| Definition | Yersinia pestis Pestoides F, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009381 |
| Length | 4,517,345 |
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Identifier: 145597875
GI number:
Start: 635669
End: 645001
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: YPDSF_0568
Alternate gene names: NA
Gene position: NA
Preceding gene: 145597874
Following gene: 145597882
Centisome position: NA
GC content: NA
Gene sequence:
>9333_bases ATGCCAAATGGAAACGAAATGGCTGGGTTTTATATAGATAAGCTGTCACTCTCTCAACGGCTTTCTATTGTTTCTGAAAC ATATGATCGGGTTAATAAAAACAATAAAAAAGAAAAATTAAAATACTCTTATGATGATATTGAAATGATCAAGAAAAGAT TTGTTAAATATATCGACGCGCAACTTTACAGTTTAATTAGAGAAGGGTTATCTGTACCGGCCACTTTAACGCAAGAAGAA AAAATAAAAATTACTGACCTGGCAATTGATGCGGCTCTTTTCAATGACTATGAAAGATTCAATGAGTTAATTATATATAT TAGTTCATTAGGTATATCTGTGACACCTCCACTACCACAAGAAGAGGGAGGGAGCAGATTGTATATCTACTTTAGTGGTG ACATTCATGCTTATATGGATGTGTGGCGAGGTGATTTATTATTAGGGAGTGGAACTGAACTTTCTGATATACAAAGTATC ACTGGTCTGCGATTTATGATTGATATGGCAGAATCACTGAAACTTAATATTATTAATCCAGCGGATAAGGCGATGGTGGA TTTAATCAATCACCTTCGGTATGAAATGATTTCATATGCCAGTTCATTTTGTGCAACCTACAGTGCTGAGCGTGGTGGGA CGGTTTACTTATCATCACCAGATGGCCTACGGATAAATAACTATTTTTGGAACAGTGAGCTGCCTGTACTGCGTGCATTG CAGAAGAAAGGATTGATAGGCGATATCCGTATTCTTCATAAACCTTTAGAGTTTTATAAAGATACACCACTGGATGAGCT GGGGGATTTGCTGACAGCAAAAGATATTTCAATGACTGTGGAGTATCAGTTTCTTCCTGTTTGGTTGCAAGAAAAATTAT TGGTCGACATCTATCAACAATGGCTAGATGAGGAGTTTCAGCCCAGTTTATTGGCTGTTAGAAAAGAGATTATTAATACA 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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TAGCAAAATAGATTAGCAGGAAGAGAGGCTGAGGGCAGGTTTCTGCCCTCAGAGACACCAGTCATACTGCAAACTGCTTG TGTGTTGGTTGCCTTCCTGC
Product: virulence determinant
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: NA
Protein sequence:
>3110_residues MPNGNEMAGFYIDKLSLSQRLSIVSETYDRVNKNNKKEKLKYSYDDIEMIKKRFVKYIDAQLYSLIREGLSVPATLTQEE KIKITDLAIDAALFNDYERFNELIIYISSLGISVTPPLPQEEGGSRLYIYFSGDIHAYMDVWRGDLLLGSGTELSDIQSI TGLRFMIDMAESLKLNIINPADKAMVDLINHLRYEMISYASSFCATYSAERGGTVYLSSPDGLRINNYFWNSELPVLRAL QKKGLIGDIRILHKPLEFYKDTPLDELGDLLTAKDISMTVEYQFLPVWLQEKLLVDIYQQWLDEEFQPSLLAVRKEIINT IDIDRHAPEVELLRYFLRKIHEQLDEITEFKVLKEAERIDSIKKKLAVGSEIESWLDNVPAIDVNERKIILESLLQKESL LFSNVRDIKKSIIPLDFNSDVININTSLLKNTFIPFNLLRESWDVIISDRSLVEGTLTIHFSVGRKIMIKVDANRNQLKQ MATLERFLLANFTPRNTPQDLKIIDNVIMSGDVVLAERRDDKGWHNDQQMIEKVKLSEFDYFLKSNDLGVKINDNGFVLY LISDPEDNRDVIIKPNDDYNLKSIKDFIENNYLFFDDVPEYLIVKKNVENKECIFAHDEGETYQVAYRDGEAWVLLSKMN TSDQIKNLNEITMSVNLNNAESRSVALILSLLNKHARLVSILPDTHPKVMENFLDIDSLLKNSTHPFEHPLYRKLLNSIS NDINKYMESLNEIKDSYHLLPFDVRPGQYMNTWSKIDRDTVIEYSFKQNDKNHHPQFIVLLQDDSLSKRVGEIIASYNNN KSIVLQFDARSSEARIAYGTQNNITEMGKFELSFVTHGTTDGVYSFSVANVIEIYKLTINSFALPPPVKIRLVICSIADN GQGAQGFNGTHPALGIVNMMHQEGFDIPILAYTTKVGVSVEHPGELVVFNSEKPGEVLKNIDDYQVLYHYKNNILLTDGV PVVELLLKDVRNKIKSVDQLIESYSQYLVPFFSDDNGVVDRELLELTINDFDTYSKFENFLDIIRQRPELRNSDNWQLVV ANNATGFLITTLDEPVVKYPDIVKVNEWDLPAIANIDKTATASQYDMQIVFQCENNPTVNRAATRLAGKHAKNSIIIQLD VDNNHRAFIIDDNTHAEWREISHNELVTKLKIQPENGKIRWQVVGHGRSEGGNDKHPTLAGQRPEQLTARLNQFSDYLQT EHQINISPQQVSLVGCAMSSSDRYTSFAHKFMSHLNENGIRTNVSASTKAIEVDPQGHKHDVDTPDIDSYNNKYLSSIKG TEKLYWNRWGEITTERKKDINGRLNNIDSLLDKLITRQLSVNQLNKKQQRKLAEIFPQLTDKKLNKGELLLTLHDSWRMQ ALKYDLLFLQKISDRPDFDTELWRVTDRWRITETDGNTLQDVRIKSGSQHKTDLATYPHSITSDPDLKTSAPELKTSNPK ARTAIFGRFGYGMQGYGFISALRLSADYQRWMSNGDLTEKQEEEIQLQLAMAWGGIGANLATDGLQYAFGKWGIGYLQKL VSKGGRLSPALLSQLTLLKRNPALLLAPGFLKDLRKLALNQFAHGAARFSMPLLSALTSGIDIYQAYHAFSQLATETDPH VRRDLIASGVFSTINATIGLGVAFAMAMGGTAATAAGPAGIALAFTMIIVGDIYSAVSQIERIRDIVPDMTGSQRFENGL RLFLKFGLTPGLDNQIRYNQTMESVYQRQRDYYEALLASKQGVDTLFYSRGEAVLKAIPFIKRDERSQTERDLEKISIFS GDPFTNAKIYTTYAEMGKHEYYELDKINDVDDYVIADFFEDNNRSVVKLQNKNLHQAFSELDIDSTYSPFILSADVDRNG LNDFIVINEKYNTTIASRKNSVGMTVIDDYVSRWHYELYTWLAQPDGSYLKIDTRLEWEKLFHAIEVDKFNEVVFPVLGD FNGDNVFELVIFHDDKMTTYHYDSLDFNQSGKDNHNVINIGDFIEPVRLAFEGEKSKNYPYSLVGDINNDGFDDILLLNK SGDMLHLMGNSSGVFRQHKTKLSSELTSLLSSSNLHRSQLQLTDLNKDGGLDLVIILNDGIYYQALGDKIDGEYHFDTPS MVNKITIKNEGGDSVRYQQNRLSQIDKHKIIAISPSDQGENRLISLSDSGELLAHPLREIKENDVAALFDLGGGDDVAKG YHKKKNIFTIGSGFKQYQGGENADTFILTSAVASKSHILSGGEGNDTVALGEVLGNEIDSIIDISNGYYSQVNGGVEKQV ALLYDFENILGHENVNDTIIGNDVDNYLNGMGGDDKIWGNGGNDLLALQSGLAQGGTGLDSYHILKSTHKKSLQIRIEEV SENNNTDMQISNIFLEHKLNQIKSIELDNIDVLININNDNGFMTQIRLVGVYNINNNQKQQVLNFTIQTVDGFTMVPLWP SYLNEITEFSPNMVAYYSSLVDRNYKELVGKGDPDDIVVRFSLDNGYQQQQVTHLQRVEGEKDIVLRQAILPDFIRLSPQ EHSMLMGFLPRYELLGDNKDNLLQVLSGEGLLEGRGGQDTYLIQEKEGSPTDIIINNFDDSLASDNLVLSSWLLCDVIVE RSDDDLLLRYRDQPEKHQSIRLVNYMNDERYRHLKITDKSGQSQYRDPVTGTFIDYQINLDKNGHPFIAAQQAPVVSSGN DEVVITSATFLPGNYIDTGDGNDAIIYIRGHEGTMLKGGGGDDTYYYSAGSGAINIADTSGLDHLYLDKHILLHTLSAER RENNLVLNIADNTSGRIIFVDWYLADENKVEFIWVEDSQITFDELFSLRPYSDEYYQLCQHLKSMGLSLTVRQLADLDSQ DGYNTLNQLRTIKAWVTKNPIYDVADLDYLVAMSSIAWRGNARNTDPLPLIEQKIDAFFQPLIAERISLTEEHVTWIQRE EFDTVDIAKWVKNYHLRSQNEINYLLEQLGLLKESPLSDKALDFTFKNRIDLAQADIELCQQECGINRQSLINLAMKYHV TGRGHFELLISNIQVLKEYGVVVSESEQPLVLRKPIDLRQYFNQKNLTKDHVGRLAEHDMSFDELTLLLDKNIPIEQAFT QRLQTQLGPLKLFNDERVFNKGDVFDQDISQLAEAMGGLESTESYSLPLERQTVMAITTHQFVSDSIAAY
Sequences:
NA
Specific function: NA
COG id: COG2931
COG function: function code Q; RTX toxins and related Ca2+-binding proteins
Gene ontology:
Cell location: NA
Metaboloic importance: NA
Operon status: NA
Operon components: NA
Similarity: NA
Homologues:
NA
Paralogues:
NA
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
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Molecular weight: NA
Theoretical pI: NA
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
NA
Transmembrane regions:
NA
Cys/Met content:
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Secondary structure: NA
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: NA
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: NA
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA