| Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008817 |
| Length | 1,704,176 |
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The map label for this gene is 123966611
Identifier: 123966611
GI number: 123966611
Start: 1212574
End: 1213944
Strand: Reverse
Name: 123966611
Synonym: P9515_13781
Alternate gene names: NA
Gene position: 1213944-1212574 (Counterclockwise)
Preceding gene: 123966612
Following gene: 123966610
Centisome position: 71.23
GC content: 26.84
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGAAAGTTTTACATATATCTTATTCTTATGACTTCAAAGATGGCGGCATAACAACTGTTGTTGAACAATTAATAAGAGAA CAAAAAAAAACTAAAATAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 456; Mature: 456
Protein sequence:
>456_residues MFIDFLFSLNSSEIFYLIVLFIICIWELLKNYNDKKWFNFFKPTTLFGALVIFYCLVGPIITSGQQDGSISYRGVDHREF YEIGLIGALLTYLSFQLGFNFKKYFKKEKFGINKLKGYQLGTKDYLFIHKWGERIILFSLFLQFINYGTSLLSRALNLYT LAEISSGGGGGGFASSWISSTVNFLIVGIVLLFICLLNGIKERTKFVFYLLTTISLYVSLGFRYRLFLLLLPLILIYFFY KKIKPDITLLLSLILSTLLIFGFIQISRNYGTGLNYELFSRKYSVTEQSVLEFVLKSATFDTNVFHTSAAIIYKTPEEIN YSGIKPIINTLTLPIPRILWQNKPKGEYLITAYRTIYDGFLWEVGAANLGFAEYYLAGGWIALITINFFLGLYFKKLWNE FLLNFNDPIAQIKYSLYLSFMFIVFTRGYLLQLTFLYFTIFIPFHYFSNIWNKRYR
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 53179; Mature: 53179
Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 0.4 %Met (Translated Protein) 1.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 0.4 %Met (Mature Protein) 1.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFIDFLFSLNSSEIFYLIVLFIICIWELLKNYNDKKWFNFFKPTTLFGALVIFYCLVGPI CEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ITSGQQDGSISYRGVDHREFYEIGLIGALLTYLSFQLGFNFKKYFKKEKFGINKLKGYQL HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC GTKDYLFIHKWGERIILFSLFLQFINYGTSLLSRALNLYTLAEISSGGGGGGFASSWISS CCCCEEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHH TVNFLIVGIVLLFICLLNGIKERTKFVFYLLTTISLYVSLGFRYRLFLLLLPLILIYFFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKIKPDITLLLSLILSTLLIFGFIQISRNYGTGLNYELFSRKYSVTEQSVLEFVLKSATF HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCC DTNVFHTSAAIIYKTPEEINYSGIKPIINTLTLPIPRILWQNKPKGEYLITAYRTIYDGF CCCEEECCEEEEEECHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH LWEVGAANLGFAEYYLAGGWIALITINFFLGLYFKKLWNEFLLNFNDPIAQIKYSLYLSF HHHHCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH MFIVFTRGYLLQLTFLYFTIFIPFHYFSNIWNKRYR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MFIDFLFSLNSSEIFYLIVLFIICIWELLKNYNDKKWFNFFKPTTLFGALVIFYCLVGPI CEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ITSGQQDGSISYRGVDHREFYEIGLIGALLTYLSFQLGFNFKKYFKKEKFGINKLKGYQL HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC GTKDYLFIHKWGERIILFSLFLQFINYGTSLLSRALNLYTLAEISSGGGGGGFASSWISS CCCCEEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHH TVNFLIVGIVLLFICLLNGIKERTKFVFYLLTTISLYVSLGFRYRLFLLLLPLILIYFFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKIKPDITLLLSLILSTLLIFGFIQISRNYGTGLNYELFSRKYSVTEQSVLEFVLKSATF HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCC DTNVFHTSAAIIYKTPEEINYSGIKPIINTLTLPIPRILWQNKPKGEYLITAYRTIYDGF CCCEEECCEEEEEECHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH LWEVGAANLGFAEYYLAGGWIALITINFFLGLYFKKLWNEFLLNFNDPIAQIKYSLYLSF HHHHCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH MFIVFTRGYLLQLTFLYFTIFIPFHYFSNIWNKRYR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA