| Definition | Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009004 |
| Length | 2,529,478 |
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The map label for this gene is 125624385
Identifier: 125624385
GI number: 125624385
Start: 1557660
End: 1558601
Strand: Direct
Name: 125624385
Synonym: llmg_1583
Alternate gene names: NA
Gene position: 1557660-1558601 (Clockwise)
Preceding gene: 125624369
Following gene: 125624399
Centisome position: 61.58
GC content: 33.33
Gene sequence:
>942_bases ATGACTTTAAAAACTTTCTTTAATTTTACACGTATTCAAACTTTACCAGCGGCTTTGCTCTCACCAATTGCTGGCTGCCT TTTTGCTCTTTGGTATTTTAAAAGCTTCCACTTTTGGCCCACCTTTTTCTTTTTTATCGGTTTAGCGAGTATTAATCTTT TTGTCTCTGCTTGGAATAATTTAATGGATTATCAAAAGGCGCTTGACCCTGAATATAAAAAATGGAATATTATCGTTGCC AAATCAATTAATCCTAAACTTGCTTTAAAAATATGCTTGTCTTTCTTAGTTGTTGATGTAATTGTTGGACTAGTTGTTCT TTTCATGACTAATCTTGCTGTTCTTCCCATTGGTGGCCTTTGCTTTTTGATTGCTATTTTCTATACCTACGGTCCTTTTG CTTTCTCTCGCTTTCCTCTAGGTGAACTTTTAGCCGGTCTTTGTGAGGGATTTTTTGGATTTTTCCTTGCGGTCTATCTT AACTCTTATGACAAAGGATATTTTTTCATTAGCTTTGACAAAAACTGGCTCATGACTTGGACTTGGGATTTTAAAATTCT TCTCCCAATACTTTTAGTCGGCTTGATGTGTTTTGTTCAAAATTTTAATATCATGTTTTCTGACAATATTTGCGATTTAG ACCAAGACATTCGTAACGAGCGTTATACCCTTCCATATTATTTAAAAATTCCACTGAGTTTAAAAATATTTACTGGACTT TATCTTTTTGTCGGGCTTTGTATTCTACTTGCTATTTGTCTCAAAATTTTACCCATTTGGTCACTACTCATGCTAATCAT TTCAGTTAGAGTCATTCCTAATATTCAAAAATTCAGGGCAAAGCAAAGTAAATCAGAAACTTTCCATTTACAGATTAACA ATCTTATGCTATTTAATGCCTCACTTGCTATCACTCTTTTACTAGGTATCATTTTTAGATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAGTCAATTTTCTTGTCAAGTAAATAAAGTTTTTTAGACAGCTTTGTCAGTACATTTGAATTATGTTTTATCTCCCTTAT TTTGCTATAATCAGCTTATC
Downstream 100 bases:
>100_bases ACAAAAAAATCGCTAAGCGCTTTTTATTTTTCTAAAGAAAAGTCCATGAGAACAGGTTGATGGTCTGACGATTTAAATTG ATTATCAATGGTTTGTATTT
Product: putative prenyltransferase
Products: NA
Alternate protein names: UbiA Prenyltransferase; Prenyltransferase; 1 4-Dihydroxy-2-Naphtoate Prenyltransferase; 1 4-Dihydroxy-2-Naphthoate Polyprenyltransferase; 1 4-Dihydroxy-2-Naphthoate Octaprenyl Transferase; Prenyltransferase Ubia Family; Ubia Prenyltransferase; Prenyltransferase UbiA Family; Prenyltransferase UbiA Superfamily
Number of amino acids: Translated: 313; Mature: 312
Protein sequence:
>313_residues MTLKTFFNFTRIQTLPAALLSPIAGCLFALWYFKSFHFWPTFFFFIGLASINLFVSAWNNLMDYQKALDPEYKKWNIIVA KSINPKLALKICLSFLVVDVIVGLVVLFMTNLAVLPIGGLCFLIAIFYTYGPFAFSRFPLGELLAGLCEGFFGFFLAVYL NSYDKGYFFISFDKNWLMTWTWDFKILLPILLVGLMCFVQNFNIMFSDNICDLDQDIRNERYTLPYYLKIPLSLKIFTGL YLFVGLCILLAICLKILPIWSLLMLIISVRVIPNIQKFRAKQSKSETFHLQINNLMLFNASLAITLLLGIIFR
Sequences:
>Translated_313_residues MTLKTFFNFTRIQTLPAALLSPIAGCLFALWYFKSFHFWPTFFFFIGLASINLFVSAWNNLMDYQKALDPEYKKWNIIVA KSINPKLALKICLSFLVVDVIVGLVVLFMTNLAVLPIGGLCFLIAIFYTYGPFAFSRFPLGELLAGLCEGFFGFFLAVYL NSYDKGYFFISFDKNWLMTWTWDFKILLPILLVGLMCFVQNFNIMFSDNICDLDQDIRNERYTLPYYLKIPLSLKIFTGL YLFVGLCILLAICLKILPIWSLLMLIISVRVIPNIQKFRAKQSKSETFHLQINNLMLFNASLAITLLLGIIFR >Mature_312_residues TLKTFFNFTRIQTLPAALLSPIAGCLFALWYFKSFHFWPTFFFFIGLASINLFVSAWNNLMDYQKALDPEYKKWNIIVAK SINPKLALKICLSFLVVDVIVGLVVLFMTNLAVLPIGGLCFLIAIFYTYGPFAFSRFPLGELLAGLCEGFFGFFLAVYLN SYDKGYFFISFDKNWLMTWTWDFKILLPILLVGLMCFVQNFNIMFSDNICDLDQDIRNERYTLPYYLKIPLSLKIFTGLY LFVGLCILLAICLKILPIWSLLMLIISVRVIPNIQKFRAKQSKSETFHLQINNLMLFNASLAITLLLGIIFR
Specific function: Unknown
COG id: COG1575
COG function: function code H; 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 36143; Mature: 36012
Theoretical pI: Translated: 9.17; Mature: 9.17
Prosite motif: PS00678 WD_REPEATS_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.6 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 5.1 %Cys+Met (Translated Protein) 2.6 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTLKTFFNFTRIQTLPAALLSPIAGCLFALWYFKSFHFWPTFFFFIGLASINLFVSAWNN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LMDYQKALDPEYKKWNIIVAKSINPKLALKICLSFLVVDVIVGLVVLFMTNLAVLPIGGL HHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH CFLIAIFYTYGPFAFSRFPLGELLAGLCEGFFGFFLAVYLNSYDKGYFFISFDKNWLMTW HHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCEEEEE TWDFKILLPILLVGLMCFVQNFNIMFSDNICDLDQDIRNERYTLPYYLKIPLSLKIFTGL EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHH YLFVGLCILLAICLKILPIWSLLMLIISVRVIPNIQKFRAKQSKSETFHLQINNLMLFNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEEEEHH SLAITLLLGIIFR HHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure TLKTFFNFTRIQTLPAALLSPIAGCLFALWYFKSFHFWPTFFFFIGLASINLFVSAWNN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LMDYQKALDPEYKKWNIIVAKSINPKLALKICLSFLVVDVIVGLVVLFMTNLAVLPIGGL HHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH CFLIAIFYTYGPFAFSRFPLGELLAGLCEGFFGFFLAVYLNSYDKGYFFISFDKNWLMTW HHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCEEEEE TWDFKILLPILLVGLMCFVQNFNIMFSDNICDLDQDIRNERYTLPYYLKIPLSLKIFTGL EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHH YLFVGLCILLAICLKILPIWSLLMLIISVRVIPNIQKFRAKQSKSETFHLQINNLMLFNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEEEEHH SLAITLLLGIIFR HHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA