| Definition | Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008639 |
| Length | 3,133,902 |
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The map label for this gene is 119357616
Identifier: 119357616
GI number: 119357616
Start: 2076394
End: 2078154
Strand: Reverse
Name: 119357616
Synonym: Cpha266_1820
Alternate gene names: NA
Gene position: 2078154-2076394 (Counterclockwise)
Preceding gene: 119357617
Following gene: 119357615
Centisome position: 66.31
GC content: 46.05
Gene sequence:
>1761_bases ATGAATCAGAAGGAAAACGCGCTTAAAAAACTTGCAGGTAATGCTGTTTCGGGTATGGTGGCGACGATTATTTATATGGT CAGCCGCCTTCTTCTTACACCGTTCATTCTGCAGTATCTCTCTCTGGAGGAGTTCGGCTTATGGTCGCTCTGTTTTATCA TTCTCTCTTATGCCGGAATGGGAGGGTTCGGAGTAAACAGTACCTATATCCGTTATTCGGCAAGATACCTTGCGGAGGGA AAAGAGAAAGAGATCAGCAAGCTGCTCTCAACCGGTGTTGCCTATATGTTTTCATTCTGTCTCTTTTTCTGTCTGGTTCT TTATCTGATTATGCCTTTTCTTCTCGAAAGGTTCCATATAGCGCCTGCGCAGCAGGATCTTGCCTCAACAATATTTCTTG GTACTGCTGCAGTTTTCAGTCTTGAACTTACTCTTGGCGGATTCCGGTTTGTCATTAACGGAATGCATGAGTTTTTAAAG GAGAAAATCGTTTCAACCGTTGCCGGACTCATTGAGATTGGCGCTATCCTTCTGTTTCTTTACTTCGGAGCGGGGGTTAA AGGGCTCTTGTACGCGTTTGCCTTAAGGCTGGTTCTTGAAACTATTGGCTGCTGGGCAATTGCCCGATCCTTGCTTCCTT CGCTCTCTGTTTCATGGAGATTGATCAGCCGTGAAAATTTCAGGCTTTTTCTCGGTTTTGGCGGCAAAGTCCAGGTGCTC GGCATTCTGGGTATCTTTCTTACGGCGCTTGACAGATTGTTCATTACGGCAATTGCCGGACTTGCCGCAGGAGGCATGTT TGAGATAGGTCGAAAGCTCCCTTCAACGGCAGGGGGTATCTCATCATCCGCATTCGGTCCGTTTTTATCTACCGCATCTC ATATCGAAGGCCGTTGGGCAGGTGAAAAACCGGATGCTTTTCCGGACAGGCTTAAAACCTATGGTCTTATTGTTGCAACA ACCGTTACGCTATCCCTTGTCCCGCTTTTTTTTCTACTGCCCGTGCAAAAACGGCTGCAGGGGGCAAGTCCGCTGATCGC TGTATTTGCAGGGGTTTTAACCGTTGTTCTGTTTTATCTGCTCAATCGCAGAATGAAAAATGAAAATTTTCTCGATAACA TTGAATTAAAGCAGCTTTATCTCAACGGGATTCGTTTTACCAACATGATCAACTCGACACTGTTTCTTTTTCTTGTCGCC ATGGCTCATCCACTGATGAATGCATGGGTTGGCAAGGAGTATGCGCGTGCTGCCGATGTTATGATCTTTTTATCGACAGC CTACTCGATTCAATTGTGTACAGGTCCGATAACCATGATATTTCGGGGAATTGATCGTAACGGAAGAGAGCTTGAGTACA TGCTGGTTCAGGTTATACTGATGGTTATCTGGATTCCTGCCGGAACGATTGCATCGGGATTGATCGGATCAGCAGCAGCT ATTGCGTGCAGTTCGATAGTCAGCACATGCTTTCTTTTCTGGCGGAGCAATAACACGTTTCAGATTCGATTCCGTAAATT TGTTTCAGTCACCGTTATCCCTGCGCTTGTTCCTCTCTTGCCGGCAGTGGCTGTTTTTGCCGTTTCGGAGATCTATCCCG CAGAAGGGAGACTTGTGGCTGTCTTGCAGGTTCTTGTTTGCGGTGTTGTCTATGTGTTGCTTTCTGTCATGATGTTCTGG AAATTTATCCTGAACGGCGAGGAAAAATCAAAAGCACTGGAAATGATACCTTTTAACCGGAAACGGAATCCTCCATGCTG A
Upstream 100 bases:
>100_bases CAATGCGGCAATCGAATCACAAAAATAACACAGCAGCGCATCCTGTGAATTGTTCTGTTTAAGGAGGGTTGTTGCCATTG GGTGAACACAACGGGAAGTG
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGAGAATGCTCTGAGAGAAGCCCTTCCTTTCGGAAAGCCATCAAAGTCTCTCAATATTCCAGGCTTTCTCAAACGCTAC GGGCTGCTCATACTGGTGAT
Product: polysaccharide biosynthesis protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 586; Mature: 586
Protein sequence:
>586_residues MNQKENALKKLAGNAVSGMVATIIYMVSRLLLTPFILQYLSLEEFGLWSLCFIILSYAGMGGFGVNSTYIRYSARYLAEG KEKEISKLLSTGVAYMFSFCLFFCLVLYLIMPFLLERFHIAPAQQDLASTIFLGTAAVFSLELTLGGFRFVINGMHEFLK EKIVSTVAGLIEIGAILLFLYFGAGVKGLLYAFALRLVLETIGCWAIARSLLPSLSVSWRLISRENFRLFLGFGGKVQVL GILGIFLTALDRLFITAIAGLAAGGMFEIGRKLPSTAGGISSSAFGPFLSTASHIEGRWAGEKPDAFPDRLKTYGLIVAT TVTLSLVPLFFLLPVQKRLQGASPLIAVFAGVLTVVLFYLLNRRMKNENFLDNIELKQLYLNGIRFTNMINSTLFLFLVA MAHPLMNAWVGKEYARAADVMIFLSTAYSIQLCTGPITMIFRGIDRNGRELEYMLVQVILMVIWIPAGTIASGLIGSAAA IACSSIVSTCFLFWRSNNTFQIRFRKFVSVTVIPALVPLLPAVAVFAVSEIYPAEGRLVAVLQVLVCGVVYVLLSVMMFW KFILNGEEKSKALEMIPFNRKRNPPC
Sequences:
>Translated_586_residues MNQKENALKKLAGNAVSGMVATIIYMVSRLLLTPFILQYLSLEEFGLWSLCFIILSYAGMGGFGVNSTYIRYSARYLAEG KEKEISKLLSTGVAYMFSFCLFFCLVLYLIMPFLLERFHIAPAQQDLASTIFLGTAAVFSLELTLGGFRFVINGMHEFLK EKIVSTVAGLIEIGAILLFLYFGAGVKGLLYAFALRLVLETIGCWAIARSLLPSLSVSWRLISRENFRLFLGFGGKVQVL GILGIFLTALDRLFITAIAGLAAGGMFEIGRKLPSTAGGISSSAFGPFLSTASHIEGRWAGEKPDAFPDRLKTYGLIVAT TVTLSLVPLFFLLPVQKRLQGASPLIAVFAGVLTVVLFYLLNRRMKNENFLDNIELKQLYLNGIRFTNMINSTLFLFLVA MAHPLMNAWVGKEYARAADVMIFLSTAYSIQLCTGPITMIFRGIDRNGRELEYMLVQVILMVIWIPAGTIASGLIGSAAA IACSSIVSTCFLFWRSNNTFQIRFRKFVSVTVIPALVPLLPAVAVFAVSEIYPAEGRLVAVLQVLVCGVVYVLLSVMMFW KFILNGEEKSKALEMIPFNRKRNPPC >Mature_586_residues MNQKENALKKLAGNAVSGMVATIIYMVSRLLLTPFILQYLSLEEFGLWSLCFIILSYAGMGGFGVNSTYIRYSARYLAEG KEKEISKLLSTGVAYMFSFCLFFCLVLYLIMPFLLERFHIAPAQQDLASTIFLGTAAVFSLELTLGGFRFVINGMHEFLK EKIVSTVAGLIEIGAILLFLYFGAGVKGLLYAFALRLVLETIGCWAIARSLLPSLSVSWRLISRENFRLFLGFGGKVQVL GILGIFLTALDRLFITAIAGLAAGGMFEIGRKLPSTAGGISSSAFGPFLSTASHIEGRWAGEKPDAFPDRLKTYGLIVAT TVTLSLVPLFFLLPVQKRLQGASPLIAVFAGVLTVVLFYLLNRRMKNENFLDNIELKQLYLNGIRFTNMINSTLFLFLVA MAHPLMNAWVGKEYARAADVMIFLSTAYSIQLCTGPITMIFRGIDRNGRELEYMLVQVILMVIWIPAGTIASGLIGSAAA IACSSIVSTCFLFWRSNNTFQIRFRKFVSVTVIPALVPLLPAVAVFAVSEIYPAEGRLVAVLQVLVCGVVYVLLSVMMFW KFILNGEEKSKALEMIPFNRKRNPPC
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 64670; Mature: 64670
Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 4.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNQKENALKKLAGNAVSGMVATIIYMVSRLLLTPFILQYLSLEEFGLWSLCFIILSYAGM CCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCC GGFGVNSTYIRYSARYLAEGKEKEISKLLSTGVAYMFSFCLFFCLVLYLIMPFLLERFHI CCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC APAQQDLASTIFLGTAAVFSLELTLGGFRFVINGMHEFLKEKIVSTVAGLIEIGAILLFL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFGAGVKGLLYAFALRLVLETIGCWAIARSLLPSLSVSWRLISRENFRLFLGFGGKVQVL HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCHHHH GILGIFLTALDRLFITAIAGLAAGGMFEIGRKLPSTAGGISSSAFGPFLSTASHIEGRWA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCC GEKPDAFPDRLKTYGLIVATTVTLSLVPLFFLLPVQKRLQGASPLIAVFAGVLTVVLFYL CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LNRRMKNENFLDNIELKQLYLNGIRFTNMINSTLFLFLVAMAHPLMNAWVGKEYARAADV HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH MIFLSTAYSIQLCTGPITMIFRGIDRNGRELEYMLVQVILMVIWIPAGTIASGLIGSAAA HHHEEHHCEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH IACSSIVSTCFLFWRSNNTFQIRFRKFVSVTVIPALVPLLPAVAVFAVSEIYPAEGRLVA HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH VLQVLVCGVVYVLLSVMMFWKFILNGEEKSKALEMIPFNRKRNPPC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNQKENALKKLAGNAVSGMVATIIYMVSRLLLTPFILQYLSLEEFGLWSLCFIILSYAGM CCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCC GGFGVNSTYIRYSARYLAEGKEKEISKLLSTGVAYMFSFCLFFCLVLYLIMPFLLERFHI CCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC APAQQDLASTIFLGTAAVFSLELTLGGFRFVINGMHEFLKEKIVSTVAGLIEIGAILLFL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFGAGVKGLLYAFALRLVLETIGCWAIARSLLPSLSVSWRLISRENFRLFLGFGGKVQVL HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCHHHH GILGIFLTALDRLFITAIAGLAAGGMFEIGRKLPSTAGGISSSAFGPFLSTASHIEGRWA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCC GEKPDAFPDRLKTYGLIVATTVTLSLVPLFFLLPVQKRLQGASPLIAVFAGVLTVVLFYL CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LNRRMKNENFLDNIELKQLYLNGIRFTNMINSTLFLFLVAMAHPLMNAWVGKEYARAADV HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH MIFLSTAYSIQLCTGPITMIFRGIDRNGRELEYMLVQVILMVIWIPAGTIASGLIGSAAA HHHEEHHCEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH IACSSIVSTCFLFWRSNNTFQIRFRKFVSVTVIPALVPLLPAVAVFAVSEIYPAEGRLVA HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH VLQVLVCGVVYVLLSVMMFWKFILNGEEKSKALEMIPFNRKRNPPC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA