Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yhjX [C]

Identifier: 126700931

GI number: 126700931

Start: 3877134

End: 3878417

Strand: Direct

Name: yhjX [C]

Synonym: CD3312

Alternate gene names: 126700931

Gene position: 3877134-3878417 (Clockwise)

Preceding gene: 126700922

Following gene: 126700937

Centisome position: 90.37

GC content: 29.05

Gene sequence:

>1284_bases
ATGAATACATTACTAAACAATAAATTTAGCATTAAAAACTTTTCAAATGCTTGGGTTATAGTACTTGGTTGTATGTTGAT
ACAAGCTGTTCCATTTAGTATTGTAGCAAGTATACAGCCTCAATTTATAAGTTATGTTGTAGAAGGAGAAGGCTTTAGTT
TAGCTTCTTTTTCTCTAATATTCACTATTGGTACTATTGCCTCAGCAATTGCATCACCTTTTATAGGTGTATTATTTTCT
AAAGTCAATATTAAGATACTATATTTATTAGGTTGTATAATTTCTAGTATTGCTTTTGCTACTTTTTCTATATGTACTGA
ACTATGGCAATTTTACACTGTATCATGTATTGTTCAAATTGGCGCTACAATTATATCTGCTATAGGAATACCTGTTTTAA
TAAGTGCTTGGTTTGATGAAGAAAGCAAAGGAAAAGCTTTGGGCTTTGCTTTTGCTGGTGGTTCTATTGGTAGTATATTT
CTACAACCACTTGCAGTTCGCTTATTAGCAACTCAAGGATACAGTCGTTCTTATCTAATATTTGGAATTATAGCATTAAT
AGTTGGTATACCTGTAATATTATTCATACTCAGGATGCCTAAAGATATTAATGAAAAGGTAAAATCTAAAGGTAAAAAAG
AGAAAGCATCTGATACAATTTCTCCTTCAGTATGGGGTTATACATTAAAAGAAGCTAAAAAAATTAAATATTTTTGGATT
ATGACTATTGGATTTATATTTGTTGGTATATATGTTTCATCATTATCCGTACAATATCCAACTTATCTTAGAAATTATCT
AAATCCTATTCTAATAGGAACAGTAGGCTCCACATTTGCTTTATTTGCTCTCATTGGTAATTTATTTGGAGGATTATTGT
TTGATAAATTCGGTCAAACAAAGCCACTTATTATATCTTTTGTATTGGTTCTTATAGCAACTTTATCATTACTATTGGTA
GATAAATCTTCTACTTTTGCATTTGTATTTGCCATTTTGAAAGGTCTTTCTGTATTTGCTTATATGATTGGTCCTGCTTA
TTTAACTGGCTCTTTCTTTGGTCAAAAGGAGTTTGGTAGCATATATGGAATCGTACAATTAATTTTTGCAGTGGGATTTG
CATTAGGTTCAACATTATTTGGATTGTTAGTTGATAATTTTGGATACAGATTTTCTTGGTCTATTATAATTTTATCAGTT
ATAATTGCCTATACTTTACTTATTATAACTTCTATAGGAATGAAAAAATTGAATAAAGAAAGATTAGATAAACTAATGCA
ATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACCCAAATTATATTTAAATAGTTAGGCTATCCAAAACTAATATATAAAATTAGAATAATTAGATTAATATCTACAAATCA
TAACCTAAAGGAGAGATACC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGATTTTTAGATATATAAATATTATAATAAAAAAGATGGAGCTTTTAATCATAAATAAAACTCCATCTTTTTTATATTA
CAATATAGCTAATTTTCTCT

Product: transporter

Products: NA

Alternate protein names: Bile Salt Transporter; Facilitator Transporter; Facilitator Family Transporter; MFS Superfamily Permease

Number of amino acids: Translated: 427; Mature: 427

Protein sequence:

>427_residues
MNTLLNNKFSIKNFSNAWVIVLGCMLIQAVPFSIVASIQPQFISYVVEGEGFSLASFSLIFTIGTIASAIASPFIGVLFS
KVNIKILYLLGCIISSIAFATFSICTELWQFYTVSCIVQIGATIISAIGIPVLISAWFDEESKGKALGFAFAGGSIGSIF
LQPLAVRLLATQGYSRSYLIFGIIALIVGIPVILFILRMPKDINEKVKSKGKKEKASDTISPSVWGYTLKEAKKIKYFWI
MTIGFIFVGIYVSSLSVQYPTYLRNYLNPILIGTVGSTFALFALIGNLFGGLLFDKFGQTKPLIISFVLVLIATLSLLLV
DKSSTFAFVFAILKGLSVFAYMIGPAYLTGSFFGQKEFGSIYGIVQLIFAVGFALGSTLFGLLVDNFGYRFSWSIIILSV
IIAYTLLIITSIGMKKLNKERLDKLMQ

Sequences:

>Translated_427_residues
MNTLLNNKFSIKNFSNAWVIVLGCMLIQAVPFSIVASIQPQFISYVVEGEGFSLASFSLIFTIGTIASAIASPFIGVLFS
KVNIKILYLLGCIISSIAFATFSICTELWQFYTVSCIVQIGATIISAIGIPVLISAWFDEESKGKALGFAFAGGSIGSIF
LQPLAVRLLATQGYSRSYLIFGIIALIVGIPVILFILRMPKDINEKVKSKGKKEKASDTISPSVWGYTLKEAKKIKYFWI
MTIGFIFVGIYVSSLSVQYPTYLRNYLNPILIGTVGSTFALFALIGNLFGGLLFDKFGQTKPLIISFVLVLIATLSLLLV
DKSSTFAFVFAILKGLSVFAYMIGPAYLTGSFFGQKEFGSIYGIVQLIFAVGFALGSTLFGLLVDNFGYRFSWSIIILSV
IIAYTLLIITSIGMKKLNKERLDKLMQ
>Mature_427_residues
MNTLLNNKFSIKNFSNAWVIVLGCMLIQAVPFSIVASIQPQFISYVVEGEGFSLASFSLIFTIGTIASAIASPFIGVLFS
KVNIKILYLLGCIISSIAFATFSICTELWQFYTVSCIVQIGATIISAIGIPVLISAWFDEESKGKALGFAFAGGSIGSIF
LQPLAVRLLATQGYSRSYLIFGIIALIVGIPVILFILRMPKDINEKVKSKGKKEKASDTISPSVWGYTLKEAKKIKYFWI
MTIGFIFVGIYVSSLSVQYPTYLRNYLNPILIGTVGSTFALFALIGNLFGGLLFDKFGQTKPLIISFVLVLIATLSLLLV
DKSSTFAFVFAILKGLSVFAYMIGPAYLTGSFFGQKEFGSIYGIVQLIFAVGFALGSTLFGLLVDNFGYRFSWSIIILSV
IIAYTLLIITSIGMKKLNKERLDKLMQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46715; Mature: 46715

Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNTLLNNKFSIKNFSNAWVIVLGCMLIQAVPFSIVASIQPQFISYVVEGEGFSLASFSLI
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHEECCCCCCHHHHHHH
FTIGTIASAIASPFIGVLFSKVNIKILYLLGCIISSIAFATFSICTELWQFYTVSCIVQI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GATIISAIGIPVLISAWFDEESKGKALGFAFAGGSIGSIFLQPLAVRLLATQGYSRSYLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
FGIIALIVGIPVILFILRMPKDINEKVKSKGKKEKASDTISPSVWGYTLKEAKKIKYFWI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
MTIGFIFVGIYVSSLSVQYPTYLRNYLNPILIGTVGSTFALFALIGNLFGGLLFDKFGQT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KPLIISFVLVLIATLSLLLVDKSSTFAFVFAILKGLSVFAYMIGPAYLTGSFFGQKEFGS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
IYGIVQLIFAVGFALGSTLFGLLVDNFGYRFSWSIIILSVIIAYTLLIITSIGMKKLNKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
RLDKLMQ
HHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNTLLNNKFSIKNFSNAWVIVLGCMLIQAVPFSIVASIQPQFISYVVEGEGFSLASFSLI
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHEECCCCCCHHHHHHH
FTIGTIASAIASPFIGVLFSKVNIKILYLLGCIISSIAFATFSICTELWQFYTVSCIVQI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GATIISAIGIPVLISAWFDEESKGKALGFAFAGGSIGSIFLQPLAVRLLATQGYSRSYLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
FGIIALIVGIPVILFILRMPKDINEKVKSKGKKEKASDTISPSVWGYTLKEAKKIKYFWI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
MTIGFIFVGIYVSSLSVQYPTYLRNYLNPILIGTVGSTFALFALIGNLFGGLLFDKFGQT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KPLIISFVLVLIATLSLLLVDKSSTFAFVFAILKGLSVFAYMIGPAYLTGSFFGQKEFGS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
IYGIVQLIFAVGFALGSTLFGLLVDNFGYRFSWSIIILSVIIAYTLLIITSIGMKKLNKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
RLDKLMQ
HHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA