| Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008817 |
| Length | 1,704,176 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 123965929
Identifier: 123965929
GI number: 123965929
Start: 628922
End: 630301
Strand: Direct
Name: 123965929
Synonym: P9515_06941
Alternate gene names: NA
Gene position: 628922-630301 (Clockwise)
Preceding gene: 123965928
Following gene: 123965930
Centisome position: 36.9
GC content: 30.29
Gene sequence:
>1380_bases TTGAATATTTCTTTCCTACAAAATAAAGATGTTTTTTCAAATTCCCTTTTAATAAGCTTTTCCGGATTTTTAATAATATC TTTTTTCTTGATATTTGGGAGAAGATTAAAACTAGCTGTTCAATTAGAAAGATTTGGATTACCCATCGCAGTTATTTCAG GTGTCGCTGGTATCTCAATAGGACCTTATGGTTTAATCCATTTTTTATCTAAAGAGACTACAAGTGTTTGGAGTAATTTC CCAACTCCTCTATTGTCATTAGTTTTTGCAACTTTGATGATGGGAAGACCAATACCTAACATTAATGGTTTAATTAAGCC TATTGTCAACCAGTTTTTACTTGCTCTTTCCTTAGGGTTTGGCCAGTTTTTTATTGGTGGATTAGTTGTTAAATACCTTT TAGCTCCTCATATGGATATAAATCCTTTAATGGGATGTTTGATAGAGGTTGGTTTTGAGGGGGGGCATGGAGCTGCCACT ATTATTGGAGAAAGTTTTGATAGACTTGGATTCTCAGATGGACTTGATCTCGGACTAGCGATGGCAACAATGGGACTTTT GACGTCTTCATTATTAGGCAGTATATTCATTTTTATTGGAAGAACTTTAAGGCTTTCAGATACAGAGGAAATTATAGATA AAAAAGAAAATTTAAATACAAATATAAATCTTAAAACCGAATTTTTAGTAGATTTGAGAGTATTGCTAATAAATCTTGGT TTTGCAGGTTTAGCAATCATTTTTGGTGTATTGCTTCTTCAGTTTTTAAGATATATTTCAAATTACTTTGGTGAATTTTC AAGAGAAATTATCTTTTCACTTCCTGTCTTTCCTCTTATTCTTATAGGCTCTCTTTTGATAAGATATATTTTAGAAAAAA CAAAAAATACAGATTTTATCTCTAATATTCTTCAAAGAGAAATAGGCATACTATCAACAGATTTATTGATTTTTACAGCA ATGGCAAGTTTAGATATCGCAACTGTTTTTGAAAATTGGGTTCTTATATTATTGCTTACTATTTTTGGTTTGTTCTGGAA TTTGATTTGTATTGCTTATTTTGCATACTTTATATTTGATGATTACTGGTTTGAGAAAAGTTTAATAGAGTTTGGTAATT CTACAGGTGTAGTTGCTTCGGGTTTATTATTGTTGAGGCTTGCAGATCCTAAAAACATTTCTAAAACTCTTCCTATTTTT ACATCTAAACAACTTTTCGCCCAATTAATACTATCAGGAGGCTTTTTTACTGTAGTAGCACCTCTAGTTATATCTAAAAT CGGACTAGATTATTGGACAGAGATTTGCGCATTAATAACTTTTTTAATTATTATTATCGCTTTTTTATTTAATAAAAAAT TTTCTGCAAGTTACCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCATTAATAATATTTAAAGGCCTCATTATTTGAGGCCTTTTTTATTTGGTAAGATTAATTTATTAAATTAAATTTATAGA GTTATTAAATCTCGAACTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GAAGTTCAGTTAGTATTAAAATATATTTCTATTGATTCATGTCGCATACCCCATACGATATTCCTCCTCAAGAAAACAAG GAAAAATGGTTTAGGAGTCA
Product: sodium/solute symporter family protein
Products: NA
Alternate protein names: Na+/Glutamate Symporter; Sodium/Solute Symporter Family Protein; Sodium/Glutamate Symporter Superfamily; SodiumSolute Symporter ESS Family; Sodium/Glutamate Symport Carrier Protein; Integral Membrane Protein
Number of amino acids: Translated: 459; Mature: 459
Protein sequence:
>459_residues MNISFLQNKDVFSNSLLISFSGFLIISFFLIFGRRLKLAVQLERFGLPIAVISGVAGISIGPYGLIHFLSKETTSVWSNF PTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLIKPIVNQFLLALSLGFGQFFIGGLVVKYLLAPHMDINPLMGCLIEVGFEGGHGAAT IIGESFDRLGFSDGLDLGLAMATMGLLTSSLLGSIFIFIGRTLRLSDTEEIIDKKENLNTNINLKTEFLVDLRVLLINLG FAGLAIIFGVLLLQFLRYISNYFGEFSREIIFSLPVFPLILIGSLLIRYILEKTKNTDFISNILQREIGILSTDLLIFTA MASLDIATVFENWVLILLLTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIF TSKQLFAQLILSGGFFTVVAPLVISKIGLDYWTEICALITFLIIIIAFLFNKKFSASYQ
Sequences:
>Translated_459_residues MNISFLQNKDVFSNSLLISFSGFLIISFFLIFGRRLKLAVQLERFGLPIAVISGVAGISIGPYGLIHFLSKETTSVWSNF PTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLIKPIVNQFLLALSLGFGQFFIGGLVVKYLLAPHMDINPLMGCLIEVGFEGGHGAAT IIGESFDRLGFSDGLDLGLAMATMGLLTSSLLGSIFIFIGRTLRLSDTEEIIDKKENLNTNINLKTEFLVDLRVLLINLG FAGLAIIFGVLLLQFLRYISNYFGEFSREIIFSLPVFPLILIGSLLIRYILEKTKNTDFISNILQREIGILSTDLLIFTA MASLDIATVFENWVLILLLTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIF TSKQLFAQLILSGGFFTVVAPLVISKIGLDYWTEICALITFLIIIIAFLFNKKFSASYQ >Mature_459_residues MNISFLQNKDVFSNSLLISFSGFLIISFFLIFGRRLKLAVQLERFGLPIAVISGVAGISIGPYGLIHFLSKETTSVWSNF PTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLIKPIVNQFLLALSLGFGQFFIGGLVVKYLLAPHMDINPLMGCLIEVGFEGGHGAAT IIGESFDRLGFSDGLDLGLAMATMGLLTSSLLGSIFIFIGRTLRLSDTEEIIDKKENLNTNINLKTEFLVDLRVLLINLG FAGLAIIFGVLLLQFLRYISNYFGEFSREIIFSLPVFPLILIGSLLIRYILEKTKNTDFISNILQREIGILSTDLLIFTA MASLDIATVFENWVLILLLTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIF TSKQLFAQLILSGGFFTVVAPLVISKIGLDYWTEICALITFLIIIIAFLFNKKFSASYQ
Specific function: Unknown
COG id: COG0786
COG function: function code E; Na+/glutamate symporter
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50993; Mature: 50993
Theoretical pI: Translated: 6.29; Mature: 6.29
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNISFLQNKDVFSNSLLISFSGFLIISFFLIFGRRLKLAVQLERFGLPIAVISGVAGISI CCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCC GPYGLIHFLSKETTSVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLIKPIVNQFLLALSLGF CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GQFFIGGLVVKYLLAPHMDINPLMGCLIEVGFEGGHGAATIIGESFDRLGFSDGLDLGLA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH MATMGLLTSSLLGSIFIFIGRTLRLSDTEEIIDKKENLNTNINLKTEFLVDLRVLLINLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCC FAGLAIIFGVLLLQFLRYISNYFGEFSREIIFSLPVFPLILIGSLLIRYILEKTKNTDFI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH SNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIATVFENWVLILLLTIFGLFWNLICIAYFAYFIFD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIFTSKQLFAQLILSGGFFTVVA HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHH PLVISKIGLDYWTEICALITFLIIIIAFLFNKKFSASYQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNISFLQNKDVFSNSLLISFSGFLIISFFLIFGRRLKLAVQLERFGLPIAVISGVAGISI CCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCC GPYGLIHFLSKETTSVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLIKPIVNQFLLALSLGF CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GQFFIGGLVVKYLLAPHMDINPLMGCLIEVGFEGGHGAATIIGESFDRLGFSDGLDLGLA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH MATMGLLTSSLLGSIFIFIGRTLRLSDTEEIIDKKENLNTNINLKTEFLVDLRVLLINLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCC FAGLAIIFGVLLLQFLRYISNYFGEFSREIIFSLPVFPLILIGSLLIRYILEKTKNTDFI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH SNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIATVFENWVLILLLTIFGLFWNLICIAYFAYFIFD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIFTSKQLFAQLILSGGFFTVVA HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHH PLVISKIGLDYWTEICALITFLIIIIAFLFNKKFSASYQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA