| Definition | Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009004 |
| Length | 2,529,478 |
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The map label for this gene is yhgE [H]
Identifier: 125624458
GI number: 125624458
Start: 1635111
End: 1637510
Strand: Reverse
Name: yhgE [H]
Synonym: llmg_1659
Alternate gene names: 125624458
Gene position: 1637510-1635111 (Counterclockwise)
Preceding gene: 125624460
Following gene: 125624457
Centisome position: 64.74
GC content: 37.58
Gene sequence:
>2400_bases ATGTTAAAAAAGGAATGGCAGGCCATTTTAAAACACAAATTTTTTATTATTGTTATTATTGCATTGGCGCTTGTACCAGC AATTTACAACTATATTTTCTTGGGGTCGATGTGGGACCCCTATGGTAAGCTAAATGACTTACCGGTAGCAGTTGTAAATT TGGACAAGACGTCTGAATTGAACGGTAAAAAATTCAAACTTGGTGATGATGTCATTACTGAGATGAAAAAATCAAAGGAT TTAGACTATCATTTCGTTTCCAAGGACAAAGCTTCTGAGGGAATAAAAAAAGGTGACTATTATATGGTCATTACTTTCCC AGAAAACTTTTCAGAAAATGCGACGACGCTGATGAATAAAGAGCCAAAAACAGTCCAGTTAGATTATCAAACAACACGCG GTCACAATTATATTTCATCAAAAATGAGTGAAAGTGCGATGAATCAACTGAAATCAGAGGTTTCTAAAAACATTACCCAA ACTTATACAAAAGAAATATTTGCTAAACTTGGTGACATGAAGTCGGGAATGAAAGAAGCTTCTGACGGCTCAAATAAATT AGCTGATGGGACTTCGTCAGCGCTGTCAGGTTCCACAGAATTGACTAATAATTTGAACACTTTGTCCTCTTCTAGTGTAA CTTTTAATAATGGCGCTGATAGTTTAAATTTTGGCCTAAATAAGTTTGTTTCAGGAGTGGATCAAGCTGCAAATGGAGGA CAACAAGTTTCTTCAGGTGCTGACCAATTTGTCAGTGGAACTCAACAATTAGCTGAGGGAACCCAAACTTTGGCTGATAA ATCTAAAGATCTGTCAGCAGGAATTTCACAGATTTCTCAAAGTACAGAAGCGGTGAGCCAATTGCAATTGGGTGTGCAAC AACTATCCGAAGGCTTAAGTCAAATGGCTCAAAAAACAACTTTATCCGAAACTCAACAGCAAAATATTAGTGCTGTGCAA AATGGTCTTACTGAATTAAATCAAGAGTTACAAAAAAATACGATTGACCCAAATTTGGCTGCTAATGTCCAAAAAAACTT GGAAGGTCTTGGAGCTACGGTTACAAATTTAGCTAATGATCAAGTGGCAGCCTCTAAGGCAGCAGTTGAAAGTACTGAGA CTTTTAAAACTTTAACCAAAAGTCAGAAAACAGATATAAGAAATGCATTAGATAATTCTGTTGGTGCCGGAGCGGTTCAA GCTGATTTAGTTTCATTAAATGAGAATATTACAGGGGTCAAAAACAGTCTTACAAATCTACTACCAATGCTTGGAAAAAT TGCTGATCTTAAAACATTAGTTCCAGGGGCAAGTCAAACAATTACTGACCTTTCTACAGGTTTAAATAGTGTGAATAGTA GCTTAAATAGTCAAATTTTACCAGGAATGAATAAACTAGACAGTGGTTTGACAACATTCAATAGTCAACTCACCTCTGGT GGACAAAAATTGAGTTCTGGCTTTACCCAATATGCTGACGGAGTAGCTAAGGCAAACGCTGGTGCTCAACAATTGGCAAG TAAATCAAAAGACTTGCAAAGTGGAACCATGCAATTAGTCTCAGGATTGACTCAACTACAAGCGAATGGTCCATCATTAA CTTCTGGCTCAAACCAATTGGCAAGTGGTGCAAAGCAAATTTCAACGGGTTCACAACAGTTGGCAAATGGTGGCTCAAAC TTAACTAATGGTTTGGGAACTTTAAATACAGGTGCTACTGATTTATCAACAGCTTTAACTAAGGCTGATGATAGTCTGTC AGCAACAAATTCTACTGACGAAAATGCTAAAAAAGTAGCAGCTCCACTGAAACTTAAACATACTGACCATGATAATGTGC CAGTAAATGGTGCTGGGATGACTCCTTATATGATTAATGTTGCACTCTTTATTGGGGCGCTTGCCACTAATGTCGTAATT GGAGTTGGTTTCTCAGGAGAAAAATGGAAATCAGGACGCGAATTTATGTTTGCTAAGATTGGCACAAATGGTTTAGTTGC ACTTTTGCAAGGAATCATTGTCTGGGGAGCAGTGGCACTTCTTGGTTTGAGTCCAAATCATTGGTGGGAAATGCTATTAG TCGTTCTTTTGATAAGTTTTGCATATATGGCTATAAATACTTTCTTCTTAACGGCTTTAGGAAAAGTAGGTGAGTTTGTC ATGATTGTCGTTCTTGTGTTGCAATTAGCGACAAGCGCTGGAACCTATCCATTACAATTAGCTCCTAAGATCTATCAAGT CATCAGTCCTTGGTTGCCAATGACCTATGGATTAAAGATGCTACGTGAAACAATTGGCTTGAATGGCGCGATTTTACCTG AAGCAATTCTCTTTGTGGTTATTATCGCCGTCTTTACATTAATGTTGAGTTTCTTCAAAAAATTCTCACGCTTTGCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCCAAAAGCGAATGGATAATAATTGTCAATTTTTCTAAAAAGTTTATAATACATATTGTAACAGTTTTTGGACGTTGTGT CCATAAAGAAAGGGGAAATG
Downstream 100 bases:
>100_bases TATAAAAATTACTGACAGAAACTTTCTAGACTGAATTTTTACCTGCCAGTAATTTTTTGTCTAGAAATTTTAAAATAAAT TTGGTAAAATAAAGCTGTAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORFB [H]
Number of amino acids: Translated: 799; Mature: 799
Protein sequence:
>799_residues MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSELNGKKFKLGDDVITEMKKSKD LDYHFVSKDKASEGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNKEPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITQ TYTKEIFAKLGDMKSGMKEASDGSNKLADGTSSALSGSTELTNNLNTLSSSSVTFNNGADSLNFGLNKFVSGVDQAANGG QQVSSGADQFVSGTQQLAEGTQTLADKSKDLSAGISQISQSTEAVSQLQLGVQQLSEGLSQMAQKTTLSETQQQNISAVQ NGLTELNQELQKNTIDPNLAANVQKNLEGLGATVTNLANDQVAASKAAVESTETFKTLTKSQKTDIRNALDNSVGAGAVQ ADLVSLNENITGVKNSLTNLLPMLGKIADLKTLVPGASQTITDLSTGLNSVNSSLNSQILPGMNKLDSGLTTFNSQLTSG GQKLSSGFTQYADGVAKANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLTQLQANGPSLTSGSNQLASGAKQISTGSQQLANGGSN LTNGLGTLNTGATDLSTALTKADDSLSATNSTDENAKKVAAPLKLKHTDHDNVPVNGAGMTPYMINVALFIGALATNVVI GVGFSGEKWKSGREFMFAKIGTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLSPNHWWEMLLVVLLISFAYMAINTFFLTALGKVGEFV MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVVIIAVFTLMLSFFKKFSRFA
Sequences:
>Translated_799_residues MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSELNGKKFKLGDDVITEMKKSKD LDYHFVSKDKASEGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNKEPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITQ TYTKEIFAKLGDMKSGMKEASDGSNKLADGTSSALSGSTELTNNLNTLSSSSVTFNNGADSLNFGLNKFVSGVDQAANGG QQVSSGADQFVSGTQQLAEGTQTLADKSKDLSAGISQISQSTEAVSQLQLGVQQLSEGLSQMAQKTTLSETQQQNISAVQ NGLTELNQELQKNTIDPNLAANVQKNLEGLGATVTNLANDQVAASKAAVESTETFKTLTKSQKTDIRNALDNSVGAGAVQ ADLVSLNENITGVKNSLTNLLPMLGKIADLKTLVPGASQTITDLSTGLNSVNSSLNSQILPGMNKLDSGLTTFNSQLTSG GQKLSSGFTQYADGVAKANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLTQLQANGPSLTSGSNQLASGAKQISTGSQQLANGGSN LTNGLGTLNTGATDLSTALTKADDSLSATNSTDENAKKVAAPLKLKHTDHDNVPVNGAGMTPYMINVALFIGALATNVVI GVGFSGEKWKSGREFMFAKIGTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLSPNHWWEMLLVVLLISFAYMAINTFFLTALGKVGEFV MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVVIIAVFTLMLSFFKKFSRFA >Mature_799_residues MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSELNGKKFKLGDDVITEMKKSKD LDYHFVSKDKASEGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNKEPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITQ TYTKEIFAKLGDMKSGMKEASDGSNKLADGTSSALSGSTELTNNLNTLSSSSVTFNNGADSLNFGLNKFVSGVDQAANGG QQVSSGADQFVSGTQQLAEGTQTLADKSKDLSAGISQISQSTEAVSQLQLGVQQLSEGLSQMAQKTTLSETQQQNISAVQ NGLTELNQELQKNTIDPNLAANVQKNLEGLGATVTNLANDQVAASKAAVESTETFKTLTKSQKTDIRNALDNSVGAGAVQ ADLVSLNENITGVKNSLTNLLPMLGKIADLKTLVPGASQTITDLSTGLNSVNSSLNSQILPGMNKLDSGLTTFNSQLTSG GQKLSSGFTQYADGVAKANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLTQLQANGPSLTSGSNQLASGAKQISTGSQQLANGGSN LTNGLGTLNTGATDLSTALTKADDSLSATNSTDENAKKVAAPLKLKHTDHDNVPVNGAGMTPYMINVALFIGALATNVVI GVGFSGEKWKSGREFMFAKIGTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLSPNHWWEMLLVVLLISFAYMAINTFFLTALGKVGEFV MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVVIIAVFTLMLSFFKKFSRFA
Specific function: Unknown
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR022703 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 84982; Mature: 84982
Theoretical pI: Translated: 7.83; Mature: 7.83
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSEL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCC NGKKFKLGDDVITEMKKSKDLDYHFVSKDKASEGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNK CCCEEECCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHCC EPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITQTYTKEIFAKLGDMKSGMKEA CCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SDGSNKLADGTSSALSGSTELTNNLNTLSSSSVTFNNGADSLNFGLNKFVSGVDQAANGG CCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHCHHHCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC QQVSSGADQFVSGTQQLAEGTQTLADKSKDLSAGISQISQSTEAVSQLQLGVQQLSEGLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QMAQKTTLSETQQQNISAVQNGLTELNQELQKNTIDPNLAANVQKNLEGLGATVTNLAND HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH QVAASKAAVESTETFKTLTKSQKTDIRNALDNSVGAGAVQADLVSLNENITGVKNSLTNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH LPMLGKIADLKTLVPGASQTITDLSTGLNSVNSSLNSQILPGMNKLDSGLTTFNSQLTSG HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH GQKLSSGFTQYADGVAKANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLTQLQANGPSLTSGSNQL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH ASGAKQISTGSQQLANGGSNLTNGLGTLNTGATDLSTALTKADDSLSATNSTDENAKKVA HHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHH APLKLKHTDHDNVPVNGAGMTPYMINVALFIGALATNVVIGVGFSGEKWKSGREFMFAKI CCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEC GTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLSPNHWWEMLLVVLLISFAYMAINTFFLTALGKVGEFV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVV HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH IIAVFTLMLSFFKKFSRFA HHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSEL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCC NGKKFKLGDDVITEMKKSKDLDYHFVSKDKASEGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNK CCCEEECCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHCC EPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITQTYTKEIFAKLGDMKSGMKEA CCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SDGSNKLADGTSSALSGSTELTNNLNTLSSSSVTFNNGADSLNFGLNKFVSGVDQAANGG CCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHCHHHCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC QQVSSGADQFVSGTQQLAEGTQTLADKSKDLSAGISQISQSTEAVSQLQLGVQQLSEGLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QMAQKTTLSETQQQNISAVQNGLTELNQELQKNTIDPNLAANVQKNLEGLGATVTNLAND HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH QVAASKAAVESTETFKTLTKSQKTDIRNALDNSVGAGAVQADLVSLNENITGVKNSLTNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH LPMLGKIADLKTLVPGASQTITDLSTGLNSVNSSLNSQILPGMNKLDSGLTTFNSQLTSG HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH GQKLSSGFTQYADGVAKANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLTQLQANGPSLTSGSNQL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH ASGAKQISTGSQQLANGGSNLTNGLGTLNTGATDLSTALTKADDSLSATNSTDENAKKVA HHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHH APLKLKHTDHDNVPVNGAGMTPYMINVALFIGALATNVVIGVGFSGEKWKSGREFMFAKI CCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEC GTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLSPNHWWEMLLVVLLISFAYMAINTFFLTALGKVGEFV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVV HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH IIAVFTLMLSFFKKFSRFA HHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]