| Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9303, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008820 |
| Length | 2,682,675 |
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The map label for this gene is 124023165
Identifier: 124023165
GI number: 124023165
Start: 1255510
End: 1258362
Strand: Direct
Name: 124023165
Synonym: P9303_14611
Alternate gene names: NA
Gene position: 1255510-1258362 (Clockwise)
Preceding gene: 124023163
Following gene: 124023167
Centisome position: 46.8
GC content: 46.34
Gene sequence:
>2853_bases ATGGGCTTGGCTGGTTTCGCCCGACCCTTGCAATGGTTCAAGAGCCAGTGGCTTTGGCTCTTGCTCTCTATCGCAGCTTT CTGGTTGTTGATGCGGGTTCAAGTCGAATGGTTGTGGTTCGGTCAATTTGATTGGCAAGGGATGCTTCTCCGCCGTTGGC TCTGGCAACTGGGAGGACTTCTACTCGCCCTTCTGGTTGTAGCGACTTGTCAGCTTTGGCAGCGCAACTGGATCAAACTC GAAGGTGCAAGCAACTTGGCAGAGCCAGCGCTTCCCCTGCATGGATGGCGTTATGGATTGGGGCTACTTGGCTGCTTCGT GGTGGTGGTCGGTGATCTTGTATTACTCACTCGATTGGCGTGGTTAGCTTGTTTTAAGCCATTTGCCCTTGGGCATTGGT GGAGTGAACCTTTTGAAGACATTTGGGCGTTGGTGATTCCGCTGTCCTGTGTATTCATCTCAATTTGCGTGATGCTTGGC AATGCCCGAGGGGGAAGGATTGCTCATTTGATGGGTTGTTTTTGCTTCAGTATCTCCATCGCTAGAGGCTGGGGATTATG GTCACTCGCCCTTGCTATCCCTCCTACAGGTATTAAAGAACCACTACTGGGCGCTGATGTGAGTTTTGGGCTCGGTCAAT TTCCAGCACTTGCCTTTGCCTTGGTTGTTCTATTGGCCCAACTCGTCTTAACAACGAGTACGACAATATGGATGAAGTTA GCCCAGCCTGAATCTCTTTCAGATTGGGTTTTCAAAGGTTTATCGCCTAGACAGTGTGATGTTATGAGGCCATTAATTGG CATCATACTTTTAACACTTTCAGCACTTTTATGGTTGTCACGTCATGAACTTCTGTGGACGCAGAACGGTACGGTAGCCG GAGCTGGTTGGTTGGATGCTCACCTGATACTTCCTCTACGAAGTTTGGCGAGCTTGGCCATTTTGGTTCTCGCATTTCTG GTGATTCCATTTCCATGGATACAACAAAGGCGTTTATGGAGATTAATCGCTTCAATTATTGGCGTAGGCGCAATTCTTCT CGAAGTGCTTTTGGCTCCTTTTGTCCAGTGGATGGTCGTAAAACCTAGAGAACTGAAACTAGAAACCCCTTACATCATTC GAGCAATTAAAGCCACAAGGAAAGCATTTCAGCTTGACTCGATTACGACTACACTTATTAATCCTCAACCTCAGTTAACT CAACTTGATCTTGAACAAGGTGCAAGCACCCTAAGGAATATTCGTCTATGGGACAGCCAGCCTCTCTTGGCAACCAATCG TCAATTACAGCAATTGAGGGTTTACTATCGCTTTTCAAATGCGGCGGTAGATCGTTATCGCTTTGTGCCTGACAAGGCGA ACCGGCAACAGGTGATGATCACAGCACGCGAACTTGATCAGGCTGCACTTCCAAAACGTTCACGTACTTGGTTGAATCGT CATTTTGTTTTCACGCATGGATATGGCTTTACTCTCAGTCCAGTCAATACAAGAGCACCCGATGGCCTCCCTGACTATTT TATCAGTGATCTAGGAACCTCAACACGTCTTGAAGGTAGTTCTGAGCTCGGCATTACTCGTGAAGATGTCAAAGAGGCAG TGCCTATTGGGCGAGCAGCTCTCTATTTTGGAATGCTTCCCTCTCCTTATGCTCTTGCTCCGAGCAAACTAAAAGAACTA GATTATCCAGTAGGCGATAAGAATATCTACAACCACTATTTAGGATCAGGAGGTGTGCCGGTGGGTCATCCCTGGCAACA ATTAGCAGCAGCTATGTACCTTTTTGAACCCCGCCTTCTTAATACAGGGTCGCTAACGATTAATTCCAAACTTCTTATTA GGCGAGAAGTGAGACAAAGAGTGAGTGCAATAGCGCCATTCCTTGAAGTTATTGGTGATCCATATTTGGTCTCTACATCT GTTAATTCTAGAGATCATGATTATCAAGCTAAGCAAAACCAATATTGGATTGTTGAAGCTTATACAAGCTCACGCACATA TCCCTACGCAGCAAACCTGCCAGATGGTCGCCCTGTGCGATATTTACGTAACTCAGTCAAAGCTATTGTTGATGCATACA GTGGTCGTGTTCACTTGTATGTGAGCGAACCGCGGGATCCGATAATATTGGGTTGGCAGCGATTGTTTCCAGATCTTTTC AAACCTCTTGAGGAGATGCCTTCAAGCTTACGAGAGCATCTTAAGGTTCCTACAGATTTGTTTAATGTACAGGTACAGCA ATTGCTTAGATACCACGTTACTGATCCTCGTATATTTTATAGCGGTGATGATGTTTGGCAGGTTCCAAAGGAACTCTATG GTAAGCGGCAGGTTCCTGTTGATCCCTATCACATCACTGCACAATTAGGTAGTCAAGAAAGTTCAGAATTTCTCTTATTA CAACCACTAACACCACTAGCTCGCCCCAATCTTTCTGCGTGGCTCGCTGCTCGAAGTGATGGTGATCATTATGGAAAATT AGTGTTGCTACGTTTCCCAAGTCAAACGCCAATCTTTGGCCCTGAACAGATTCAGGCCCTTATCAATCAGGACCCGCAGA TCAGCCAACAGTTTGGTCTTTGGGATCGTGCTGGGTCTGAAGTTGTGCAAGGGAACCTTCTTGTTGTACCCCTAGGCAAG GCCCTTCTTTATGTAGAACCTGTTTACCTAAGGGCACGTCAAGGTGGTCTACCAACCCTTACCAGGGTAGTTGTTAGTGA TGGCAAAAGGATTGCCATGGCTGAGGATCTCGGAGAAGGCCTAAGGGCCTTGGTTGACGGATCAAGCAAAAAAGCAGTGT ATTTAAATAGAAATGATCTGCCACCGATTAAGGCAGCAGATCAATCAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCCATACTGATCGGTTTCTGCAATTGGCTGGATTGACTGTTGATCAGTCACAGCCAGTGGGCGTGTAACTAGAACGACTT AGCCTGTGTTGATTGAGTAG
Downstream 100 bases:
>100_bases TGATGTATTGATAGATTAATGATTAATTTATTGAGGCGAAGAACTCCTTACTTCCAACTGGGTCTGGTTTCATTGTTTTC TCTCCTGGTGTCCAATTAGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 950; Mature: 949
Protein sequence:
>950_residues MGLAGFARPLQWFKSQWLWLLLSIAAFWLLMRVQVEWLWFGQFDWQGMLLRRWLWQLGGLLLALLVVATCQLWQRNWIKL EGASNLAEPALPLHGWRYGLGLLGCFVVVVGDLVLLTRLAWLACFKPFALGHWWSEPFEDIWALVIPLSCVFISICVMLG NARGGRIAHLMGCFCFSISIARGWGLWSLALAIPPTGIKEPLLGADVSFGLGQFPALAFALVVLLAQLVLTTSTTIWMKL AQPESLSDWVFKGLSPRQCDVMRPLIGIILLTLSALLWLSRHELLWTQNGTVAGAGWLDAHLILPLRSLASLAILVLAFL VIPFPWIQQRRLWRLIASIIGVGAILLEVLLAPFVQWMVVKPRELKLETPYIIRAIKATRKAFQLDSITTTLINPQPQLT QLDLEQGASTLRNIRLWDSQPLLATNRQLQQLRVYYRFSNAAVDRYRFVPDKANRQQVMITARELDQAALPKRSRTWLNR HFVFTHGYGFTLSPVNTRAPDGLPDYFISDLGTSTRLEGSSELGITREDVKEAVPIGRAALYFGMLPSPYALAPSKLKEL DYPVGDKNIYNHYLGSGGVPVGHPWQQLAAAMYLFEPRLLNTGSLTINSKLLIRREVRQRVSAIAPFLEVIGDPYLVSTS VNSRDHDYQAKQNQYWIVEAYTSSRTYPYAANLPDGRPVRYLRNSVKAIVDAYSGRVHLYVSEPRDPIILGWQRLFPDLF KPLEEMPSSLREHLKVPTDLFNVQVQQLLRYHVTDPRIFYSGDDVWQVPKELYGKRQVPVDPYHITAQLGSQESSEFLLL QPLTPLARPNLSAWLAARSDGDHYGKLVLLRFPSQTPIFGPEQIQALINQDPQISQQFGLWDRAGSEVVQGNLLVVPLGK ALLYVEPVYLRARQGGLPTLTRVVVSDGKRIAMAEDLGEGLRALVDGSSKKAVYLNRNDLPPIKAADQSN
Sequences:
>Translated_950_residues MGLAGFARPLQWFKSQWLWLLLSIAAFWLLMRVQVEWLWFGQFDWQGMLLRRWLWQLGGLLLALLVVATCQLWQRNWIKL EGASNLAEPALPLHGWRYGLGLLGCFVVVVGDLVLLTRLAWLACFKPFALGHWWSEPFEDIWALVIPLSCVFISICVMLG NARGGRIAHLMGCFCFSISIARGWGLWSLALAIPPTGIKEPLLGADVSFGLGQFPALAFALVVLLAQLVLTTSTTIWMKL AQPESLSDWVFKGLSPRQCDVMRPLIGIILLTLSALLWLSRHELLWTQNGTVAGAGWLDAHLILPLRSLASLAILVLAFL VIPFPWIQQRRLWRLIASIIGVGAILLEVLLAPFVQWMVVKPRELKLETPYIIRAIKATRKAFQLDSITTTLINPQPQLT QLDLEQGASTLRNIRLWDSQPLLATNRQLQQLRVYYRFSNAAVDRYRFVPDKANRQQVMITARELDQAALPKRSRTWLNR HFVFTHGYGFTLSPVNTRAPDGLPDYFISDLGTSTRLEGSSELGITREDVKEAVPIGRAALYFGMLPSPYALAPSKLKEL DYPVGDKNIYNHYLGSGGVPVGHPWQQLAAAMYLFEPRLLNTGSLTINSKLLIRREVRQRVSAIAPFLEVIGDPYLVSTS VNSRDHDYQAKQNQYWIVEAYTSSRTYPYAANLPDGRPVRYLRNSVKAIVDAYSGRVHLYVSEPRDPIILGWQRLFPDLF KPLEEMPSSLREHLKVPTDLFNVQVQQLLRYHVTDPRIFYSGDDVWQVPKELYGKRQVPVDPYHITAQLGSQESSEFLLL QPLTPLARPNLSAWLAARSDGDHYGKLVLLRFPSQTPIFGPEQIQALINQDPQISQQFGLWDRAGSEVVQGNLLVVPLGK ALLYVEPVYLRARQGGLPTLTRVVVSDGKRIAMAEDLGEGLRALVDGSSKKAVYLNRNDLPPIKAADQSN >Mature_949_residues GLAGFARPLQWFKSQWLWLLLSIAAFWLLMRVQVEWLWFGQFDWQGMLLRRWLWQLGGLLLALLVVATCQLWQRNWIKLE GASNLAEPALPLHGWRYGLGLLGCFVVVVGDLVLLTRLAWLACFKPFALGHWWSEPFEDIWALVIPLSCVFISICVMLGN ARGGRIAHLMGCFCFSISIARGWGLWSLALAIPPTGIKEPLLGADVSFGLGQFPALAFALVVLLAQLVLTTSTTIWMKLA QPESLSDWVFKGLSPRQCDVMRPLIGIILLTLSALLWLSRHELLWTQNGTVAGAGWLDAHLILPLRSLASLAILVLAFLV IPFPWIQQRRLWRLIASIIGVGAILLEVLLAPFVQWMVVKPRELKLETPYIIRAIKATRKAFQLDSITTTLINPQPQLTQ LDLEQGASTLRNIRLWDSQPLLATNRQLQQLRVYYRFSNAAVDRYRFVPDKANRQQVMITARELDQAALPKRSRTWLNRH FVFTHGYGFTLSPVNTRAPDGLPDYFISDLGTSTRLEGSSELGITREDVKEAVPIGRAALYFGMLPSPYALAPSKLKELD YPVGDKNIYNHYLGSGGVPVGHPWQQLAAAMYLFEPRLLNTGSLTINSKLLIRREVRQRVSAIAPFLEVIGDPYLVSTSV NSRDHDYQAKQNQYWIVEAYTSSRTYPYAANLPDGRPVRYLRNSVKAIVDAYSGRVHLYVSEPRDPIILGWQRLFPDLFK PLEEMPSSLREHLKVPTDLFNVQVQQLLRYHVTDPRIFYSGDDVWQVPKELYGKRQVPVDPYHITAQLGSQESSEFLLLQ PLTPLARPNLSAWLAARSDGDHYGKLVLLRFPSQTPIFGPEQIQALINQDPQISQQFGLWDRAGSEVVQGNLLVVPLGKA LLYVEPVYLRARQGGLPTLTRVVVSDGKRIAMAEDLGEGLRALVDGSSKKAVYLNRNDLPPIKAADQSN
Specific function: Unknown
COG id: COG1615
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the UPF0182 family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR005372 [H]
Pfam domain/function: PF03699 UPF0182 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 107055; Mature: 106924
Theoretical pI: Translated: 9.64; Mature: 9.64
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGLAGFARPLQWFKSQWLWLLLSIAAFWLLMRVQVEWLWFGQFDWQGMLLRRWLWQLGGL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH LLALLVVATCQLWQRNWIKLEGASNLAEPALPLHGWRYGLGLLGCFVVVVGDLVLLTRLA HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WLACFKPFALGHWWSEPFEDIWALVIPLSCVFISICVMLGNARGGRIAHLMGCFCFSISI HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ARGWGLWSLALAIPPTGIKEPLLGADVSFGLGQFPALAFALVVLLAQLVLTTSTTIWMKL HCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE AQPESLSDWVFKGLSPRQCDVMRPLIGIILLTLSALLWLSRHELLWTQNGTVAGAGWLDA CCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEECCHHHH HLILPLRSLASLAILVLAFLVIPFPWIQQRRLWRLIASIIGVGAILLEVLLAPFVQWMVV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KPRELKLETPYIIRAIKATRKAFQLDSITTTLINPQPQLTQLDLEQGASTLRNIRLWDSQ CCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCC PLLATNRQLQQLRVYYRFSNAAVDRYRFVPDKANRQQVMITARELDQAALPKRSRTWLNR CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEECCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHC HFVFTHGYGFTLSPVNTRAPDGLPDYFISDLGTSTRLEGSSELGITREDVKEAVPIGRAA EEEEEECCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHH LYFGMLPSPYALAPSKLKELDYPVGDKNIYNHYLGSGGVPVGHPWQQLAAAMYLFEPRLL HHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEE NTGSLTINSKLLIRREVRQRVSAIAPFLEVIGDPYLVSTSVNSRDHDYQAKQNQYWIVEA CCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEE YTSSRTYPYAANLPDGRPVRYLRNSVKAIVDAYSGRVHLYVSEPRDPIILGWQRLFPDLF ECCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEECHHHHHHHHH KPLEEMPSSLREHLKVPTDLFNVQVQQLLRYHVTDPRIFYSGDDVWQVPKELYGKRQVPV HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCC DPYHITAQLGSQESSEFLLLQPLTPLARPNLSAWLAARSDGDHYGKLVLLRFPSQTPIFG CCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCC PEQIQALINQDPQISQQFGLWDRAGSEVVQGNLLVVPLGKALLYVEPVYLRARQGGLPTL HHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHCCCHHHCCCEEEEECCCEEEEECHHHEEECCCCCHHH TRVVVSDGKRIAMAEDLGEGLRALVDGSSKKAVYLNRNDLPPIKAADQSN HHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure GLAGFARPLQWFKSQWLWLLLSIAAFWLLMRVQVEWLWFGQFDWQGMLLRRWLWQLGGL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH LLALLVVATCQLWQRNWIKLEGASNLAEPALPLHGWRYGLGLLGCFVVVVGDLVLLTRLA HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WLACFKPFALGHWWSEPFEDIWALVIPLSCVFISICVMLGNARGGRIAHLMGCFCFSISI HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ARGWGLWSLALAIPPTGIKEPLLGADVSFGLGQFPALAFALVVLLAQLVLTTSTTIWMKL HCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE AQPESLSDWVFKGLSPRQCDVMRPLIGIILLTLSALLWLSRHELLWTQNGTVAGAGWLDA CCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEECCHHHH HLILPLRSLASLAILVLAFLVIPFPWIQQRRLWRLIASIIGVGAILLEVLLAPFVQWMVV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KPRELKLETPYIIRAIKATRKAFQLDSITTTLINPQPQLTQLDLEQGASTLRNIRLWDSQ CCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCC PLLATNRQLQQLRVYYRFSNAAVDRYRFVPDKANRQQVMITARELDQAALPKRSRTWLNR CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEECCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHC HFVFTHGYGFTLSPVNTRAPDGLPDYFISDLGTSTRLEGSSELGITREDVKEAVPIGRAA EEEEEECCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHH LYFGMLPSPYALAPSKLKELDYPVGDKNIYNHYLGSGGVPVGHPWQQLAAAMYLFEPRLL HHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEE NTGSLTINSKLLIRREVRQRVSAIAPFLEVIGDPYLVSTSVNSRDHDYQAKQNQYWIVEA CCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEE YTSSRTYPYAANLPDGRPVRYLRNSVKAIVDAYSGRVHLYVSEPRDPIILGWQRLFPDLF ECCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEECHHHHHHHHH KPLEEMPSSLREHLKVPTDLFNVQVQQLLRYHVTDPRIFYSGDDVWQVPKELYGKRQVPV HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCC DPYHITAQLGSQESSEFLLLQPLTPLARPNLSAWLAARSDGDHYGKLVLLRFPSQTPIFG CCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCC PEQIQALINQDPQISQQFGLWDRAGSEVVQGNLLVVPLGKALLYVEPVYLRARQGGLPTL HHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHCCCHHHCCCEEEEECCCEEEEECHHHEEECCCCCHHH TRVVVSDGKRIAMAEDLGEGLRALVDGSSKKAVYLNRNDLPPIKAADQSN HHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 12917642 [H]