Definition Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome.
Accession NC_009441
Length 6,096,872

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The map label for this gene is 146299882

Identifier: 146299882

GI number: 146299882

Start: 2569868

End: 2572705

Strand: Direct

Name: 146299882

Synonym: Fjoh_2126

Alternate gene names: NA

Gene position: 2569868-2572705 (Clockwise)

Preceding gene: 146299881

Following gene: 146299885

Centisome position: 42.15

GC content: 23.11

Gene sequence:

>2838_bases
ATGGAGAGAATATTAAAACTAAAAATTTTCTTAAAAAGTAAATTATCATTTTTTTTTGAAGCAATAATAAATCTATTTGG
TAAAATATTAGTCTTTCTAAAAAGCAATTTTAATGTTTTTTTTTCTTGGTTAGTTTTGGTTACAATAGTTTTGATTTTTC
AAAATAAAATTGCAACTTTTTTAGCAGAAAATTCTATCATAAAACATGTTGATGTTAAAAAACAAAGTTTCAATTTAGCA
TTTGTAACATTAGTACTGATATTCTTGATTCGTTTTTTTTGGTTTATAGTAAAAAACTATAGAATTTCTCAAAAACAGAA
CTATTTTATCTTTTTATTTAGTTCAATTTACTTCTTTCTTAGGAATGATGAAAATGACTCTTTATATTTTTCATATTTAA
GTAGAAGACACGAATTATATTATTCTGATATAATATTACTAATTGCAATTTTATCAATTTTATTAATCTTTAGAAATATA
TTTTTAAGAAATTGGAGTTTATATGATAATATAGTTAGTTGGTTTGATGAATTGATCAAAAAAGGCGAACATGTTAAATC
CTCTTTTTTAATAGAAGACATTCCTCTAAATAATACAAATATTAACGATAATGAAAAAGTAATTGATGAGGTTGTAAAGG
CTGTAATAAATTTAAAACCATCTTATTCATTTATAATAGGAATAAACTCAATATGGGGAATTGGTAAAACAAGTTTTTTG
AAACGTCTAGAATATAAACTTACCATTCAAAAAATACACAATGAAAGTAAGCCAATAACTTTTTGGTTTAATGCTTGGCA
ACATCAGGATGAAAAATCAATAATTAATAATTTTTTCAATCAATTAAAAAAAGAACTATCAGTATTTTCAGGAGATTCTG
AAAATTCAATCGACAATTATTTAAAAGAAATGCTGGCTTTAGCCGACAATAAATATTTAAATTTCTTTAAATCAATAACT
GATAGCATATTCTCTAATGGAGATAGTATAAAAGAGTCTTATGATGAAATAAATGTTATCATTGAGGAAATTAATAGAAA
AATAATTGTATTTGTTGATGATATTGATAGATTAAATAAAGTTGAAATTTTAGAGACATTACGGATTTTACGTAATATAG
CAAATTTTAAAAATGTTGTTTTTGTCTGTGGTTTTGATAGAGAATATGTGGTCAAACAATCGCAAATTGATAATCATTAT
CTCGATAAAATTTTCAATTTAGAAATTAATTTAACTACACAAAATCAAAAAGGATTTGTTTCTTTTTTTAGTGAATTAAT
TAATAGTTCGTCTGGCTACGATAATGATGAAAAAAATATATTAATAGAATCTGTTAATAAAATATTTTATGCAGATGAAG
AAAGCAGTATTGATATTAGTTCACTCATTAAAATGACACGCGAAAATAACACAAATCAAGAAGGTTTTAAAAATGAAGAA
GTTTTAGCCAAAATACCTTTAATTCCTTCATTTTTCTTTGAATCAAGAAGGGATGTTAAAAAATTTTATAACGAATTATA
TATTAATTTTAAAACTCTGGGTAGCAACATTTCGGATATTAATCTTGAGAAATACTTATTATTGAAACTATTATTATTCA
AATATAAATGGATGCATAAAAATTTTGCTTCGAAAAGAATAAATTCTTGGCTTGGAAGTGAACCTGTTTTGAGGTTTAAA
GAATTAAATTTAAAAAAATTATTGCTGAATAAGGAAATAGAAAATCAAGATAGTTATATAATTTTTTCAGTTTTACTTCT
CTTATTTCCAGAAAATGGTTTGCATAATCATTCTCCAGAAATAAATCAAAAAAGATATTTTCCTATCTATTTCAGTAACA
ATGTATTTAATGAATGTCTGACTTATTATCAGCTAACTGATGCTATTAAAAATAATAGAGTTAAAAAACTTTTAACAGAT
ATTGTAAATGGGAAAGAAAATGAAAGGTCAATTATAAATGATATAAAATTATTTTTGCTAAAACCTGAGAATATAGATAA
TATTAATGAATACAAACAAGTCGTAGATTTAATCAAAAATGGTGATTTGGGTAAAGTTGATGAAATGAAAATTCTTAATT
TTTTGCATTTAGGCGAGAAAAATTTTGGAATTGAGTACAAGAAATTGTTAGCTTTTATTTTTACAAATTTTGAAGATCCT
TTCGGATCTTTTGCATTAGATTTAAGTATCTATTATAGAAAATATCCTCTTGATTCTTCAAGAAACAAATATAAACTTGA
GGACGGCATTGATCATAAAACAATTGATGCTTTAAAGATTTTGAATAAAGAAGTTCTAAAGAAACTAAATTTAGTAATTC
TCAGAAAAGAAATAAATGCTAAAAATTTGGATACTAAAATGATTTTATCAAATTTTAATAGATTCTATGAAATATATTTT
ACAGACCTTAAATTCGGATTTTTTTATGAAGAATATAAGGTAATCATAAAGGGTTATATGACTGAAAATTTTGAAAATAT
TTTTTTAGCTAATAATGTAGAGAAAACAATTTCAGATATGGATACAACTTTATTGACCAATCTTTTTGAAAATGATATTG
ATAAAAAAGAATTTGTAGAGGTATTAAAAATGCAAGTTGACGGCAAAGTTAATGGAACATCTAAGCCAATGAATGGAATA
ATTTATAGAGAAGGAGGATTGAATAATTTTATTAAATATGTTGAAGATATAGAGAATTTAATTAGCCCAGAAAAAATAGA
AATTTATAAAGAGTTTTTAGTATGGTTACATACATTTAGAGATAATTTTTACTTAGGTAAACCAACTACAAAAGAAGTAA
GTGATTTTAAAAATGGAATTCGTAATAATGTTAATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATAAATCTGTAAAACAAAGCTAAAACATGAGTGCGGGCACGGATTTCAAATCCGCGCTATCGGGTTCTATGATTGGATA
CTTAACTTTAAAAACATCAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTGAAGATATACTTCTAAATAAAGATTTTATAGTCCCTGTCTCGTCCTGAAACCCGATAACGCAGATTGCAAATCCA
CGTTATCGGGTTTTTAAACT

Product: KAP P-loop domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: KAP Family P-Loop Domain Protein; KAP Family P-Loop Domain-Containing Protein; Protein Containing KAP Family P-Loop Domain; P-Loop ATPase

Number of amino acids: Translated: 945; Mature: 945

Protein sequence:

>945_residues
MERILKLKIFLKSKLSFFFEAIINLFGKILVFLKSNFNVFFSWLVLVTIVLIFQNKIATFLAENSIIKHVDVKKQSFNLA
FVTLVLIFLIRFFWFIVKNYRISQKQNYFIFLFSSIYFFLRNDENDSLYFSYLSRRHELYYSDIILLIAILSILLIFRNI
FLRNWSLYDNIVSWFDELIKKGEHVKSSFLIEDIPLNNTNINDNEKVIDEVVKAVINLKPSYSFIIGINSIWGIGKTSFL
KRLEYKLTIQKIHNESKPITFWFNAWQHQDEKSIINNFFNQLKKELSVFSGDSENSIDNYLKEMLALADNKYLNFFKSIT
DSIFSNGDSIKESYDEINVIIEEINRKIIVFVDDIDRLNKVEILETLRILRNIANFKNVVFVCGFDREYVVKQSQIDNHY
LDKIFNLEINLTTQNQKGFVSFFSELINSSSGYDNDEKNILIESVNKIFYADEESSIDISSLIKMTRENNTNQEGFKNEE
VLAKIPLIPSFFFESRRDVKKFYNELYINFKTLGSNISDINLEKYLLLKLLLFKYKWMHKNFASKRINSWLGSEPVLRFK
ELNLKKLLLNKEIENQDSYIIFSVLLLLFPENGLHNHSPEINQKRYFPIYFSNNVFNECLTYYQLTDAIKNNRVKKLLTD
IVNGKENERSIINDIKLFLLKPENIDNINEYKQVVDLIKNGDLGKVDEMKILNFLHLGEKNFGIEYKKLLAFIFTNFEDP
FGSFALDLSIYYRKYPLDSSRNKYKLEDGIDHKTIDALKILNKEVLKKLNLVILRKEINAKNLDTKMILSNFNRFYEIYF
TDLKFGFFYEEYKVIIKGYMTENFENIFLANNVEKTISDMDTTLLTNLFENDIDKKEFVEVLKMQVDGKVNGTSKPMNGI
IYREGGLNNFIKYVEDIENLISPEKIEIYKEFLVWLHTFRDNFYLGKPTTKEVSDFKNGIRNNVN

Sequences:

>Translated_945_residues
MERILKLKIFLKSKLSFFFEAIINLFGKILVFLKSNFNVFFSWLVLVTIVLIFQNKIATFLAENSIIKHVDVKKQSFNLA
FVTLVLIFLIRFFWFIVKNYRISQKQNYFIFLFSSIYFFLRNDENDSLYFSYLSRRHELYYSDIILLIAILSILLIFRNI
FLRNWSLYDNIVSWFDELIKKGEHVKSSFLIEDIPLNNTNINDNEKVIDEVVKAVINLKPSYSFIIGINSIWGIGKTSFL
KRLEYKLTIQKIHNESKPITFWFNAWQHQDEKSIINNFFNQLKKELSVFSGDSENSIDNYLKEMLALADNKYLNFFKSIT
DSIFSNGDSIKESYDEINVIIEEINRKIIVFVDDIDRLNKVEILETLRILRNIANFKNVVFVCGFDREYVVKQSQIDNHY
LDKIFNLEINLTTQNQKGFVSFFSELINSSSGYDNDEKNILIESVNKIFYADEESSIDISSLIKMTRENNTNQEGFKNEE
VLAKIPLIPSFFFESRRDVKKFYNELYINFKTLGSNISDINLEKYLLLKLLLFKYKWMHKNFASKRINSWLGSEPVLRFK
ELNLKKLLLNKEIENQDSYIIFSVLLLLFPENGLHNHSPEINQKRYFPIYFSNNVFNECLTYYQLTDAIKNNRVKKLLTD
IVNGKENERSIINDIKLFLLKPENIDNINEYKQVVDLIKNGDLGKVDEMKILNFLHLGEKNFGIEYKKLLAFIFTNFEDP
FGSFALDLSIYYRKYPLDSSRNKYKLEDGIDHKTIDALKILNKEVLKKLNLVILRKEINAKNLDTKMILSNFNRFYEIYF
TDLKFGFFYEEYKVIIKGYMTENFENIFLANNVEKTISDMDTTLLTNLFENDIDKKEFVEVLKMQVDGKVNGTSKPMNGI
IYREGGLNNFIKYVEDIENLISPEKIEIYKEFLVWLHTFRDNFYLGKPTTKEVSDFKNGIRNNVN
>Mature_945_residues
MERILKLKIFLKSKLSFFFEAIINLFGKILVFLKSNFNVFFSWLVLVTIVLIFQNKIATFLAENSIIKHVDVKKQSFNLA
FVTLVLIFLIRFFWFIVKNYRISQKQNYFIFLFSSIYFFLRNDENDSLYFSYLSRRHELYYSDIILLIAILSILLIFRNI
FLRNWSLYDNIVSWFDELIKKGEHVKSSFLIEDIPLNNTNINDNEKVIDEVVKAVINLKPSYSFIIGINSIWGIGKTSFL
KRLEYKLTIQKIHNESKPITFWFNAWQHQDEKSIINNFFNQLKKELSVFSGDSENSIDNYLKEMLALADNKYLNFFKSIT
DSIFSNGDSIKESYDEINVIIEEINRKIIVFVDDIDRLNKVEILETLRILRNIANFKNVVFVCGFDREYVVKQSQIDNHY
LDKIFNLEINLTTQNQKGFVSFFSELINSSSGYDNDEKNILIESVNKIFYADEESSIDISSLIKMTRENNTNQEGFKNEE
VLAKIPLIPSFFFESRRDVKKFYNELYINFKTLGSNISDINLEKYLLLKLLLFKYKWMHKNFASKRINSWLGSEPVLRFK
ELNLKKLLLNKEIENQDSYIIFSVLLLLFPENGLHNHSPEINQKRYFPIYFSNNVFNECLTYYQLTDAIKNNRVKKLLTD
IVNGKENERSIINDIKLFLLKPENIDNINEYKQVVDLIKNGDLGKVDEMKILNFLHLGEKNFGIEYKKLLAFIFTNFEDP
FGSFALDLSIYYRKYPLDSSRNKYKLEDGIDHKTIDALKILNKEVLKKLNLVILRKEINAKNLDTKMILSNFNRFYEIYF
TDLKFGFFYEEYKVIIKGYMTENFENIFLANNVEKTISDMDTTLLTNLFENDIDKKEFVEVLKMQVDGKVNGTSKPMNGI
IYREGGLNNFIKYVEDIENLISPEKIEIYKEFLVWLHTFRDNFYLGKPTTKEVSDFKNGIRNNVN

Specific function: Unknown

COG id: COG4928

COG function: function code R; Predicted P-loop ATPase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 111764; Mature: 111764

Theoretical pI: Translated: 8.07; Mature: 8.07

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MERILKLKIFLKSKLSFFFEAIINLFGKILVFLKSNFNVFFSWLVLVTIVLIFQNKIATF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAENSIIKHVDVKKQSFNLAFVTLVLIFLIRFFWFIVKNYRISQKQNYFIFLFSSIYFFL
HHHCCHHHHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHH
RNDENDSLYFSYLSRRHELYYSDIILLIAILSILLIFRNIFLRNWSLYDNIVSWFDELIK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
KGEHVKSSFLIEDIPLNNTNINDNEKVIDEVVKAVINLKPSYSFIIGINSIWGIGKTSFL
CCCHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHCCCCHHHHH
KRLEYKLTIQKIHNESKPITFWFNAWQHQDEKSIINNFFNQLKKELSVFSGDSENSIDNY
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
LKEMLALADNKYLNFFKSITDSIFSNGDSIKESYDEINVIIEEINRKIIVFVDDIDRLNK
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHH
VEILETLRILRNIANFKNVVFVCGFDREYVVKQSQIDNHYLDKIFNLEINLTTQNQKGFV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHEEEEEEEEECCCCHHH
SFFSELINSSSGYDNDEKNILIESVNKIFYADEESSIDISSLIKMTRENNTNQEGFKNEE
HHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCH
VLAKIPLIPSFFFESRRDVKKFYNELYINFKTLGSNISDINLEKYLLLKLLLFKYKWMHK
HHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFASKRINSWLGSEPVLRFKELNLKKLLLNKEIENQDSYIIFSVLLLLFPENGLHNHSPE
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
INQKRYFPIYFSNNVFNECLTYYQLTDAIKNNRVKKLLTDIVNGKENERSIINDIKLFLL
CCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHEEEE
KPENIDNINEYKQVVDLIKNGDLGKVDEMKILNFLHLGEKNFGIEYKKLLAFIFTNFEDP
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC
FGSFALDLSIYYRKYPLDSSRNKYKLEDGIDHKTIDALKILNKEVLKKLNLVILRKEINA
CCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCC
KNLDTKMILSNFNRFYEIYFTDLKFGFFYEEYKVIIKGYMTENFENIFLANNVEKTISDM
CCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHH
DTTLLTNLFENDIDKKEFVEVLKMQVDGKVNGTSKPMNGIIYREGGLNNFIKYVEDIENL
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
ISPEKIEIYKEFLVWLHTFRDNFYLGKPTTKEVSDFKNGIRNNVN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MERILKLKIFLKSKLSFFFEAIINLFGKILVFLKSNFNVFFSWLVLVTIVLIFQNKIATF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAENSIIKHVDVKKQSFNLAFVTLVLIFLIRFFWFIVKNYRISQKQNYFIFLFSSIYFFL
HHHCCHHHHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHH
RNDENDSLYFSYLSRRHELYYSDIILLIAILSILLIFRNIFLRNWSLYDNIVSWFDELIK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
KGEHVKSSFLIEDIPLNNTNINDNEKVIDEVVKAVINLKPSYSFIIGINSIWGIGKTSFL
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KRLEYKLTIQKIHNESKPITFWFNAWQHQDEKSIINNFFNQLKKELSVFSGDSENSIDNY
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
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HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHH
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CCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHEEEE
KPENIDNINEYKQVVDLIKNGDLGKVDEMKILNFLHLGEKNFGIEYKKLLAFIFTNFEDP
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC
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CCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCC
KNLDTKMILSNFNRFYEIYFTDLKFGFFYEEYKVIIKGYMTENFENIFLANNVEKTISDM
CCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
ISPEKIEIYKEFLVWLHTFRDNFYLGKPTTKEVSDFKNGIRNNVN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA