| Definition | Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008639 |
| Length | 3,133,902 |
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The map label for this gene is 119358111
Identifier: 119358111
GI number: 119358111
Start: 2717968
End: 2720022
Strand: Reverse
Name: 119358111
Synonym: Cpha266_2343
Alternate gene names: NA
Gene position: 2720022-2717968 (Counterclockwise)
Preceding gene: 119358112
Following gene: 119358110
Centisome position: 86.79
GC content: 45.99
Gene sequence:
>2055_bases ATGAACAAGATTGTTATTGTCGGGCACCCTCAGTCAGGGTATCAAGAGGTCGAGCAGTTGCTTCATGCCTGTGGCATGAA GACCGCCTTGCCATCAAAACGGGATGAGTTATTTCCCGCTGATATTGGCGCCATACTGTGTAAGGCACATAAGACGCCCG AGTTATCACAGGTAAATTCGGAAAACGATATAGGCCAGATAGACGCAGGTGCGGTATGGCAAGGCATGGCTCTCGATTTG CTGCTTGGTAATCTGGATCAGGACCTATGGGGTTGGTCGGATCCAAATGCGATTTTTATGCTCGATTACTGGAAAACGAT CGATCCGGCAATAACCTTTGTCCTTGCATATGACCAACCGCACAGGGTTCTGCTCGATACGCCATACAGTTTGATGGAGA CGCTTTCATCGGATATGTTGCAGCATCGACTGAACAACTGGACGGCATATAACAGTGCATTGATGCGATTTTTCCTCAAT AATTCCGAACGCTGTATGCTTGTGCATGTTCAGCAGGTTCGTCTTGCATCCGAAAACTATTTGAAACAGTTGCAGGATCG CTTGGGAGGTGCTCTGCCGAAAAACGCCCTTCCTCCTCAGAACGGAACACTACCTGCATTTGCCTGCCTGAATGGTTCTT ATAATGGAGGGACAAGATATCCACACGGATCCACAGCAAAAGCGGATCTTTATCTTTCAGATAACGTCATTGCGGAGCAT CCTGACTGTATGCAACGATACGAAGAGCTTCAATCCGTTGCTACACTGCCTTTCGATAACGATCATTACACTGATATCGG GCCAACGGATGCCTGGCTTTCGCATGGTCAGCTGCGAACGCAAGATAAAAAACATATTGAGCAGCTTATAGAGTCGAGAC ATCAGCTTGAGCTTCGTTTGCAGCAAAAACTATCCGATATACAGCAAGAACTTGAAGAGAGAAACAAGCAGAGCAAGGAA CAGATAGCAGCTCTTGGCGGAGAGCTCGAAGCAAGAACTGAAGAACTCGAGAAAACACGTGAAGAGCAGAGGTCAGGCCT ACGGGCTGCAAAAGAGGAAAACGAGTTATTGTTGACCCAGTTGCATCAGGTACAGGAAGAGCTTGAACGGTATTTTCTCG AAAACCTTCAGCTTGCTCAGAAAGCTGAATCGGAGATGAAAAAAGTTGAAAGCCAGACGAACGCAAACAAGGAGCTTTCA GTCGCCCGACAGGAGGCAGATGCCAGATCGATGCAGCTTGAGAAACAGCTCAAGTCGCTTACCGGAGCCCTCGAAATCGG TAAACAAGAGTTGGAAAAAATTCGTAAGGAACAAAATGCACAGCTAAAAAATACGAAAGAGGAAAATGAGTTGCTGTTGA CGCAGTTGCAACGGATGCGTGAAGAGGTTGAACGGTACAAACTCGAAAACCGTCAGCTTGCTCAGAAAGCTGAATCGGAG GTGAAAAAAGTTGAAAATCAGACGAAAGCAAACAAAGAGCTTTCAATCGCCAGACAGGAAGCGGAGGCCAGATCGCTGCA GCTCGAGAAGCAACTTGAGTCGCTTACCGGAGCCCTCGATAAAACACGCGAAGAGCGGCGAGCAGAATTACAGGATGCTA AAGTGGAAAACGAGTTGCTGTTGACGCAATTGCATCAGGTACAGGAAGAGCTTGAACGTTATTACCATGAAAACCGGAAG CTTAAAGAAAGCCAGGTGCCGATATATACCGGTGCTCCGGAACGTATCAAACACGAACTGCCATATAGGTTGGGAGCTGT TATGATCAGTAATTCACGCACCTTTTCAGGTTGGTTTCAAATACCTGCTGCCCTCGCTCGAGAGAAAAAGGCTTTTCTTA AAGAAAAAGCCGATCAATCTCATCAGACTTTGCCGCCATTGATTCTATACCGTGATGTCGAGCAGGCGAAAAAAATTAAA AAACATCTTTCATACCGTCTTGGAAGTATTCTGGTCGAAAAAAACAAGTCACCAATAGGATGGTTATTGATGCCATATCA ACTTGGTCGAGAGGTTTTTACATTCAGAAAAGAAAAGTTAAGCAGTGATAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CCTTCTATTGAAATTCAGTAAACCAGAGATGTTCTGAAGTATGTATGTTCGATAGCGATATGCGAGAGCTCTATTATAAA GACAATCCTTTCCTTTTCCT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGGAATATGATCCGTTTTCAGTACCGCTTACAACATGGTTGCAGTTTTTGCGATATTTCCTGCCTCCAAGCGGTATTCTG TTGATTGGTGCAGGTACAGG
Product: chromosome segregation ATPases-like
Products: NA
Alternate protein names: Glycosyltransferase; Chromosome Segregation ATPases-Like
Number of amino acids: Translated: 684; Mature: 684
Protein sequence:
>684_residues MNKIVIVGHPQSGYQEVEQLLHACGMKTALPSKRDELFPADIGAILCKAHKTPELSQVNSENDIGQIDAGAVWQGMALDL LLGNLDQDLWGWSDPNAIFMLDYWKTIDPAITFVLAYDQPHRVLLDTPYSLMETLSSDMLQHRLNNWTAYNSALMRFFLN NSERCMLVHVQQVRLASENYLKQLQDRLGGALPKNALPPQNGTLPAFACLNGSYNGGTRYPHGSTAKADLYLSDNVIAEH PDCMQRYEELQSVATLPFDNDHYTDIGPTDAWLSHGQLRTQDKKHIEQLIESRHQLELRLQQKLSDIQQELEERNKQSKE QIAALGGELEARTEELEKTREEQRSGLRAAKEENELLLTQLHQVQEELERYFLENLQLAQKAESEMKKVESQTNANKELS VARQEADARSMQLEKQLKSLTGALEIGKQELEKIRKEQNAQLKNTKEENELLLTQLQRMREEVERYKLENRQLAQKAESE VKKVENQTKANKELSIARQEAEARSLQLEKQLESLTGALDKTREERRAELQDAKVENELLLTQLHQVQEELERYYHENRK LKESQVPIYTGAPERIKHELPYRLGAVMISNSRTFSGWFQIPAALAREKKAFLKEKADQSHQTLPPLILYRDVEQAKKIK KHLSYRLGSILVEKNKSPIGWLLMPYQLGREVFTFRKEKLSSDK
Sequences:
>Translated_684_residues MNKIVIVGHPQSGYQEVEQLLHACGMKTALPSKRDELFPADIGAILCKAHKTPELSQVNSENDIGQIDAGAVWQGMALDL LLGNLDQDLWGWSDPNAIFMLDYWKTIDPAITFVLAYDQPHRVLLDTPYSLMETLSSDMLQHRLNNWTAYNSALMRFFLN NSERCMLVHVQQVRLASENYLKQLQDRLGGALPKNALPPQNGTLPAFACLNGSYNGGTRYPHGSTAKADLYLSDNVIAEH PDCMQRYEELQSVATLPFDNDHYTDIGPTDAWLSHGQLRTQDKKHIEQLIESRHQLELRLQQKLSDIQQELEERNKQSKE QIAALGGELEARTEELEKTREEQRSGLRAAKEENELLLTQLHQVQEELERYFLENLQLAQKAESEMKKVESQTNANKELS VARQEADARSMQLEKQLKSLTGALEIGKQELEKIRKEQNAQLKNTKEENELLLTQLQRMREEVERYKLENRQLAQKAESE VKKVENQTKANKELSIARQEAEARSLQLEKQLESLTGALDKTREERRAELQDAKVENELLLTQLHQVQEELERYYHENRK LKESQVPIYTGAPERIKHELPYRLGAVMISNSRTFSGWFQIPAALAREKKAFLKEKADQSHQTLPPLILYRDVEQAKKIK KHLSYRLGSILVEKNKSPIGWLLMPYQLGREVFTFRKEKLSSDK >Mature_684_residues MNKIVIVGHPQSGYQEVEQLLHACGMKTALPSKRDELFPADIGAILCKAHKTPELSQVNSENDIGQIDAGAVWQGMALDL LLGNLDQDLWGWSDPNAIFMLDYWKTIDPAITFVLAYDQPHRVLLDTPYSLMETLSSDMLQHRLNNWTAYNSALMRFFLN NSERCMLVHVQQVRLASENYLKQLQDRLGGALPKNALPPQNGTLPAFACLNGSYNGGTRYPHGSTAKADLYLSDNVIAEH PDCMQRYEELQSVATLPFDNDHYTDIGPTDAWLSHGQLRTQDKKHIEQLIESRHQLELRLQQKLSDIQQELEERNKQSKE QIAALGGELEARTEELEKTREEQRSGLRAAKEENELLLTQLHQVQEELERYFLENLQLAQKAESEMKKVESQTNANKELS VARQEADARSMQLEKQLKSLTGALEIGKQELEKIRKEQNAQLKNTKEENELLLTQLQRMREEVERYKLENRQLAQKAESE VKKVENQTKANKELSIARQEAEARSLQLEKQLESLTGALDKTREERRAELQDAKVENELLLTQLHQVQEELERYYHENRK LKESQVPIYTGAPERIKHELPYRLGAVMISNSRTFSGWFQIPAALAREKKAFLKEKADQSHQTLPPLILYRDVEQAKKIK KHLSYRLGSILVEKNKSPIGWLLMPYQLGREVFTFRKEKLSSDK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 78703; Mature: 78703
Theoretical pI: Translated: 6.26; Mature: 6.26
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKIVIVGHPQSGYQEVEQLLHACGMKTALPSKRDELFPADIGAILCKAHKTPELSQVNS CCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCC ENDIGQIDAGAVWQGMALDLLLGNLDQDLWGWSDPNAIFMLDYWKTIDPAITFVLAYDQP CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHCHHHEEEEEECCC HRVLLDTPYSLMETLSSDMLQHRLNNWTAYNSALMRFFLNNSERCMLVHVQQVRLASENY CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHH LKQLQDRLGGALPKNALPPQNGTLPAFACLNGSYNGGTRYPHGSTAKADLYLSDNVIAEH HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCC PDCMQRYEELQSVATLPFDNDHYTDIGPTDAWLSHGQLRTQDKKHIEQLIESRHQLELRL CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQKLSDIQQELEERNKQSKEQIAALGGELEARTEELEKTREEQRSGLRAAKEENELLLTQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LHQVQEELERYFLENLQLAQKAESEMKKVESQTNANKELSVARQEADARSMQLEKQLKSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGALEIGKQELEKIRKEQNAQLKNTKEENELLLTQLQRMREEVERYKLENRQLAQKAESE HHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VKKVENQTKANKELSIARQEAEARSLQLEKQLESLTGALDKTREERRAELQDAKVENELL HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTQLHQVQEELERYYHENRKLKESQVPIYTGAPERIKHELPYRLGAVMISNSRTFSGWFQ HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCEECCCHHHHHHHCCHHHHHEEEECCCCCHHHHH IPAALAREKKAFLKEKADQSHQTLPPLILYRDVEQAKKIKKHLSYRLGSILVEKNKSPIG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE WLLMPYQLGREVFTFRKEKLSSDK EEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MNKIVIVGHPQSGYQEVEQLLHACGMKTALPSKRDELFPADIGAILCKAHKTPELSQVNS CCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCC ENDIGQIDAGAVWQGMALDLLLGNLDQDLWGWSDPNAIFMLDYWKTIDPAITFVLAYDQP CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHCHHHEEEEEECCC HRVLLDTPYSLMETLSSDMLQHRLNNWTAYNSALMRFFLNNSERCMLVHVQQVRLASENY CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHH LKQLQDRLGGALPKNALPPQNGTLPAFACLNGSYNGGTRYPHGSTAKADLYLSDNVIAEH HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCC PDCMQRYEELQSVATLPFDNDHYTDIGPTDAWLSHGQLRTQDKKHIEQLIESRHQLELRL CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQKLSDIQQELEERNKQSKEQIAALGGELEARTEELEKTREEQRSGLRAAKEENELLLTQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LHQVQEELERYFLENLQLAQKAESEMKKVESQTNANKELSVARQEADARSMQLEKQLKSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGALEIGKQELEKIRKEQNAQLKNTKEENELLLTQLQRMREEVERYKLENRQLAQKAESE HHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VKKVENQTKANKELSIARQEAEARSLQLEKQLESLTGALDKTREERRAELQDAKVENELL HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTQLHQVQEELERYYHENRKLKESQVPIYTGAPERIKHELPYRLGAVMISNSRTFSGWFQ HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCEECCCHHHHHHHCCHHHHHEEEECCCCCHHHHH IPAALAREKKAFLKEKADQSHQTLPPLILYRDVEQAKKIKKHLSYRLGSILVEKNKSPIG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE WLLMPYQLGREVFTFRKEKLSSDK EEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA