEKLEELYFESLDEKTG
MFYQERKKFDNAMSIINKKLASVLDKKQVEAQQIYPHYYERFKTDGVEHNLYIGASISPTKPFDIMYLHNLRLWQLQTLC
EMELEHHQLKESLPYELDVTSLILVFSSPLSIRFRMDEKRFDVDGTYNARYEVVKKRIDKSHIKGTNERITEKEKITIVY
SQNSEEAEYLKYIKYLQHKKILEPSIEQFEVEDLQGVSGLKAIRVKVINNTNASKMKKITYQDLLDELN
>Mature_789_residues
MDRHVPKESPFETIISFHKLIESFEEIALSDVDYRSNYAKAILKEIEAFPEFRTGIRDLNSIRNNEALIKNIAADLFPTA
LTHNEIKAITIPFQNISFNYTERFKKILRNAGDEFYMEIRDFDDHQFYVNNCCLILAYHYNQNVDFSKPFFYDIPDEEGV
ERHYRIMYNADFMEIIPTEKSVELSQDDIDQLIDNYNDIDLWKSKFPPGSWILKGFGIVSLFDATTESAISTLKSNLLKP
DNTRVTSTDIVENIFRSIFKIPSLKVGFIIYNPEEEKFIRPMKFDNHMESYLLKSDQEMDCKNAFFGCSFENLLDNKEPF
VISNVKKFIEESSNKKLGEHLLKQGIQSCVFAPVIKDDHLLGIVELVSENPRDLNSVNAIKLDLVLPYLTDTIDRYNTDM
QHQIEAIIQREYTTIHPSVYWKFRKESQNYFQNISHTKDYIFKEIVFKNVFPLYGQIDIKGSSEHRNETVKIDLKNQLTA
LLEIFDNQDPNSNLVLLEQRKFELESLRSELDFPLKADMEQHIQRYIEEEIHPILKNTKSNAKNEKLEELYFESLDEKTG
MFYQERKKFDNAMSIINKKLASVLDKKQVEAQQIYPHYYERFKTDGVEHNLYIGASISPTKPFDIMYLHNLRLWQLQTLC
EMELEHHQLKESLPYELDVTSLILVFSSPLSIRFRMDEKRFDVDGTYNARYEVVKKRIDKSHIKGTNERITEKEKITIVY
SQNSEEAEYLKYIKYLQHKKILEPSIEQFEVEDLQGVSGLKAIRVKVINNTNASKMKKITYQDLLDELN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 92821; Mature: 92821

Theoretical pI: Translated: 5.25; Mature: 5.25

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDRHVPKESPFETIISFHKLIESFEEIALSDVDYRSNYAKAILKEIEAFPEFRTGIRDLN
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
SIRNNEALIKNIAADLFPTALTHNEIKAITIPFQNISFNYTERFKKILRNAGDEFYMEIR
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEE
DFDDHQFYVNNCCLILAYHYNQNVDFSKPFFYDIPDEEGVERHYRIMYNADFMEIIPTEK
CCCCCEEEECCEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHEEEEECCCHHEECCCCC
SVELSQDDIDQLIDNYNDIDLWKSKFPPGSWILKGFGIVSLFDATTESAISTLKSNLLKP
CCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DNTRVTSTDIVENIFRSIFKIPSLKVGFIIYNPEEEKFIRPMKFDNHMESYLLKSDQEMD
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCC
CKNAFFGCSFENLLDNKEPFVISNVKKFIEESSNKKLGEHLLKQGIQSCVFAPVIKDDHL
HHHHHCCCCHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH
LGIVELVSENPRDLNSVNAIKLDLVLPYLTDTIDRYNTDMQHQIEAIIQREYTTIHPSVY
HHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCEECCHHE
WKFRKESQNYFQNISHTKDYIFKEIVFKNVFPLYGQIDIKGSSEHRNETVKIDLKNQLTA
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEHHHHHHH
LLEIFDNQDPNSNLVLLEQRKFELESLRSELDFPLKADMEQHIQRYIEEEIHPILKNTKS
HHHHHCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
NAKNEKLEELYFESLDEKTGMFYQERKKFDNAMSIINKKLASVLDKKQVEAQQIYPHYYE
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH
RFKTDGVEHNLYIGASISPTKPFDIMYLHNLRLWQLQTLCEMELEHHQLKESLPYELDVT
HHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
SLILVFSSPLSIRFRMDEKRFDVDGTYNARYEVVKKRIDKSHIKGTNERITEKEKITIVY
HHHHHHCCCCEEEEEECCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCEEEEEEE
SQNSEEAEYLKYIKYLQHKKILEPSIEQFEVEDLQGVSGLKAIRVKVINNTNASKMKKIT
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHH
YQDLLDELN
HHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MDRHVPKESPFETIISFHKLIESFEEIALSDVDYRSNYAKAILKEIEAFPEFRTGIRDLN
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
SIRNNEALIKNIAADLFPTALTHNEIKAITIPFQNISFNYTERFKKILRNAGDEFYMEIR
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEE
DFDDHQFYVNNCCLILAYHYNQNVDFSKPFFYDIPDEEGVERHYRIMYNADFMEIIPTEK
CCCCCEEEECCEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHEEEEECCCHHEECCCCC
SVELSQDDIDQLIDNYNDIDLWKSKFPPGSWILKGFGIVSLFDATTESAISTLKSNLLKP
CCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DNTRVTSTDIVENIFRSIFKIPSLKVGFIIYNPEEEKFIRPMKFDNHMESYLLKSDQEMD
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCC
CKNAFFGCSFENLLDNKEPFVISNVKKFIEESSNKKLGEHLLKQGIQSCVFAPVIKDDHL
HHHHHCCCCHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH
LGIVELVSENPRDLNSVNAIKLDLVLPYLTDTIDRYNTDMQHQIEAIIQREYTTIHPSVY
HHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCEECCHHE
WKFRKESQNYFQNISHTKDYIFKEIVFKNVFPLYGQIDIKGSSEHRNETVKIDLKNQLTA
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEHHHHHHH
LLEIFDNQDPNSNLVLLEQRKFELESLRSELDFPLKADMEQHIQRYIEEEIHPILKNTKS
HHHHHCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
NAKNEKLEELYFESLDEKTGMFYQERKKFDNAMSIINKKLASVLDKKQVEAQQIYPHYYE
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH
RFKTDGVEHNLYIGASISPTKPFDIMYLHNLRLWQLQTLCEMELEHHQLKESLPYELDVT
HHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
SLILVFSSPLSIRFRMDEKRFDVDGTYNARYEVVKKRIDKSHIKGTNERITEKEKITIVY
HHHHHHCCCCEEEEEECCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCEEEEEEE
SQNSEEAEYLKYIKYLQHKKILEPSIEQFEVEDLQGVSGLKAIRVKVINNTNASKMKKIT
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHH
YQDLLDELN
HHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA