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The map label for this gene is norM [H]

Identifier: 125625146

GI number: 125625146

Start: 2327625

End: 2328914

Strand: Reverse

Name: norM [H]

Synonym: llmg_2386

Alternate gene names: 125625146

Gene position: 2328914-2327625 (Counterclockwise)

Preceding gene: 125625147

Following gene: 125625144

Centisome position: 92.07

GC content: 35.66

Gene sequence:

>1290_bases
ATGAAAACAAATAAAGAAATATTAAAATTCGCCCTTCCTGCGATTATTGAAAATTTCTTGCAAATGTTAGTTGGTGTGAG
TGATACAATGATTGTTGCTCACCTTAGTCTTTCTGCTGTGGCCGCAGTTTCTCTTGCGAATAATTTAATTACGGTATATC
AGGCAATATTTATCGCCCTAGGAACAATTATTTCAAGTTTATTTGCCAAGGTACTTATTGAAAAAAAGGCAAAAGAAAAA
TCAAAAGAATTAATCAATTCTGCAACTAAACTCACCGTTTTAATCGGTTTAGTTTTTGGTCTATTTTCCCTTTTTGCTGC
TCAACCGATTCTTTATTTGTTGGGGGCTCGTCAGCAAGTTTTAGAACTTTCAATCATTTATCTGAGTTTAGTGGGTGGTT
TGATTGTTCTTTTAGCTTTAATGACAACTTTTGGGGCCTTTTTGCGGGCTGATGGAAACACAAAGACACCCATGTGGGCG
TCTTTCTTTGCAAGTGTTCTAAATTTATTATTTTCAATTGTTTTTATCTTTGTTTTTCATTTAGGCGTCTTAGGAACGGC
ACTTGGAGCAGTTCTTGCCAGAGTAATTGGGACAGCTTTCCTCTATTATAAATTAAAAGAAAAACGGCCCAGTCTTCAAT
TTTATAAAGAAAAACTCAATCGTCAGTTAATCAAGCTAAGTCTACCTGCGGCAGGAGAAAGATTATCCATGAGATTGGGT
GATTTATTAATCATGATGATTATTGTCCGTTTAGGAGAACGTGTCTTTGCGGGAAATGCAATTGGCGAGAGCATTACACA
ATTTAATTATATGCCAGTCTTTGGGATGGCAACCGTGACAGTTATTTTAGTCGCACAGGCAACCGCTGAAAACAATATTG
AAAATATTAAATCTTACATCAAAAAAACTTACTGGTTGGCAACAAGTATGATGTTTGTCATTGGATTAGTTCTTTTACTG
ACAGCCAATATGCTAAATCAGCTATTTACTACTGACAGAATTGCCATGGGCGCAAGTATGACAGTCATCTTATTTTCTTT
TTTAGCGACTTTCTTCGTCACAGGAGCGACGACTTACACAGCGGCTTTTCAGGGAATTGGAAATACCAAACTTCCATTTT
ATGCAACAACTTTAGGCATGTTTGGCATTCGGTTAATCTTAGGCGCATTTTTAGCTTTAGTATTGAAGTTAGGCTTAGAA
GGTGTTTGGTTGGCGGTCTTACTTGATAACTTTTTTAGATTCGTTTTTCTTAAGATAAAATTTAAGAAAACACTCATAAC
AGAAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCAAAGCTGTGTTAGGGCTTGAAAAAGCTGAAATTTTGCATCATACAGTAGTTCCAGTTCAGGAAATGCAAAAAGAAGTA
GAGAAATACCTTGGTTTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAAAAAAAAACTGACAAGATTTTGTCAGTATTTTTATTATTTTTTCAACAAGTCGCGAATTTCTTGGAGAGTTTCCAAT
TCTTCGTTTTTTTGTTCTTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Multidrug-efflux transporter [H]

Number of amino acids: Translated: 429; Mature: 429

Protein sequence:

>429_residues
MKTNKEILKFALPAIIENFLQMLVGVSDTMIVAHLSLSAVAAVSLANNLITVYQAIFIALGTIISSLFAKVLIEKKAKEK
SKELINSATKLTVLIGLVFGLFSLFAAQPILYLLGARQQVLELSIIYLSLVGGLIVLLALMTTFGAFLRADGNTKTPMWA
SFFASVLNLLFSIVFIFVFHLGVLGTALGAVLARVIGTAFLYYKLKEKRPSLQFYKEKLNRQLIKLSLPAAGERLSMRLG
DLLIMMIIVRLGERVFAGNAIGESITQFNYMPVFGMATVTVILVAQATAENNIENIKSYIKKTYWLATSMMFVIGLVLLL
TANMLNQLFTTDRIAMGASMTVILFSFLATFFVTGATTYTAAFQGIGNTKLPFYATTLGMFGIRLILGAFLALVLKLGLE
GVWLAVLLDNFFRFVFLKIKFKKTLITEI

Sequences:

>Translated_429_residues
MKTNKEILKFALPAIIENFLQMLVGVSDTMIVAHLSLSAVAAVSLANNLITVYQAIFIALGTIISSLFAKVLIEKKAKEK
SKELINSATKLTVLIGLVFGLFSLFAAQPILYLLGARQQVLELSIIYLSLVGGLIVLLALMTTFGAFLRADGNTKTPMWA
SFFASVLNLLFSIVFIFVFHLGVLGTALGAVLARVIGTAFLYYKLKEKRPSLQFYKEKLNRQLIKLSLPAAGERLSMRLG
DLLIMMIIVRLGERVFAGNAIGESITQFNYMPVFGMATVTVILVAQATAENNIENIKSYIKKTYWLATSMMFVIGLVLLL
TANMLNQLFTTDRIAMGASMTVILFSFLATFFVTGATTYTAAFQGIGNTKLPFYATTLGMFGIRLILGAFLALVLKLGLE
GVWLAVLLDNFFRFVFLKIKFKKTLITEI
>Mature_429_residues
MKTNKEILKFALPAIIENFLQMLVGVSDTMIVAHLSLSAVAAVSLANNLITVYQAIFIALGTIISSLFAKVLIEKKAKEK
SKELINSATKLTVLIGLVFGLFSLFAAQPILYLLGARQQVLELSIIYLSLVGGLIVLLALMTTFGAFLRADGNTKTPMWA
SFFASVLNLLFSIVFIFVFHLGVLGTALGAVLARVIGTAFLYYKLKEKRPSLQFYKEKLNRQLIKLSLPAAGERLSMRLG
DLLIMMIIVRLGERVFAGNAIGESITQFNYMPVFGMATVTVILVAQATAENNIENIKSYIKKTYWLATSMMFVIGLVLLL
TANMLNQLFTTDRIAMGASMTVILFSFLATFFVTGATTYTAAFQGIGNTKLPFYATTLGMFGIRLILGAFLALVLKLGLE
GVWLAVLLDNFFRFVFLKIKFKKTLITEI

Specific function: Multidrug efflux pump [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=435, Percent_Identity=27.1264367816092, Blast_Score=115, Evalue=7e-27,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47198; Mature: 47198

Theoretical pI: Translated: 10.52; Mature: 10.52

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10360571 [H]