Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 119946484

Identifier: 119946484

GI number: 119946484

Start: 3538927

End: 3540288

Strand: Reverse

Name: 119946484

Synonym: Ping_2860

Alternate gene names: NA

Gene position: 3540288-3538927 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119946494

Following gene: 119946483

Centisome position: 77.64

GC content: 35.54

Gene sequence:

>1362_bases
ATGTTTACCTTCACTAAAGATTTTAATTGCTGCAAAACAGTGCATTGTGAGAATTTTGCCGTTATAAATAGTGCTGATTA
CATTCAAAAAAGTAGGCAGTTAGGGTATTTGTCCACTGGCTGTAAATTATGTGGTAGCTACCCGCCCTGGGTGAATAATA
AGCTGGTTGAAAAAATTATAAATGAAAAACTTGAGCTTAACTTCGCCCGGAAATTAACCGGTTGTCGCAAATGCGCGCAA
TATTTTTTCTTTGAAAAAAGCACTAAATCAATATCACATGGTTATACATCGGCAGGCACGCAAAGAAAAAAGTGCTCTGA
TTGTCATGCTGTTTTCACTCTGCCATACTTTAAAAATATTAATGCGCTTAGACTCATTCTCAACAGTATTATGGCCAATC
AGGAAATAAAGGAATCCATTAAAGCCACTGGACTCTCGGCTCGATTATATTATTTTTACCTTAATAAATTAGCCCAGATT
CTGGTGACCTTTAGTCGTTTAAATGAAGAAAAAGTGATTCAACAAAAACAGCTGTCACTCTACACTCAGGGCAAAGTAGT
TCATCTTGCTCATAACAGAGGTTTTTATACTTTACTGACTTCAGAGGTTGATAGTGGTTATCTGTTATTACAAAACAATA
ACTTAACCAGAGAGTCTTTGGTTAAGAAAGCGCTCTATGATGAGCAGGAAAATACAATAATATCTGCTAATAATAAGGAT
AATTTAGAAACGGCGCTGATAAAAAGATATGAACAACACTTTAAAAGAAGACATTTTGAACAACTACTAGTCGGAGAATT
AAAACCGACCACAAAGTGTTATTTAATCTACCCCGATAAATTGGCTTATGCTCATTTCCAACTATTAACGGTTTTTACTG
CAAAAGCATCTTCTTACACCCATTATATTGAACATGAAAGTTGTTTTAGAGCTGCCGCCTTAATGGCGTCCGCCGCAGAT
ATCAAAACCGCTAAAGCAGACATTTATTTCTATTTGTCATCCTATAAAACAGGTGAGCATTTACAAGGGAGAAAAATTGG
CTGGTGGGGTGATAAATGGTTCAGTAACGATTTTGGCGCTTATTGCCCAATCGCATCCAGCACAACATTGAATGCTGATT
TAAAATTAAGTGATACGAGCAGCAATGGGTTATTTTATGCCTACCTGGATAGCCATTTGAATAAAGGGATAAATAGTATT
AATGTCATTGATAATCTATCTGAAATACATCGTACTATATTTAATTACTGCGAACTGAAAAATAAGACCAGCAGAGCAAA
ATTATTAAAGGTCACAGACAGAATTTATACGCCGCAAAGTTTACTTGATGCCGCATTAAAAACCATAATGAACGGTTATT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGTGCAATGATTAATTAATTGACTTTGTTTATATAAAACCAAGTTATTTTAATTGGATTATTGGTGAATCATTAAAGGGT
CTAGGGATCCGGGGGATAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAATAGTGCTGAGAATACACTTTATAGTTGTATTTTTATTAAACAAATGAATATTCCTATCTGGATACCCATTTAAATA
AAGAAATAATGAGTATTAAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 453; Mature: 453

Protein sequence:

>453_residues
MFTFTKDFNCCKTVHCENFAVINSADYIQKSRQLGYLSTGCKLCGSYPPWVNNKLVEKIINEKLELNFARKLTGCRKCAQ
YFFFEKSTKSISHGYTSAGTQRKKCSDCHAVFTLPYFKNINALRLILNSIMANQEIKESIKATGLSARLYYFYLNKLAQI
LVTFSRLNEEKVIQQKQLSLYTQGKVVHLAHNRGFYTLLTSEVDSGYLLLQNNNLTRESLVKKALYDEQENTIISANNKD
NLETALIKRYEQHFKRRHFEQLLVGELKPTTKCYLIYPDKLAYAHFQLLTVFTAKASSYTHYIEHESCFRAAALMASAAD
IKTAKADIYFYLSSYKTGEHLQGRKIGWWGDKWFSNDFGAYCPIASSTTLNADLKLSDTSSNGLFYAYLDSHLNKGINSI
NVIDNLSEIHRTIFNYCELKNKTSRAKLLKVTDRIYTPQSLLDAALKTIMNGY

Sequences:

>Translated_453_residues
MFTFTKDFNCCKTVHCENFAVINSADYIQKSRQLGYLSTGCKLCGSYPPWVNNKLVEKIINEKLELNFARKLTGCRKCAQ
YFFFEKSTKSISHGYTSAGTQRKKCSDCHAVFTLPYFKNINALRLILNSIMANQEIKESIKATGLSARLYYFYLNKLAQI
LVTFSRLNEEKVIQQKQLSLYTQGKVVHLAHNRGFYTLLTSEVDSGYLLLQNNNLTRESLVKKALYDEQENTIISANNKD
NLETALIKRYEQHFKRRHFEQLLVGELKPTTKCYLIYPDKLAYAHFQLLTVFTAKASSYTHYIEHESCFRAAALMASAAD
IKTAKADIYFYLSSYKTGEHLQGRKIGWWGDKWFSNDFGAYCPIASSTTLNADLKLSDTSSNGLFYAYLDSHLNKGINSI
NVIDNLSEIHRTIFNYCELKNKTSRAKLLKVTDRIYTPQSLLDAALKTIMNGY
>Mature_453_residues
MFTFTKDFNCCKTVHCENFAVINSADYIQKSRQLGYLSTGCKLCGSYPPWVNNKLVEKIINEKLELNFARKLTGCRKCAQ
YFFFEKSTKSISHGYTSAGTQRKKCSDCHAVFTLPYFKNINALRLILNSIMANQEIKESIKATGLSARLYYFYLNKLAQI
LVTFSRLNEEKVIQQKQLSLYTQGKVVHLAHNRGFYTLLTSEVDSGYLLLQNNNLTRESLVKKALYDEQENTIISANNKD
NLETALIKRYEQHFKRRHFEQLLVGELKPTTKCYLIYPDKLAYAHFQLLTVFTAKASSYTHYIEHESCFRAAALMASAAD
IKTAKADIYFYLSSYKTGEHLQGRKIGWWGDKWFSNDFGAYCPIASSTTLNADLKLSDTSSNGLFYAYLDSHLNKGINSI
NVIDNLSEIHRTIFNYCELKNKTSRAKLLKVTDRIYTPQSLLDAALKTIMNGY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51905; Mature: 51905

Theoretical pI: Translated: 9.42; Mature: 9.42

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.9 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
2.9 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFTFTKDFNCCKTVHCENFAVINSADYIQKSRQLGYLSTGCKLCGSYPPWVNNKLVEKII
CCCCCCCCCCHHEECCCCEEEECCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH
NEKLELNFARKLTGCRKCAQYFFFEKSTKSISHGYTSAGTQRKKCSDCHAVFTLPYFKNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCCEEEECHHHHCC
NALRLILNSIMANQEIKESIKATGLSARLYYFYLNKLAQILVTFSRLNEEKVIQQKQLSL
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
YTQGKVVHLAHNRGFYTLLTSEVDSGYLLLQNNNLTRESLVKKALYDEQENTIISANNKD
EECCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCC
NLETALIKRYEQHFKRRHFEQLLVGELKPTTKCYLIYPDKLAYAHFQLLTVFTAKASSYT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
HYIEHESCFRAAALMASAADIKTAKADIYFYLSSYKTGEHLQGRKIGWWGDKWFSNDFGA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
YCPIASSTTLNADLKLSDTSSNGLFYAYLDSHLNKGINSINVIDNLSEIHRTIFNYCELK
CCCCCCCCEECCEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NKTSRAKLLKVTDRIYTPQSLLDAALKTIMNGY
CCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MFTFTKDFNCCKTVHCENFAVINSADYIQKSRQLGYLSTGCKLCGSYPPWVNNKLVEKII
CCCCCCCCCCHHEECCCCEEEECCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH
NEKLELNFARKLTGCRKCAQYFFFEKSTKSISHGYTSAGTQRKKCSDCHAVFTLPYFKNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCCEEEECHHHHCC
NALRLILNSIMANQEIKESIKATGLSARLYYFYLNKLAQILVTFSRLNEEKVIQQKQLSL
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
YTQGKVVHLAHNRGFYTLLTSEVDSGYLLLQNNNLTRESLVKKALYDEQENTIISANNKD
EECCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCC
NLETALIKRYEQHFKRRHFEQLLVGELKPTTKCYLIYPDKLAYAHFQLLTVFTAKASSYT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
HYIEHESCFRAAALMASAADIKTAKADIYFYLSSYKTGEHLQGRKIGWWGDKWFSNDFGA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
YCPIASSTTLNADLKLSDTSSNGLFYAYLDSHLNKGINSINVIDNLSEIHRTIFNYCELK
CCCCCCCCEECCEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NKTSRAKLLKVTDRIYTPQSLLDAALKTIMNGY
CCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA