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The map label for this gene is 126175050

Identifier: 126175050

GI number: 126175050

Start: 3351989

End: 3353557

Strand: Reverse

Name: 126175050

Synonym: Sbal_2845

Alternate gene names: NA

Gene position: 3353557-3351989 (Counterclockwise)

Preceding gene: 126175051

Following gene: 126175047

Centisome position: 65.4

GC content: 44.61

Gene sequence:

>1569_bases
ATGACTGTTATGAATTATGCCGATTCGGCACTTTCCTTGCTGCCGCCTGCGGTGGCTATTGTGTTGGCGATCTTAACTCG
CCGTGTACTGCTTTCTTTGGGGTTAGGTATTTTAATTGGTGCTTTATTGCTCAATCAATTTTCACCTGTAGCGACGGGTG
AATTTGTATTTAATGGCGTTAAAGGACTTTTTTGGACGGGCGAAGGCCTTAATTCGTGGAACTTATATATTCTCGGTTTC
TTAATTGTACTGGGAATGATCACAGCGTTAATTACCGTAAGTGGCAGCGCGCGGGCTTTTGCCGATTGGGCTCGTTTACA
TATACGTAATAAACGTGACGCTAAATTATTAACCATGTTTTTAGGGTGTGTGGTTTTTATTGACGACTATTTCAATAGCT
TAGTCGTAGGTTCGGTCGCTAGACCTGTTACCGACCGTTATTATATTTCCCGCGCTAAGTTAGCTTATTTATTAGATTCT
ACTGCGGCACCTGTGTGCGTTATTTCACCAGTATCAAGTTGGGGCGCGTATATTATTGCACTTATTGGTGGAATATTAAC
GGCCCATGGTTTTGCTGATACTGGCCATTTGAGTATTTTTATTCAAATGATCCCAATGAACTTCTACGCAATCTTCTCCT
TGTTATTATTACTTTTCGTTGTCTTTATGGGATTAGATGTTGGGCCAATGCGCGAGCATGAACTCAATGCCCAACGTGGT
AATTTATACGATGAGTCAAAAGGATTACCGCCTGGAGCCAATGCGGATTTACCTGAAGCCGAAACCGGTAAGATCTTAGG
TTTATTCCTGCCGATTACTGTGTTGGTATTTGCAACCCTGTATTTTATGGTCAACAGTGGCGCTCAAGTGCTTGCCGCAG
AAGGGATTGAATTTAATATTATTTCAGCATTTGAGAAAACCGATGTCAGTTCATCCCTTTTCTTTGGTGCATTAATCGGT
TTAGCGATTTCGCTGATATTGAATTTAGTCCAAGGCGTTGAGAAATCAATGATAGTCAAAGGCATAGTGCAGGGCGCTCG
CTCTATGCTGCCAGCGATTTATATCCTGTTATTTGCTTGGACTATCGCAGGCGTGATTGGCCAGCTCGAAACCGGCAAGT
TTATGGCGAGCCTCGCGACGGGCAATATTCCGTTCGCCTTTTTGCCAGCCCTAATGTTTGTGTTAGCGGGTATTACTGCG
TTCTCAACCGGCACTAGCTGGGGCACGTTCGGTATCATGTTGCCGATTGCTGCGGATATGGCGATGGGAAGTCACACTGG
CATGATGCTACCTATGCTTGCTTCTGTGCTGGCGGGCGCGGTATTTGGCGATCACTGTTCACCGATTTCCGATACCACGA
TTTTGTCGTCTACGGGCGCGAGTTGTCACCATATCGACCATGTCGTCACTCAGCTACCGTATGCATTGATTGCGGCGTTT
ATTAGCTTAACGGGTTATGTCGTACTTGGATTTACTGAGTCAGTTGTCGCAGGTTTAGTGGCCTGTAGTGTGGTGTTTGT
GGTTAGCATCATAGTGCTAAAAATCAAATCTAAAGGCGCAATTAGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTATGGAGCGCTACTGATAGGACAGGTGACCTTGGGTATCTATTGCCTTTCCCCACCAGTTCAGTCGCCCTCCATTCGTA
TTTAACGAAGATAATAATCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACGCTAATTGAAACCTTTCCACTGCTACAAATAAATCAGCCAGCATTATGCTGGCTGATTTTTTTGGTTAACGCTCTATC
TCTAACTTAATTGCATTAAG

Product: Na+/H+ antiporter NhaC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 522; Mature: 521

Protein sequence:

>522_residues
MTVMNYADSALSLLPPAVAIVLAILTRRVLLSLGLGILIGALLLNQFSPVATGEFVFNGVKGLFWTGEGLNSWNLYILGF
LIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDS
TAAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADTGHLSIFIQMIPMNFYAIFSLLLLLFVVFMGLDVGPMREHELNAQRG
NLYDESKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMVNSGAQVLAAEGIEFNIISAFEKTDVSSSLFFGALIG
LAISLILNLVQGVEKSMIVKGIVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGITA
FSTGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIAAF
ISLTGYVVLGFTESVVAGLVACSVVFVVSIIVLKIKSKGAIS

Sequences:

>Translated_522_residues
MTVMNYADSALSLLPPAVAIVLAILTRRVLLSLGLGILIGALLLNQFSPVATGEFVFNGVKGLFWTGEGLNSWNLYILGF
LIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDS
TAAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADTGHLSIFIQMIPMNFYAIFSLLLLLFVVFMGLDVGPMREHELNAQRG
NLYDESKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMVNSGAQVLAAEGIEFNIISAFEKTDVSSSLFFGALIG
LAISLILNLVQGVEKSMIVKGIVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGITA
FSTGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIAAF
ISLTGYVVLGFTESVVAGLVACSVVFVVSIIVLKIKSKGAIS
>Mature_521_residues
TVMNYADSALSLLPPAVAIVLAILTRRVLLSLGLGILIGALLLNQFSPVATGEFVFNGVKGLFWTGEGLNSWNLYILGFL
IVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDST
AAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADTGHLSIFIQMIPMNFYAIFSLLLLLFVVFMGLDVGPMREHELNAQRGN
LYDESKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMVNSGAQVLAAEGIEFNIISAFEKTDVSSSLFFGALIGL
AISLILNLVQGVEKSMIVKGIVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGITAF
STGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIAAFI
SLTGYVVLGFTESVVAGLVACSVVFVVSIIVLKIKSKGAIS

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55374; Mature: 55243

Theoretical pI: Translated: 6.60; Mature: 6.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTVMNYADSALSLLPPAVAIVLAILTRRVLLSLGLGILIGALLLNQFSPVATGEFVFNGV
CCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCC
KGLFWTGEGLNSWNLYILGFLIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMF
CCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDSTAAPVCVISPVSSWGAYIIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH
LIGGILTAHGFADTGHLSIFIQMIPMNFYAIFSLLLLLFVVFMGLDVGPMREHELNAQRG
HHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCC
NLYDESKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMVNSGAQVLAAEGIEFNI
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEEE
ISAFEKTDVSSSLFFGALIGLAISLILNLVQGVEKSMIVKGIVQGARSMLPAIYILLFAW
EHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGITAFSTGTSWGTFGIMLPIAADM
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIAAF
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLTGYVVLGFTESVVAGLVACSVVFVVSIIVLKIKSKGAIS
HHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TVMNYADSALSLLPPAVAIVLAILTRRVLLSLGLGILIGALLLNQFSPVATGEFVFNGV
CCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCC
KGLFWTGEGLNSWNLYILGFLIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMF
CCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDSTAAPVCVISPVSSWGAYIIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH
LIGGILTAHGFADTGHLSIFIQMIPMNFYAIFSLLLLLFVVFMGLDVGPMREHELNAQRG
HHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCC
NLYDESKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMVNSGAQVLAAEGIEFNI
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEEE
ISAFEKTDVSSSLFFGALIGLAISLILNLVQGVEKSMIVKGIVQGARSMLPAIYILLFAW
EHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGITAFSTGTSWGTFGIMLPIAADM
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIAAF
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLTGYVVLGFTESVVAGLVACSVVFVVSIIVLKIKSKGAIS
HHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]