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The map label for this gene is cstA [H]

Identifier: 125623297

GI number: 125623297

Start: 420997

End: 423351

Strand: Direct

Name: cstA [H]

Synonym: llmg_0430

Alternate gene names: 125623297

Gene position: 420997-423351 (Clockwise)

Preceding gene: 125623296

Following gene: 125623299

Centisome position: 16.64

GC content: 40.76

Gene sequence:

>2355_bases
ATGAAAGATGATGGAAACTCTTCAAACTTTACTGATGAAGAAGAGCTGTTTTTGTTGCGCAATAAAGAAGGAAAAATTGT
CGGAATCAAGGATTTAAAGCAGGCAAATTTTCAAGAAACCATGAAAGACTGGAAAGAACATCTGCCAAAACCTAGCTTAT
TATCAATTATTATTTGGGTGGCTGTTGCTTTACTGGGTGGTCTTGCTTGGTCATTAATTGCGCTAGCGCAAGGGGAAACG
ATTAATGCGATTTGGTTTGTTATTGCAGCTGTTTGTTCTTATTTAATTGGTTATCGTTTCTATGCTTTATATATTCAACG
CAAAATCATGCGTCCTAATGACTTGCGAGCAACACCGTCAGAAGCTCATAATGACGGAAAAGAATTCGACCCAACCAATC
GAGTGGTTTTATTCGGACACCATTTTGCATCAATCGCTGGAGCTGGGCCTTTGGTTGGACCAGTTTTAGCGGCACAGATG
GGTTACTTACCAGGGACAATTTGGATTATTTTTGGGGTTATTTTTGCTGGTGGGGTACAAGATATGCTTGTTCTCTGGTA
TTCTCATCGTCGTCGTGCAAAATCAATTGGGGCAATGGCTCATGATGAAGTAGGTAGATTTGCTGGTGGCTTGACATCAT
TTATTGTTTTTATCATGACCATGATTGTTCTTGCTGTTTTGGCTTTGATTTGTGTGACGGCAATGGCAAATTCTGCTTGG
GCAGTCTTTTCGATTGGAATGACGATTCCAATTGCTTTACTAATGGGGATTTATCTAAAATACATCCGTCCAGGTCATGT
TAATGAAATTTCAGCAATTGGTTTTATTTTACTTTTAGTGGCTATTTTTGGTGGTCGTTGGGTTTCAGAATCTTCATTTG
CTCATATTTTCATGCTTTCGCCAACGGCTTTGGTATGGTGGGTGATGGGCTATACTTTTATTGCGGCGATTATTCCTGCT
TGGATTTTACTTACACCACGTGACTATCTATCAATGTTTATGAAAATTGGTACAATTGCTATTTTAGCAATAGCAGTCGT
TGGTGTGCGTCCTGATGTCACGATTCCAGCTTTGACAAATTTCGCACATAATACAGATGGCCCAGCTTTTGCTGGTTCAC
TCTTTCCGTTTTTATTCGTCACGATTGCCTGTGGGGCCTTGTCAGGCTTTCATGTCATGATGTCTTCTGGGACAACGCCC
CATTTGATTGCCAAAGAATCGCAAACGCGTATGATTGGTTATGGTGGTATGTTATTTGAGTCATTTGTTGCCATTATGGC
TTTAGTCGCTGCGATTTCTCTTAATCCGGGGATTTATTATTCAATGAACACACCCCAAGCCAGTATTCAAAAACTAGCAG
GTTCAAGTTATCAAGCAGATAAAAGTGCCGAATATAATGCTTCTAAGGCTATTCCCAATGTTGCGATGATGCCAGATGGC
TCAAAACTCAGTATTGATTGGGAAGGAACGACTGGCGAAAAAGCACTTGAGCAAGTTGCAAAAGATGTTGGCGAAAAATC
GATTGTTTCACGGACTGGTGGGGCACCAACGCTGGCTGTTTCAATGTCAAACATTCTACATAAGGTGCCAGTTATTGGTG
GGACAAATATGATGGGCTTCTGGTATCATTTTGCCATTATGTTTGAGGCACTCTTTATCCTGTCAGCCGTTTCAGCCGCA
ACCAAGTCCACTCGTTATTTACTTAATGATGCGCTTCGAGGCTTCAAAAAATTAGGACGGTTGGGCGATGATGATTGGCT
ACCAAGTAAAATCGTGACAACGGCTGTCATTGTTGGTGTTTGGGGGGCTTTACTTTTGATGGGCGTTTCTGACCCCAACG
GTGGGATCAAAATCATGTATCCACTCTTTGGGATTTCTAATCAGCTGATTGCAGCTGTGGCTCTCGCCATTGTCTGTGTC
ATGGTTATTCGTAAAGGTTACCTCAAATGGGTCTGGATTCCTGCCATTCCATTGGTCTGGGATGTTTGTGTGACCTTTGC
TGCCAGCTGGCAAAAAATCTTTTCTACGGATGTAAATATTGGGTATTTTGCTTCTTATTCAGCAGCGAAAAGTCAAGTAG
ATTCAGGAAAATTGACAGGTTTATTATTAACCAATGCGCAAGCAACCATGCGAAATACGATGATTCAAGGAATTCTGTCA
GTAATTTTCTTGCTTTGCGTGGCCATATTATTAGCAATTTGTGCCGTTAAAGTTGTCAAGATTTTGCAAACCAATAAAGT
CGGTGATAAGTTCAGCTCAGAAGAAGCTTTTGAAGAGTCCAACCTTTTTGAAACTTCAAGTTTCTGGCCAAGTCATCTTG
AACATAAGGTTTTAAAAAGCAAAGTTAAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGATTAAATAGTGCTAAAATATTATTGTAATCGGTTACATTGCGCTTTTAAAAAATAAGAAAGGTAAATACATCAAAAG
ATGTATAGGAATAAAGGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGATGAATAGAAAATGAAAAGTTACTGATAGAAATTTCTGTCAGTAGCTTTTTTATGGATCATCTGATGCTTTGATTATT
TCAATCGATACAAGTGTGGA

Product: carbon starvation protein A

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 784; Mature: 784

Protein sequence:

>784_residues
MKDDGNSSNFTDEEELFLLRNKEGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKEHLPKPSLLSIIIWVAVALLGGLAWSLIALAQGET
INAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPSEAHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQM
GYLPGTIWIIFGVIFAGGVQDMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW
AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLSPTALVWWVMGYTFIAAIIPA
WILLTPRDYLSMFMKIGTIAILAIAVVGVRPDVTIPALTNFAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTP
HLIAKESQTRMIGYGGMLFESFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAGSSYQADKSAEYNASKAIPNVAMMPDG
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TKSTRYLLNDALRGFKKLGRLGDDDWLPSKIVTTAVIVGVWGALLLMGVSDPNGGIKIMYPLFGISNQLIAAVALAIVCV
MVIRKGYLKWVWIPAIPLVWDVCVTFAASWQKIFSTDVNIGYFASYSAAKSQVDSGKLTGLLLTNAQATMRNTMIQGILS
VIFLLCVAILLAICAVKVVKILQTNKVGDKFSSEEAFEESNLFETSSFWPSHLEHKVLKSKVKN

Sequences:

>Translated_784_residues
MKDDGNSSNFTDEEELFLLRNKEGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKEHLPKPSLLSIIIWVAVALLGGLAWSLIALAQGET
INAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPSEAHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQM
GYLPGTIWIIFGVIFAGGVQDMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW
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WILLTPRDYLSMFMKIGTIAILAIAVVGVRPDVTIPALTNFAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTP
HLIAKESQTRMIGYGGMLFESFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAGSSYQADKSAEYNASKAIPNVAMMPDG
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MVIRKGYLKWVWIPAIPLVWDVCVTFAASWQKIFSTDVNIGYFASYSAAKSQVDSGKLTGLLLTNAQATMRNTMIQGILS
VIFLLCVAILLAICAVKVVKILQTNKVGDKFSSEEAFEESNLFETSSFWPSHLEHKVLKSKVKN
>Mature_784_residues
MKDDGNSSNFTDEEELFLLRNKEGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKEHLPKPSLLSIIIWVAVALLGGLAWSLIALAQGET
INAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPSEAHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQM
GYLPGTIWIIFGVIFAGGVQDMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW
AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLSPTALVWWVMGYTFIAAIIPA
WILLTPRDYLSMFMKIGTIAILAIAVVGVRPDVTIPALTNFAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTP
HLIAKESQTRMIGYGGMLFESFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAGSSYQADKSAEYNASKAIPNVAMMPDG
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MVIRKGYLKWVWIPAIPLVWDVCVTFAASWQKIFSTDVNIGYFASYSAAKSQVDSGKLTGLLLTNAQATMRNTMIQGILS
VIFLLCVAILLAICAVKVVKILQTNKVGDKFSSEEAFEESNLFETSSFWPSHLEHKVLKSKVKN

Specific function: Peptide Utilization During Carbon Starvation. [C]

COG id: COG1966

COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CstA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=708, Percent_Identity=45.6214689265537, Blast_Score=620, Evalue=1e-178,
Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=678, Percent_Identity=46.165191740413, Blast_Score=588, Evalue=1e-169,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003706 [H]

Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 85290; Mature: 85290

Theoretical pI: Translated: 9.10; Mature: 9.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKDDGNSSNFTDEEELFLLRNKEGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKEHLPKPSLLSIIIWV
CCCCCCCCCCCCCHHEEEEECCCCCEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
AVALLGGLAWSLIALAQGETINAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
EAHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQMGYLPGTIWIIFGVIFAGGVQ
HHCCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHH
DMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLS
HEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEC
PTALVWWVMGYTFIAAIIPAWILLTPRDYLSMFMKIGTIAILAIAVVGVRPDVTIPALTN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
FAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTPHLIAKESQTRMIGYGGMLFE
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEECCCCCEEEECCHHHHH
SFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAGSSYQADKSAEYNASKAIPNVAMMPDG
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCEEECCCC
SKLSIDWEGTTGEKALEQVAKDVGEKSIVSRTGGAPTLAVSMSNILHKVPVIGGTNMMGF
CEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
WYHFAIMFEALFILSAVSAATKSTRYLLNDALRGFKKLGRLGDDDWLPSKIVTTAVIVGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
WGALLLMGVSDPNGGIKIMYPLFGISNQLIAAVALAIVCVMVIRKGYLKWVWIPAIPLVW
HHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHH
DVCVTFAASWQKIFSTDVNIGYFASYSAAKSQVDSGKLTGLLLTNAQATMRNTMIQGILS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
KVKN
HCCC
>Mature Secondary Structure
MKDDGNSSNFTDEEELFLLRNKEGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKEHLPKPSLLSIIIWV
CCCCCCCCCCCCCHHEEEEECCCCCEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
AVALLGGLAWSLIALAQGETINAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPS
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AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLS
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PTALVWWVMGYTFIAAIIPAWILLTPRDYLSMFMKIGTIAILAIAVVGVRPDVTIPALTN
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FAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTPHLIAKESQTRMIGYGGMLFE
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SFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAGSSYQADKSAEYNASKAIPNVAMMPDG
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CEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
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VIFLLCVAILLAICAVKVVKILQTNKVGDKFSSEEAFEESNLFETSSFWPSHLEHKVLKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
KVKN
HCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]