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Definition Prochlorococcus marinus str. AS9601, complete genome.
Accession NC_008816
Length 1,669,886

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The map label for this gene is 123967965

Identifier: 123967965

GI number: 123967965

Start: 366365

End: 369070

Strand: Direct

Name: 123967965

Synonym: A9601_04281

Alternate gene names: NA

Gene position: 366365-369070 (Clockwise)

Preceding gene: 123967964

Following gene: 123967966

Centisome position: 21.94

GC content: 28.6

Gene sequence:

>2706_bases
ATGGAAAAGATTGAAGAATATAAATTTAATAACGATAAATATGAAAGTTCTATAGAAGATTTAAAAAACTATAAAACCCT
AAATAATGTTTCCTTAGATGATGCATTTTTAAAATATAAAAATGATTATATAAAATTTTTTGATAGTAAATTTATCATTG
AGCTTGAAGCTGCTAAAAAATTTTTAGAGGAAGATGAAATAAAAGCACTTGATTATTCAAAAACACTTTCTTCAAGGAAG
CAAGAAAGTTGGTATTTTGGACCAAAAGAAAATCATAAAAATTGGAATTCATATAAAAGCTATCTTTTAAATGTCAAAAA
TAGAACTAAGGAATCTGTCGAAATTTTGAATAATGAAACAACTGAAGTAGTTAATCAAATTTTGAATCCTTACGCGCCTT
CAGGGAAAAAAATTAAAGGATTAGTTTTGGGGTATGTGCAGTCAGGAAAAACTGCAAATATGGCTGGTGTAATAGCAAAG
GCAGCAGACTCTGGCTACAAGTTAATAATAGTGCTGGCAGGATTAACAAAAGCTTTAAGAGCCCAGACACAAGCCAGAAT
TCAAAATGATATTCTTCAGCATAATGATATTCTTTGGCATCCTTTAACTGATAATGAAAATGATATTGAAGAGGGCCTAG
ATGCTATTCCAATATTTACTAAGAAAACTACTATTTGTATTATTAAAAAAAATGTTCAAATAATTATAAAACTTATTTCC
AAGATGAAAAGGATGCCTAAATTAGAGATGCAGGCATCAACATTGATTATTGATGATGAATGTGATCAGGCAAGTCTTAA
TACAAAAGAATATAAGGATAAAGCTAATGAAATATCAAGTACAAATAAGTTATTAAAACAGCTATTAATTGATTTTAAAA
ATGTTACTTATGTTGGTTATACCGCAACGCCGAACGCTCCTTTTTTAACACATCCAAAAGCACCTGATGGTCTGCAAAGT
CTTTACCCCAGCGATTTCATAACCCCCTTAGAAGAACCAGCTGATTATTTTGGAGTAAATAAGCTATTTGCTAATAATAT
AACTAATGAAAGTGGAGAAGATCTTAGTTTACCCTTTATTAAAAGAATACCTGATTCTGAACTTGAATCTTTAACTTGTA
AAAGAAAAGATCTACCTATTTTTAAACCTTCTTTAACTAATAGTTTAAGAGATGCATGCGACTATTTTTTGTTAGTTCTT
TCTGCCAGGTCATTGAGAAATCTTAAAGAAGATCATTGTTGCATGATGATCCATGTTTCAAGAAGTCTAAAGATGCATGA
ATTATATAGAAACTTAATTTTTGAAGAATGGTTCATCCCAATAAAAATAGGTCTTGAAAATAAAGATAAAGAAATAATTG
ATAGATTAGAGAATTTATGGAAAATTGAGTCAAAAGCAATTAATTCATCTGTTAGATCAAATTTAAATTGTCCTCTCAAA
ATTGAGTCTTTTCAGAAAATAGAAAAGAATTTATTAAATGAATTAAATGATCTTTCTATAAATGTTGAAAATTCAGATGA
GTCTAATTTTGATGAAAGATTAGAATTTAAAGATAAAAGAGATAAAGACTATAAAACTATTCATTCAATTGTTATTGGAG
GAGACGTACTTTCAAGAGGTTTAACAATTGATGGCTTAGTTAGCAGTTTTTTCTTAAGAGAGACTAAACAGGATGATACG
CTTATGCAAATGGGAAGATGGTTTGGTTTTAGATATGGTTATGAAGATTTGCCAAGAATATGGATGACATACAAAGTTGA
GTTGGATTTTACTAATTTTGTTAGTGGAGAAAACTTTTATAGAGAACAAATTAATTGGATGAATAGCCAAAATCTAACGC
CTTCTGATTTTCCTGTTTTAGTTCAAATGTTTGAACAAAGAAATCCCACAAGTAAAGGAAAAATATCCAAAAAAGTCAAA
AAATCATCTTGGACATTTTTTGGGAGAGAATTATGGACTTTAAGGTTTAAATTAGATCAACAAATTCATAAAGATAATGA
AAAAGCAATCATCAATTTAATCGATGAGTGTGAAAGTAGTACTCAATCCCATTTTGTATATAAAAAAAGGAGGAATGCCC
ACATAATTAAAGATATAGGTTTTAAAGTTTTACTCAAATTCCTTGATAACTATAATTTTCATTTTCACGAGGATCTTTTC
AATAATGTCAAAAACTTTATAAATACAGATTTAGAAAATATTGATTCCATATTTAAAACTTGGAATATAGCTATAAAGGG
AGGTTCTTATTTAAAGAGAGATATTGGAACAGTTCTAAATGTGAAAACAATGAATAGGACAAAAATACAAAATGGAACTA
GCGAAGATGATTTAAAGATAATAGATATTAAATCTCTTACTAGTCCTGATGATCTACTTGTGGATATAGATCAAAAAGAT
ATAAATGAATGGGATGAATCTGAGGAAAAGAAAAAATTTGGGAAACAACTGCGGTCTGCGGCCAAAAAATGTAGAGAAAA
ATATTTAGGTCCTCGACCTTTATTAATTATTTATCCAATTAGTAAAGATTCAAAACCTGATGAAGAGTCAACTACTAGAT
TCAAACTTTTTTCTAAAACCCAAAAAGAGGATTTAGGGGATTTAGATTATGAACCTCATGATATTTTTGGAATAGTATTA
GCTATACCCACTCCTCCAAATTTTATTTCTAATAGAAACAGTTTGGGGCTTGATTTAAACAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTTCTGAATAAATTAATTTCAAATTTTTTATGATGAATAATACCAAAATTTACTTATACTTATTCCAAGACTAATTAA
AAAAATTTAAATTATTTGGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTATGTCTGAAGAAAAATTAAAAAAAATTTGGCAAGAAGTTGAGCTAGAAAGAGATAAATTCTTAAAAGAGTTTGCTTA
TAAAAATTTTTATTCGGGTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Endonuclease Z1 Domain Protein; Endonuclease Z1 Domain; Endonuclease Z1 Domain-Containing Protein; Conserved Hypothethical Protein; Z1 Domain-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 901; Mature: 901

