| Definition | Methanocorpusculum labreanum Z chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008942 |
| Length | 1,804,962 |
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The map label for this gene is 124485795
Identifier: 124485795
GI number: 124485795
Start: 967078
End: 970914
Strand: Reverse
Name: 124485795
Synonym: Mlab_0974
Alternate gene names: NA
Gene position: 970914-967078 (Counterclockwise)
Preceding gene: 124485797
Following gene: 124485794
Centisome position: 53.79
GC content: 36.72
Gene sequence:
>3837_bases ATGACACACTTATTTGAGATTGGCCATAAAGATATTCTAAGACTGGATGATGAGCAATTAACACAATTATTAAAGAAACT CCTCTCTCTTGAAGTTAAAAGATGGAATTTACAGATACAATCATTTAGGGTTTCTCTAGCTTCAAACCAAAAAGATGGTG GGGAGGATGGGTATATAAAATGGGATCACTCATCAATAAAAAAAACAGATTATTTTCCAAATAAATCAATATTATTCCAA TGTAAACAAAGAACTGATGCAAATGGTTTTACCGCAGCTGCATGCAAAAAAGAATTATTGAACACCGATAATAAAACCGT TAAAGAACGCATTAATTCTCACTTTTTAGACCAGGGTACATATATCTTGTTCTGTAATTTTCCATGTAATCGGAGTATGC AAGAAGATAGAATAGAGGGGTTTCGAAAGGGTTTGAGGGCTGCACACGCGCCTTATGCTGAAAGTTGTGCTATTCAGATT TATGATGGGGAAAAAATTGCAGATTGGACAAACCAATTTCCAGCAGCGGCTCTTTATGTGTGTGAATGTATTGGTCGTCC AGTCCCCTGCGGTGCTCTCACGTGGGGAGAATGGGAAAAATATTATTGTAATAGGTTTTTTTCAGACAAATATCTTCAAG ATATAATTACAGGAATACGAACGAATATCTCTGGTAAGCAGAAGGTTGTGCGTTTTGTCGGAAATTCTGGATTAGGGAAA ACCCGAGTAGCATTAGAGGCCTTTAGACCCCCTGAACTTCTTAGTGATGAGATATCACCTGGTGATATTGTACAGAGTCA GCTAAGTGCCGACGTCGTTTATTTTGACAACGCTCGGGATGTTGAAAACCTTATTTCAGCGATAAGAAATTGGCGTAAGA GTAAGTTGTCTGGAACAATAATTGTTGATGAATGCGATTGTGAAACCCATGATCGCCTTGCAATAGAGATAAAACATTCA GATAGCTGTTTATCCTTATTATCAATTGATTACACAGATACGTGTGGTATAAGAGAAGATCCCGTTTACAAACTCCAACC GGTTAGTAATGACATAATCGAAAAAATTGTATTGGAACAATTTTCTGGATTGCCTGAGCCAGATGTTAAACGAATAGTAG ATTTTACTCAGGGATATCCTGAAATGGCTGTTTTGATTGCTAAGAATAGAACAGCCGGCGCTGAATCGATTGGAACAATT ACTAAAGAATATCTCATAGATCGATTAATTGGCGGTCGAGAAAAACCAACCGATATTCAGAAAGACGTAATTAAAGCGTG TTCTCTTTTCACGGAATTTGGTGTGAAGGATAATCTGTATATCCATGCAGATTTTATTGCTAAAAATATTTGCAATATAT CCTCTGATGATTTCCACCGTATCATCAAACAGATAAAATCTGAACGTGGTATTATCGAAGAAAGAGGACGGTATTTTAGA GTAACTCCCATGCCCCTTGCAATCACTCTTGCAACAGGGTGGTGGAAATATTGTTCTCCAGATCAGGCTGAAAAACTCTT ATTCGGAAATGATATTCCAGAGGGTTTGGTCAATTCTCTCTGTAATCAATTTAGATACATAAACATTGATCCAGAAATTG AAGAATTAACTAAAGAACTATGCAATAATCGACGCCGTTTAGGGAAAGCAGAGACACTAAATTCTGAGAGGGGTTCACGG ATCTTCCGCTCAATTGCAGAAGTGAATCCCCGCGAGGCTACCGATGCCCTTTACCGATGTTTTGGTGACGCAGATAAAGA ATTGATTAAACAAATTATCCCAGGTAGAAGAAACATTGTTTGGGCTCTCGAAAATTTGTGTTTCTGGGAAAACACCTTTA CGAAAGCCGCAAATTTATTACTTAAGTTCGCAGTTTCAGAAACTGAACCAGGATTGGGAAATAACTCTACAGAGCAGTTT TATCAGTTGTTTCATTTGGCATTGTCTGGTACGCAAGCACCGCCGAACATGAGATTAAAGGTAATTGATGAGGGATTATC AACAAATGATCCTGAGTTCCAGACGATCTGTATCACAGCTCTGGGTCATGCCCTCCAAACCCATAGTTTCTTAAGGATCG GTGGTGTAGAGCTTCAAGGCAGTCGATATCCCAAAAAAGACTGGATTCCAAAAACAAGGAAAGAAGTTTTTGATTATTGG GATGATGTTCTACGGATATTGAAAAAATATGCCTTAAATGAGGATCCAATTGGAAAGCTTGCTATATCTCAAATAGAAAA ATCCATCTGGGGTATGCTAGAGTATAGACGACTTGATATTTTAGATGATGTTATATTCTCTATTTGTAAAGAGAGGGGAT ATTTCTGGCCGGAAGTATCAGCAGAATTAAACAGGTTTCTCCATTACCATTCAGAGGATATTCCAGAAGATGCAAAGATC CGACTAAATAATTGGATCAATAAATTGGGACCTCAATCGATTATTGATGAAGCATATCTCAAAATAATAAGCCCGAAACA ATATACGCCGTATGATGGTTCGAATCATTATGAAAAAGTAAATACTGAGACTATTGAATTTGCAAAATATCTAAGCAGTA AACCAGAAGACTTGCGTGAAGTCTTAGAATTATTATCTAGAACCCCGTCAAGTCAAGGATATCAGTTTGGTTATGCCCTT TGTAATTGCACTGATGACAAAGATAAGATCATCAACACGTTAATTGATTTATTAAAAGGCGTACCTAAAGAGGAAATGGA TGATTCTGTTTTAGGGGGCTATCTCTATGCACTCCGATCGGAAAACTCGGCTCTTGTAAGTCAGTATCTTAAAAGGATAT CCGAAGATCCACAATTATCCCATTTATTATTAGTTTTGACTGCACGAACTAAACCTGAAAAGACTGATTTGGATTTATTG ATCACTCAATTAAAGAATGATAAATTACATATTGAGGATTTTAGGGAATTTCAGTATAGAAACGCTCTTAGGCACTTATA TCCTGCTTCAGTACTTGATTTCTTTAATGATTTGTTGTTAAATTCTGAGAATGGGTGTATCATGGTATTTGAATTAGCAT TTGACTATGCTTATGATGATGAAATAAAGACGCATATGTTTAGACCATTTTTCAAAAAACTATTCATTGATTACAAATGT TTTTCCACGATGATAAAAGATACTAACTCGCTTCAAGGTACCCTTTATTCAGTTACTAACATTATTTCAGGTTTGTTACA ACAATCCGGACCCGATTTAGACATAGCAAAGAACTTAACCGAAGAAATAATCGCATTATGTTCTGGCAACACGGTTATCG TATTAATTTATGAAGATCTTGAAGAAATTATTAAATTACTTCTCTTACCAGAATATATTGAAACAACTTGGCCAATATTT GGAGCTGCTATAACCTCCAGGGAATATCGCGGATCTGATTCTCTTGAGCTTATTCTTGGATCGGAAGCATCAGCTGGAAA ATGGGCGCCCAGTCCATTAGAATCTATCCAATTACCACTAATAACTCAGTGGTGTGAAGACGAACCAGATCGTGCTCCCA TCTTCCTTGCAAATGCAATATTACCACTTATTAATATTGATCAGAAAATCACTTGGAGTCCATTGGCCAAGTATTTAATT AATCATTATGGTGACAATGAAAAAGTGTTGGCAGGGTTAACTAACAAAATTTCTATTTTTTCGTGGATTGGTTCTAAAAG ACCATTTTATGAAACTTGGTTAAATAATTTCGAAGCGCTCCTCACTCACCTTAATCCACGTGTCAAAAGATGGGCTGAAA TAAATATTGAATCTTTGAGAGATAACATACGAGCTGCTGAACGTGAAGATGAAGAAAAGGAGTTATACCGCGGTTAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ATCCATTAAAAATCATTTTTCATCTGTATTCATGGAAAATAGAATCCTCTCTCTCTGTTTTGGTGGATTTGTTTGTGAAT TTAGCGTGATGAGTCATACT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1278; Mature: 1277
Protein sequence:
>1278_residues MTHLFEIGHKDILRLDDEQLTQLLKKLLSLEVKRWNLQIQSFRVSLASNQKDGGEDGYIKWDHSSIKKTDYFPNKSILFQ CKQRTDANGFTAAACKKELLNTDNKTVKERINSHFLDQGTYILFCNFPCNRSMQEDRIEGFRKGLRAAHAPYAESCAIQI YDGEKIADWTNQFPAAALYVCECIGRPVPCGALTWGEWEKYYCNRFFSDKYLQDIITGIRTNISGKQKVVRFVGNSGLGK TRVALEAFRPPELLSDEISPGDIVQSQLSADVVYFDNARDVENLISAIRNWRKSKLSGTIIVDECDCETHDRLAIEIKHS DSCLSLLSIDYTDTCGIREDPVYKLQPVSNDIIEKIVLEQFSGLPEPDVKRIVDFTQGYPEMAVLIAKNRTAGAESIGTI TKEYLIDRLIGGREKPTDIQKDVIKACSLFTEFGVKDNLYIHADFIAKNICNISSDDFHRIIKQIKSERGIIEERGRYFR VTPMPLAITLATGWWKYCSPDQAEKLLFGNDIPEGLVNSLCNQFRYINIDPEIEELTKELCNNRRRLGKAETLNSERGSR IFRSIAEVNPREATDALYRCFGDADKELIKQIIPGRRNIVWALENLCFWENTFTKAANLLLKFAVSETEPGLGNNSTEQF YQLFHLALSGTQAPPNMRLKVIDEGLSTNDPEFQTICITALGHALQTHSFLRIGGVELQGSRYPKKDWIPKTRKEVFDYW DDVLRILKKYALNEDPIGKLAISQIEKSIWGMLEYRRLDILDDVIFSICKERGYFWPEVSAELNRFLHYHSEDIPEDAKI RLNNWINKLGPQSIIDEAYLKIISPKQYTPYDGSNHYEKVNTETIEFAKYLSSKPEDLREVLELLSRTPSSQGYQFGYAL CNCTDDKDKIINTLIDLLKGVPKEEMDDSVLGGYLYALRSENSALVSQYLKRISEDPQLSHLLLVLTARTKPEKTDLDLL ITQLKNDKLHIEDFREFQYRNALRHLYPASVLDFFNDLLLNSENGCIMVFELAFDYAYDDEIKTHMFRPFFKKLFIDYKC FSTMIKDTNSLQGTLYSVTNIISGLLQQSGPDLDIAKNLTEEIIALCSGNTVIVLIYEDLEEIIKLLLLPEYIETTWPIF GAAITSREYRGSDSLELILGSEASAGKWAPSPLESIQLPLITQWCEDEPDRAPIFLANAILPLINIDQKITWSPLAKYLI NHYGDNEKVLAGLTNKISIFSWIGSKRPFYETWLNNFEALLTHLNPRVKRWAEINIESLRDNIRAAEREDEEKELYRG
Sequences:
>Translated_1278_residues MTHLFEIGHKDILRLDDEQLTQLLKKLLSLEVKRWNLQIQSFRVSLASNQKDGGEDGYIKWDHSSIKKTDYFPNKSILFQ CKQRTDANGFTAAACKKELLNTDNKTVKERINSHFLDQGTYILFCNFPCNRSMQEDRIEGFRKGLRAAHAPYAESCAIQI YDGEKIADWTNQFPAAALYVCECIGRPVPCGALTWGEWEKYYCNRFFSDKYLQDIITGIRTNISGKQKVVRFVGNSGLGK TRVALEAFRPPELLSDEISPGDIVQSQLSADVVYFDNARDVENLISAIRNWRKSKLSGTIIVDECDCETHDRLAIEIKHS DSCLSLLSIDYTDTCGIREDPVYKLQPVSNDIIEKIVLEQFSGLPEPDVKRIVDFTQGYPEMAVLIAKNRTAGAESIGTI TKEYLIDRLIGGREKPTDIQKDVIKACSLFTEFGVKDNLYIHADFIAKNICNISSDDFHRIIKQIKSERGIIEERGRYFR VTPMPLAITLATGWWKYCSPDQAEKLLFGNDIPEGLVNSLCNQFRYINIDPEIEELTKELCNNRRRLGKAETLNSERGSR IFRSIAEVNPREATDALYRCFGDADKELIKQIIPGRRNIVWALENLCFWENTFTKAANLLLKFAVSETEPGLGNNSTEQF YQLFHLALSGTQAPPNMRLKVIDEGLSTNDPEFQTICITALGHALQTHSFLRIGGVELQGSRYPKKDWIPKTRKEVFDYW DDVLRILKKYALNEDPIGKLAISQIEKSIWGMLEYRRLDILDDVIFSICKERGYFWPEVSAELNRFLHYHSEDIPEDAKI RLNNWINKLGPQSIIDEAYLKIISPKQYTPYDGSNHYEKVNTETIEFAKYLSSKPEDLREVLELLSRTPSSQGYQFGYAL CNCTDDKDKIINTLIDLLKGVPKEEMDDSVLGGYLYALRSENSALVSQYLKRISEDPQLSHLLLVLTARTKPEKTDLDLL ITQLKNDKLHIEDFREFQYRNALRHLYPASVLDFFNDLLLNSENGCIMVFELAFDYAYDDEIKTHMFRPFFKKLFIDYKC FSTMIKDTNSLQGTLYSVTNIISGLLQQSGPDLDIAKNLTEEIIALCSGNTVIVLIYEDLEEIIKLLLLPEYIETTWPIF GAAITSREYRGSDSLELILGSEASAGKWAPSPLESIQLPLITQWCEDEPDRAPIFLANAILPLINIDQKITWSPLAKYLI NHYGDNEKVLAGLTNKISIFSWIGSKRPFYETWLNNFEALLTHLNPRVKRWAEINIESLRDNIRAAEREDEEKELYRG >Mature_1277_residues THLFEIGHKDILRLDDEQLTQLLKKLLSLEVKRWNLQIQSFRVSLASNQKDGGEDGYIKWDHSSIKKTDYFPNKSILFQC KQRTDANGFTAAACKKELLNTDNKTVKERINSHFLDQGTYILFCNFPCNRSMQEDRIEGFRKGLRAAHAPYAESCAIQIY DGEKIADWTNQFPAAALYVCECIGRPVPCGALTWGEWEKYYCNRFFSDKYLQDIITGIRTNISGKQKVVRFVGNSGLGKT RVALEAFRPPELLSDEISPGDIVQSQLSADVVYFDNARDVENLISAIRNWRKSKLSGTIIVDECDCETHDRLAIEIKHSD SCLSLLSIDYTDTCGIREDPVYKLQPVSNDIIEKIVLEQFSGLPEPDVKRIVDFTQGYPEMAVLIAKNRTAGAESIGTIT KEYLIDRLIGGREKPTDIQKDVIKACSLFTEFGVKDNLYIHADFIAKNICNISSDDFHRIIKQIKSERGIIEERGRYFRV TPMPLAITLATGWWKYCSPDQAEKLLFGNDIPEGLVNSLCNQFRYINIDPEIEELTKELCNNRRRLGKAETLNSERGSRI FRSIAEVNPREATDALYRCFGDADKELIKQIIPGRRNIVWALENLCFWENTFTKAANLLLKFAVSETEPGLGNNSTEQFY QLFHLALSGTQAPPNMRLKVIDEGLSTNDPEFQTICITALGHALQTHSFLRIGGVELQGSRYPKKDWIPKTRKEVFDYWD DVLRILKKYALNEDPIGKLAISQIEKSIWGMLEYRRLDILDDVIFSICKERGYFWPEVSAELNRFLHYHSEDIPEDAKIR LNNWINKLGPQSIIDEAYLKIISPKQYTPYDGSNHYEKVNTETIEFAKYLSSKPEDLREVLELLSRTPSSQGYQFGYALC NCTDDKDKIINTLIDLLKGVPKEEMDDSVLGGYLYALRSENSALVSQYLKRISEDPQLSHLLLVLTARTKPEKTDLDLLI TQLKNDKLHIEDFREFQYRNALRHLYPASVLDFFNDLLLNSENGCIMVFELAFDYAYDDEIKTHMFRPFFKKLFIDYKCF STMIKDTNSLQGTLYSVTNIISGLLQQSGPDLDIAKNLTEEIIALCSGNTVIVLIYEDLEEIIKLLLLPEYIETTWPIFG AAITSREYRGSDSLELILGSEASAGKWAPSPLESIQLPLITQWCEDEPDRAPIFLANAILPLINIDQKITWSPLAKYLIN HYGDNEKVLAGLTNKISIFSWIGSKRPFYETWLNNFEALLTHLNPRVKRWAEINIESLRDNIRAAEREDEEKELYRG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 146445; Mature: 146313
Theoretical pI: Translated: 5.18; Mature: 5.18
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.2 %Cys (Translated Protein) 0.8 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 2.2 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTHLFEIGHKDILRLDDEQLTQLLKKLLSLEVKRWNLQIQSFRVSLASNQKDGGEDGYIK CCCHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEHEEEEHHCCCCCCCCCCCEE WDHSSIKKTDYFPNKSILFQCKQRTDANGFTAAACKKELLNTDNKTVKERINSHFLDQGT ECCCCCCCCCCCCCCHHHHEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC YILFCNFPCNRSMQEDRIEGFRKGLRAAHAPYAESCAIQIYDGEKIADWTNQFPAAALYV EEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCHHHHHHH CECIGRPVPCGALTWGEWEKYYCNRFFSDKYLQDIITGIRTNISGKQKVVRFVGNSGLGK HHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCH TRVALEAFRPPELLSDEISPGDIVQSQLSADVVYFDNARDVENLISAIRNWRKSKLSGTI HHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE IVDECDCETHDRLAIEIKHSDSCLSLLSIDYTDTCGIREDPVYKLQPVSNDIIEKIVLEQ EEEECCCCCCCCEEEEEECCCCEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHH FSGLPEPDVKRIVDFTQGYPEMAVLIAKNRTAGAESIGTITKEYLIDRLIGGREKPTDIQ HCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH KDVIKACSLFTEFGVKDNLYIHADFIAKNICNISSDDFHRIIKQIKSERGIIEERGRYFR HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCEEE VTPMPLAITLATGWWKYCSPDQAEKLLFGNDIPEGLVNSLCNQFRYINIDPEIEELTKEL ECCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCEEECCCCCHHHHHHHH CNNRRRLGKAETLNSERGSRIFRSIAEVNPREATDALYRCFGDADKELIKQIIPGRRNIV HHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHH WALENLCFWENTFTKAANLLLKFAVSETEPGLGNNSTEQFYQLFHLALSGTQAPPNMRLK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEE VIDEGLSTNDPEFQTICITALGHALQTHSFLRIGGVELQGSRYPKKDWIPKTRKEVFDYW EEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH DDVLRILKKYALNEDPIGKLAISQIEKSIWGMLEYRRLDILDDVIFSICKERGYFWPEVS HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH AELNRFLHYHSEDIPEDAKIRLNNWINKLGPQSIIDEAYLKIISPKQYTPYDGSNHYEKV HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHC NTETIEFAKYLSSKPEDLREVLELLSRTPSSQGYQFGYALCNCTDDKDKIINTLIDLLKG CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHC VPKEEMDDSVLGGYLYALRSENSALVSQYLKRISEDPQLSHLLLVLTARTKPEKTDLDLL 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA