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The map label for this gene is afuB_2 [H]

Identifier: 126208046

GI number: 126208046

Start: 633109

End: 635109

Strand: Direct

Name: afuB_2 [H]

Synonym: APL_0564

Alternate gene names: 126208046

Gene position: 633109-635109 (Clockwise)

Preceding gene: 126208045

Following gene: 126208047

Centisome position: 27.84

GC content: 44.08

Gene sequence:

>2001_bases
ATGTTACAACGTTTTTCTCATTCTTATTTTTGGATCTTACTAGCGTTGCTTGCCTTTGCTTGCTTGCCCTCGCAGGCTTT
AGATTACGGCTTATTCGGCGCAACCAAAAGCGAACTCGCAGCGGCAATGGGCTGGAGTAACGTTAATATCAGTTGGCTTT
GGTTTGGCGGTTTACTGATTTTTCCGGCGTTTCGTTTCATAAAAGATCGCATCTTACGCAGCCGAATCGAATTAGGTCTG
GTGCTGTTGCTCACACTTTTTCTGTTATCTTCCGCCGTTTATCTTAGCTATCGTTTCGGCTATGCGATTATTTTTCTTGC
TTTCGCACTATTAGCAATCAGCAGCAATGCGTTGGCGAATTTAAAGGTGTTACAAGCCGATCGCTTTATGATCGTGAGCT
TGTTAGTAGTGATATTGACGATAGCACTTTTTATTTTATATCCGATCACCACAATTTTTAGCACGATGTTCAGCGAGGGC
GATTCGTTTGCGATCCTAGAACAAAGCTATCTTTTACGGATTATTTGGAATTCGTTAAGCGTATCGGCAACGGTGGGCTT
GTTATCCACTATACTCGGTTTATGTTTTGCACTTTATACCACTCGAATGGCAAGCAAACGTACCCGCTTGCTCAGTAAGT
TTTTTTCGGTTCTGCCAATAGTTACGCCGCCTTTTGTGGTGAGTTTGGGCATTGCGTTAATGCTTGGGCGTTCCGGTTAT
ATTACTGACTTTTTGGTGGAATATTTCGGATTTAGTGCAAGCTGGCTGTATGGTTTTACAGGTATCACCGTTTCGCACAC
CCTAGCGCTGACACCGATGGCGTTTATGATTTTAGAAGGTGCGTTAAAATCGTCTAACGTGGCATTGGAAGAAGCGAGTT
ACACGCTACGAGCAAATAACTGGCAAACATTCCGCTTTATATTATTGCCGCTGCTCAAGCCGGCGTTAGCCAATTCGTTT
TTGGTAATTACCGTGCAATCGCTTGCCGATTTTAGTACGCCGTTTGTGTTGGGCGGTAATTTTGATGTGTTGGCGAGCCA
AATTTATTTTTACCTTGTCGGCACGCAGTTGGATTATGCGGCGGCAAGCGGTTTAGGCACAATTTTACTTGGCTTTTCCT
TGCTGTTTTTTCTGATTCAATATTGGTGGATTGGCAACGGATCTTATGTCACGGTATCCGGAAAGGGGTATCGAGGTACA
TTCCAGCCGTTACCAAGCGGTCTAAAAAGCCTAATTTTTTGCATACTCGCCGTGTGGGTCGGTTTTACCGTTTTGCTGTA
CGGTTCGATTTTTTACGGTAGCTTTACCGTGAATTGGGGCGTGGATCATAGCTTTACCTTAGAAAATTATCGCAATCTAT
TCGGGCAAGGCTTAGATCAGGGCGGTTTTCCGTCATTGATTCAAACCGTGTTGTTCTCGCTGATTGCTGCCCCAATCAGT
GCGGTATTGGGGCTATTAATCGCTTATTTGCTGACTCGCCGTAACTTTGTCGGTAAGCAGAGTTTGGAATTTGTTACTTT
ACTTTGTTTTGCCGTGCCGGGGACGGTTGCCGGCGTGTCTTATGTGCTGGCGTTTAATCATTCGCCGCTTTATCTTACCG
GCACGGCGGTAATTATTGTATTGTCGATGGTGACACGCAATATGCCGATTGGAATGCGAGCTTGTATGGCGGCATTACAG
CAATTGGATAAATCGCTCGATGAAGCCTCGTTTTCTTTAAAAGGGAGTTCGCTTAAAACGTTATTGTTTGTAACCTTGCC
TTTGTTAAAACCGGCATTTTTATCGGCGTTAGTCACCAGCTTTGTTCGTTCTATGACTACGATTAGTGCGATCGTATTTT
TAGTTTCACCAAGTACCCGAGTGGCGACCTCTTATATTCTGAATAGAGTTGAAGATGGTGCATACGGATTGGCGGTGGCA
TACGGCTCAACGTTGATTATGGTGATGGTGTTAATTATCGGTTTATTTGGCTGGTTAATGAAAGATAAACGGCAGTTTTA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGATTTTTACAAAAACATTTGCAAAATTTAGGTTAAATTTAACCGCTTATAAACCACGCTATGCCGTGGTTTCTTTTTT
TTGAATAGCACAACCCCTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTATAGATTTTTAACAAGCGGTTATTTTTATTCAAACTTTTGCAAGTTTTGGGCTAAAAATAACCGCTTGTTTTTTA
GAATTGATTTGTAAATAAAA

Product: ferric transport system permease protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 666; Mature: 666

Protein sequence:

>666_residues
MLQRFSHSYFWILLALLAFACLPSQALDYGLFGATKSELAAAMGWSNVNISWLWFGGLLIFPAFRFIKDRILRSRIELGL
VLLLTLFLLSSAVYLSYRFGYAIIFLAFALLAISSNALANLKVLQADRFMIVSLLVVILTIALFILYPITTIFSTMFSEG
DSFAILEQSYLLRIIWNSLSVSATVGLLSTILGLCFALYTTRMASKRTRLLSKFFSVLPIVTPPFVVSLGIALMLGRSGY
ITDFLVEYFGFSASWLYGFTGITVSHTLALTPMAFMILEGALKSSNVALEEASYTLRANNWQTFRFILLPLLKPALANSF
LVITVQSLADFSTPFVLGGNFDVLASQIYFYLVGTQLDYAAASGLGTILLGFSLLFFLIQYWWIGNGSYVTVSGKGYRGT
FQPLPSGLKSLIFCILAVWVGFTVLLYGSIFYGSFTVNWGVDHSFTLENYRNLFGQGLDQGGFPSLIQTVLFSLIAAPIS
AVLGLLIAYLLTRRNFVGKQSLEFVTLLCFAVPGTVAGVSYVLAFNHSPLYLTGTAVIIVLSMVTRNMPIGMRACMAALQ
QLDKSLDEASFSLKGSSLKTLLFVTLPLLKPAFLSALVTSFVRSMTTISAIVFLVSPSTRVATSYILNRVEDGAYGLAVA
YGSTLIMVMVLIIGLFGWLMKDKRQF

Sequences:

>Translated_666_residues
MLQRFSHSYFWILLALLAFACLPSQALDYGLFGATKSELAAAMGWSNVNISWLWFGGLLIFPAFRFIKDRILRSRIELGL
VLLLTLFLLSSAVYLSYRFGYAIIFLAFALLAISSNALANLKVLQADRFMIVSLLVVILTIALFILYPITTIFSTMFSEG
DSFAILEQSYLLRIIWNSLSVSATVGLLSTILGLCFALYTTRMASKRTRLLSKFFSVLPIVTPPFVVSLGIALMLGRSGY
ITDFLVEYFGFSASWLYGFTGITVSHTLALTPMAFMILEGALKSSNVALEEASYTLRANNWQTFRFILLPLLKPALANSF
LVITVQSLADFSTPFVLGGNFDVLASQIYFYLVGTQLDYAAASGLGTILLGFSLLFFLIQYWWIGNGSYVTVSGKGYRGT
FQPLPSGLKSLIFCILAVWVGFTVLLYGSIFYGSFTVNWGVDHSFTLENYRNLFGQGLDQGGFPSLIQTVLFSLIAAPIS
AVLGLLIAYLLTRRNFVGKQSLEFVTLLCFAVPGTVAGVSYVLAFNHSPLYLTGTAVIIVLSMVTRNMPIGMRACMAALQ
QLDKSLDEASFSLKGSSLKTLLFVTLPLLKPAFLSALVTSFVRSMTTISAIVFLVSPSTRVATSYILNRVEDGAYGLAVA
YGSTLIMVMVLIIGLFGWLMKDKRQF
>Mature_666_residues
MLQRFSHSYFWILLALLAFACLPSQALDYGLFGATKSELAAAMGWSNVNISWLWFGGLLIFPAFRFIKDRILRSRIELGL
VLLLTLFLLSSAVYLSYRFGYAIIFLAFALLAISSNALANLKVLQADRFMIVSLLVVILTIALFILYPITTIFSTMFSEG
DSFAILEQSYLLRIIWNSLSVSATVGLLSTILGLCFALYTTRMASKRTRLLSKFFSVLPIVTPPFVVSLGIALMLGRSGY
ITDFLVEYFGFSASWLYGFTGITVSHTLALTPMAFMILEGALKSSNVALEEASYTLRANNWQTFRFILLPLLKPALANSF
LVITVQSLADFSTPFVLGGNFDVLASQIYFYLVGTQLDYAAASGLGTILLGFSLLFFLIQYWWIGNGSYVTVSGKGYRGT
FQPLPSGLKSLIFCILAVWVGFTVLLYGSIFYGSFTVNWGVDHSFTLENYRNLFGQGLDQGGFPSLIQTVLFSLIAAPIS
AVLGLLIAYLLTRRNFVGKQSLEFVTLLCFAVPGTVAGVSYVLAFNHSPLYLTGTAVIIVLSMVTRNMPIGMRACMAALQ
QLDKSLDEASFSLKGSSLKTLLFVTLPLLKPAFLSALVTSFVRSMTTISAIVFLVSPSTRVATSYILNRVEDGAYGLAVA
YGSTLIMVMVLIIGLFGWLMKDKRQF

