| Definition | Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009004 |
| Length | 2,529,478 |
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The map label for this gene is feoB [H]
Identifier: 125623076
GI number: 125623076
Start: 188447
End: 190522
Strand: Reverse
Name: feoB [H]
Synonym: llmg_0199
Alternate gene names: 125623076
Gene position: 190522-188447 (Counterclockwise)
Preceding gene: 125623077
Following gene: 125623075
Centisome position: 7.53
GC content: 39.26
Gene sequence:
>2076_bases ATGAAAATAATTGCTCTACTCGGAAATCCAAATAGTGGAAAAACTAGCATTTTTAATCTTTTAACTGGTTCCAATCAACA AGTAGGAAATTGGCCAGGCGTCACTGTTGAAAAAAAATCTGGAATCTACCGAAAAGATAAAAATGTTTGTATTCAAGATT TACCGGGTCTCTACTCCCTCTCTCCTTACTCGCTTGATGAGCAAGTTGCCAGAGATTTTTTAGTCAAAACCCCACCTGAT GCTCTAATTAATATCGTTGATTCAACTAATCTGGAACGTTCTCTCTACTTAACTTTACAGTTGATGGAATTTGGAATTCC TATGGTACTCGCGCTCAACATGAGCGATTTGTTAGAAAATCAGGGAAAGAAAATTGACCTCGAAAAACTTTCTTACAGTC TTGGTATTCCTGTCATTACAACCTCTGCGATTAAAAACAAAGGTTTGGATGAGGTCGTTAAAGCAGCACTCAGAAGTCCT GAGGTTCAACCTTTAGATTATGACCATCGTCTTGAAGGAGCCTTGTCAGAAATTAGCAAAGTCACTGGTTTTACAAATCG CTTTGAACAAATTAAAGTTTTTGAAGGAGACCAACTTTTACTGACAAAATTATCAGCAGAACAACTAGATGAAGTTGAGG AAATTGTCAGTATCACTGAAAAATTAATGACTGATGACCGAGAGTCCATTATTGTCAATGAACGCTACGACTTAATCGGT CACTTTGTTCAGCTTTCTGTCAGCCAAACTGAAACAGGCAAAGTCAATCTGACAGACCGAATCGACCAAATCATCACTCA CAAATGGTTGGGACTTCCTATCTTTGTTTTTATCATGTGGCTAGTTTACTTTATTTCCATTCAAACTGTCGGAACAGCGG CAACTGATTGGCTTAATGATGTCTTTTTTGGTCAGTGGCTTCCTGACTTGATTGCCAATGGAATGAATGCTTTAGCGGTC ACTCCTTGGGTTCAAGATTTAGTTTTGAATGGTGTAGTTGCAGGGATTGGTGCAATTTTAGGTTTCGTTCCTCAAATTTT TGTCCTCTTTTTACTTTTAGGAATCCTTGAAGATTCTGGATATATGGCTCGGGTGGCCTTTGTCATGGACCATATCTTTA GAAGATTTGGGCTTTCGGGTAAGTCTTTTATACCGATGCTCATCGCTTCTGGCTGTGGTGTACCCGGAATTATGGCAACG AGAACCATTGAACAAGAACGGGACCGAAAAATTACGATTATGGTCACAACTTTCATGCCTTGTTCTGCAAAATTACCAAT CATCGCCTTGGTTTCTGGTGCCTTTTTCCCCCATGCTTCTTGGGTCGCTCCAAGTGCTTATTTCCTAGGGATGTCCATGA TTATTCTCTCTGGTATTATTTTGAAAAAAACGCGAATGTTTTCTGGAGATACCTCAGCTTTTATCATGGAACTTCCTACT TATCACTTACCTTATGCACTGACCGTTTTAAAATATGCCTTTGACCGTGCCTTTTCTTTTGTGAAGAGGGCCGGTACAAT CATTTTTGCGATGAATGTTTTGATTTGGTTCACTTCTAATTATAATTGGACATTAGCCCATGTTGATGCCAGTCAGTCTA TTCTTGCTGATATTGGTAAAGTTGTTGCAGTCATCTTTGCTCCACTTGGTTTTGGAGAATGGCGTGCAACAGTTGCGACG ATTACGGGATTAATCGCTAAAGAAACGATTGTCGGAACAATGGGTGTGCTTTTCGCTCATAATTCTAGCGACAGTCATCA ACTTTGGTCGGCTGTTCAAGCAACCTATACTCCTCTTTCTGCTTATTCTTTATTGGTTTTCAATCTCCTTTGTGCGCCTT GTGTTGCCGCAATTTCAACCATTTATAAAGAAATGGGAGATGTCCGATGGACTTTACGTGCCGTTGGTTTCCAAACATTA GTCGCTTATAGTATGAGTTTCATCATTTACCAATTAGGCAGTTTTTTCAGCTCACAAAACTTTGATGTCCTTAGTTTAGT CGCTCTGCTTGTATTGTTGGTTGGTTTATATTTTATTTTCAGAAAAGGAAAGGATGTTTCCTATGAACTTAGCTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCAACTCAATCTATTTCACGTTAATTTTACTAAAAACATCTTTCTTTAAAGTACATCTTTAGTAAATGATAACAGCCCT TAATAAGAAATTACAATAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TATCGTTATCTTGGCAATCATTCTCATCATTACTGGTTTTGCCATTTTTAAAACTGTTCGCAGCAAAGGGGCATGTGAAG ACTGTAATGTTAACACTTGT
Product: ferrous iron transport protein B-like protein
Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 691; Mature: 691
Protein sequence:
>691_residues MKIIALLGNPNSGKTSIFNLLTGSNQQVGNWPGVTVEKKSGIYRKDKNVCIQDLPGLYSLSPYSLDEQVARDFLVKTPPD ALINIVDSTNLERSLYLTLQLMEFGIPMVLALNMSDLLENQGKKIDLEKLSYSLGIPVITTSAIKNKGLDEVVKAALRSP EVQPLDYDHRLEGALSEISKVTGFTNRFEQIKVFEGDQLLLTKLSAEQLDEVEEIVSITEKLMTDDRESIIVNERYDLIG HFVQLSVSQTETGKVNLTDRIDQIITHKWLGLPIFVFIMWLVYFISIQTVGTAATDWLNDVFFGQWLPDLIANGMNALAV TPWVQDLVLNGVVAGIGAILGFVPQIFVLFLLLGILEDSGYMARVAFVMDHIFRRFGLSGKSFIPMLIASGCGVPGIMAT RTIEQERDRKITIMVTTFMPCSAKLPIIALVSGAFFPHASWVAPSAYFLGMSMIILSGIILKKTRMFSGDTSAFIMELPT YHLPYALTVLKYAFDRAFSFVKRAGTIIFAMNVLIWFTSNYNWTLAHVDASQSILADIGKVVAVIFAPLGFGEWRATVAT ITGLIAKETIVGTMGVLFAHNSSDSHQLWSAVQATYTPLSAYSLLVFNLLCAPCVAAISTIYKEMGDVRWTLRAVGFQTL VAYSMSFIIYQLGSFFSSQNFDVLSLVALLVLLVGLYFIFRKGKDVSYELS
Sequences:
>Translated_691_residues MKIIALLGNPNSGKTSIFNLLTGSNQQVGNWPGVTVEKKSGIYRKDKNVCIQDLPGLYSLSPYSLDEQVARDFLVKTPPD ALINIVDSTNLERSLYLTLQLMEFGIPMVLALNMSDLLENQGKKIDLEKLSYSLGIPVITTSAIKNKGLDEVVKAALRSP EVQPLDYDHRLEGALSEISKVTGFTNRFEQIKVFEGDQLLLTKLSAEQLDEVEEIVSITEKLMTDDRESIIVNERYDLIG HFVQLSVSQTETGKVNLTDRIDQIITHKWLGLPIFVFIMWLVYFISIQTVGTAATDWLNDVFFGQWLPDLIANGMNALAV TPWVQDLVLNGVVAGIGAILGFVPQIFVLFLLLGILEDSGYMARVAFVMDHIFRRFGLSGKSFIPMLIASGCGVPGIMAT RTIEQERDRKITIMVTTFMPCSAKLPIIALVSGAFFPHASWVAPSAYFLGMSMIILSGIILKKTRMFSGDTSAFIMELPT YHLPYALTVLKYAFDRAFSFVKRAGTIIFAMNVLIWFTSNYNWTLAHVDASQSILADIGKVVAVIFAPLGFGEWRATVAT ITGLIAKETIVGTMGVLFAHNSSDSHQLWSAVQATYTPLSAYSLLVFNLLCAPCVAAISTIYKEMGDVRWTLRAVGFQTL VAYSMSFIIYQLGSFFSSQNFDVLSLVALLVLLVGLYFIFRKGKDVSYELS >Mature_691_residues MKIIALLGNPNSGKTSIFNLLTGSNQQVGNWPGVTVEKKSGIYRKDKNVCIQDLPGLYSLSPYSLDEQVARDFLVKTPPD ALINIVDSTNLERSLYLTLQLMEFGIPMVLALNMSDLLENQGKKIDLEKLSYSLGIPVITTSAIKNKGLDEVVKAALRSP EVQPLDYDHRLEGALSEISKVTGFTNRFEQIKVFEGDQLLLTKLSAEQLDEVEEIVSITEKLMTDDRESIIVNERYDLIG HFVQLSVSQTETGKVNLTDRIDQIITHKWLGLPIFVFIMWLVYFISIQTVGTAATDWLNDVFFGQWLPDLIANGMNALAV TPWVQDLVLNGVVAGIGAILGFVPQIFVLFLLLGILEDSGYMARVAFVMDHIFRRFGLSGKSFIPMLIASGCGVPGIMAT RTIEQERDRKITIMVTTFMPCSAKLPIIALVSGAFFPHASWVAPSAYFLGMSMIILSGIILKKTRMFSGDTSAFIMELPT YHLPYALTVLKYAFDRAFSFVKRAGTIIFAMNVLIWFTSNYNWTLAHVDASQSILADIGKVVAVIFAPLGFGEWRATVAT ITGLIAKETIVGTMGVLFAHNSSDSHQLWSAVQATYTPLSAYSLLVFNLLCAPCVAAISTIYKEMGDVRWTLRAVGFQTL VAYSMSFIIYQLGSFFSSQNFDVLSLVALLVLLVGLYFIFRKGKDVSYELS
Specific function: Fe(2+) uptake system, probably driven by GTP [H]
COG id: COG0370
COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the feoB (TC 9.A.8) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=756, Percent_Identity=34.3915343915344, Blast_Score=369, Evalue=1e-103,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003373 - InterPro: IPR011640 - InterPro: IPR011619 - InterPro: IPR011642 - InterPro: IPR005225 [H]
Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76526; Mature: 76526
Theoretical pI: Translated: 5.89; Mature: 5.89
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKIIALLGNPNSGKTSIFNLLTGSNQQVGNWPGVTVEKKSGIYRKDKNVCIQDLPGLYSL CEEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCC SPYSLDEQVARDFLVKTPPDALINIVDSTNLERSLYLTLQLMEFGIPMVLALNMSDLLEN CCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHC QGKKIDLEKLSYSLGIPVITTSAIKNKGLDEVVKAALRSPEVQPLDYDHRLEGALSEISK CCCEEEHHHHHHHCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH VTGFTNRFEQIKVFEGDQLLLTKLSAEQLDEVEEIVSITEKLMTDDRESIIVNERYDLIG HHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECCHHHHHH HFVQLSVSQTETGKVNLTDRIDQIITHKWLGLPIFVFIMWLVYFISIQTVGTAATDWLND HHHHEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH VFFGQWLPDLIANGMNALAVTPWVQDLVLNGVVAGIGAILGFVPQIFVLFLLLGILEDSG HHHHHHHHHHHHCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC YMARVAFVMDHIFRRFGLSGKSFIPMLIASGCGVPGIMATRTIEQERDRKITIMVTTFMP HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECC CSAKLPIIALVSGAFFPHASWVAPSAYFLGMSMIILSGIILKKTRMFSGDTSAFIMELPT CCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCC YHLPYALTVLKYAFDRAFSFVKRAGTIIFAMNVLIWFTSNYNWTLAHVDASQSILADIGK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEEHHEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHH VVAVIFAPLGFGEWRATVATITGLIAKETIVGTMGVLFAHNSSDSHQLWSAVQATYTPLS HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHH AYSLLVFNLLCAPCVAAISTIYKEMGDVRWTLRAVGFQTLVAYSMSFIIYQLGSFFSSQN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC FDVLSLVALLVLLVGLYFIFRKGKDVSYELS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECC >Mature Secondary Structure MKIIALLGNPNSGKTSIFNLLTGSNQQVGNWPGVTVEKKSGIYRKDKNVCIQDLPGLYSL CEEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCC SPYSLDEQVARDFLVKTPPDALINIVDSTNLERSLYLTLQLMEFGIPMVLALNMSDLLEN CCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHC QGKKIDLEKLSYSLGIPVITTSAIKNKGLDEVVKAALRSPEVQPLDYDHRLEGALSEISK CCCEEEHHHHHHHCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH VTGFTNRFEQIKVFEGDQLLLTKLSAEQLDEVEEIVSITEKLMTDDRESIIVNERYDLIG HHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECCHHHHHH HFVQLSVSQTETGKVNLTDRIDQIITHKWLGLPIFVFIMWLVYFISIQTVGTAATDWLND HHHHEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH VFFGQWLPDLIANGMNALAVTPWVQDLVLNGVVAGIGAILGFVPQIFVLFLLLGILEDSG HHHHHHHHHHHHCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC YMARVAFVMDHIFRRFGLSGKSFIPMLIASGCGVPGIMATRTIEQERDRKITIMVTTFMP HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECC CSAKLPIIALVSGAFFPHASWVAPSAYFLGMSMIILSGIILKKTRMFSGDTSAFIMELPT CCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCC YHLPYALTVLKYAFDRAFSFVKRAGTIIFAMNVLIWFTSNYNWTLAHVDASQSILADIGK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEEHHEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHH VVAVIFAPLGFGEWRATVATITGLIAKETIVGTMGVLFAHNSSDSHQLWSAVQATYTPLS HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHH AYSLLVFNLLCAPCVAAISTIYKEMGDVRWTLRAVGFQTLVAYSMSFIIYQLGSFFSSQN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC FDVLSLVALLVLLVGLYFIFRKGKDVSYELS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA