| Definition | Prochlorococcus marinus str. AS9601, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008816 |
| Length | 1,669,886 |
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The map label for this gene is 123967965
Identifier: 123967965
GI number: 123967965
Start: 366365
End: 369070
Strand: Direct
Name: 123967965
Synonym: A9601_04281
Alternate gene names: NA
Gene position: 366365-369070 (Clockwise)
Preceding gene: 123967964
Following gene: 123967966
Centisome position: 21.94
GC content: 28.6
Gene sequence:
>2706_bases ATGGAAAAGATTGAAGAATATAAATTTAATAACGATAAATATGAAAGTTCTATAGAAGATTTAAAAAACTATAAAACCCT AAATAATGTTTCCTTAGATGATGCATTTTTAAAATATAAAAATGATTATATAAAATTTTTTGATAGTAAATTTATCATTG AGCTTGAAGCTGCTAAAAAATTTTTAGAGGAAGATGAAATAAAAGCACTTGATTATTCAAAAACACTTTCTTCAAGGAAG CAAGAAAGTTGGTATTTTGGACCAAAAGAAAATCATAAAAATTGGAATTCATATAAAAGCTATCTTTTAAATGTCAAAAA TAGAACTAAGGAATCTGTCGAAATTTTGAATAATGAAACAACTGAAGTAGTTAATCAAATTTTGAATCCTTACGCGCCTT CAGGGAAAAAAATTAAAGGATTAGTTTTGGGGTATGTGCAGTCAGGAAAAACTGCAAATATGGCTGGTGTAATAGCAAAG GCAGCAGACTCTGGCTACAAGTTAATAATAGTGCTGGCAGGATTAACAAAAGCTTTAAGAGCCCAGACACAAGCCAGAAT TCAAAATGATATTCTTCAGCATAATGATATTCTTTGGCATCCTTTAACTGATAATGAAAATGATATTGAAGAGGGCCTAG ATGCTATTCCAATATTTACTAAGAAAACTACTATTTGTATTATTAAAAAAAATGTTCAAATAATTATAAAACTTATTTCC AAGATGAAAAGGATGCCTAAATTAGAGATGCAGGCATCAACATTGATTATTGATGATGAATGTGATCAGGCAAGTCTTAA TACAAAAGAATATAAGGATAAAGCTAATGAAATATCAAGTACAAATAAGTTATTAAAACAGCTATTAATTGATTTTAAAA ATGTTACTTATGTTGGTTATACCGCAACGCCGAACGCTCCTTTTTTAACACATCCAAAAGCACCTGATGGTCTGCAAAGT CTTTACCCCAGCGATTTCATAACCCCCTTAGAAGAACCAGCTGATTATTTTGGAGTAAATAAGCTATTTGCTAATAATAT AACTAATGAAAGTGGAGAAGATCTTAGTTTACCCTTTATTAAAAGAATACCTGATTCTGAACTTGAATCTTTAACTTGTA AAAGAAAAGATCTACCTATTTTTAAACCTTCTTTAACTAATAGTTTAAGAGATGCATGCGACTATTTTTTGTTAGTTCTT TCTGCCAGGTCATTGAGAAATCTTAAAGAAGATCATTGTTGCATGATGATCCATGTTTCAAGAAGTCTAAAGATGCATGA ATTATATAGAAACTTAATTTTTGAAGAATGGTTCATCCCAATAAAAATAGGTCTTGAAAATAAAGATAAAGAAATAATTG ATAGATTAGAGAATTTATGGAAAATTGAGTCAAAAGCAATTAATTCATCTGTTAGATCAAATTTAAATTGTCCTCTCAAA ATTGAGTCTTTTCAGAAAATAGAAAAGAATTTATTAAATGAATTAAATGATCTTTCTATAAATGTTGAAAATTCAGATGA GTCTAATTTTGATGAAAGATTAGAATTTAAAGATAAAAGAGATAAAGACTATAAAACTATTCATTCAATTGTTATTGGAG GAGACGTACTTTCAAGAGGTTTAACAATTGATGGCTTAGTTAGCAGTTTTTTCTTAAGAGAGACTAAACAGGATGATACG CTTATGCAAATGGGAAGATGGTTTGGTTTTAGATATGGTTATGAAGATTTGCCAAGAATATGGATGACATACAAAGTTGA GTTGGATTTTACTAATTTTGTTAGTGGAGAAAACTTTTATAGAGAACAAATTAATTGGATGAATAGCCAAAATCTAACGC CTTCTGATTTTCCTGTTTTAGTTCAAATGTTTGAACAAAGAAATCCCACAAGTAAAGGAAAAATATCCAAAAAAGTCAAA AAATCATCTTGGACATTTTTTGGGAGAGAATTATGGACTTTAAGGTTTAAATTAGATCAACAAATTCATAAAGATAATGA AAAAGCAATCATCAATTTAATCGATGAGTGTGAAAGTAGTACTCAATCCCATTTTGTATATAAAAAAAGGAGGAATGCCC ACATAATTAAAGATATAGGTTTTAAAGTTTTACTCAAATTCCTTGATAACTATAATTTTCATTTTCACGAGGATCTTTTC AATAATGTCAAAAACTTTATAAATACAGATTTAGAAAATATTGATTCCATATTTAAAACTTGGAATATAGCTATAAAGGG AGGTTCTTATTTAAAGAGAGATATTGGAACAGTTCTAAATGTGAAAACAATGAATAGGACAAAAATACAAAATGGAACTA GCGAAGATGATTTAAAGATAATAGATATTAAATCTCTTACTAGTCCTGATGATCTACTTGTGGATATAGATCAAAAAGAT ATAAATGAATGGGATGAATCTGAGGAAAAGAAAAAATTTGGGAAACAACTGCGGTCTGCGGCCAAAAAATGTAGAGAAAA ATATTTAGGTCCTCGACCTTTATTAATTATTTATCCAATTAGTAAAGATTCAAAACCTGATGAAGAGTCAACTACTAGAT TCAAACTTTTTTCTAAAACCCAAAAAGAGGATTTAGGGGATTTAGATTATGAACCTCATGATATTTTTGGAATAGTATTA GCTATACCCACTCCTCCAAATTTTATTTCTAATAGAAACAGTTTGGGGCTTGATTTAAACAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATTTCTGAATAAATTAATTTCAAATTTTTTATGATGAATAATACCAAAATTTACTTATACTTATTCCAAGACTAATTAA AAAAATTTAAATTATTTGGA
Downstream 100 bases:
>100_bases GTTATGTCTGAAGAAAAATTAAAAAAAATTTGGCAAGAAGTTGAGCTAGAAAGAGATAAATTCTTAAAAGAGTTTGCTTA TAAAAATTTTTATTCGGGTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Endonuclease Z1 Domain Protein; Endonuclease Z1 Domain; Endonuclease Z1 Domain-Containing Protein; Conserved Hypothethical Protein; Z1 Domain-Containing Protein
Number of amino acids: Translated: 901; Mature: 901
Protein sequence:
>901_residues MEKIEEYKFNNDKYESSIEDLKNYKTLNNVSLDDAFLKYKNDYIKFFDSKFIIELEAAKKFLEEDEIKALDYSKTLSSRK QESWYFGPKENHKNWNSYKSYLLNVKNRTKESVEILNNETTEVVNQILNPYAPSGKKIKGLVLGYVQSGKTANMAGVIAK AADSGYKLIIVLAGLTKALRAQTQARIQNDILQHNDILWHPLTDNENDIEEGLDAIPIFTKKTTICIIKKNVQIIIKLIS KMKRMPKLEMQASTLIIDDECDQASLNTKEYKDKANEISSTNKLLKQLLIDFKNVTYVGYTATPNAPFLTHPKAPDGLQS LYPSDFITPLEEPADYFGVNKLFANNITNESGEDLSLPFIKRIPDSELESLTCKRKDLPIFKPSLTNSLRDACDYFLLVL SARSLRNLKEDHCCMMIHVSRSLKMHELYRNLIFEEWFIPIKIGLENKDKEIIDRLENLWKIESKAINSSVRSNLNCPLK IESFQKIEKNLLNELNDLSINVENSDESNFDERLEFKDKRDKDYKTIHSIVIGGDVLSRGLTIDGLVSSFFLRETKQDDT LMQMGRWFGFRYGYEDLPRIWMTYKVELDFTNFVSGENFYREQINWMNSQNLTPSDFPVLVQMFEQRNPTSKGKISKKVK KSSWTFFGRELWTLRFKLDQQIHKDNEKAIINLIDECESSTQSHFVYKKRRNAHIIKDIGFKVLLKFLDNYNFHFHEDLF NNVKNFINTDLENIDSIFKTWNIAIKGGSYLKRDIGTVLNVKTMNRTKIQNGTSEDDLKIIDIKSLTSPDDLLVDIDQKD INEWDESEEKKKFGKQLRSAAKKCREKYLGPRPLLIIYPISKDSKPDEESTTRFKLFSKTQKEDLGDLDYEPHDIFGIVL AIPTPPNFISNRNSLGLDLNN
Sequences:
>Translated_901_residues MEKIEEYKFNNDKYESSIEDLKNYKTLNNVSLDDAFLKYKNDYIKFFDSKFIIELEAAKKFLEEDEIKALDYSKTLSSRK QESWYFGPKENHKNWNSYKSYLLNVKNRTKESVEILNNETTEVVNQILNPYAPSGKKIKGLVLGYVQSGKTANMAGVIAK AADSGYKLIIVLAGLTKALRAQTQARIQNDILQHNDILWHPLTDNENDIEEGLDAIPIFTKKTTICIIKKNVQIIIKLIS KMKRMPKLEMQASTLIIDDECDQASLNTKEYKDKANEISSTNKLLKQLLIDFKNVTYVGYTATPNAPFLTHPKAPDGLQS LYPSDFITPLEEPADYFGVNKLFANNITNESGEDLSLPFIKRIPDSELESLTCKRKDLPIFKPSLTNSLRDACDYFLLVL SARSLRNLKEDHCCMMIHVSRSLKMHELYRNLIFEEWFIPIKIGLENKDKEIIDRLENLWKIESKAINSSVRSNLNCPLK IESFQKIEKNLLNELNDLSINVENSDESNFDERLEFKDKRDKDYKTIHSIVIGGDVLSRGLTIDGLVSSFFLRETKQDDT LMQMGRWFGFRYGYEDLPRIWMTYKVELDFTNFVSGENFYREQINWMNSQNLTPSDFPVLVQMFEQRNPTSKGKISKKVK KSSWTFFGRELWTLRFKLDQQIHKDNEKAIINLIDECESSTQSHFVYKKRRNAHIIKDIGFKVLLKFLDNYNFHFHEDLF NNVKNFINTDLENIDSIFKTWNIAIKGGSYLKRDIGTVLNVKTMNRTKIQNGTSEDDLKIIDIKSLTSPDDLLVDIDQKD INEWDESEEKKKFGKQLRSAAKKCREKYLGPRPLLIIYPISKDSKPDEESTTRFKLFSKTQKEDLGDLDYEPHDIFGIVL AIPTPPNFISNRNSLGLDLNN >Mature_901_residues MEKIEEYKFNNDKYESSIEDLKNYKTLNNVSLDDAFLKYKNDYIKFFDSKFIIELEAAKKFLEEDEIKALDYSKTLSSRK QESWYFGPKENHKNWNSYKSYLLNVKNRTKESVEILNNETTEVVNQILNPYAPSGKKIKGLVLGYVQSGKTANMAGVIAK AADSGYKLIIVLAGLTKALRAQTQARIQNDILQHNDILWHPLTDNENDIEEGLDAIPIFTKKTTICIIKKNVQIIIKLIS KMKRMPKLEMQASTLIIDDECDQASLNTKEYKDKANEISSTNKLLKQLLIDFKNVTYVGYTATPNAPFLTHPKAPDGLQS LYPSDFITPLEEPADYFGVNKLFANNITNESGEDLSLPFIKRIPDSELESLTCKRKDLPIFKPSLTNSLRDACDYFLLVL SARSLRNLKEDHCCMMIHVSRSLKMHELYRNLIFEEWFIPIKIGLENKDKEIIDRLENLWKIESKAINSSVRSNLNCPLK IESFQKIEKNLLNELNDLSINVENSDESNFDERLEFKDKRDKDYKTIHSIVIGGDVLSRGLTIDGLVSSFFLRETKQDDT LMQMGRWFGFRYGYEDLPRIWMTYKVELDFTNFVSGENFYREQINWMNSQNLTPSDFPVLVQMFEQRNPTSKGKISKKVK KSSWTFFGRELWTLRFKLDQQIHKDNEKAIINLIDECESSTQSHFVYKKRRNAHIIKDIGFKVLLKFLDNYNFHFHEDLF NNVKNFINTDLENIDSIFKTWNIAIKGGSYLKRDIGTVLNVKTMNRTKIQNGTSEDDLKIIDIKSLTSPDDLLVDIDQKD INEWDESEEKKKFGKQLRSAAKKCREKYLGPRPLLIIYPISKDSKPDEESTTRFKLFSKTQKEDLGDLDYEPHDIFGIVL AIPTPPNFISNRNSLGLDLNN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 104494; Mature: 104494
Theoretical pI: Translated: 7.02; Mature: 7.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEKIEEYKFNNDKYESSIEDLKNYKTLNNVSLDDAFLKYKNDYIKFFDSKFIIELEAAKK CCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHH FLEEDEIKALDYSKTLSSRKQESWYFGPKENHKNWNSYKSYLLNVKNRTKESVEILNNET HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCH TEVVNQILNPYAPSGKKIKGLVLGYVQSGKTANMAGVIAKAADSGYKLIIVLAGLTKALR HHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHH AQTQARIQNDILQHNDILWHPLTDNENDIEEGLDAIPIFTKKTTICIIKKNVQIIIKLIS HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHCCCCCEEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHH KMKRMPKLEMQASTLIIDDECDQASLNTKEYKDKANEISSTNKLLKQLLIDFKNVTYVGY HHHHCCCCEECCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE TATPNAPFLTHPKAPDGLQSLYPSDFITPLEEPADYFGVNKLFANNITNESGEDLSLPFI ECCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH KRIPDSELESLTCKRKDLPIFKPSLTNSLRDACDYFLLVLSARSLRNLKEDHCCMMIHVS HCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEC RSLKMHELYRNLIFEEWFIPIKIGLENKDKEIIDRLENLWKIESKAINSSVRSNLNCPLK CCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE IESFQKIEKNLLNELNDLSINVENSDESNFDERLEFKDKRDKDYKTIHSIVIGGDVLSRG HHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHCC LTIDGLVSSFFLRETKQDDTLMQMGRWFGFRYGYEDLPRIWMTYKVELDFTNFVSGENFY CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCEEEEEEEEECHHHHCCCCHHH REQINWMNSQNLTPSDFPVLVQMFEQRNPTSKGKISKKVKKSSWTFFGRELWTLRFKLDQ HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHCHHHEEEEEHHHH QIHKDNEKAIINLIDECESSTQSHFVYKKRRNAHIIKDIGFKVLLKFLDNYNFHFHEDLF HHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHH NNVKNFINTDLENIDSIFKTWNIAIKGGSYLKRDIGTVLNVKTMNRTKIQNGTSEDDLKI HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHEEEEECCHHHCCCCCCCCCEEE IDIKSLTSPDDLLVDIDQKDINEWDESEEKKKFGKQLRSAAKKCREKYLGPRPLLIIYPI EEECCCCCCCCEEEECCHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEC SKDSKPDEESTTRFKLFSKTQKEDLGDLDYEPHDIFGIVLAIPTPPNFISNRNSLGLDLN CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHCCCCCCCCCCC N C >Mature Secondary Structure MEKIEEYKFNNDKYESSIEDLKNYKTLNNVSLDDAFLKYKNDYIKFFDSKFIIELEAAKK CCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHH FLEEDEIKALDYSKTLSSRKQESWYFGPKENHKNWNSYKSYLLNVKNRTKESVEILNNET HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCH TEVVNQILNPYAPSGKKIKGLVLGYVQSGKTANMAGVIAKAADSGYKLIIVLAGLTKALR HHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHH AQTQARIQNDILQHNDILWHPLTDNENDIEEGLDAIPIFTKKTTICIIKKNVQIIIKLIS HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHCCCCCEEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHH KMKRMPKLEMQASTLIIDDECDQASLNTKEYKDKANEISSTNKLLKQLLIDFKNVTYVGY HHHHCCCCEECCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE TATPNAPFLTHPKAPDGLQSLYPSDFITPLEEPADYFGVNKLFANNITNESGEDLSLPFI ECCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH KRIPDSELESLTCKRKDLPIFKPSLTNSLRDACDYFLLVLSARSLRNLKEDHCCMMIHVS HCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEC RSLKMHELYRNLIFEEWFIPIKIGLENKDKEIIDRLENLWKIESKAINSSVRSNLNCPLK CCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE IESFQKIEKNLLNELNDLSINVENSDESNFDERLEFKDKRDKDYKTIHSIVIGGDVLSRG HHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHCC LTIDGLVSSFFLRETKQDDTLMQMGRWFGFRYGYEDLPRIWMTYKVELDFTNFVSGENFY CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCEEEEEEEEECHHHHCCCCHHH REQINWMNSQNLTPSDFPVLVQMFEQRNPTSKGKISKKVKKSSWTFFGRELWTLRFKLDQ HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHCHHHEEEEEHHHH QIHKDNEKAIINLIDECESSTQSHFVYKKRRNAHIIKDIGFKVLLKFLDNYNFHFHEDLF HHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHH NNVKNFINTDLENIDSIFKTWNIAIKGGSYLKRDIGTVLNVKTMNRTKIQNGTSEDDLKI HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHEEEEECCHHHCCCCCCCCCEEE IDIKSLTSPDDLLVDIDQKDINEWDESEEKKKFGKQLRSAAKKCREKYLGPRPLLIIYPI EEECCCCCCCCEEEECCHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEC SKDSKPDEESTTRFKLFSKTQKEDLGDLDYEPHDIFGIVLAIPTPPNFISNRNSLGLDLN CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHCCCCCCCCCCC N C
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA