| Definition | Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009004 |
| Length | 2,529,478 |
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The map label for this gene is 125624518
Identifier: 125624518
GI number: 125624518
Start: 1704039
End: 1706690
Strand: Direct
Name: 125624518
Synonym: llmg_1727
Alternate gene names: NA
Gene position: 1704039-1706690 (Clockwise)
Preceding gene: 125624517
Following gene: 125624519
Centisome position: 67.37
GC content: 35.52
Gene sequence:
>2652_bases ATGAAATTTATCAAGAAAAATAAATGGGCACTTCTTGCAAGTTTTTTTATTCCATTAATCTTAATGGTTATCGTTCTTGC AATGACTGGGATTTATTGGGGAAGTTCACGGTCAATTTTGGCTGGAGATGCTTATCATCAGTATGTCGCCATACATTCTC TCTATCGTAATATTTTACATTCTGGTGGTTCTCAAGGTTTCTTATATACTTTTACAAGTGGACTTGGTCTTAATCTTTAT GCATTTTCGGCTTATTATATGGGAAGTTTTCTCATGCCTTTCACTTTTTTCTTTGATGTGAAATCAATGCCAGATGCTTT GTATTTATTTACCATCATAAAATTTGGCCTAATTGGTTTGTCATCATTTGTCAGTTTCAAAAATATGTATCAAAAGCTTT CTAATCTGACTGTTTTATCAATAAGTACTGCTTTTGCACTGATGAGCTTTTTAACTTCGCAGCTTGAAATTACCATGTGG CTTGATGTATTCATTCTCCTTCCCTTGATTATTTGGGGACTTCACCGCTTAATGGATGAGCGAAAGCGTTGGCTCTATTT TGTAAGTTTACTGATTTTATTTATCCAGAATTACTACTTTGGCTTTATGGTCGCCATTTTCTTAGTGCTTTATTTCTTGG CGCGGATGACCTATGAAAAATGGTCTTGGACAAAAGTGCTTGATTTTGTAGTTTCTTCTACTTTGGCTGGAATCGCTAGT TTAATCATGTTATTGCCAATGTATCTGGATTTGAAGTCTAATAATTCCGATGCCTTATCCACTTTATCAGGAATTTTTAC TGAAAACTCGCATCTATTCGATCTTTTCGCCAAAAATTTTGTTGGAACTTATGATACCACTCAATTCAATGCCATTCCAA TGATTTATGTCGGCTTGATGCCACTAGGACTGGCTATCATCTTCTTTTTTACTAAAAGTATTCGACTCCGAAGTAAATTC GCTTTTCTAGGAATTATTGGTTTTTTAATTGCTTCCTTTTATCTTCAAGCCTTAGATTTATTATGGCAAGGGATGCATTC ACCTAACATGTTTTTACATCGTTATGCCTTTTTATTCAGCTTGCTCATCGTAATTATGGCTCTTGAAACTTTATCTCGCT GGAATGAAATCAAAACTTGGCATATTTTGACTATCAGCCTATTTTTAATTCTTGGATTTCTGTCAACTTTAGTCTTTGGC CATTACAAATACGTGATGACTTCCCAAGTTATGCTAACCTTTTTGTTTGGTCTTGCCTATCTGATTTTATCTATTAATTC TATCAGAAACTGGATTTCAAATCATCTTTTTGTCATTCTTCTCTTTATCTTTATGACCGTTGAGGCTGGTGTCAATGCCC TTTATCAAGTTCAAGGCGTGCAAAAAGAATGGAATTTTGCAAGTCGTGACTACTATAATACTCAAGTAAATTCTTTAGAA CCCATCGCCAATAAAGTAAATGAACTTTCTGGTTCAACTTTCGCCAGAACAGACAATACTGTTCCTGATACCGCTAATGA TGGAATGAAGTATAATTTCAATGCACTTTCCCAATTTTCATCTGTCCGTAACAGCAATGCCAGTTCAATCATGCGTCAGT TAGGATTCCATACTGACAGCACCTATTTGAACTTACGTTATCCTGGAAATACAATACTTATGGATTCAATTTTTGCTATC AAGTATAATATCAGTCAGGCCCAACCTCCAAAATTTGGTTTTTCACCTGCTTCCAACAGCCTTAGTACATTGACCCAGAA CTCAAATGCAATTGGCCTTGGTGTCTTTGTTCCTGGTGGGTTTAAAGATGCCAAATTCACTGATAAAGCGAAAGCTAGTA ACTTTATCAATAACCAAACAGCGTTAGTTAATGCATTAACTCAATCAAAGACTACCTTCTTTACTCCCTTTTACACTACA AGTGAAGAAACATCAGACAAAATTACTGGTGTGGGAAGTTCAGTGACGCTAACACGTCCAAAAACCTCTACTGCTACCGA TGTATCTGTCACTTACGGCATTACAGTTGACGCCAATAGCCAACTTTATCTGTCAGTACCAAATATTACTTATCTAAACA GTAATGCTGAAAATACTTTGATTACAATCTCTGATGTATCTAATCCAAAAATGACTCGTTCCCTTAATAGTTATTATATT GGCACGAATGACACTGGTTCTTTCTTCAATTTGGGAAGTTTTGCTAAAGAAACGAAACTCAAAGTGACCTTATCTTTTCC TGAAAATTCACAAGTTACCTTTGATACCACTTCGTTTTGGCGTCTAGATACTCAGACTTATCAAAAAGAAATGGCGCGTT TGAAATCTCGTAGCCCTAAAACGGAAACCATAAAAAATGGTGTTCGCATGACTTATAATGAGAAAGAAAAAGGAGATATT TTCCTTACTATCCCTTATGACAAAGGCTGGTCAGCTAAAATTGACGGTAAAAAAGTCCCTGTCAGTAAAGCTCAAGATGG TTTTACAAAAGTGACTGTTCCCGCTGGAAAACATCAACTAGAGCTCAAATTCTTCCCTAATGGCTTAAAAGAAGGAATCA TTTGCTTTATCTTAGGAATTTTGTTATTTATAGGTTACAACTACTTCACTAACAAACAAAGAAAAGCTGGAGGTCAGCAA AATGAAAGCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTTAGAATTCGGTTAAATAAAAAATACTGATTATTTTATCAGTATTTTTTTAATACACTTAATATAAGGTTGAATTTTGT ATCTTTGGTATAATAGAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATCAATTTTAACCTTTACTCTTGGAATTCTAGTAGCGGTAAGCATTCCTGTCTCTTATTCTCTAAAAACAAAACATTTTG AAGTCAATTTCAAAAAAGGA
Product: ABC transporter permease protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 883; Mature: 883
Protein sequence:
>883_residues MKFIKKNKWALLASFFIPLILMVIVLAMTGIYWGSSRSILAGDAYHQYVAIHSLYRNILHSGGSQGFLYTFTSGLGLNLY AFSAYYMGSFLMPFTFFFDVKSMPDALYLFTIIKFGLIGLSSFVSFKNMYQKLSNLTVLSISTAFALMSFLTSQLEITMW LDVFILLPLIIWGLHRLMDERKRWLYFVSLLILFIQNYYFGFMVAIFLVLYFLARMTYEKWSWTKVLDFVVSSTLAGIAS LIMLLPMYLDLKSNNSDALSTLSGIFTENSHLFDLFAKNFVGTYDTTQFNAIPMIYVGLMPLGLAIIFFFTKSIRLRSKF AFLGIIGFLIASFYLQALDLLWQGMHSPNMFLHRYAFLFSLLIVIMALETLSRWNEIKTWHILTISLFLILGFLSTLVFG HYKYVMTSQVMLTFLFGLAYLILSINSIRNWISNHLFVILLFIFMTVEAGVNALYQVQGVQKEWNFASRDYYNTQVNSLE PIANKVNELSGSTFARTDNTVPDTANDGMKYNFNALSQFSSVRNSNASSIMRQLGFHTDSTYLNLRYPGNTILMDSIFAI KYNISQAQPPKFGFSPASNSLSTLTQNSNAIGLGVFVPGGFKDAKFTDKAKASNFINNQTALVNALTQSKTTFFTPFYTT SEETSDKITGVGSSVTLTRPKTSTATDVSVTYGITVDANSQLYLSVPNITYLNSNAENTLITISDVSNPKMTRSLNSYYI GTNDTGSFFNLGSFAKETKLKVTLSFPENSQVTFDTTSFWRLDTQTYQKEMARLKSRSPKTETIKNGVRMTYNEKEKGDI FLTIPYDKGWSAKIDGKKVPVSKAQDGFTKVTVPAGKHQLELKFFPNGLKEGIICFILGILLFIGYNYFTNKQRKAGGQQ NES
Sequences:
>Translated_883_residues MKFIKKNKWALLASFFIPLILMVIVLAMTGIYWGSSRSILAGDAYHQYVAIHSLYRNILHSGGSQGFLYTFTSGLGLNLY AFSAYYMGSFLMPFTFFFDVKSMPDALYLFTIIKFGLIGLSSFVSFKNMYQKLSNLTVLSISTAFALMSFLTSQLEITMW LDVFILLPLIIWGLHRLMDERKRWLYFVSLLILFIQNYYFGFMVAIFLVLYFLARMTYEKWSWTKVLDFVVSSTLAGIAS LIMLLPMYLDLKSNNSDALSTLSGIFTENSHLFDLFAKNFVGTYDTTQFNAIPMIYVGLMPLGLAIIFFFTKSIRLRSKF AFLGIIGFLIASFYLQALDLLWQGMHSPNMFLHRYAFLFSLLIVIMALETLSRWNEIKTWHILTISLFLILGFLSTLVFG HYKYVMTSQVMLTFLFGLAYLILSINSIRNWISNHLFVILLFIFMTVEAGVNALYQVQGVQKEWNFASRDYYNTQVNSLE PIANKVNELSGSTFARTDNTVPDTANDGMKYNFNALSQFSSVRNSNASSIMRQLGFHTDSTYLNLRYPGNTILMDSIFAI KYNISQAQPPKFGFSPASNSLSTLTQNSNAIGLGVFVPGGFKDAKFTDKAKASNFINNQTALVNALTQSKTTFFTPFYTT SEETSDKITGVGSSVTLTRPKTSTATDVSVTYGITVDANSQLYLSVPNITYLNSNAENTLITISDVSNPKMTRSLNSYYI GTNDTGSFFNLGSFAKETKLKVTLSFPENSQVTFDTTSFWRLDTQTYQKEMARLKSRSPKTETIKNGVRMTYNEKEKGDI FLTIPYDKGWSAKIDGKKVPVSKAQDGFTKVTVPAGKHQLELKFFPNGLKEGIICFILGILLFIGYNYFTNKQRKAGGQQ NES >Mature_883_residues MKFIKKNKWALLASFFIPLILMVIVLAMTGIYWGSSRSILAGDAYHQYVAIHSLYRNILHSGGSQGFLYTFTSGLGLNLY AFSAYYMGSFLMPFTFFFDVKSMPDALYLFTIIKFGLIGLSSFVSFKNMYQKLSNLTVLSISTAFALMSFLTSQLEITMW LDVFILLPLIIWGLHRLMDERKRWLYFVSLLILFIQNYYFGFMVAIFLVLYFLARMTYEKWSWTKVLDFVVSSTLAGIAS LIMLLPMYLDLKSNNSDALSTLSGIFTENSHLFDLFAKNFVGTYDTTQFNAIPMIYVGLMPLGLAIIFFFTKSIRLRSKF AFLGIIGFLIASFYLQALDLLWQGMHSPNMFLHRYAFLFSLLIVIMALETLSRWNEIKTWHILTISLFLILGFLSTLVFG HYKYVMTSQVMLTFLFGLAYLILSINSIRNWISNHLFVILLFIFMTVEAGVNALYQVQGVQKEWNFASRDYYNTQVNSLE PIANKVNELSGSTFARTDNTVPDTANDGMKYNFNALSQFSSVRNSNASSIMRQLGFHTDSTYLNLRYPGNTILMDSIFAI KYNISQAQPPKFGFSPASNSLSTLTQNSNAIGLGVFVPGGFKDAKFTDKAKASNFINNQTALVNALTQSKTTFFTPFYTT SEETSDKITGVGSSVTLTRPKTSTATDVSVTYGITVDANSQLYLSVPNITYLNSNAENTLITISDVSNPKMTRSLNSYYI GTNDTGSFFNLGSFAKETKLKVTLSFPENSQVTFDTTSFWRLDTQTYQKEMARLKSRSPKTETIKNGVRMTYNEKEKGDI FLTIPYDKGWSAKIDGKKVPVSKAQDGFTKVTVPAGKHQLELKFFPNGLKEGIICFILGILLFIGYNYFTNKQRKAGGQQ NES
Specific function: Unknown
COG id: COG4485
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 99804; Mature: 99804
Theoretical pI: Translated: 9.83; Mature: 9.83
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKFIKKNKWALLASFFIPLILMVIVLAMTGIYWGSSRSILAGDAYHQYVAIHSLYRNILH CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH SGGSQGFLYTFTSGLGLNLYAFSAYYMGSFLMPFTFFFDVKSMPDALYLFTIIKFGLIGL CCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SSFVSFKNMYQKLSNLTVLSISTAFALMSFLTSQLEITMWLDVFILLPLIIWGLHRLMDE HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKRWLYFVSLLILFIQNYYFGFMVAIFLVLYFLARMTYEKWSWTKVLDFVVSSTLAGIAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIMLLPMYLDLKSNNSDALSTLSGIFTENSHLFDLFAKNFVGTYDTTQFNAIPMIYVGLM HHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH PLGLAIIFFFTKSIRLRSKFAFLGIIGFLIASFYLQALDLLWQGMHSPNMFLHRYAFLFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LLIVIMALETLSRWNEIKTWHILTISLFLILGFLSTLVFGHYKYVMTSQVMLTFLFGLAY HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILSINSIRNWISNHLFVILLFIFMTVEAGVNALYQVQGVQKEWNFASRDYYNTQVNSLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCHH PIANKVNELSGSTFARTDNTVPDTANDGMKYNFNALSQFSSVRNSNASSIMRQLGFHTDS HHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCC TYLNLRYPGNTILMDSIFAIKYNISQAQPPKFGFSPASNSLSTLTQNSNAIGLGVFVPGG CEEEEEECCCEEEEECEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEEECCC FKDAKFTDKAKASNFINNQTALVNALTQSKTTFFTPFYTTSEETSDKITGVGSSVTLTRP CCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHCCCCCEEEEECC KTSTATDVSVTYGITVDANSQLYLSVPNITYLNSNAENTLITISDVSNPKMTRSLNSYYI CCCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEECCCEEEECCCCCCEEEEEECCCCCHHHHCCCCEEE GTNDTGSFFNLGSFAKETKLKVTLSFPENSQVTFDTTSFWRLDTQTYQKEMARLKSRSPK CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCC TETIKNGVRMTYNEKEKGDIFLTIPYDKGWSAKIDGKKVPVSKAQDGFTKVTVPAGKHQL HHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEE ELKFFPNGLKEGIICFILGILLFIGYNYFTNKQRKAGGQQNES EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKFIKKNKWALLASFFIPLILMVIVLAMTGIYWGSSRSILAGDAYHQYVAIHSLYRNILH CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH SGGSQGFLYTFTSGLGLNLYAFSAYYMGSFLMPFTFFFDVKSMPDALYLFTIIKFGLIGL CCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SSFVSFKNMYQKLSNLTVLSISTAFALMSFLTSQLEITMWLDVFILLPLIIWGLHRLMDE HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKRWLYFVSLLILFIQNYYFGFMVAIFLVLYFLARMTYEKWSWTKVLDFVVSSTLAGIAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIMLLPMYLDLKSNNSDALSTLSGIFTENSHLFDLFAKNFVGTYDTTQFNAIPMIYVGLM HHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH PLGLAIIFFFTKSIRLRSKFAFLGIIGFLIASFYLQALDLLWQGMHSPNMFLHRYAFLFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LLIVIMALETLSRWNEIKTWHILTISLFLILGFLSTLVFGHYKYVMTSQVMLTFLFGLAY HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILSINSIRNWISNHLFVILLFIFMTVEAGVNALYQVQGVQKEWNFASRDYYNTQVNSLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCHH PIANKVNELSGSTFARTDNTVPDTANDGMKYNFNALSQFSSVRNSNASSIMRQLGFHTDS HHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCC TYLNLRYPGNTILMDSIFAIKYNISQAQPPKFGFSPASNSLSTLTQNSNAIGLGVFVPGG CEEEEEECCCEEEEECEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEEECCC FKDAKFTDKAKASNFINNQTALVNALTQSKTTFFTPFYTTSEETSDKITGVGSSVTLTRP CCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHCCCCCEEEEECC KTSTATDVSVTYGITVDANSQLYLSVPNITYLNSNAENTLITISDVSNPKMTRSLNSYYI CCCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEECCCEEEECCCCCCEEEEEECCCCCHHHHCCCCEEE GTNDTGSFFNLGSFAKETKLKVTLSFPENSQVTFDTTSFWRLDTQTYQKEMARLKSRSPK CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCC TETIKNGVRMTYNEKEKGDIFLTIPYDKGWSAKIDGKKVPVSKAQDGFTKVTVPAGKHQL HHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEE ELKFFPNGLKEGIICFILGILLFIGYNYFTNKQRKAGGQQNES EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA