| Definition | Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009004 |
| Length | 2,529,478 |
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The map label for this gene is ps453 [H]
Identifier: 125624861
GI number: 125624861
Start: 2072866
End: 2078013
Strand: Reverse
Name: ps453 [H]
Synonym: llmg_2089
Alternate gene names: 125624861
Gene position: 2078013-2072866 (Counterclockwise)
Preceding gene: 125624862
Following gene: 125624860
Centisome position: 82.15
GC content: 36.38
Gene sequence:
>5148_bases ATGGCAGATATAATGGTTGATTCAGTCACCACAGGGATTGACTTGAATGAGACAAAAGCTGTTGAGGCTATCAACCGCTT AAAATCAGCAGTTAAAGATAGTACTCGTGAATGGCAGATAAATGAAGCACAGGCTAAATCTGCTGGAGATGCTGTTTCTG CATCAAAATATCGCTATGAAGGTCTTAGTGAAGCAATGGAAAAGCAAAAAGCTTATATTGCTAACCTTTCAGAAGGTATG AAGACAATCAATAGAGATACTGATGCTGGCGAGAAAGCTTATCAAAAATATAATGCTCAGTTAAGCACAGCAGAACGTTC TCTTGCCTCAATGACAGGGCAATTAAACCGTGCGAAATCAGCTTATGAATATCAACAAACAGGAATTGAAGATTTAAATA AATCTCTCAGTGCTAATGATAAACTCATGCAGTCTCAAATTGATTTATATGAGAAGACTCGTAATAAAATGGGGGCTGCC AAAGCTGAAGTTTCTGGTCTATCTACTTCATACGCAAAGCAAACTGAGATTTATAGAGCCCAAGTAACTGAGCTTAAACG TTTAGAATCTGCTGAGGGTACAAGTTCAGAAACTCTTGTCAAACAAAAAACAAGAGTAAATGAAGCTGCTTCGTCATTAT TGAACTACAGAAATAAACTTTTAGAAGCTAACTTGGCAGTTACAAAGATGCAACCGTTTAATTCTGAGTCTCTCATTGGT AAAGGTTTAAATACTGTTTATCAAACAACTGAGAAAGCTACCGATGTAATGGCAGCAGGATATCAGAAAGTAAAAAATGC AGCATATCAAAGCGCTTTTGGTATTGCAGCAATTGGAGCGGCAGCTATAAAAGGCTCTCAAATGGCAGCTGATTTGCAGG ATAGTTATATTAGAACAACCAATCTTGCTGTAACTGGTGGTGAAAAAGTTGCAGAAGTAACCAAAAATGTTGCTCAAATG 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Upstream 100 bases:
>100_bases GCTTCATTCGATGATTTGAAGAAGATGTTCGGACAATAATATTCATGTTAATACCTAATGTTTAGGTTTTTTTATACTCA AAAATTAGAAAGGAGTAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CATTTTCAATAAGTTTTAACGGTATTGAGTTATCTGCATTGGCAGATGGATTTACATCGATTGAGAGAAACTTTGGGGCT ACTTGGACAAACAATCTAGG
Product: phage tail component
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1715; Mature: 1714
Protein sequence:
>1715_residues MADIMVDSVTTGIDLNETKAVEAINRLKSAVKDSTREWQINEAQAKSAGDAVSASKYRYEGLSEAMEKQKAYIANLSEGM KTINRDTDAGEKAYQKYNAQLSTAERSLASMTGQLNRAKSAYEYQQTGIEDLNKSLSANDKLMQSQIDLYEKTRNKMGAA KAEVSGLSTSYAKQTEIYRAQVTELKRLESAEGTSSETLVKQKTRVNEAASSLLNYRNKLLEANLAVTKMQPFNSESLIG KGLNTVYQTTEKATDVMAAGYQKVKNAAYQSAFGIAAIGAAAIKGSQMAADLQDSYIRTTNLAVTGGEKVAEVTKNVAQM QKDGAQYSVEYGKSQKEIAEGYQELIKRGYTSTEALGAMRSELQASVASGDDFNNVLSVTSQVVDAYGMRTDNAAQMTKN TKDVVNQLAYAADMTATDFASMGKAMEYVGDSSHSAGFQLSEASSAIGILSNHGLEADKAGTGLRKVINSITGALSDQSA SQEDAAKSESALNEKIAEHQKKLEEAQAVVNSGTGNTKAATKAIEKQKEAIGKLQNKVDQLQSGGAAKDMLSKLGIKNSD LVDANGNLRDLTTIMSIVNDHTKNMGTAEKSSVFQQLFGTTGQQAGIILAQNNKELEELNNKVKNSADGQGYVANLAKKN MGSVKSEIKQFKAAGEAVLIMIGQKFLPVLSDAATSMAKAFNSKEGKQGLEEIAGWIAKIFQGIVDTVKFIGTHKDEVVT FGKIFAGIWATKKIGDVIVWLKKLKKSLLEIQAIDALSGGLGTGGIKSSVGKGVVSEAGTVASTVTKGGVAAEGEALVAS GGLSKATSLIPRLLGIIGSVGGSTVLSGGINAGAELLSKDSTAQKTGGVAGSLGGAAAGAAIGSLIAPGIGTAIGAAIGG MGGKNLGKKLGDLINDGLKESSLKSEKLPVVKFDLKAPTKDMKEFSKDYQGFLDKIKKSATIDIVDEKSLEKAKKATADA YAKMSKDIDKFYQNQEKDSKKQVDILVKNGVITQAQADKLNKGQKDSDEKQKNAQKKNLDEMKKNTDNYYASVSKEQKRA NDANTRLTKDHDAEIKKIKSGSTDALLALEKKYGKNSPQYQKEMMAEILRATNSFDNKQEQNKKEHSNNMNKIEKDYAKT QTKSEEQMNNQINTATKIAQNKQLDLLDDLKNKKGKLNQKQLIDTLEKADDEYKGVKDKAQKQKDDVVKAANEQYKKSVA AIDKQRAENGSITKAQYDEMIKTAKKQRDDSIGHANEQYKGVVDKAQKTHKETIDFANDKADKNVKAAAGEQKQTVEQYT KGFRDSRDLINSFVDGINGVLNFLHKGWGNIGHVSLKGYAVGTRGLAQDETALVGEEGFELAHHPNRGIFAVGQQGPEIR NLKAGTSILPHSMSKEFLSLTANLPAHADGVSGFLSDALGWVKSTYKDVTSVISKGPKGVVDAIYNGLGLDDLENDFPPV VTRIAKGSAQTAQDNFIKFLQSFFKKAESDAGGSQGSPSGSGVQRWAGQVKQALAANGLSTSQDMIDRVLRQISSESSGN EKAVQGNIGDINNITGDLAKGLMQTISSTFNANKFPGHGDIFNGYDNLLAALNYAKKTYGSSLSFLGNGHGYENGGVIDA HGFYEIAEGNRPEMVIPLDPQKKSRATQLLNQASQTIAAHEPSNKPNNNIETALTEAVNLLSQMLGITKEQTTALKNQPA PIIDENSLFKGAAATINKTQNAYQNSSNRRRGIIN
Sequences:
>Translated_1715_residues MADIMVDSVTTGIDLNETKAVEAINRLKSAVKDSTREWQINEAQAKSAGDAVSASKYRYEGLSEAMEKQKAYIANLSEGM KTINRDTDAGEKAYQKYNAQLSTAERSLASMTGQLNRAKSAYEYQQTGIEDLNKSLSANDKLMQSQIDLYEKTRNKMGAA KAEVSGLSTSYAKQTEIYRAQVTELKRLESAEGTSSETLVKQKTRVNEAASSLLNYRNKLLEANLAVTKMQPFNSESLIG KGLNTVYQTTEKATDVMAAGYQKVKNAAYQSAFGIAAIGAAAIKGSQMAADLQDSYIRTTNLAVTGGEKVAEVTKNVAQM QKDGAQYSVEYGKSQKEIAEGYQELIKRGYTSTEALGAMRSELQASVASGDDFNNVLSVTSQVVDAYGMRTDNAAQMTKN TKDVVNQLAYAADMTATDFASMGKAMEYVGDSSHSAGFQLSEASSAIGILSNHGLEADKAGTGLRKVINSITGALSDQSA SQEDAAKSESALNEKIAEHQKKLEEAQAVVNSGTGNTKAATKAIEKQKEAIGKLQNKVDQLQSGGAAKDMLSKLGIKNSD LVDANGNLRDLTTIMSIVNDHTKNMGTAEKSSVFQQLFGTTGQQAGIILAQNNKELEELNNKVKNSADGQGYVANLAKKN MGSVKSEIKQFKAAGEAVLIMIGQKFLPVLSDAATSMAKAFNSKEGKQGLEEIAGWIAKIFQGIVDTVKFIGTHKDEVVT FGKIFAGIWATKKIGDVIVWLKKLKKSLLEIQAIDALSGGLGTGGIKSSVGKGVVSEAGTVASTVTKGGVAAEGEALVAS GGLSKATSLIPRLLGIIGSVGGSTVLSGGINAGAELLSKDSTAQKTGGVAGSLGGAAAGAAIGSLIAPGIGTAIGAAIGG MGGKNLGKKLGDLINDGLKESSLKSEKLPVVKFDLKAPTKDMKEFSKDYQGFLDKIKKSATIDIVDEKSLEKAKKATADA YAKMSKDIDKFYQNQEKDSKKQVDILVKNGVITQAQADKLNKGQKDSDEKQKNAQKKNLDEMKKNTDNYYASVSKEQKRA NDANTRLTKDHDAEIKKIKSGSTDALLALEKKYGKNSPQYQKEMMAEILRATNSFDNKQEQNKKEHSNNMNKIEKDYAKT QTKSEEQMNNQINTATKIAQNKQLDLLDDLKNKKGKLNQKQLIDTLEKADDEYKGVKDKAQKQKDDVVKAANEQYKKSVA AIDKQRAENGSITKAQYDEMIKTAKKQRDDSIGHANEQYKGVVDKAQKTHKETIDFANDKADKNVKAAAGEQKQTVEQYT KGFRDSRDLINSFVDGINGVLNFLHKGWGNIGHVSLKGYAVGTRGLAQDETALVGEEGFELAHHPNRGIFAVGQQGPEIR NLKAGTSILPHSMSKEFLSLTANLPAHADGVSGFLSDALGWVKSTYKDVTSVISKGPKGVVDAIYNGLGLDDLENDFPPV VTRIAKGSAQTAQDNFIKFLQSFFKKAESDAGGSQGSPSGSGVQRWAGQVKQALAANGLSTSQDMIDRVLRQISSESSGN EKAVQGNIGDINNITGDLAKGLMQTISSTFNANKFPGHGDIFNGYDNLLAALNYAKKTYGSSLSFLGNGHGYENGGVIDA HGFYEIAEGNRPEMVIPLDPQKKSRATQLLNQASQTIAAHEPSNKPNNNIETALTEAVNLLSQMLGITKEQTTALKNQPA PIIDENSLFKGAAATINKTQNAYQNSSNRRRGIIN >Mature_1714_residues ADIMVDSVTTGIDLNETKAVEAINRLKSAVKDSTREWQINEAQAKSAGDAVSASKYRYEGLSEAMEKQKAYIANLSEGMK TINRDTDAGEKAYQKYNAQLSTAERSLASMTGQLNRAKSAYEYQQTGIEDLNKSLSANDKLMQSQIDLYEKTRNKMGAAK AEVSGLSTSYAKQTEIYRAQVTELKRLESAEGTSSETLVKQKTRVNEAASSLLNYRNKLLEANLAVTKMQPFNSESLIGK GLNTVYQTTEKATDVMAAGYQKVKNAAYQSAFGIAAIGAAAIKGSQMAADLQDSYIRTTNLAVTGGEKVAEVTKNVAQMQ KDGAQYSVEYGKSQKEIAEGYQELIKRGYTSTEALGAMRSELQASVASGDDFNNVLSVTSQVVDAYGMRTDNAAQMTKNT KDVVNQLAYAADMTATDFASMGKAMEYVGDSSHSAGFQLSEASSAIGILSNHGLEADKAGTGLRKVINSITGALSDQSAS QEDAAKSESALNEKIAEHQKKLEEAQAVVNSGTGNTKAATKAIEKQKEAIGKLQNKVDQLQSGGAAKDMLSKLGIKNSDL VDANGNLRDLTTIMSIVNDHTKNMGTAEKSSVFQQLFGTTGQQAGIILAQNNKELEELNNKVKNSADGQGYVANLAKKNM GSVKSEIKQFKAAGEAVLIMIGQKFLPVLSDAATSMAKAFNSKEGKQGLEEIAGWIAKIFQGIVDTVKFIGTHKDEVVTF GKIFAGIWATKKIGDVIVWLKKLKKSLLEIQAIDALSGGLGTGGIKSSVGKGVVSEAGTVASTVTKGGVAAEGEALVASG GLSKATSLIPRLLGIIGSVGGSTVLSGGINAGAELLSKDSTAQKTGGVAGSLGGAAAGAAIGSLIAPGIGTAIGAAIGGM GGKNLGKKLGDLINDGLKESSLKSEKLPVVKFDLKAPTKDMKEFSKDYQGFLDKIKKSATIDIVDEKSLEKAKKATADAY AKMSKDIDKFYQNQEKDSKKQVDILVKNGVITQAQADKLNKGQKDSDEKQKNAQKKNLDEMKKNTDNYYASVSKEQKRAN DANTRLTKDHDAEIKKIKSGSTDALLALEKKYGKNSPQYQKEMMAEILRATNSFDNKQEQNKKEHSNNMNKIEKDYAKTQ TKSEEQMNNQINTATKIAQNKQLDLLDDLKNKKGKLNQKQLIDTLEKADDEYKGVKDKAQKQKDDVVKAANEQYKKSVAA IDKQRAENGSITKAQYDEMIKTAKKQRDDSIGHANEQYKGVVDKAQKTHKETIDFANDKADKNVKAAAGEQKQTVEQYTK GFRDSRDLINSFVDGINGVLNFLHKGWGNIGHVSLKGYAVGTRGLAQDETALVGEEGFELAHHPNRGIFAVGQQGPEIRN LKAGTSILPHSMSKEFLSLTANLPAHADGVSGFLSDALGWVKSTYKDVTSVISKGPKGVVDAIYNGLGLDDLENDFPPVV TRIAKGSAQTAQDNFIKFLQSFFKKAESDAGGSQGSPSGSGVQRWAGQVKQALAANGLSTSQDMIDRVLRQISSESSGNE KAVQGNIGDINNITGDLAKGLMQTISSTFNANKFPGHGDIFNGYDNLLAALNYAKKTYGSSLSFLGNGHGYENGGVIDAH GFYEIAEGNRPEMVIPLDPQKKSRATQLLNQASQTIAAHEPSNKPNNNIETALTEAVNLLSQMLGITKEQTTALKNQPAP IIDENSLFKGAAATINKTQNAYQNSSNRRRGIIN
Specific function: Unknown
COG id: COG5283
COG function: function code S; Phage-related tail protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To B.subtilis xkdO [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR008258 - InterPro: IPR010090 [H]
Pfam domain/function: PF10145 PhageMin_Tail; PF01464 SLT [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 183850; Mature: 183718
Theoretical pI: Translated: 9.53; Mature: 9.53
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MADIMVDSVTTGIDLNETKAVEAINRLKSAVKDSTREWQINEAQAKSAGDAVSASKYRYE CCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHH GLSEAMEKQKAYIANLSEGMKTINRDTDAGEKAYQKYNAQLSTAERSLASMTGQLNRAKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AYEYQQTGIEDLNKSLSANDKLMQSQIDLYEKTRNKMGAAKAEVSGLSTSYAKQTEIYRA HHHHHHHCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH QVTELKRLESAEGTSSETLVKQKTRVNEAASSLLNYRNKLLEANLAVTKMQPFNSESLIG HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHH KGLNTVYQTTEKATDVMAAGYQKVKNAAYQSAFGIAAIGAAAIKGSQMAADLQDSYIRTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC NLAVTGGEKVAEVTKNVAQMQKDGAQYSVEYGKSQKEIAEGYQELIKRGYTSTEALGAMR CEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH SELQASVASGDDFNNVLSVTSQVVDAYGMRTDNAAQMTKNTKDVVNQLAYAADMTATDFA HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH SMGKAMEYVGDSSHSAGFQLSEASSAIGILSNHGLEADKAGTGLRKVINSITGALSDQSA 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HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCHHCCCCHHH VTRIAKGSAQTAQDNFIKFLQSFFKKAESDAGGSQGSPSGSGVQRWAGQVKQALAANGLS HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TSQDMIDRVLRQISSESSGNEKAVQGNIGDINNITGDLAKGLMQTISSTFNANKFPGHGD CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC IFNGYDNLLAALNYAKKTYGSSLSFLGNGHGYENGGVIDAHGFYEIAEGNRPEMVIPLDP CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCEEECCCCCCCEEEECCC QKKSRATQLLNQASQTIAAHEPSNKPNNNIETALTEAVNLLSQMLGITKEQTTALKNQPA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCC PIIDENSLFKGAAATINKTQNAYQNSSNRRRGIIN CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure ADIMVDSVTTGIDLNETKAVEAINRLKSAVKDSTREWQINEAQAKSAGDAVSASKYRYE CCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHH GLSEAMEKQKAYIANLSEGMKTINRDTDAGEKAYQKYNAQLSTAERSLASMTGQLNRAKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AYEYQQTGIEDLNKSLSANDKLMQSQIDLYEKTRNKMGAAKAEVSGLSTSYAKQTEIYRA 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