Specific function: Part of the ABC transporter complex fbpABC (TC 3.A.1.10.1) involved in Fe(3+) ions import. Probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane [H]

COG id: COG1178

COG function: function code P; ABC-type Fe3+ transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 ABC transmembrane type-1 domains [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788764, Length=190, Percent_Identity=28.4210526315789, Blast_Score=73, Evalue=6e-14,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000515 [H]

Pfam domain/function: PF00528 BPD_transp_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 73243; Mature: 73243

Theoretical pI: Translated: 9.67; Mature: 9.67

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN ; PS50928 ABC_TM1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLQRFSHSYFWILLALLAFACLPSQALDYGLFGATKSELAAAMGWSNVNISWLWFGGLLI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHH
FPAFRFIKDRILRSRIELGLVLLLTLFLLSSAVYLSYRFGYAIIFLAFALLAISSNALAN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHC
LKVLQADRFMIVSLLVVILTIALFILYPITTIFSTMFSEGDSFAILEQSYLLRIIWNSLS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH
VSATVGLLSTILGLCFALYTTRMASKRTRLLSKFFSVLPIVTPPFVVSLGIALMLGRSGY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC
ITDFLVEYFGFSASWLYGFTGITVSHTLALTPMAFMILEGALKSSNVALEEASYTLRANN
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCEEEECCC
WQTFRFILLPLLKPALANSFLVITVQSLADFSTPFVLGGNFDVLASQIYFYLVGTQLDYA
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
AASGLGTILLGFSLLFFLIQYWWIGNGSYVTVSGKGYRGTFQPLPSGLKSLIFCILAVWV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFTVLLYGSIFYGSFTVNWGVDHSFTLENYRNLFGQGLDQGGFPSLIQTVLFSLIAAPIS
HHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVLGLLIAYLLTRRNFVGKQSLEFVTLLCFAVPGTVAGVSYVLAFNHSPLYLTGTAVIIV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHEEECCCCEEEHHHHHHHH
LSMVTRNMPIGMRACMAALQQLDKSLDEASFSLKGSSLKTLLFVTLPLLKPAFLSALVTS
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVRSMTTISAIVFLVSPSTRVATSYILNRVEDGAYGLAVAYGSTLIMVMVLIIGLFGWLM
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KDKRQF
HHCCCC
>Mature Secondary Structure
MLQRFSHSYFWILLALLAFACLPSQALDYGLFGATKSELAAAMGWSNVNISWLWFGGLLI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHH
FPAFRFIKDRILRSRIELGLVLLLTLFLLSSAVYLSYRFGYAIIFLAFALLAISSNALAN
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LKVLQADRFMIVSLLVVILTIALFILYPITTIFSTMFSEGDSFAILEQSYLLRIIWNSLS
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ITDFLVEYFGFSASWLYGFTGITVSHTLALTPMAFMILEGALKSSNVALEEASYTLRANN
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WQTFRFILLPLLKPALANSFLVITVQSLADFSTPFVLGGNFDVLASQIYFYLVGTQLDYA
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
AASGLGTILLGFSLLFFLIQYWWIGNGSYVTVSGKGYRGTFQPLPSGLKSLIFCILAVWV
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HHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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LSMVTRNMPIGMRACMAALQQLDKSLDEASFSLKGSSLKTLLFVTLPLLKPAFLSALVTS
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVRSMTTISAIVFLVSPSTRVATSYILNRVEDGAYGLAVAYGSTLIMVMVLIIGLFGWLM
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KDKRQF
HHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8807793 [H]