The gene/protein map for NC_009441 is currently unavailable.
Definition Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome.
Accession NC_009441
Length 6,096,872

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 146301274

Identifier: 146301274

GI number: 146301274

Start: 4213480

End: 4215861

Strand: Reverse

Name: 146301274

Synonym: Fjoh_3532

Alternate gene names: NA

Gene position: 4215861-4213480 (Counterclockwise)

Preceding gene: 146301275

Following gene: 146301273

Centisome position: 69.15

GC content: 32.16

Gene sequence:

>2382_bases
ATGTCGAATTACGATTTCTCTACTTTAAACCCGATTGATTTTGAAAAGCTGGTTTGCGATCTGCTCAATGTGAGTATTAA
ATCACCAACAGGCTCGATGTTTAGAAGCTTTAAAGAAGGAAAAGACGCTGGAGTGGATCTTTTGCGTTCAACTCCAAATA
ATGATATTGAAGTGGTGGTGCAAGTCAAGCATTTTCATAAAAGTTCATTTTCATCATTGAGAAGAGAACTGAAAGCAGAA
TTGGAAAAAGTCCAAAAACTGAAACCCAAAAAGTATATTGTTGTTACATCGCTCGCCTTGAGCATGCATAACAAAAAGGA
AATTAAGGATATTTTTACTCCGTTTATAGCAAGTCTGGATGATATTTTTGGGGTGGATGATCTGAATGATATTCTCAGAA
TAAACAAACAGATTGAGGAAAGACATTTTAAGTTATGGTTTTCAAGTTCACTTGCAATTCAAAAATTAACTGAGTACAAG
TATGCAGGAAGGAACAACGAATTTTCCGAAAATGGAATGAAAAAAAAGCTGAGGCTCTTTGTAAGTACAAAGGAGTTAAG
ACAGGCAATACAGATGCTCCAACGAAATAAATTTCTGATTATAACCGGTGAGCCTGGAGTCGGAAAAACAACGCTTTCTG
AGATTATTATTTACAAACATCTTTCCTTGGATTATCAGCTGACGGTTATTTATGATGATATCAAAGAGATAGAAGGAATC
TTAAGGGACGATGACAGCAAGCAGATTTTTTACTTTGATGATTTTCTGGGACATACCCAGGCTGAAATACTAAAATCAAA
ATCTGCAGAAACATCATTGCTGAAAATATTATCGAGGTTTGAAACGTCCGAAAACAAGTATTTAATTTTAAATACACGAA
AATTTATACTAAATACCTTTTTGGATGAATCTGAGCGATTTAGAAATTTCAATCCCTTGCGGAGTGAAAGTAAGATAGAA
CTGCTTTCTTATTCCTACGGAGCAAAACGCCGTATGCTTGACAATCATATTGCGGAGTCAGAGTTGAATTTTGAACAAAT
TGAAGTGCTGCGAAACTTGTCATTTTTTATTTGCCAACACCGAAATTTTTCTCCACGGCATCTGGAGTTTTATACTGATA
ACCGCCTTGTTGGTGAATTTAGTGGTTCCAATTTCAAAACATTTGTGATCGATAATTTGTCAAATCCCAAAAAAATATGG
GAGCATGCCTATATGAATCAAATCACCGATATGGAAAGGTTTTTATTAAACACGCTTTACTCTCTAGGTTCCAATGCATC
AAAAGAGTTATTACAACTTGCTTTTTCATCCAGATTAAATTACGAAGTGAAGACAAATAATTATTTCAAGCCAATCGATC
CATTTAATAATAGTGTTCGAAAACTAAATGATGGTTTTATTGTCAGCTTTAATCTTGGCGAAATTTCAGATTTTTCCTTT
ATTAATCCTTCATTAGAAGACTTTCTTAAATTTTTTATTGAAAACAATAAGTCTGAGTATGAACGTATCTTGTTATCATC
AATAGATATAGCGCAATGGTTCGTTTTTTTTAAGCCGTTCAATGATAATTTAATAGAAAGTAATTTACTTGATCATTTTA
ATATTTCCTTTTCTGAAAACGCTGTTACTGACATAGATTTATTCAAAAGTGCTATTTTTTTAATTTCTCTAGATAAAAAA
AATTATCTACAGATCAGTAGAATTTTAAAAAAGATTAAAAATTGGGAAGAAATTGTGCAGGATCCGTTTATTAGTGCTAA
TTCGTTCCCATTTTTAAAGGAGTGTATTAAAAATAAAATATTAATATATACGGTAGCAAAACTCGATTTTCAGTTTTTTT
TAAATCTTATTTTAAGCTGTGGGACACTGGAAGAAATTTACCAGTTGATTCATTTATTTAAAAATCATTTTGAGTTGAAT
TTTATCCAGAATTTTGACCGAAATGCAAATTGCTATGGTAGATATAAAGTTTTGGTTGCCGAAGTAATTTTACTATGTAT
TAGACTTTTAGAGCAGGAAGTGGAGGCAAAGTATCAATTGCTTTATAAAAATGTTTATCATGATGGGCATGTAGATATAT
TAGAACAGTTGGAGGAATATACTAAATTTTTTAGAGATTTTGTAAGCGAGCAAATAGTTGTTGGTTTTGACTTTTTATAT
AAACAAGATTGGAATGTAGTGGCAGAACAAAATTATCTAAATCAGCTCTCCAGTGGTAGAGAGTTTGAAACAGAGCAAGA
TTTTGCTGATGATTATCAGCAAATGGACTATTATGAAGATGAAGATTATGATTACGATTTTGAAACTGAAAAAATATCTG
CTGAAGAATGGCTTGTGAAGATTCCGGTAAGAGAAATTGAACCCGATGACCTTCCCTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCATGAATGTTATGACTGCGATACAGATTTAAGGGGACTTTATAATAAAGATTTTCAGCCCTGAGATTATATAAAAATG
CACTGTTAAAAAATATTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAAGATATAATTGATTTATAGCAAAATTAATCATATGAGATCTAATAATGGTTACTGAAAAAAATATTTAACATTACAT
GAATAAATTATAATTACAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 793; Mature: 792

Protein sequence:

>793_residues
MSNYDFSTLNPIDFEKLVCDLLNVSIKSPTGSMFRSFKEGKDAGVDLLRSTPNNDIEVVVQVKHFHKSSFSSLRRELKAE
LEKVQKLKPKKYIVVTSLALSMHNKKEIKDIFTPFIASLDDIFGVDDLNDILRINKQIEERHFKLWFSSSLAIQKLTEYK
YAGRNNEFSENGMKKKLRLFVSTKELRQAIQMLQRNKFLIITGEPGVGKTTLSEIIIYKHLSLDYQLTVIYDDIKEIEGI
LRDDDSKQIFYFDDFLGHTQAEILKSKSAETSLLKILSRFETSENKYLILNTRKFILNTFLDESERFRNFNPLRSESKIE
LLSYSYGAKRRMLDNHIAESELNFEQIEVLRNLSFFICQHRNFSPRHLEFYTDNRLVGEFSGSNFKTFVIDNLSNPKKIW
EHAYMNQITDMERFLLNTLYSLGSNASKELLQLAFSSRLNYEVKTNNYFKPIDPFNNSVRKLNDGFIVSFNLGEISDFSF
INPSLEDFLKFFIENNKSEYERILLSSIDIAQWFVFFKPFNDNLIESNLLDHFNISFSENAVTDIDLFKSAIFLISLDKK
NYLQISRILKKIKNWEEIVQDPFISANSFPFLKECIKNKILIYTVAKLDFQFFLNLILSCGTLEEIYQLIHLFKNHFELN
FIQNFDRNANCYGRYKVLVAEVILLCIRLLEQEVEAKYQLLYKNVYHDGHVDILEQLEEYTKFFRDFVSEQIVVGFDFLY
KQDWNVVAEQNYLNQLSSGREFETEQDFADDYQQMDYYEDEDYDYDFETEKISAEEWLVKIPVREIEPDDLPF

Sequences:

>Translated_793_residues
MSNYDFSTLNPIDFEKLVCDLLNVSIKSPTGSMFRSFKEGKDAGVDLLRSTPNNDIEVVVQVKHFHKSSFSSLRRELKAE
LEKVQKLKPKKYIVVTSLALSMHNKKEIKDIFTPFIASLDDIFGVDDLNDILRINKQIEERHFKLWFSSSLAIQKLTEYK
YAGRNNEFSENGMKKKLRLFVSTKELRQAIQMLQRNKFLIITGEPGVGKTTLSEIIIYKHLSLDYQLTVIYDDIKEIEGI
LRDDDSKQIFYFDDFLGHTQAEILKSKSAETSLLKILSRFETSENKYLILNTRKFILNTFLDESERFRNFNPLRSESKIE
LLSYSYGAKRRMLDNHIAESELNFEQIEVLRNLSFFICQHRNFSPRHLEFYTDNRLVGEFSGSNFKTFVIDNLSNPKKIW
EHAYMNQITDMERFLLNTLYSLGSNASKELLQLAFSSRLNYEVKTNNYFKPIDPFNNSVRKLNDGFIVSFNLGEISDFSF
INPSLEDFLKFFIENNKSEYERILLSSIDIAQWFVFFKPFNDNLIESNLLDHFNISFSENAVTDIDLFKSAIFLISLDKK
NYLQISRILKKIKNWEEIVQDPFISANSFPFLKECIKNKILIYTVAKLDFQFFLNLILSCGTLEEIYQLIHLFKNHFELN
FIQNFDRNANCYGRYKVLVAEVILLCIRLLEQEVEAKYQLLYKNVYHDGHVDILEQLEEYTKFFRDFVSEQIVVGFDFLY
KQDWNVVAEQNYLNQLSSGREFETEQDFADDYQQMDYYEDEDYDYDFETEKISAEEWLVKIPVREIEPDDLPF
>Mature_792_residues
SNYDFSTLNPIDFEKLVCDLLNVSIKSPTGSMFRSFKEGKDAGVDLLRSTPNNDIEVVVQVKHFHKSSFSSLRRELKAEL
EKVQKLKPKKYIVVTSLALSMHNKKEIKDIFTPFIASLDDIFGVDDLNDILRINKQIEERHFKLWFSSSLAIQKLTEYKY
AGRNNEFSENGMKKKLRLFVSTKELRQAIQMLQRNKFLIITGEPGVGKTTLSEIIIYKHLSLDYQLTVIYDDIKEIEGIL
RDDDSKQIFYFDDFLGHTQAEILKSKSAETSLLKILSRFETSENKYLILNTRKFILNTFLDESERFRNFNPLRSESKIEL
LSYSYGAKRRMLDNHIAESELNFEQIEVLRNLSFFICQHRNFSPRHLEFYTDNRLVGEFSGSNFKTFVIDNLSNPKKIWE
HAYMNQITDMERFLLNTLYSLGSNASKELLQLAFSSRLNYEVKTNNYFKPIDPFNNSVRKLNDGFIVSFNLGEISDFSFI
NPSLEDFLKFFIENNKSEYERILLSSIDIAQWFVFFKPFNDNLIESNLLDHFNISFSENAVTDIDLFKSAIFLISLDKKN
YLQISRILKKIKNWEEIVQDPFISANSFPFLKECIKNKILIYTVAKLDFQFFLNLILSCGTLEEIYQLIHLFKNHFELNF
IQNFDRNANCYGRYKVLVAEVILLCIRLLEQEVEAKYQLLYKNVYHDGHVDILEQLEEYTKFFRDFVSEQIVVGFDFLYK
QDWNVVAEQNYLNQLSSGREFETEQDFADDYQQMDYYEDEDYDYDFETEKISAEEWLVKIPVREIEPDDLPF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93586; Mature: 93454

Theoretical pI: Translated: 5.04; Mature: 5.04

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNYDFSTLNPIDFEKLVCDLLNVSIKSPTGSMFRSFKEGKDAGVDLLRSTPNNDIEVVV
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEE
QVKHFHKSSFSSLRRELKAELEKVQKLKPKKYIVVTSLALSMHNKKEIKDIFTPFIASLD
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DIFGVDDLNDILRINKQIEERHFKLWFSSSLAIQKLTEYKYAGRNNEFSENGMKKKLRLF
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
VSTKELRQAIQMLQRNKFLIITGEPGVGKTTLSEIIIYKHLSLDYQLTVIYDDIKEIEGI
HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEEHHHHHHHHH
LRDDDSKQIFYFDDFLGHTQAEILKSKSAETSLLKILSRFETSENKYLILNTRKFILNTF
HCCCCCCEEEEEHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHH
LDESERFRNFNPLRSESKIELLSYSYGAKRRMLDNHIAESELNFEQIEVLRNLSFFICQH
HHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEC
RNFSPRHLEFYTDNRLVGEFSGSNFKTFVIDNLSNPKKIWEHAYMNQITDMERFLLNTLY
CCCCCCEEEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLGSNASKELLQLAFSSRLNYEVKTNNYFKPIDPFNNSVRKLNDGFIVSFNLGEISDFSF
HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCC
INPSLEDFLKFFIENNKSEYERILLSSIDIAQWFVFFKPFNDNLIESNLLDHFNISFSEN
CCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHCHHHCCCCCCCC
AVTDIDLFKSAIFLISLDKKNYLQISRILKKIKNWEEIVQDPFISANSFPFLKECIKNKI
CCHHHHHHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCE
LIYTVAKLDFQFFLNLILSCGTLEEIYQLIHLFKNHFELNFIQNFDRNANCYGRYKVLVA
EEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH
EVILLCIRLLEQEVEAKYQLLYKNVYHDGHVDILEQLEEYTKFFRDFVSEQIVVGFDFLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHH
KQDWNVVAEQNYLNQLSSGREFETEQDFADDYQQMDYYEDEDYDYDFETEKISAEEWLVK
HCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHEEE
IPVREIEPDDLPF
CCHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SNYDFSTLNPIDFEKLVCDLLNVSIKSPTGSMFRSFKEGKDAGVDLLRSTPNNDIEVVV
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEE
QVKHFHKSSFSSLRRELKAELEKVQKLKPKKYIVVTSLALSMHNKKEIKDIFTPFIASLD
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DIFGVDDLNDILRINKQIEERHFKLWFSSSLAIQKLTEYKYAGRNNEFSENGMKKKLRLF
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
VSTKELRQAIQMLQRNKFLIITGEPGVGKTTLSEIIIYKHLSLDYQLTVIYDDIKEIEGI
HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEEHHHHHHHHH
LRDDDSKQIFYFDDFLGHTQAEILKSKSAETSLLKILSRFETSENKYLILNTRKFILNTF
HCCCCCCEEEEEHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHH
LDESERFRNFNPLRSESKIELLSYSYGAKRRMLDNHIAESELNFEQIEVLRNLSFFICQH
HHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEC
RNFSPRHLEFYTDNRLVGEFSGSNFKTFVIDNLSNPKKIWEHAYMNQITDMERFLLNTLY
CCCCCCEEEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLGSNASKELLQLAFSSRLNYEVKTNNYFKPIDPFNNSVRKLNDGFIVSFNLGEISDFSF
HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCC
INPSLEDFLKFFIENNKSEYERILLSSIDIAQWFVFFKPFNDNLIESNLLDHFNISFSEN
CCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHCHHHCCCCCCCC
AVTDIDLFKSAIFLISLDKKNYLQISRILKKIKNWEEIVQDPFISANSFPFLKECIKNKI
CCHHHHHHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCE
LIYTVAKLDFQFFLNLILSCGTLEEIYQLIHLFKNHFELNFIQNFDRNANCYGRYKVLVA
EEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH
EVILLCIRLLEQEVEAKYQLLYKNVYHDGHVDILEQLEEYTKFFRDFVSEQIVVGFDFLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHH
KQDWNVVAEQNYLNQLSSGREFETEQDFADDYQQMDYYEDEDYDYDFETEKISAEEWLVK
HCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHEEE
IPVREIEPDDLPF
CCHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9163424 [H]