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Definition Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome, complete genome.
Accession NC_008639
Length 3,133,902

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The map label for this gene is 119357616

Identifier: 119357616

GI number: 119357616

Start: 2076394

End: 2078154

Strand: Reverse

Name: 119357616

Synonym: Cpha266_1820

Alternate gene names: NA

Gene position: 2078154-2076394 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119357617

Following gene: 119357615

Centisome position: 66.31

GC content: 46.05

Gene sequence:

>1761_bases
ATGAATCAGAAGGAAAACGCGCTTAAAAAACTTGCAGGTAATGCTGTTTCGGGTATGGTGGCGACGATTATTTATATGGT
CAGCCGCCTTCTTCTTACACCGTTCATTCTGCAGTATCTCTCTCTGGAGGAGTTCGGCTTATGGTCGCTCTGTTTTATCA
TTCTCTCTTATGCCGGAATGGGAGGGTTCGGAGTAAACAGTACCTATATCCGTTATTCGGCAAGATACCTTGCGGAGGGA
AAAGAGAAAGAGATCAGCAAGCTGCTCTCAACCGGTGTTGCCTATATGTTTTCATTCTGTCTCTTTTTCTGTCTGGTTCT
TTATCTGATTATGCCTTTTCTTCTCGAAAGGTTCCATATAGCGCCTGCGCAGCAGGATCTTGCCTCAACAATATTTCTTG
GTACTGCTGCAGTTTTCAGTCTTGAACTTACTCTTGGCGGATTCCGGTTTGTCATTAACGGAATGCATGAGTTTTTAAAG
GAGAAAATCGTTTCAACCGTTGCCGGACTCATTGAGATTGGCGCTATCCTTCTGTTTCTTTACTTCGGAGCGGGGGTTAA
AGGGCTCTTGTACGCGTTTGCCTTAAGGCTGGTTCTTGAAACTATTGGCTGCTGGGCAATTGCCCGATCCTTGCTTCCTT
CGCTCTCTGTTTCATGGAGATTGATCAGCCGTGAAAATTTCAGGCTTTTTCTCGGTTTTGGCGGCAAAGTCCAGGTGCTC
GGCATTCTGGGTATCTTTCTTACGGCGCTTGACAGATTGTTCATTACGGCAATTGCCGGACTTGCCGCAGGAGGCATGTT
TGAGATAGGTCGAAAGCTCCCTTCAACGGCAGGGGGTATCTCATCATCCGCATTCGGTCCGTTTTTATCTACCGCATCTC
ATATCGAAGGCCGTTGGGCAGGTGAAAAACCGGATGCTTTTCCGGACAGGCTTAAAACCTATGGTCTTATTGTTGCAACA
ACCGTTACGCTATCCCTTGTCCCGCTTTTTTTTCTACTGCCCGTGCAAAAACGGCTGCAGGGGGCAAGTCCGCTGATCGC
TGTATTTGCAGGGGTTTTAACCGTTGTTCTGTTTTATCTGCTCAATCGCAGAATGAAAAATGAAAATTTTCTCGATAACA
TTGAATTAAAGCAGCTTTATCTCAACGGGATTCGTTTTACCAACATGATCAACTCGACACTGTTTCTTTTTCTTGTCGCC
ATGGCTCATCCACTGATGAATGCATGGGTTGGCAAGGAGTATGCGCGTGCTGCCGATGTTATGATCTTTTTATCGACAGC
CTACTCGATTCAATTGTGTACAGGTCCGATAACCATGATATTTCGGGGAATTGATCGTAACGGAAGAGAGCTTGAGTACA
TGCTGGTTCAGGTTATACTGATGGTTATCTGGATTCCTGCCGGAACGATTGCATCGGGATTGATCGGATCAGCAGCAGCT
ATTGCGTGCAGTTCGATAGTCAGCACATGCTTTCTTTTCTGGCGGAGCAATAACACGTTTCAGATTCGATTCCGTAAATT
TGTTTCAGTCACCGTTATCCCTGCGCTTGTTCCTCTCTTGCCGGCAGTGGCTGTTTTTGCCGTTTCGGAGATCTATCCCG
CAGAAGGGAGACTTGTGGCTGTCTTGCAGGTTCTTGTTTGCGGTGTTGTCTATGTGTTGCTTTCTGTCATGATGTTCTGG
AAATTTATCCTGAACGGCGAGGAAAAATCAAAAGCACTGGAAATGATACCTTTTAACCGGAAACGGAATCCTCCATGCTG
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAATGCGGCAATCGAATCACAAAAATAACACAGCAGCGCATCCTGTGAATTGTTCTGTTTAAGGAGGGTTGTTGCCATTG
GGTGAACACAACGGGAAGTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGAGAATGCTCTGAGAGAAGCCCTTCCTTTCGGAAAGCCATCAAAGTCTCTCAATATTCCAGGCTTTCTCAAACGCTAC
GGGCTGCTCATACTGGTGAT

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 586; Mature: 586

Protein sequence:

>586_residues
MNQKENALKKLAGNAVSGMVATIIYMVSRLLLTPFILQYLSLEEFGLWSLCFIILSYAGMGGFGVNSTYIRYSARYLAEG
KEKEISKLLSTGVAYMFSFCLFFCLVLYLIMPFLLERFHIAPAQQDLASTIFLGTAAVFSLELTLGGFRFVINGMHEFLK
EKIVSTVAGLIEIGAILLFLYFGAGVKGLLYAFALRLVLETIGCWAIARSLLPSLSVSWRLISRENFRLFLGFGGKVQVL
GILGIFLTALDRLFITAIAGLAAGGMFEIGRKLPSTAGGISSSAFGPFLSTASHIEGRWAGEKPDAFPDRLKTYGLIVAT
TVTLSLVPLFFLLPVQKRLQGASPLIAVFAGVLTVVLFYLLNRRMKNENFLDNIELKQLYLNGIRFTNMINSTLFLFLVA
MAHPLMNAWVGKEYARAADVMIFLSTAYSIQLCTGPITMIFRGIDRNGRELEYMLVQVILMVIWIPAGTIASGLIGSAAA
IACSSIVSTCFLFWRSNNTFQIRFRKFVSVTVIPALVPLLPAVAVFAVSEIYPAEGRLVAVLQVLVCGVVYVLLSVMMFW
KFILNGEEKSKALEMIPFNRKRNPPC

Sequences:

>Translated_586_residues
MNQKENALKKLAGNAVSGMVATIIYMVSRLLLTPFILQYLSLEEFGLWSLCFIILSYAGMGGFGVNSTYIRYSARYLAEG
KEKEISKLLSTGVAYMFSFCLFFCLVLYLIMPFLLERFHIAPAQQDLASTIFLGTAAVFSLELTLGGFRFVINGMHEFLK
EKIVSTVAGLIEIGAILLFLYFGAGVKGLLYAFALRLVLETIGCWAIARSLLPSLSVSWRLISRENFRLFLGFGGKVQVL
GILGIFLTALDRLFITAIAGLAAGGMFEIGRKLPSTAGGISSSAFGPFLSTASHIEGRWAGEKPDAFPDRLKTYGLIVAT
TVTLSLVPLFFLLPVQKRLQGASPLIAVFAGVLTVVLFYLLNRRMKNENFLDNIELKQLYLNGIRFTNMINSTLFLFLVA
MAHPLMNAWVGKEYARAADVMIFLSTAYSIQLCTGPITMIFRGIDRNGRELEYMLVQVILMVIWIPAGTIASGLIGSAAA
IACSSIVSTCFLFWRSNNTFQIRFRKFVSVTVIPALVPLLPAVAVFAVSEIYPAEGRLVAVLQVLVCGVVYVLLSVMMFW
KFILNGEEKSKALEMIPFNRKRNPPC
>Mature_586_residues
MNQKENALKKLAGNAVSGMVATIIYMVSRLLLTPFILQYLSLEEFGLWSLCFIILSYAGMGGFGVNSTYIRYSARYLAEG
KEKEISKLLSTGVAYMFSFCLFFCLVLYLIMPFLLERFHIAPAQQDLASTIFLGTAAVFSLELTLGGFRFVINGMHEFLK
EKIVSTVAGLIEIGAILLFLYFGAGVKGLLYAFALRLVLETIGCWAIARSLLPSLSVSWRLISRENFRLFLGFGGKVQVL
GILGIFLTALDRLFITAIAGLAAGGMFEIGRKLPSTAGGISSSAFGPFLSTASHIEGRWAGEKPDAFPDRLKTYGLIVAT
TVTLSLVPLFFLLPVQKRLQGASPLIAVFAGVLTVVLFYLLNRRMKNENFLDNIELKQLYLNGIRFTNMINSTLFLFLVA
MAHPLMNAWVGKEYARAADVMIFLSTAYSIQLCTGPITMIFRGIDRNGRELEYMLVQVILMVIWIPAGTIASGLIGSAAA
IACSSIVSTCFLFWRSNNTFQIRFRKFVSVTVIPALVPLLPAVAVFAVSEIYPAEGRLVAVLQVLVCGVVYVLLSVMMFW
KFILNGEEKSKALEMIPFNRKRNPPC

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64670; Mature: 64670

Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNQKENALKKLAGNAVSGMVATIIYMVSRLLLTPFILQYLSLEEFGLWSLCFIILSYAGM
CCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCC
GGFGVNSTYIRYSARYLAEGKEKEISKLLSTGVAYMFSFCLFFCLVLYLIMPFLLERFHI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
APAQQDLASTIFLGTAAVFSLELTLGGFRFVINGMHEFLKEKIVSTVAGLIEIGAILLFL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFGAGVKGLLYAFALRLVLETIGCWAIARSLLPSLSVSWRLISRENFRLFLGFGGKVQVL
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCHHHH
GILGIFLTALDRLFITAIAGLAAGGMFEIGRKLPSTAGGISSSAFGPFLSTASHIEGRWA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCC
GEKPDAFPDRLKTYGLIVATTVTLSLVPLFFLLPVQKRLQGASPLIAVFAGVLTVVLFYL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNRRMKNENFLDNIELKQLYLNGIRFTNMINSTLFLFLVAMAHPLMNAWVGKEYARAADV
HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH
MIFLSTAYSIQLCTGPITMIFRGIDRNGRELEYMLVQVILMVIWIPAGTIASGLIGSAAA
HHHEEHHCEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
IACSSIVSTCFLFWRSNNTFQIRFRKFVSVTVIPALVPLLPAVAVFAVSEIYPAEGRLVA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
VLQVLVCGVVYVLLSVMMFWKFILNGEEKSKALEMIPFNRKRNPPC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNQKENALKKLAGNAVSGMVATIIYMVSRLLLTPFILQYLSLEEFGLWSLCFIILSYAGM
CCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCC
GGFGVNSTYIRYSARYLAEGKEKEISKLLSTGVAYMFSFCLFFCLVLYLIMPFLLERFHI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
APAQQDLASTIFLGTAAVFSLELTLGGFRFVINGMHEFLKEKIVSTVAGLIEIGAILLFL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFGAGVKGLLYAFALRLVLETIGCWAIARSLLPSLSVSWRLISRENFRLFLGFGGKVQVL
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCHHHH
GILGIFLTALDRLFITAIAGLAAGGMFEIGRKLPSTAGGISSSAFGPFLSTASHIEGRWA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCC
GEKPDAFPDRLKTYGLIVATTVTLSLVPLFFLLPVQKRLQGASPLIAVFAGVLTVVLFYL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNRRMKNENFLDNIELKQLYLNGIRFTNMINSTLFLFLVAMAHPLMNAWVGKEYARAADV
HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH
MIFLSTAYSIQLCTGPITMIFRGIDRNGRELEYMLVQVILMVIWIPAGTIASGLIGSAAA
HHHEEHHCEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
IACSSIVSTCFLFWRSNNTFQIRFRKFVSVTVIPALVPLLPAVAVFAVSEIYPAEGRLVA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
VLQVLVCGVVYVLLSVMMFWKFILNGEEKSKALEMIPFNRKRNPPC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA