| Definition | Prochlorococcus marinus str. NATL1A, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008819 |
| Length | 1,864,731 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 124025575
Identifier: 124025575
GI number: 124025575
Start: 803010
End: 804476
Strand: Reverse
Name: 124025575
Synonym: NATL1_08681
Alternate gene names: NA
Gene position: 804476-803010 (Counterclockwise)
Preceding gene: 124025576
Following gene: 124025573
Centisome position: 43.14
GC content: 24.2
Gene sequence:
>1467_bases ATGAAACCAAAATATAGTATAAGCAACATAATCAAATATTCATCTGGCGAAATAATAAGCAGAATACCTTTGACTCTTTT AGAAATGTCATTAGTCGCTATACTTTCTCCTTCCTTATATGGGGCTTGGAGTTTAATACAATCACTAGTAAGTTATGGAA ATTTTTCTCACTTTGGTATTGCATCATCTCTTACAAGAAAAGAGCCAGGATTAATTTCAAAAAATTTATTTGCTCAGATA AAAAAGTACAGATCAAATGCTTATGCTTCACAAATAATAATTATTATATTTATTTCATTAATACTAATATTATGGAATAA GATATTTAAAAATTCATTTGAATTAATAGGAGGGTACCCATCTATAATATTTTTATTGATTACTATTTATCTTCAACAAC TTTTAATCGTTGGTTATTCATCATCAATTAATGAATTAAAAATAAAATTAGTATCATTTTTAAGAATATTTTACTCATTA ATATTTCTATTCTTAGGACTATTAGCAGCAATTTATCATAAAAGCATTTATTCATTACTTATATCATGGTCAATTTCACT TCTAGTTACGTTTATTATCTTAATAAGAAACGTTCCTTCACTTCGTATAAAACCAGAATTTGATAGACACATTACAAAGC TTTTATTATTTGATGGTTTTCCAATTTTATTTCAAGGATTGCAAAGATTTGCTATCGTAAATATAGATAGATTATTTCTA ATAAAAGTAAGCACACTAGAGAACTTAGGATATTACTCAATTGGACTTTTGGCATCAAACTTAGTTTCTCTTCCAGGTAC AATCATCACAAAAGTTACACTTCCAATAATACTTAGACGAATATCATCATTAGGTTTTTATACCGATGAAAATAAAAAAG TAGTAAAAGTAAGTATAATGTTAATTCATAAATCATGTATTTTCTTAGGTCTTATTCTTACAGTATTTCTACCAATTATT ATTAGAAATTTATTCCCTGCCTATTTACCATCTTTAGATTTATGCACAATTTTAATTATTGTTGGAGTTGAAATTGGAAT TGCACAAAGTTGTATAGATTTTACGCTTGCTGTTGGAAAAAAAAAGAAGATATTAATAATTACAAGCTTATTTATACCAA TAATTTTAATATCCCACTCATTATTTTGGATAAATTATAAATCAATAACTTTTCTTGCAATATCGTTATTTATTTGCATA ACAGTCTACACATCCATAATAATTAATATATGCTTAAATTATTTTAAGATAAATAGAGCAGAATCTAAAAGAATTAATCT TATAATTATTAGTGATATCCTAAAATATCTTATACTTGGCTTATCGTATAATTTTGCACTTAATACATCATTAGATAATA AATATTATATAATTTTAATAATAATACTCATATCGACTAGTCTAATTATTACTGAAATAAATTCTATAATTAAAGTATCA AAAGAGTATCAAAAATTGAATAATTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCAAGAAAAATCGGAATAGATATATAAATAAACAGTTTAAAGGTAATAATAGTATCGATAAAACAATGAATCTTTTAGAA AATATATAATTCAGATAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTACAATTAATTTTAAAAATTTTTATTTAATCAGATATATAAATTATAAAAATATCTATTTCTTAACTAATTTTTCAGCA ACTGTAATTCAATTGTCTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 488; Mature: 488
Protein sequence:
>488_residues MKPKYSISNIIKYSSGEIISRIPLTLLEMSLVAILSPSLYGAWSLIQSLVSYGNFSHFGIASSLTRKEPGLISKNLFAQI KKYRSNAYASQIIIIIFISLILILWNKIFKNSFELIGGYPSIIFLLITIYLQQLLIVGYSSSINELKIKLVSFLRIFYSL IFLFLGLLAAIYHKSIYSLLISWSISLLVTFIILIRNVPSLRIKPEFDRHITKLLLFDGFPILFQGLQRFAIVNIDRLFL IKVSTLENLGYYSIGLLASNLVSLPGTIITKVTLPIILRRISSLGFYTDENKKVVKVSIMLIHKSCIFLGLILTVFLPII IRNLFPAYLPSLDLCTILIIVGVEIGIAQSCIDFTLAVGKKKKILIITSLFIPIILISHSLFWINYKSITFLAISLFICI TVYTSIIINICLNYFKINRAESKRINLIIISDILKYLILGLSYNFALNTSLDNKYYIILIIILISTSLIITEINSIIKVS KEYQKLNN
Sequences:
>Translated_488_residues MKPKYSISNIIKYSSGEIISRIPLTLLEMSLVAILSPSLYGAWSLIQSLVSYGNFSHFGIASSLTRKEPGLISKNLFAQI KKYRSNAYASQIIIIIFISLILILWNKIFKNSFELIGGYPSIIFLLITIYLQQLLIVGYSSSINELKIKLVSFLRIFYSL IFLFLGLLAAIYHKSIYSLLISWSISLLVTFIILIRNVPSLRIKPEFDRHITKLLLFDGFPILFQGLQRFAIVNIDRLFL IKVSTLENLGYYSIGLLASNLVSLPGTIITKVTLPIILRRISSLGFYTDENKKVVKVSIMLIHKSCIFLGLILTVFLPII IRNLFPAYLPSLDLCTILIIVGVEIGIAQSCIDFTLAVGKKKKILIITSLFIPIILISHSLFWINYKSITFLAISLFICI TVYTSIIINICLNYFKINRAESKRINLIIISDILKYLILGLSYNFALNTSLDNKYYIILIIILISTSLIITEINSIIKVS KEYQKLNN >Mature_488_residues MKPKYSISNIIKYSSGEIISRIPLTLLEMSLVAILSPSLYGAWSLIQSLVSYGNFSHFGIASSLTRKEPGLISKNLFAQI KKYRSNAYASQIIIIIFISLILILWNKIFKNSFELIGGYPSIIFLLITIYLQQLLIVGYSSSINELKIKLVSFLRIFYSL IFLFLGLLAAIYHKSIYSLLISWSISLLVTFIILIRNVPSLRIKPEFDRHITKLLLFDGFPILFQGLQRFAIVNIDRLFL IKVSTLENLGYYSIGLLASNLVSLPGTIITKVTLPIILRRISSLGFYTDENKKVVKVSIMLIHKSCIFLGLILTVFLPII IRNLFPAYLPSLDLCTILIIVGVEIGIAQSCIDFTLAVGKKKKILIITSLFIPIILISHSLFWINYKSITFLAISLFICI TVYTSIIINICLNYFKINRAESKRINLIIISDILKYLILGLSYNFALNTSLDNKYYIILIIILISTSLIITEINSIIKVS KEYQKLNN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 55329; Mature: 55329
Theoretical pI: Translated: 10.21; Mature: 10.21
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKPKYSISNIIKYSSGEIISRIPLTLLEMSLVAILSPSLYGAWSLIQSLVSYGNFSHFGI CCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH ASSLTRKEPGLISKNLFAQIKKYRSNAYASQIIIIIFISLILILWNKIFKNSFELIGGYP HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCH SIIFLLITIYLQQLLIVGYSSSINELKIKLVSFLRIFYSLIFLFLGLLAAIYHKSIYSLL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISWSISLLVTFIILIRNVPSLRIKPEFDRHITKLLLFDGFPILFQGLQRFAIVNIDRLFL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE IKVSTLENLGYYSIGLLASNLVSLPGTIITKVTLPIILRRISSLGFYTDENKKVVKVSIM EEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCEEEEEEHH LIHKSCIFLGLILTVFLPIIIRNLFPAYLPSLDLCTILIIVGVEIGIAQSCIDFTLAVGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KKKILIITSLFIPIILISHSLFWINYKSITFLAISLFICITVYTSIIINICLNYFKINRA CCEEEEHHHHHHHHHHHHCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC ESKRINLIIISDILKYLILGLSYNFALNTSLDNKYYIILIIILISTSLIITEINSIIKVS CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEYQKLNN HHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKPKYSISNIIKYSSGEIISRIPLTLLEMSLVAILSPSLYGAWSLIQSLVSYGNFSHFGI CCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH ASSLTRKEPGLISKNLFAQIKKYRSNAYASQIIIIIFISLILILWNKIFKNSFELIGGYP HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCH SIIFLLITIYLQQLLIVGYSSSINELKIKLVSFLRIFYSLIFLFLGLLAAIYHKSIYSLL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISWSISLLVTFIILIRNVPSLRIKPEFDRHITKLLLFDGFPILFQGLQRFAIVNIDRLFL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE IKVSTLENLGYYSIGLLASNLVSLPGTIITKVTLPIILRRISSLGFYTDENKKVVKVSIM EEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCEEEEEEHH LIHKSCIFLGLILTVFLPIIIRNLFPAYLPSLDLCTILIIVGVEIGIAQSCIDFTLAVGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KKKILIITSLFIPIILISHSLFWINYKSITFLAISLFICITVYTSIIINICLNYFKINRA CCEEEEHHHHHHHHHHHHCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC ESKRINLIIISDILKYLILGLSYNFALNTSLDNKYYIILIIILISTSLIITEINSIIKVS CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEYQKLNN HHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA