| Definition | Psychromonas ingrahamii 37, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008709 |
| Length | 4,559,598 |
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The map label for this gene is 119945542
Identifier: 119945542
GI number: 119945542
Start: 2243243
End: 2247046
Strand: Direct
Name: 119945542
Synonym: Ping_1846
Alternate gene names: NA
Gene position: 2243243-2247046 (Clockwise)
Preceding gene: 119945541
Following gene: 119945543
Centisome position: 49.2
GC content: 39.75
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGTTTAAACAAACGGTGCAAAAATTATTAACTGGGGCGGTTATTTGTGAAACCGCTTATCCGGAAGAGTTTGAATATTTG AAAGCGGGCAGTAATAGTGG
Product: SMC domain-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1267; Mature: 1266
Protein sequence:
>1267_residues MAQQAYQLLRIIIIDSFWKGQVNELNLTGHTQLEGTNGAGKTSLMRLLPLFYGMRPSDIVSKVDQAHNFADYYLPRDSSM LVYEYQRPFSQTCMVIASSDGRGVHFKFIDGAYNSEYFIAENNKPYPVSDVDKFYRNAGCDRSIFLGVDKYRQVIQNLRS GRKLKEVYLLQKRYSFSDQPCPHIDKVINGTIEKNLDFDAVKRMLVAIASDHLARNSVDEKEQISLKKEEISHWLADIQA GRAIQKVAHKITLWQNDFSSLESLLLKLQHLHFEIVSHQTRIESLQKERAETKADKRQLLISLEKQLQESVDRLNGELFT LKAKIQADQSHIDLLDEDKLIFDQDDAPSYHLHAEQAPQIQNELNEVNAIIEAFEGNINKIQQKFDRLIQNRKLENVTDI AGNKDKTANIKETAALQLTVISDVYQQQCNELNEQLNQQNLNLKIGQERIESALENAKFQLNQAIIEPELLTDIENNQVL LNAAQEKQTQRFKEQSSLQSELTQFDKLREKQSDKHQQENRYLEQLRSECAEVELQLIPKAGSLHHYLNNEPLAGDWKQS IGRLLSSAQLGRCDLDPEWVGGELNFYGLKLDLQQIQHNDSLFLNETQLREKRDALETTYQTQSDKIKQIDEQLAQLSKQ IENQQLKMTRAAQGLKQNELNLQQLNVQHQNLAVKKQRAIKAHIDSVNEQINSLEKQKKVNDKKQQAFSEQQQGQKSELS TQMLEKRLVVESDRDVQLDLLSEALLALESGHKARIKALQKQNDTDLDKLDPDGEVDKRSRERKNLIRSLERCAVFEQKA RSYFQFMNERYSQRDSLAEHNQNRKITKRNTEQSIEELQINLGKQISDTKLFIKKLNMQSHASEDLLVLLNESHRDCEQS GINATFAEHQPSNQADLSISFCNDCLEQFKSIHKRLSEQLNKFNDRFKKDHSASELYENWQKLVADNDHYQGAELLFKYR SPIADLLSSAEQKQKSTYQLVTVNANMINEFYQHIENFGQRIKQIGKKLSNNVTALTHFEALAEINVTTVMKQEELDYWG PLQVFAKAFELYRDQLREGVGEIPDELVQAMQRLSAYLPSEGFVLAHNNLFDIEFTITEKGHVKHARNAKQLKKVSSTGL SYLAMLSLFAGLLGMLRGSGENRSQIILPVDELGELAAENVDLLLQMFNDNNISMLSASPSTDRHILSLYQRHYKLKDNK IFHADIPASRLDELLAKRASAQNRLDSGVIKEFDESLGKEKLVQQVSTVNNESDASLAKEKAAQELS
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 145504; Mature: 145373
Theoretical pI: Translated: 6.27; Mature: 6.27
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAQQAYQLLRIIIIDSFWKGQVNELNLTGHTQLEGTNGAGKTSLMRLLPLFYGMRPSDIV CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH SKVDQAHNFADYYLPRDSSMLVYEYQRPFSQTCMVIASSDGRGVHFKFIDGAYNSEYFIA HHHHHHCCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEE ENNKPYPVSDVDKFYRNAGCDRSIFLGVDKYRQVIQNLRSGRKLKEVYLLQKRYSFSDQP CCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC CPHIDKVINGTIEKNLDFDAVKRMLVAIASDHLARNSVDEKEQISLKKEEISHWLADIQA CCHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GRAIQKVAHKITLWQNDFSSLESLLLKLQHLHFEIVSHQTRIESLQKERAETKADKRQLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLEKQLQESVDRLNGELFTLKAKIQADQSHIDLLDEDKLIFDQDDAPSYHLHAEQAPQI HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCHHCCCCCCCCEEECCCCCCCEEECCCCCHHH QNELNEVNAIIEAFEGNINKIQQKFDRLIQNRKLENVTDIAGNKDKTANIKETAALQLTV HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH ISDVYQQQCNELNEQLNQQNLNLKIGQERIESALENAKFQLNQAIIEPELLTDIENNQVL 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ENNKPYPVSDVDKFYRNAGCDRSIFLGVDKYRQVIQNLRSGRKLKEVYLLQKRYSFSDQP CCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC CPHIDKVINGTIEKNLDFDAVKRMLVAIASDHLARNSVDEKEQISLKKEEISHWLADIQA CCHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GRAIQKVAHKITLWQNDFSSLESLLLKLQHLHFEIVSHQTRIESLQKERAETKADKRQLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLEKQLQESVDRLNGELFTLKAKIQADQSHIDLLDEDKLIFDQDDAPSYHLHAEQAPQI HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCHHCCCCCCCCEEECCCCCCCEEECCCCCHHH QNELNEVNAIIEAFEGNINKIQQKFDRLIQNRKLENVTDIAGNKDKTANIKETAALQLTV HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH ISDVYQQQCNELNEQLNQQNLNLKIGQERIESALENAKFQLNQAIIEPELLTDIENNQVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEE LNAAQEKQTQRFKEQSSLQSELTQFDKLREKQSDKHQQENRYLEQLRSECAEVELQLIPK EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECC AGSLHHYLNNEPLAGDWKQSIGRLLSSAQLGRCDLDPEWVGGELNFYGLKLDLQQIQHND CCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHCCC 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA