Definition Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome.
Accession NC_009441
Length 6,096,872

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The map label for this gene is 146301277

Identifier: 146301277

GI number: 146301277

Start: 4218434

End: 4224805

Strand: Reverse

Name: 146301277

Synonym: Fjoh_3535

Alternate gene names: NA

Gene position: 4224805-4218434 (Counterclockwise)

Preceding gene: 146301278

Following gene: 146301276

Centisome position: 69.29

GC content: 41.54

Gene sequence:

>6372_bases
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AAGGTTCTTTTGTTGGCAGAGGGCAAAACTGTTTCAAAAGGATTTTTGAAGACCATTACAGCTTATACTAGACTTAGTTC
TTCAGAATTATCAAAGTTCTGCGGACTTTTGGATTTTGAGGACGGCGAGGGGGATTATGACAGCCAGAAAGACGAGCTGA
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TTTCCAGTTATTCATTTATTGTTCACGCGCCGGGAGGTGTAGGAAAGTCTATGTTCTGCCGGCAGCTGTCAGCTTCACTG
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AAGACAGCGATATCATGCGAAAATTTTTATGGCGCCTGGAGGCGTCCGTAAAAAATCTAAGACACAGGGATGATTCCGCT
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CCTTGCAGAAAAAAAGAAAAAGAATCAATATGAACGGGACGATGAAATCAAGAAGTTGAGGGAAGTAATAGGCGGTTTGT
TCCCATGGTATCAGCTGCGGACATTGATATTAAGCGGACAGGATTTTGATTTCGAGGCTCAGGTACGAAAGGCAGATGAA
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TAGTCAGGAGATGGGAAGCTGTTGTTTCACTTGCAGAACGGTCATGTAGTGAAAAGGGAAGTCCAGACTTGGCTGCTTAT
CGATTTATACGCTGTGCAGAAGTGGTTGGAGAATATGTCGACCGTGAAAAACACTGGGACAGGAGTGATGCAATTGCGGT
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CGACTCGGTCAGACTGCTGGAGTCAGTCGGCACAAGTCCAGAATTCTGGGAGAGGATAAAAGCGATCGGATATGATGGGA
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ACAACTCCGAAATCGATAAGCTCAAGGAGGGAATATTTGAGGGACTTGCAGGTACGTACGAGTTTTCTGATGCTCAAACA
TTTTTTGGATTTGTAGATATGACTGCGCCCCTGATTAAACCTGAGGAAGCAGCTGAATTGCTGGATTTTGCACTGTCCAG
GTTTGAGCTTCATATTGAAGAGGATTTTGGCGACGGGCAGTGGAGTGAATGGCTGTCTGTTCCAGAAGATATTAATAATC
AGCTTGCTGGTTTCATCTGGTCGGCGCTAGGTTCTCCAAGATCTTCCGAACGCTGGAGTGCTGCGCACTGTGTAAGATTG
CTGGCAGAATTTGACTGCATTGAGATTATTGAAGAGCTCTTCAAATGGATGCAGCATGACAAGACAGATGCTTTTGGCTG
TGCTGAATTTCCTTTCTATAATCTTCACGCAAGACTGTATATGTTGATTGCATCTGCGCGGATCTCTGTTGAAAGAGCGG
GTCTGCTGTTTCCTTTCAAGGACGTATTTGTTCGATATGCCCTTGGAGATCCTCATGCGCTTATCCAAAAATTTGCGGCA
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AAGCAATATGCCTGTAGTGAAAATGAACTATAATGATACAGTTGAGAGCTATTGGCATGTTAAGGATGAAATTGCTACGG
ATTACGACTTTGATTTTAGTTATGATTTTGACAGATACTGGTTTGATCCCCTTGGTGATGTTTTCGGAATATCGGGCAAA
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GCTTTTATAGAACACTGAAAACTGAAGGTGCAAATGGGGATGTATGGCTGAACGTGCGGGGCGGATGGGAAGAAAAACAT
TCTGAGAGAATCGAGACAGTTTCAATCGCTTCGGCATTGGTCTCCAGAAATGCATCTGATGCCTTAATGAGGGCACTGCA
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CCCTATAGGATTGGTTCGGATGTCGCTGCGAAACTGAATTTGTCTTTAGAAAATGATGGAAAATCATGGTTTCTGCCGCT
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Upstream 100 bases:

>100_bases
AAACATATAACTAATAAAGTAAAATTAGCAGACAGAATTACGAATATCTTACCGCGGGATCACCTTATCATTGCTACCAA
AACCTATTATTCCTTTAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTATTTGTCCAAGAGCTTAAACTGGAACCGGGAGTGGATACTTTTTCTAGATGGATGGCCCATTATATTGCTGAAAAAA
TGACTATCGTAGAATGTTCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 2123; Mature: 2123

Protein sequence:

>2123_residues
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Sequences:

>Translated_2123_residues
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Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 244655; Mature: 244655

Theoretical pI: Translated: 5.31; Mature: 5.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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CCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCEEE
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HHCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHCC
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CCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHC
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