| Definition | Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009253 |
| Length | 3,608,104 |
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The map label for this gene is 134299248
Identifier: 134299248
GI number: 134299248
Start: 1494827
End: 1497523
Strand: Reverse
Name: 134299248
Synonym: Dred_1389
Alternate gene names: NA
Gene position: 1497523-1494827 (Counterclockwise)
Preceding gene: 134299249
Following gene: 134299247
Centisome position: 41.5
GC content: 41.68
Gene sequence:
>2697_bases ATGAATCAAAACGAGTTCAAACAATACATTAAAAATATGGTTAACTCGATGTTGGAAAAAGTTCCAAACTACAGTGAACA AGACCTGGAAGAACTCCTAAAAGATGATTTGCCGGAGGAATTCGCTAAAGAGTCATCAAAAAAACCCATAGGTAATTTTT TAGATGACTTTGATGAAGATCTACCACAGAGTTTTTCACAGGACTTAACGGAAGATGCAGCAGATTTCTCTGAGGACTTG ACAGAAGACATAGCCGATGAGATCGTTGATGAACTATCAGATGACATAGAGTATTTAGAAAAAAACTTTGGTTTTAAAGA CGATTGGGGAGATATTTCAGACTGGAATGACCTTATTGACTGGGCAGGCCTTAAGGAATTTGGCAGTTACGGCGACACTT GTGATCCTTATGATCAAAAGAATCCATTCAAAGATTCTTGCGATATTAATGATCCCTTTAATTGTAATGATCCCGGCCAT CATGATCACCACCATTGCCATCACCATGACCATCATAAAGATCCCTGCTTTGATGACAAACTACTCAAGTGCTTTATTTT CACCTGCCTCAAACTAAAAATTATTCTCTGCCTGCTAAAAAATAAAAAGTTTGGGCTTAGGGAGATTAAGAAAGAAATTA AATGCATTGAAGAGGCTATCTTTAACCGGAGATTTGGCCTGAAAGAAATTAAAAGAGAAGTTAACCGCATTGAAAATGGT GTTTTCAGTTGCACCTTTGGATTACCAGAGATTAAGTCTGAAGTTTCTATTATTCTAACAATTGTAGCCGGTATTGATGA CGAAATTAATAATCCTACCTTTGGTTTGTCCGAGATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATCGAGTCTGCTGTGTTCAGTGAGA CCTTCGGGTTATCCGAAATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATCCTTGCTCTGGTCAGTAGCCTGAGTATTGTTGACTTCGGC GATATTAAGTCCGAGATCTCTGCTATCGAATCTGCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCTGAAATTAAGGCTGAAGT ATCTGCCATCGAGTCTGCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCTGAAATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATCCTTGCTC TGGTCAGCAGCCTGAGTATTGTTGACTTCGGCGATATTAAGTCCGAAATCTCTGCTATCGAATCTGCGGTGTTCAGTGAG ACCTTTGGTTTGTCCGAGATTAAGTCCGAGATCTCTGCCATCGAGTCTGCTGTGTTCAGTGAGACCTTCGGGTTATCCGA AATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATACTTGCTCTGGTCAGCAGCCTGAGTATTGTTGACTTCGGCGATATTAAGTCTGAAA TCTCTGCTATCGAGTCCGCTGTATTCAGTGAGACCTTTGGGTTATCCGAGATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATCGAGTCT GCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCTGAAATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATCCTTGCTCTGGTCAGCAGCCTGAG TATTGTTGACTTCGGCGATATTAAGTCCGAAATCTCTGCTATCGAATCCGCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCTG AAATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATCCTTGCTCTGGTCAGCAGCCTGAGTATTGTTGACTTCGGCGATATTAAGTCCGAG ATCTCTGCTATCGAGTCCGCTGTATTCAGTGAGACCTTTGGGTTATCCGAGATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATCGAGTC TGCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCCGAAATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATCGAGTCTGCTGTGTTCAGTGAGA CCTTCGGGTTATCCGAAATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATCCTTGCTCTGGTCAGTAGCCTGAGTATTGTTGACTTCGGC GATATTAAGTCCGAGATCTCTGCTATCGAATCCGCTGTATTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCTGAAATCAAGGCTGAGGT TTCTGATATCCTTGCTCTGGTCAGCAGCCTAAGTATTGTTGACTTCGGCGATATTAAGTCTGAAATCTCTGCTATCGAGT CTGCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCCGAGATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATTGAATCCGCTGTATTCAGTGAG ACCTTCGGGTTATCCGAAATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATTGAATCCGCTGTATTCAGTGAGACCTTCGGGTTATCCGA AATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATTGAATCCGCTGTGTTCAGTGAGACCTTCGGGTTATCTGAAATCAAGGCTGAGGTTT CATCATTGCTTGCCCTCCGGGGTCCAGCACAGAATCTAACCACCGGCCCCTTCCTTCTAATAAAAACTATAATGGATCTT GAATATAAAATGTTCAATGCCAGCGGGACAACCGCAAGTGTAACATTTAAAACCTTCGATATTGGAACTTGTCCAATATC GCAAATAAACACAATTGGTTTCTCTAATATTACTAACTGTTGTGGTACTCATTTTATTTTTAGTAATCCTTTTAACGAAG ATAAAAATTTAATAATAAATGCCCAAACCAGTTCCACTTTTGGCATCTTCCTTTACGTTGCTGGAAATACAGGACAAAAC ATACCAGTATCATTTAAATCAGGAGATTTTCTCCCCTTTGGCACCCTTTGCAGCTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CGATATTTAGGTTTCGAGTGTTTTTTTAGTCTTAAAACGTCACCTATTTACTTAGCGTGGAATAAATTAACAACATATAG AAAGGGGGTAGCTAGCTTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases ACAGAAGTCGGCAACATTTGTTGCCGACTTCCCTATTTACAAATATTTTCCTTTTGACACTTCATTTACTACTTTAACAT ATACTAACCTAATAACTTTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 898; Mature: 898
Protein sequence:
>898_residues MNQNEFKQYIKNMVNSMLEKVPNYSEQDLEELLKDDLPEEFAKESSKKPIGNFLDDFDEDLPQSFSQDLTEDAADFSEDL TEDIADEIVDELSDDIEYLEKNFGFKDDWGDISDWNDLIDWAGLKEFGSYGDTCDPYDQKNPFKDSCDINDPFNCNDPGH HDHHHCHHHDHHKDPCFDDKLLKCFIFTCLKLKIILCLLKNKKFGLREIKKEIKCIEEAIFNRRFGLKEIKREVNRIENG VFSCTFGLPEIKSEVSIILTIVAGIDDEINNPTFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSE TFGLSEIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIES AVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSE ISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSE TFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSSLLALRGPAQNLTTGPFLLIKTIMDL EYKMFNASGTTASVTFKTFDIGTCPISQINTIGFSNITNCCGTHFIFSNPFNEDKNLIINAQTSSTFGIFLYVAGNTGQN IPVSFKSGDFLPFGTLCS
Sequences:
>Translated_898_residues MNQNEFKQYIKNMVNSMLEKVPNYSEQDLEELLKDDLPEEFAKESSKKPIGNFLDDFDEDLPQSFSQDLTEDAADFSEDL TEDIADEIVDELSDDIEYLEKNFGFKDDWGDISDWNDLIDWAGLKEFGSYGDTCDPYDQKNPFKDSCDINDPFNCNDPGH HDHHHCHHHDHHKDPCFDDKLLKCFIFTCLKLKIILCLLKNKKFGLREIKKEIKCIEEAIFNRRFGLKEIKREVNRIENG VFSCTFGLPEIKSEVSIILTIVAGIDDEINNPTFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSE TFGLSEIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIES AVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSE ISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSE TFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSSLLALRGPAQNLTTGPFLLIKTIMDL EYKMFNASGTTASVTFKTFDIGTCPISQINTIGFSNITNCCGTHFIFSNPFNEDKNLIINAQTSSTFGIFLYVAGNTGQN IPVSFKSGDFLPFGTLCS >Mature_898_residues MNQNEFKQYIKNMVNSMLEKVPNYSEQDLEELLKDDLPEEFAKESSKKPIGNFLDDFDEDLPQSFSQDLTEDAADFSEDL TEDIADEIVDELSDDIEYLEKNFGFKDDWGDISDWNDLIDWAGLKEFGSYGDTCDPYDQKNPFKDSCDINDPFNCNDPGH HDHHHCHHHDHHKDPCFDDKLLKCFIFTCLKLKIILCLLKNKKFGLREIKKEIKCIEEAIFNRRFGLKEIKREVNRIENG VFSCTFGLPEIKSEVSIILTIVAGIDDEINNPTFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSE TFGLSEIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIES AVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSE ISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSE TFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSSLLALRGPAQNLTTGPFLLIKTIMDL EYKMFNASGTTASVTFKTFDIGTCPISQINTIGFSNITNCCGTHFIFSNPFNEDKNLIINAQTSSTFGIFLYVAGNTGQN IPVSFKSGDFLPFGTLCS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 97659; Mature: 97659
Theoretical pI: Translated: 3.93; Mature: 3.93
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNQNEFKQYIKNMVNSMLEKVPNYSEQDLEELLKDDLPEEFAKESSKKPIGNFLDDFDED CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LPQSFSQDLTEDAADFSEDLTEDIADEIVDELSDDIEYLEKNFGFKDDWGDISDWNDLID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH WAGLKEFGSYGDTCDPYDQKNPFKDSCDINDPFNCNDPGHHDHHHCHHHDHHKDPCFDDK HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHH LLKCFIFTCLKLKIILCLLKNKKFGLREIKKEIKCIEEAIFNRRFGLKEIKREVNRIENG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCC VFSCTFGLPEIKSEVSIILTIVAGIDDEINNPTFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEI CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH KAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSAIESAVFSETFG HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC LSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEISAIESAVFS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIES HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH AVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVS HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH DILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIK HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH SEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGL HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH SEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH TFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSSLLALR HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC GPAQNLTTGPFLLIKTIMDLEYKMFNASGTTASVTFKTFDIGTCPISQINTIGFSNITNC CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHH CGTHFIFSNPFNEDKNLIINAQTSSTFGIFLYVAGNTGQNIPVSFKSGDFLPFGTLCS HHCCCEECCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNQNEFKQYIKNMVNSMLEKVPNYSEQDLEELLKDDLPEEFAKESSKKPIGNFLDDFDED CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LPQSFSQDLTEDAADFSEDLTEDIADEIVDELSDDIEYLEKNFGFKDDWGDISDWNDLID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH WAGLKEFGSYGDTCDPYDQKNPFKDSCDINDPFNCNDPGHHDHHHCHHHDHHKDPCFDDK HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHH LLKCFIFTCLKLKIILCLLKNKKFGLREIKKEIKCIEEAIFNRRFGLKEIKREVNRIENG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCC VFSCTFGLPEIKSEVSIILTIVAGIDDEINNPTFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEI CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH KAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSAIESAVFSETFG HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC LSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEISAIESAVFS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIES HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH AVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVS HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH DILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIK HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH SEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGL HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH SEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH TFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSSLLALR HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC GPAQNLTTGPFLLIKTIMDLEYKMFNASGTTASVTFKTFDIGTCPISQINTIGFSNITNC CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHH CGTHFIFSNPFNEDKNLIINAQTSSTFGIFLYVAGNTGQNIPVSFKSGDFLPFGTLCS HHCCCEECCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA