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The map label for this gene is 126208450

Identifier: 126208450

GI number: 126208450

Start: 1129435

End: 1130811

Strand: Direct

Name: 126208450

Synonym: APL_0976

Alternate gene names: NA

Gene position: 1129435-1130811 (Clockwise)

Preceding gene: 126208449

Following gene: 126208451

Centisome position: 49.66

GC content: 43.43

Gene sequence:

>1377_bases
ATGTTATCTAACGAAGTTGTTATCTCAATTATCGTATTACTTGCCCTGAGTTTACTCAGAATTAATGTGGTAATTGCGCT
AATTATTGCAGCATTGACCTGTGGCGTAATCGGCTTCTATGGGGTTGATGATATGAGCATGTTCGATGCTCTGACAAAAA
CGATCGAAAAATTTACCAGCGGTTTAGGCGGTGGTGCGGAAACCGCGATGAACTACGCCGTACTCGGCGCATTTGCCGTA
GCCTTATCTAAATCGGGTGTTACCGATTTATTGGCATATAAAGTTATTTCTTCATTCGGGAAACGCCCTTCCGGTCGTTC
GGTGTTTTGGTTTAAATATCTTGTACTCTTCGTATTAACCGCATTTGCGATTTCATCACAAAACCTTATTCCGATTCATA
TCGCCTTTATTCCGATTGTGGTTCCGCCGTTATTAAGCGTGATGAATCAGCTAAAAATCGACCGCCGAGCGGTAGCTTGT
GCTTTAACATTCGGTTTAACCGCTACTTATATGTTAATCCCTGCCGGTTTCGGACAAATCTTTATTGAAAGTATCTTAGT
TAAAAATATTAACCAAGCGGGACAGCCTTTTAATCTTGTCGCAACCACGGCGGAAATGACTAAAGCGATGGCGGTACCGG
TTGCCGGTATGATTTTAGGTTTACTATTCGCTTTCTTCGTTTCCTATCGTAAACCGAGAACTTACGTAGAAAACGTAAAA
GAAGCGACCGCCGATGAAATTGCCGCACGTGTCGCAAAAGTTAAACCGTTTCATATCGGTGTAAGCATTATCGCAATCCT
TGCGACATGTTCCGTGCAATTGACAACCAATTCCACCGTTATCGGCGGTTTAGCCGGCTTAATTATTTTCGCTTTAGGCG
GCGTATTCAAATTAAAACAAACTAACGATTTATTCCAAGACGGCTTACGTTTAATGGCGATGATTGGTTTCGTAATGATT
GCCGCATCCGGTTTTGCCAGCGTAGTAAATGCAACCGGCGGCGTGCCGGAATTGGTTGAAGCCTTACGCGATTCGATTCA
AACGAAAGAAATGGCTGCGTTATTGATGTTAATTGTCGGCTTATTTATTACAATGGGTATCGGTTCATCATTCTCAACCG
TGCCGATTATTACCTCTATTTATGTACCGCTATGTGTATCATTCGGTTTCTCTCCGTTAGCAACGATGGCTATCGTGGGT
GTAGCAGCCGCTTTAGGTGACGCGGGTTCTCCGGCATCCGACTCAACATTAGGTCCGACATCCGGTTTAAATGCCGACGG
TAAACACGACCATATTTGGGATTCTGTCGTACCGACATTCTTACACTTTAATATTCCGTTATTAGTGTTCGGTTGGATTG
CGGCAATGATGCTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCATTATTTTCTTTATTCTATAAAAAAATGCTCGACAACTCCGTTTTTTACGTTACATTAAACTCTTATTTAATTTGTTA
TTACAAAAAGGGAAAACACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTTTTTGCTTATACCACGGATAATGCAAATTTTTTCGGAAATATAACCGCTTGTTTGCTTTATCCGTGGTTTCTATTTG
GATTTTACGTATGAAATTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 458; Mature: 458

Protein sequence:

>458_residues
MLSNEVVISIIVLLALSLLRINVVIALIIAALTCGVIGFYGVDDMSMFDALTKTIEKFTSGLGGGAETAMNYAVLGAFAV
ALSKSGVTDLLAYKVISSFGKRPSGRSVFWFKYLVLFVLTAFAISSQNLIPIHIAFIPIVVPPLLSVMNQLKIDRRAVAC
ALTFGLTATYMLIPAGFGQIFIESILVKNINQAGQPFNLVATTAEMTKAMAVPVAGMILGLLFAFFVSYRKPRTYVENVK
EATADEIAARVAKVKPFHIGVSIIAILATCSVQLTTNSTVIGGLAGLIIFALGGVFKLKQTNDLFQDGLRLMAMIGFVMI
AASGFASVVNATGGVPELVEALRDSIQTKEMAALLMLIVGLFITMGIGSSFSTVPIITSIYVPLCVSFGFSPLATMAIVG
VAAALGDAGSPASDSTLGPTSGLNADGKHDHIWDSVVPTFLHFNIPLLVFGWIAAMML

Sequences:

>Translated_458_residues
MLSNEVVISIIVLLALSLLRINVVIALIIAALTCGVIGFYGVDDMSMFDALTKTIEKFTSGLGGGAETAMNYAVLGAFAV
ALSKSGVTDLLAYKVISSFGKRPSGRSVFWFKYLVLFVLTAFAISSQNLIPIHIAFIPIVVPPLLSVMNQLKIDRRAVAC
ALTFGLTATYMLIPAGFGQIFIESILVKNINQAGQPFNLVATTAEMTKAMAVPVAGMILGLLFAFFVSYRKPRTYVENVK
EATADEIAARVAKVKPFHIGVSIIAILATCSVQLTTNSTVIGGLAGLIIFALGGVFKLKQTNDLFQDGLRLMAMIGFVMI
AASGFASVVNATGGVPELVEALRDSIQTKEMAALLMLIVGLFITMGIGSSFSTVPIITSIYVPLCVSFGFSPLATMAIVG
VAAALGDAGSPASDSTLGPTSGLNADGKHDHIWDSVVPTFLHFNIPLLVFGWIAAMML
>Mature_458_residues
MLSNEVVISIIVLLALSLLRINVVIALIIAALTCGVIGFYGVDDMSMFDALTKTIEKFTSGLGGGAETAMNYAVLGAFAV
ALSKSGVTDLLAYKVISSFGKRPSGRSVFWFKYLVLFVLTAFAISSQNLIPIHIAFIPIVVPPLLSVMNQLKIDRRAVAC
ALTFGLTATYMLIPAGFGQIFIESILVKNINQAGQPFNLVATTAEMTKAMAVPVAGMILGLLFAFFVSYRKPRTYVENVK
EATADEIAARVAKVKPFHIGVSIIAILATCSVQLTTNSTVIGGLAGLIIFALGGVFKLKQTNDLFQDGLRLMAMIGFVMI
AASGFASVVNATGGVPELVEALRDSIQTKEMAALLMLIVGLFITMGIGSSFSTVPIITSIYVPLCVSFGFSPLATMAIVG
VAAALGDAGSPASDSTLGPTSGLNADGKHDHIWDSVVPTFLHFNIPLLVFGWIAAMML

Specific function: Unknown

COG id: COG2056

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48335; Mature: 48335

Theoretical pI: Translated: 8.31; Mature: 8.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure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CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]