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The map label for this gene is yaaJ [C]

Identifier: 126699891

GI number: 126699891

Start: 2640783

End: 2642150

Strand: Direct

Name: yaaJ [C]

Synonym: CD2276

Alternate gene names: 126699891

Gene position: 2640783-2642150 (Clockwise)

Preceding gene: 126699888

Following gene: 126699899

Centisome position: 61.55

GC content: 34.58

Gene sequence:

>1368_bases
ATGAATCTAATTGATATTTTAAACAAAGTTGATGCTTTTATTTGGGGACCACCCCTACTGGTACTATTAGTTGGTACTGG
TATACTACTTACTGTTAAGCTTGGAGTTGTTCAAATAACTAAACTGCCAAGAGCTCTTAAGTTAATATTCTCTGCTGAAA
ACAAAGGTAGTGGTGATGTTTCAAGTTTTGCAGCCTTATGTACTGCTCTAGCTGCTACAGTTGGTACTGGTAATATTGTT
GGTGTTGCTACAGCTATCAAAGCTGGTGGACCTGGTGCACTTTTTTGGATGTGGATAGCAGCATTCTTTGGAATGGCTAC
TAAGTATTCAGAAGGTGTTCTTGCAATAAAATACAGAACTAAAGATAAAAATGGTCAAGTGTCTGGTGGGCCAATGTATT
ACATAGTAAATGGTATGGGAGAAAAATGGAGACCTCTTGCAATATTTTTCGCTATAAGTGGTATACTAGTTGCACTTTTA
GGAATCGGTACTTTTACTCAAGTAAATTCAATAACAGATGCAATAAATAATAGTTTCGGGATAGACCCTAGAATTACAGG
GGTTGTATTAGCAGTATTTGTAGCTTTAGTTGTATTTGGAGGACTTAAAAGTATATCTAATGTAGCTACTAAAATAGTAC
CTTTTATGGCAGTTATATATGTTGTAATCTGTGGAATCATTTTAATATCTTTTTGGAATAAAATCCCTGAAACTTTTATG
TTAATAATTAAAAGTGCATTTACACCTACTGCTGCTACTGGTGGTTTTTTAGGAGCAACTATGTCACTGGCAATTAGAAA
TGGTATCGCTCGTGGTGTATTTTCAAATGAGTCTGGTCTAGGTAGTGCTCCAATAGCTGCAGCTGCTGCTAAAACTGAAT
GGCCAGCGGAACAAGGTCTTATATCTATGACAGGTACTTTTATAGATACTATTATAATCTGTACTCTTACTGGATTCTCT
CTTGTTATTTCAGGAGTGTGGTGTTCAGACCTAAATGGAGCTGTTATGACACAAGCAGCTTTTAACGGAGCAATTCCTAC
ATTTGGACCAATATTACTTACAGTTAGTTTAACATTATTTGCATTTACTACAATTTTGGGATGGAGTTATTATGGAGAAA
GATGTTTTGAATTTCTGTTTGGTGTAAAAGGCATGAATGGGTATAGAACTGTATTTGTGGCTATGGTGTTATTAGGTGCT
TTCTTAAAGTTAGAAGTTGTTTGGATAATTGCTGATATTGTAAATGGGCTTATGGCAATACCTAACCTTATAGCTTTACT
TGCATTATCACCTATAATAGTATCTGAAACTAAAAAATATTTTGAACATATAAATTCTCCAGAAAATCAGATAAAGAAAA
ATGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TACACTAGAAATTATTAATAAATTATACTTATTTCCTGTCAATTACTTCATTAAAAATTCTATTGATTATGTAAAGCAAA
AAAAATGAGGGAGTGTTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAAAGTATAGAATCCCAAGTCAATTTTATATGGCTTTCGGATTCTATATTTTTTTGAAAAAATGTAATAAATATATT
TGCAAAATACGGTAATTAAC

Product: sodium:solute symporter

Products: Na (I) [Cytoplasm]; L-alanine [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 455; Mature: 455

Protein sequence:

>455_residues
MNLIDILNKVDAFIWGPPLLVLLVGTGILLTVKLGVVQITKLPRALKLIFSAENKGSGDVSSFAALCTALAATVGTGNIV
GVATAIKAGGPGALFWMWIAAFFGMATKYSEGVLAIKYRTKDKNGQVSGGPMYYIVNGMGEKWRPLAIFFAISGILVALL
GIGTFTQVNSITDAINNSFGIDPRITGVVLAVFVALVVFGGLKSISNVATKIVPFMAVIYVVICGIILISFWNKIPETFM
LIIKSAFTPTAATGGFLGATMSLAIRNGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTEWPAEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGFS
LVISGVWCSDLNGAVMTQAAFNGAIPTFGPILLTVSLTLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGVKGMNGYRTVFVAMVLLGA
FLKLEVVWIIADIVNGLMAIPNLIALLALSPIIVSETKKYFEHINSPENQIKKNA

Sequences:

>Translated_455_residues
MNLIDILNKVDAFIWGPPLLVLLVGTGILLTVKLGVVQITKLPRALKLIFSAENKGSGDVSSFAALCTALAATVGTGNIV
GVATAIKAGGPGALFWMWIAAFFGMATKYSEGVLAIKYRTKDKNGQVSGGPMYYIVNGMGEKWRPLAIFFAISGILVALL
GIGTFTQVNSITDAINNSFGIDPRITGVVLAVFVALVVFGGLKSISNVATKIVPFMAVIYVVICGIILISFWNKIPETFM
LIIKSAFTPTAATGGFLGATMSLAIRNGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTEWPAEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGFS
LVISGVWCSDLNGAVMTQAAFNGAIPTFGPILLTVSLTLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGVKGMNGYRTVFVAMVLLGA
FLKLEVVWIIADIVNGLMAIPNLIALLALSPIIVSETKKYFEHINSPENQIKKNA
>Mature_455_residues
MNLIDILNKVDAFIWGPPLLVLLVGTGILLTVKLGVVQITKLPRALKLIFSAENKGSGDVSSFAALCTALAATVGTGNIV
GVATAIKAGGPGALFWMWIAAFFGMATKYSEGVLAIKYRTKDKNGQVSGGPMYYIVNGMGEKWRPLAIFFAISGILVALL
GIGTFTQVNSITDAINNSFGIDPRITGVVLAVFVALVVFGGLKSISNVATKIVPFMAVIYVVICGIILISFWNKIPETFM
LIIKSAFTPTAATGGFLGATMSLAIRNGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTEWPAEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGFS
LVISGVWCSDLNGAVMTQAAFNGAIPTFGPILLTVSLTLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGVKGMNGYRTVFVAMVLLGA
FLKLEVVWIIADIVNGLMAIPNLIALLALSPIIVSETKKYFEHINSPENQIKKNA

Specific function: Unknown

COG id: COG1115

COG function: function code E; Na+/alanine symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:alanine (SAF) symporter family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786188, Length=445, Percent_Identity=37.5280898876404, Blast_Score=265, Evalue=6e-72,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001463 [H]

Pfam domain/function: PF01235 Na_Ala_symp [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48201; Mature: 48201

Theoretical pI: Translated: 9.45; Mature: 9.45

Prosite motif: PS00873 NA_ALANINE_SYMP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNLIDILNKVDAFIWGPPLLVLLVGTGILLTVKLGVVQITKLPRALKLIFSAENKGSGDV
CCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
SSFAALCTALAATVGTGNIVGVATAIKAGGPGALFWMWIAAFFGMATKYSEGVLAIKYRT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEE
KDKNGQVSGGPMYYIVNGMGEKWRPLAIFFAISGILVALLGIGTFTQVNSITDAINNSFG
CCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
IDPRITGVVLAVFVALVVFGGLKSISNVATKIVPFMAVIYVVICGIILISFWNKIPETFM
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIIKSAFTPTAATGGFLGATMSLAIRNGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTEWPAEQGL
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHCCH
ISMTGTFIDTIIICTLTGFSLVISGVWCSDLNGAVMTQAAFNGAIPTFGPILLTVSLTLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
AFTTILGWSYYGERCFEFLFGVKGMNGYRTVFVAMVLLGAFLKLEVVWIIADIVNGLMAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PNLIALLALSPIIVSETKKYFEHINSPENQIKKNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MNLIDILNKVDAFIWGPPLLVLLVGTGILLTVKLGVVQITKLPRALKLIFSAENKGSGDV
CCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
SSFAALCTALAATVGTGNIVGVATAIKAGGPGALFWMWIAAFFGMATKYSEGVLAIKYRT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEE
KDKNGQVSGGPMYYIVNGMGEKWRPLAIFFAISGILVALLGIGTFTQVNSITDAINNSFG
CCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
IDPRITGVVLAVFVALVVFGGLKSISNVATKIVPFMAVIYVVICGIILISFWNKIPETFM
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIIKSAFTPTAATGGFLGATMSLAIRNGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTEWPAEQGL
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHCCH
ISMTGTFIDTIIICTLTGFSLVISGVWCSDLNGAVMTQAAFNGAIPTFGPILLTVSLTLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
AFTTILGWSYYGERCFEFLFGVKGMNGYRTVFVAMVLLGAFLKLEVVWIIADIVNGLMAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PNLIALLALSPIIVSETKKYFEHINSPENQIKKNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; L-alanine [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + L-alanine [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + L-alanine [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]