Protein sequence:

>901_residues
MEKIEEYKFNNDKYESSIEDLKNYKTLNNVSLDDAFLKYKNDYIKFFDSKFIIELEAAKKFLEEDEIKALDYSKTLSSRK
QESWYFGPKENHKNWNSYKSYLLNVKNRTKESVEILNNETTEVVNQILNPYAPSGKKIKGLVLGYVQSGKTANMAGVIAK
AADSGYKLIIVLAGLTKALRAQTQARIQNDILQHNDILWHPLTDNENDIEEGLDAIPIFTKKTTICIIKKNVQIIIKLIS
KMKRMPKLEMQASTLIIDDECDQASLNTKEYKDKANEISSTNKLLKQLLIDFKNVTYVGYTATPNAPFLTHPKAPDGLQS
LYPSDFITPLEEPADYFGVNKLFANNITNESGEDLSLPFIKRIPDSELESLTCKRKDLPIFKPSLTNSLRDACDYFLLVL
SARSLRNLKEDHCCMMIHVSRSLKMHELYRNLIFEEWFIPIKIGLENKDKEIIDRLENLWKIESKAINSSVRSNLNCPLK
IESFQKIEKNLLNELNDLSINVENSDESNFDERLEFKDKRDKDYKTIHSIVIGGDVLSRGLTIDGLVSSFFLRETKQDDT
LMQMGRWFGFRYGYEDLPRIWMTYKVELDFTNFVSGENFYREQINWMNSQNLTPSDFPVLVQMFEQRNPTSKGKISKKVK
KSSWTFFGRELWTLRFKLDQQIHKDNEKAIINLIDECESSTQSHFVYKKRRNAHIIKDIGFKVLLKFLDNYNFHFHEDLF
NNVKNFINTDLENIDSIFKTWNIAIKGGSYLKRDIGTVLNVKTMNRTKIQNGTSEDDLKIIDIKSLTSPDDLLVDIDQKD
INEWDESEEKKKFGKQLRSAAKKCREKYLGPRPLLIIYPISKDSKPDEESTTRFKLFSKTQKEDLGDLDYEPHDIFGIVL
AIPTPPNFISNRNSLGLDLNN

Sequences:

>Translated_901_residues
MEKIEEYKFNNDKYESSIEDLKNYKTLNNVSLDDAFLKYKNDYIKFFDSKFIIELEAAKKFLEEDEIKALDYSKTLSSRK
QESWYFGPKENHKNWNSYKSYLLNVKNRTKESVEILNNETTEVVNQILNPYAPSGKKIKGLVLGYVQSGKTANMAGVIAK
AADSGYKLIIVLAGLTKALRAQTQARIQNDILQHNDILWHPLTDNENDIEEGLDAIPIFTKKTTICIIKKNVQIIIKLIS
KMKRMPKLEMQASTLIIDDECDQASLNTKEYKDKANEISSTNKLLKQLLIDFKNVTYVGYTATPNAPFLTHPKAPDGLQS
LYPSDFITPLEEPADYFGVNKLFANNITNESGEDLSLPFIKRIPDSELESLTCKRKDLPIFKPSLTNSLRDACDYFLLVL
SARSLRNLKEDHCCMMIHVSRSLKMHELYRNLIFEEWFIPIKIGLENKDKEIIDRLENLWKIESKAINSSVRSNLNCPLK
IESFQKIEKNLLNELNDLSINVENSDESNFDERLEFKDKRDKDYKTIHSIVIGGDVLSRGLTIDGLVSSFFLRETKQDDT
LMQMGRWFGFRYGYEDLPRIWMTYKVELDFTNFVSGENFYREQINWMNSQNLTPSDFPVLVQMFEQRNPTSKGKISKKVK
KSSWTFFGRELWTLRFKLDQQIHKDNEKAIINLIDECESSTQSHFVYKKRRNAHIIKDIGFKVLLKFLDNYNFHFHEDLF
NNVKNFINTDLENIDSIFKTWNIAIKGGSYLKRDIGTVLNVKTMNRTKIQNGTSEDDLKIIDIKSLTSPDDLLVDIDQKD
INEWDESEEKKKFGKQLRSAAKKCREKYLGPRPLLIIYPISKDSKPDEESTTRFKLFSKTQKEDLGDLDYEPHDIFGIVL
AIPTPPNFISNRNSLGLDLNN
>Mature_901_residues
MEKIEEYKFNNDKYESSIEDLKNYKTLNNVSLDDAFLKYKNDYIKFFDSKFIIELEAAKKFLEEDEIKALDYSKTLSSRK
QESWYFGPKENHKNWNSYKSYLLNVKNRTKESVEILNNETTEVVNQILNPYAPSGKKIKGLVLGYVQSGKTANMAGVIAK
AADSGYKLIIVLAGLTKALRAQTQARIQNDILQHNDILWHPLTDNENDIEEGLDAIPIFTKKTTICIIKKNVQIIIKLIS
KMKRMPKLEMQASTLIIDDECDQASLNTKEYKDKANEISSTNKLLKQLLIDFKNVTYVGYTATPNAPFLTHPKAPDGLQS
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SARSLRNLKEDHCCMMIHVSRSLKMHELYRNLIFEEWFIPIKIGLENKDKEIIDRLENLWKIESKAINSSVRSNLNCPLK
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LMQMGRWFGFRYGYEDLPRIWMTYKVELDFTNFVSGENFYREQINWMNSQNLTPSDFPVLVQMFEQRNPTSKGKISKKVK
KSSWTFFGRELWTLRFKLDQQIHKDNEKAIINLIDECESSTQSHFVYKKRRNAHIIKDIGFKVLLKFLDNYNFHFHEDLF
NNVKNFINTDLENIDSIFKTWNIAIKGGSYLKRDIGTVLNVKTMNRTKIQNGTSEDDLKIIDIKSLTSPDDLLVDIDQKD
INEWDESEEKKKFGKQLRSAAKKCREKYLGPRPLLIIYPISKDSKPDEESTTRFKLFSKTQKEDLGDLDYEPHDIFGIVL
AIPTPPNFISNRNSLGLDLNN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 104494; Mature: 104494

Theoretical pI: Translated: 7.02; Mature: 7.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEKIEEYKFNNDKYESSIEDLKNYKTLNNVSLDDAFLKYKNDYIKFFDSKFIIELEAAKK
CCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHH
FLEEDEIKALDYSKTLSSRKQESWYFGPKENHKNWNSYKSYLLNVKNRTKESVEILNNET
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCH
TEVVNQILNPYAPSGKKIKGLVLGYVQSGKTANMAGVIAKAADSGYKLIIVLAGLTKALR
HHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHH
AQTQARIQNDILQHNDILWHPLTDNENDIEEGLDAIPIFTKKTTICIIKKNVQIIIKLIS
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHCCCCCEEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHH
KMKRMPKLEMQASTLIIDDECDQASLNTKEYKDKANEISSTNKLLKQLLIDFKNVTYVGY
HHHHCCCCEECCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE
TATPNAPFLTHPKAPDGLQSLYPSDFITPLEEPADYFGVNKLFANNITNESGEDLSLPFI
ECCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH
KRIPDSELESLTCKRKDLPIFKPSLTNSLRDACDYFLLVLSARSLRNLKEDHCCMMIHVS
HCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEC
RSLKMHELYRNLIFEEWFIPIKIGLENKDKEIIDRLENLWKIESKAINSSVRSNLNCPLK
CCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
IESFQKIEKNLLNELNDLSINVENSDESNFDERLEFKDKRDKDYKTIHSIVIGGDVLSRG
HHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHCC
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CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCEEEEEEEEECHHHHCCCCHHH
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HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHCHHHEEEEEHHHH
QIHKDNEKAIINLIDECESSTQSHFVYKKRRNAHIIKDIGFKVLLKFLDNYNFHFHEDLF
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NNVKNFINTDLENIDSIFKTWNIAIKGGSYLKRDIGTVLNVKTMNRTKIQNGTSEDDLKI
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHEEEEECCHHHCCCCCCCCCEEE
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N
C
>Mature Secondary Structure
MEKIEEYKFNNDKYESSIEDLKNYKTLNNVSLDDAFLKYKNDYIKFFDSKFIIELEAAKK
CCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHH
FLEEDEIKALDYSKTLSSRKQESWYFGPKENHKNWNSYKSYLLNVKNRTKESVEILNNET
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TEVVNQILNPYAPSGKKIKGLVLGYVQSGKTANMAGVIAKAADSGYKLIIVLAGLTKALR
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TATPNAPFLTHPKAPDGLQSLYPSDFITPLEEPADYFGVNKLFANNITNESGEDLSLPFI
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SKDSKPDEESTTRFKLFSKTQKEDLGDLDYEPHDIFGIVLAIPTPPNFISNRNSLGLDLN
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N
C

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA