| Definition | Prochlorococcus marinus str. NATL1A, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008819 |
| Length | 1,864,731 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is yfbI [C]
Identifier: 124026357
GI number: 124026357
Start: 1343984
End: 1345822
Strand: Reverse
Name: yfbI [C]
Synonym: NATL1_16511
Alternate gene names: 124026357
Gene position: 1345822-1343984 (Counterclockwise)
Preceding gene: 124026358
Following gene: 124026354
Centisome position: 72.17
GC content: 33.22
Gene sequence:
>1839_bases TTGAAAAGCTTCACTAAACCTTTTTATCCAACTTCAATACAAAGAAGACGTGGTCTTCTTTGTATTTTATTTATTGGATT AATAATTTTTGTTTGGCAATTAGGGACAACAGGTTTAGTTGATGAAACACCACCTTTGTTTGCTGCAGCCAGTCGAGCAA TGGCTGAAACGGGTAATTGGTTTACTCCTCAAGTAAATGGATTACCTCGATTTGACAAGCCTCCTTTGGTTTATTGGTTG ATGGGACTGGGATTTTCAATCCCAGGGAATATTTCTTGGGACCCTTTAGGGACATGGGCTGCAAGGCTTCCTTCTGCATT ATCAACAATTTTTTTAATGCTCGTTTTAGGGGACACAATGATGAAATATCCCCAAGAAGAAAATAATTTCAATAGAAGAA CCGCAGTTATTACTGCGCTGGTATTTGCGTTGTCGCCTTTGGTAATAATTTGGGGAAGAATTGCTGTAAGTGATGCACTC CTTTGCAGCACTTTAGGAATTTGCTTACTTCTTAAATGGAGAAGATTCGCTAATCCAGAGGGAGAAGCTTGGTGGTTGTC TTGGATTTTTTTGTCATTTGCAGTTTTAACTAAAGGTCCTGTCGCTTTGGTTTTATCAGCATTAACAATTTTATTTTTTT CCTTATTTCAAAATAATTTGCTCGGAATTTTAAAAATATTGAAAGTAATTCCAGGACTTTTTCTTGTTTTTATTATTAGT TTTCCTTGGTATTTAATTGAATTATTAATAGAGGGAAAACCCTTCTTAGATAGTTTTTTTGGGTATCATAATCTTCAAAG ATTCACCTCAGTAGTAAATTCTCATGGGGAGCCTTGGTGGTTTTTTTTAATAGTATTATGTATTGCTTCTTTACCACTTA CTCCATTTTTATTAATAAGTATTTGGAAGAATTTTTACAATGTATCTAAATGGTCTAGAAGAGTTATTAAAAAACCAGAA AAGTCATTATTTGAGTTTTCATTTTTTTGGTTAATAGCTGTATTTGTTTTCTTTACTATTTCAGCTACCAAGCTACCGAG CTATTGGCTTCCTGCTACACCTGCAGCATCAGTTTTAATATCACTTTCCTTAACCAATAATGTTAAAGAGGAATTCTTAA AATCTTTGGCTTGGAAATTTACAATATTTTTATCAATACTCTTTTCCATATTTCTCTTCTCTTCAAAGCTATGGATTCAG CTTCTTAACGATCCTGAGATTCCAAACTTCTCAGAAGAATTAACCAATAGCTTTTTAATTGAAAAGTCTGGTTTTATTTT TCTTTTACTTGCTGTTCTAGGAATAATATTTTCCTCTAGAAAAATATATGGAAAACTATTGATTTTGCAAATCCCTATAG CTTTATCTCATTTCCTGATTGTGTTACCAACTTTTGATTTGGCAGATAGATTAAGACAACTCCCCTTAAGAGAAGCCTCA GAATTACTTTTAAATTCCCAAAATAGAAACGAGCCTTTAGTAATGGTAGGAGCTATGAAACCCTCAATTCATTTTTATAC TAATCAAGTCATTGTTTTTGAAGGTAGATCTAAAAATGCTTTTGTAAATGTTTCAGATCGACTTAAAAACGAGAAGAGAA GAGGCTGGAAAGGAAGGCCAATATATGGATCCAATGGCTCAGAAACTACACTTTTACTTATTGATAAAAGATCAGTGGAA AAATCTTATTGGCAAGGACTTAATCCAGAAGTCTTAGGTAATTTTGGTGTTTATAGCGTTTGGAGACTTGATAGAGAAAT TATTGAAAGACGAGCTAAATTGTTGAAAATAGATGGTGTCACTTCTACTTGGAAAAATCCTAGACCAGAGAGATTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTTGAAAAAAAAGCCACTAGCAAAGTCTTTGCAGAAAGAGTGGAGAATTGGCTTTATAAAGGCTTAAATAAGAAAATCT CAGCAGACTTTAAAGATTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAACGTCAAATACCTATTGAATCGAATTTATTAAATCTTGTTTGCTACATCTTTCAGGGATAATAACAATGCCTAGAT CATCCTGAAGACTCTCTAAA
Product: glycosyltransferase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 612; Mature: 612
Protein sequence:
>612_residues MKSFTKPFYPTSIQRRRGLLCILFIGLIIFVWQLGTTGLVDETPPLFAAASRAMAETGNWFTPQVNGLPRFDKPPLVYWL MGLGFSIPGNISWDPLGTWAARLPSALSTIFLMLVLGDTMMKYPQEENNFNRRTAVITALVFALSPLVIIWGRIAVSDAL LCSTLGICLLLKWRRFANPEGEAWWLSWIFLSFAVLTKGPVALVLSALTILFFSLFQNNLLGILKILKVIPGLFLVFIIS FPWYLIELLIEGKPFLDSFFGYHNLQRFTSVVNSHGEPWWFFLIVLCIASLPLTPFLLISIWKNFYNVSKWSRRVIKKPE KSLFEFSFFWLIAVFVFFTISATKLPSYWLPATPAASVLISLSLTNNVKEEFLKSLAWKFTIFLSILFSIFLFSSKLWIQ LLNDPEIPNFSEELTNSFLIEKSGFIFLLLAVLGIIFSSRKIYGKLLILQIPIALSHFLIVLPTFDLADRLRQLPLREAS ELLLNSQNRNEPLVMVGAMKPSIHFYTNQVIVFEGRSKNAFVNVSDRLKNEKRRGWKGRPIYGSNGSETTLLLIDKRSVE KSYWQGLNPEVLGNFGVYSVWRLDREIIERRAKLLKIDGVTSTWKNPRPERF
Sequences:
>Translated_612_residues MKSFTKPFYPTSIQRRRGLLCILFIGLIIFVWQLGTTGLVDETPPLFAAASRAMAETGNWFTPQVNGLPRFDKPPLVYWL MGLGFSIPGNISWDPLGTWAARLPSALSTIFLMLVLGDTMMKYPQEENNFNRRTAVITALVFALSPLVIIWGRIAVSDAL LCSTLGICLLLKWRRFANPEGEAWWLSWIFLSFAVLTKGPVALVLSALTILFFSLFQNNLLGILKILKVIPGLFLVFIIS FPWYLIELLIEGKPFLDSFFGYHNLQRFTSVVNSHGEPWWFFLIVLCIASLPLTPFLLISIWKNFYNVSKWSRRVIKKPE KSLFEFSFFWLIAVFVFFTISATKLPSYWLPATPAASVLISLSLTNNVKEEFLKSLAWKFTIFLSILFSIFLFSSKLWIQ LLNDPEIPNFSEELTNSFLIEKSGFIFLLLAVLGIIFSSRKIYGKLLILQIPIALSHFLIVLPTFDLADRLRQLPLREAS ELLLNSQNRNEPLVMVGAMKPSIHFYTNQVIVFEGRSKNAFVNVSDRLKNEKRRGWKGRPIYGSNGSETTLLLIDKRSVE KSYWQGLNPEVLGNFGVYSVWRLDREIIERRAKLLKIDGVTSTWKNPRPERF >Mature_612_residues MKSFTKPFYPTSIQRRRGLLCILFIGLIIFVWQLGTTGLVDETPPLFAAASRAMAETGNWFTPQVNGLPRFDKPPLVYWL MGLGFSIPGNISWDPLGTWAARLPSALSTIFLMLVLGDTMMKYPQEENNFNRRTAVITALVFALSPLVIIWGRIAVSDAL LCSTLGICLLLKWRRFANPEGEAWWLSWIFLSFAVLTKGPVALVLSALTILFFSLFQNNLLGILKILKVIPGLFLVFIIS FPWYLIELLIEGKPFLDSFFGYHNLQRFTSVVNSHGEPWWFFLIVLCIASLPLTPFLLISIWKNFYNVSKWSRRVIKKPE KSLFEFSFFWLIAVFVFFTISATKLPSYWLPATPAASVLISLSLTNNVKEEFLKSLAWKFTIFLSILFSIFLFSSKLWIQ LLNDPEIPNFSEELTNSFLIEKSGFIFLLLAVLGIIFSSRKIYGKLLILQIPIALSHFLIVLPTFDLADRLRQLPLREAS ELLLNSQNRNEPLVMVGAMKPSIHFYTNQVIVFEGRSKNAFVNVSDRLKNEKRRGWKGRPIYGSNGSETTLLLIDKRSVE KSYWQGLNPEVLGNFGVYSVWRLDREIIERRAKLLKIDGVTSTWKNPRPERF
Specific function: Unknown
COG id: COG1807
COG function: function code M; 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the glycosyltransferase 83 family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788591, Length=343, Percent_Identity=27.1137026239067, Blast_Score=67, Evalue=3e-12,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003342 [H]
Pfam domain/function: PF02366 PMT [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 70089; Mature: 70089
Theoretical pI: Translated: 10.39; Mature: 10.39
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKSFTKPFYPTSIQRRRGLLCILFIGLIIFVWQLGTTGLVDETPPLFAAASRAMAETGNW CCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC FTPQVNGLPRFDKPPLVYWLMGLGFSIPGNISWDPLGTWAARLPSALSTIFLMLVLGDTM CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MKYPQEENNFNRRTAVITALVFALSPLVIIWGRIAVSDALLCSTLGICLLLKWRRFANPE HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GEAWWLSWIFLSFAVLTKGPVALVLSALTILFFSLFQNNLLGILKILKVIPGLFLVFIIS CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FPWYLIELLIEGKPFLDSFFGYHNLQRFTSVVNSHGEPWWFFLIVLCIASLPLTPFLLIS HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH IWKNFYNVSKWSRRVIKKPEKSLFEFSFFWLIAVFVFFTISATKLPSYWLPATPAASVLI HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHEE SLSLTNNVKEEFLKSLAWKFTIFLSILFSIFLFSSKLWIQLLNDPEIPNFSEELTNSFLI EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC EKSGFIFLLLAVLGIIFSSRKIYGKLLILQIPIALSHFLIVLPTFDLADRLRQLPLREAS CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHH ELLLNSQNRNEPLVMVGAMKPSIHFYTNQVIVFEGRSKNAFVNVSDRLKNEKRRGWKGRP HHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECEEEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCC IYGSNGSETTLLLIDKRSVEKSYWQGLNPEVLGNFGVYSVWRLDREIIERRAKLLKIDGV CCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC TSTWKNPRPERF CCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKSFTKPFYPTSIQRRRGLLCILFIGLIIFVWQLGTTGLVDETPPLFAAASRAMAETGNW CCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC FTPQVNGLPRFDKPPLVYWLMGLGFSIPGNISWDPLGTWAARLPSALSTIFLMLVLGDTM CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MKYPQEENNFNRRTAVITALVFALSPLVIIWGRIAVSDALLCSTLGICLLLKWRRFANPE HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GEAWWLSWIFLSFAVLTKGPVALVLSALTILFFSLFQNNLLGILKILKVIPGLFLVFIIS CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FPWYLIELLIEGKPFLDSFFGYHNLQRFTSVVNSHGEPWWFFLIVLCIASLPLTPFLLIS HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH IWKNFYNVSKWSRRVIKKPEKSLFEFSFFWLIAVFVFFTISATKLPSYWLPATPAASVLI HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHEE SLSLTNNVKEEFLKSLAWKFTIFLSILFSIFLFSSKLWIQLLNDPEIPNFSEELTNSFLI EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC EKSGFIFLLLAVLGIIFSSRKIYGKLLILQIPIALSHFLIVLPTFDLADRLRQLPLREAS CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHH ELLLNSQNRNEPLVMVGAMKPSIHFYTNQVIVFEGRSKNAFVNVSDRLKNEKRRGWKGRP HHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECEEEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCC IYGSNGSETTLLLIDKRSVEKSYWQGLNPEVLGNFGVYSVWRLDREIIERRAKLLKIDGV CCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC TSTWKNPRPERF CCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9537320 [H]