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The map label for this gene is pkn1 [H]

Identifier: 119357111

GI number: 119357111

Start: 1476041

End: 1480519

Strand: Reverse

Name: pkn1 [H]

Synonym: Cpha266_1299

Alternate gene names: 119357111

Gene position: 1480519-1476041 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119357112

Following gene: 119357110

Centisome position: 47.24

GC content: 42.29

Gene sequence:

>4479_bases
ATGCAAGTAGATAATAAAAAGACGCAATCGTCAATTTCGGAGTTTCCTGAAGATGCTTTTTTGATTTTTATTGGACATAG
CGATGATGCGACTGCAGAAGCGCATGCCATTTATGAATTACAAGGGAGGCTCGAAAAAGACTTTCGCACTTTTCTTAAAA
CAAATCACGAATCTCCTTTTAAAAGCCTTATGCTTTGGGAATGGCAAATTGATGCTTCTTCAAAACCAGGAGGCCAAAAC
GTTGTTGTTACACCCGTTCTTCATCGTGCACAAATAATTATTTTTGTTTTTAAGGAACGAGTTGGAACTGTTACATCAGA
GGAAATTGAAAATGCTCGAGAACTTAGTAAATATACCAGAATAAATATACTTGCGTTTTTTCCGGCATATCACCCTGAGA
GTAGCAAAATCAATAATACAATAGGTGCTCGGGATTGGGCAAATTTAAAGGGACTTTATGATAAATTAACAGAGGATTGG
TCAGCGGAAGACTCCACTTCCGTTACGCCATGCTTACCACTATACGCTGATATAGATGATCTTAAAAATATTGCTCTTGA
AAAGCTCCGGGATGCAATGCGAGACATTATTGCAGATATTAAGTGTATAAAAGTACCAAAGCACTCCACAACATATTCGT
CAAAACGTATAATTGGATATATAAAAGATATTAGTTTTGATCGACGTCCTGTACTGATTCATATGGTTGAGGAGTTAGAT
AAAGTGTTGATAGAAAAGTTTCTATCAACCGAAGATTCTCTCAAAGAGTTGCCACAAGCCAAGCATTCCTCATCTATTGA
AGAACGCTTAGCTATTCTCGGTTGTGTGATGGGTAGTCGTCCGACATTGGGCGCATTTCTTTGCTTCGCACCATCCCGGC
TTATTATAGATAAATTTAGTTCATGCAGTTTACAGGTAGTTCGCTTTAAAGGTGTGAGCCGGACGTCGTCAGGAGTTGAA
AAATTTTCAATGCATGACAACTTGCTTAACTTGTTTGATCAAGGAATAAATTGGTTGACTTCTGAAGCCCACCTTGGTCG
TCAAGGTCGGGTTGGTTCAACTGACCGTGATGATCTGGAAATTCCAAAGATTGCTCTACGTGAAGCGTTAGCCAATGCAC
TGGTGCATAGAGACTATGAGGATGCGCTGAACAGAGATCAACCTACTCGTGTCGAAGTTTTTGATAATCGGATTGAAATA
ACAAGCTTTGGGACATTGCCCGGGTCAGTAAATATTGATCAGTTAAACCAATATTCCGATACTCTAAGGCCGGTTCGAAG
AAATCCAATTATTGCTGATATCTTTCAGCATATTACTCATGTTGAACTTAATGCTTCAGGAATCTCCCGTATGCGGTATG
CTATGCAACAAGCGCTTTTACCGCCGCCAAAAATACATATTCAGAATGGAGCCGTAGTCGTATGCTTTACGAGACCAATT
TTCATTGACTCCAATACTCGTCAACCTATCGAGTTAAGAAAACGAGCGCTTATTGGGGGATCATTATCTGGATTGGATGC
TTATAGAACCGCCGCATTTGCAGTTTGCCTTAGGTCAGGATATTTTCCTGTTATGATGGAGCATCATCCTAATACAGAGA
ATGATGAGGATGATGCCATTCGGCTATCTAATACAATGGTAGATTATGCCGATATCTACATCGGAATACTTACCAACCAA
TATGGATATGTTCCTGATACACATGATAAATCAATAACCGAAATTGAATATTATCGAGTAAAAGCGAGAAAGGAGATGCC
ACGGCTTATGTTTTCTTTGAAACAAAAAACCATTGAAAATGATACGTATGAGAATGAATCAAGCAGTCAGAAGCAATTAA
ATTTTATCGAAACAGTTACCCGTGAATCACTTGTTCATGATGTATGTTCAGTCGATGAGCTTCAAGATAAATTAAAAGGG
CTTATAAAAGTAGCAAATAATTCTCCATTCGAAGCAAAAGAATATGAACTTCGCTATCAAAGAGCGCTTAAAACCGAACT
TGGTATTATCAGCTTGCTGGGTACTCATGCGCTTGAGAACATTCAGGTAACGCTGACTGATACTTTTGTCTCTCTGCGTA
TTTCTGATACCTGGCGTACCGATATGCGATGGAACCCGAAAGCTCCTTACGAATCGCTACAAGAAGAACGCATTCGTAAC
CCTGAAGAGGTAATGAGCCTTGTCTTTGAAACCTGTCGTATCCTACTGGTTATTGGTGATCCCGGTTCCGGTAAAACAAC
TCTGCTCAAACATTACGCACTTTCGTGCCTTGAAAATGAGCACTACACCACACTTGGATTCAAGGAACGCGTTCTGGTTT
TTTATCTTCCTTTGCGAGAGCTTGTTAAGAGTGGTGTAGGTTATGACACGCTTCCAGCAAATCTTTTCGCATGGAGCGAA
AAGCATTCACTTGGTATCGCGGAAACGGTTTTCTTTGATTGGCTGCATAACCGGCAAACCCTTCTTCTGTTTGATGGCCT
TGATGAAATCAGCGAGCCTGAACAGAGGATTAAGGCATGTGACTGGATTGACCGTGTCGTAACTGGTTTTGAAAAAGCAA
ACGTTGTGGTCACCTCCCGTTATACTGGCTACCGGAAGGGTGACGGGATTGAACTTCGTTCCCATCATGTGCGGGCCGAC
ATCATGGACTTTTCATCGGAGCAGCAAAAAGAGTTTCTGGAGAAGTGGTTTAGCTCGGTTTTGTGTAGTGAGTTGCGTCC
CGGGTTCAAAAGTTTACAAGAGTGGACAGTGGAACAGAAGCAAAAAGCAGCGGAGAAAGCTGCGACAATTATTGCTTTTT
TGGAGAGGGAAGAGAACAGGAGTTTGCGATTATTGGCAGCGGTTCCAATGCTATTACAGATTATGGCGATTCTCTGGAAA
GAGCGACACTATCTACCGAAAACCCGATCAGAGTTGTTTAATGCAGCAGTGAACTATCTTCTTGATTATCGCGACAGACA
AAAAGAGATCTCTCCTTTGCTGAGTGCTGAAGATGCCCGGCGAGTACTGATGCCGGTGTCACTCTGGATGCAGGAGGAGC
TCCAAAAGGACGAAGCGGATAAAGCGCTGATGCAAAATGAGATGCAGAAACACCTTAAAACGCTTAACAAGCCACCTTCA
GTCGAGATGTTTTGTGCAAACCTGATTGATCGTGCGGGGTTGCTGGTAGCTTATGGAGATAAAGAGTATCGTTTTCGACA
CAAATTATTTCGGGAGTACATGGCGGGAATACAGCTTGAGAAAAAAATGCACAGCTCCCCAGGTTATCTCAATACGTTAG
TGAACAATTTTGGGAAAGACTGGTGGGAGGAACCGCTCCGTTTTTATATCTCAGAGGTTGATGCTGATGCTTTTGATGCT
TTTATGGGCAAGCTGTTTGACTCAGAGGTTAGCGCCATGTTTAATCAAAAGCAGCAGGATTTATTGATTACTTTCATTGA
AGAGGCCCGGCAAACAAAAACTGATGCTTTGCAGAAGAAGTTGCTTGATTCGGCTACCACAACAAACCGGCAGCGATATA
TAATGCAATGTCTAAAAGCCATCGGCACTGCGGATGCCCTTGATGCTGTGCGGAAGTTTCTTGATGCTCCGTTTGAGAAA
AAAGCAGAAGTGCTGGATTTTTCCTTTGAAATTGCAGGCGATACAGAGCAGTTAAGTTTGGGTAGCAAACGTGATCGCTA
TGGGTCAAAAGACACGATTATATCCGATAAGCTTGGTGCTCACTATATTCTGATCAAGGGTGGGAGCTTCACCTTCTCTC
TGACAAAGAGGCAGGAGAGCGTACCAGACTTCTACGTTGCAAAATATACGGTGACCAACCAGCACTACCGCAGGTTTATC
AACTATCTGGATTCAAAAGAGGCTGGTTATGCCTCTATACTGCCTGTTGAAACCTACATAAAAAGTCTCTTTGATCTGGC
AGAGAGCATCAATGGCTTCAGCGACTTTATAAAGGGGGAAAAATCGCTGGCAACACGATTTCGTAGCTTTTGGGATGATG
ATAAAAAGTTAAACAAGGATTATCAGCCAGTGATAGAGCCAAGCTGGTATGCAGCTCGAGCATATTGCCTGTGGCTCTCA
TTGCTGGAAAGTGATAGGAGAGATACCGATTTGTATTGTTTGCCAACTGAAAAAGAATGGGAATATGCAGCAGGCGGAAA
AGAGAGCAGAACGTACCCGTGGGGCAATAAAAAGCCCTCGGAAACACTTGCCAATTATAACAATAATGAAGGCTCTACAA
CACCGTCAGGCCGTTACCCTGAGGGAGCAACACTTGAAGGATTGCATGATATGGCGGGCAATGTGTGGGAGTGGACAGCA
GATTTGTATAACCAAGATGAAAACTGGCGTTCATTACGAGGTGGCGATTATAGTACAGAAGCTGGCGCACTAAGTTGCTA
TGCACGGAAAGATCGCGATCCAAGCATTAAAAGCTATAGTATTGTTGGCTTTCGTGTTATTCGATCGTGTAAATTCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTGTTTTTTAACAAAATGGTAGTATTCTGTTTTAAGAAACGTATTTATTTGTAATCAGTTAACGGGTAATGACTTCTGGA
ACATTAATAATACAAATTCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATTAAATATAGTAGGATAACATTCGGAAAACAAATTGGTATTAAAAGAATAATTATAATACCTCATATTATTATAGTA
TTGCTTGATTTTTTATATAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1492; Mature: 1492

Protein sequence:

>1492_residues
MQVDNKKTQSSISEFPEDAFLIFIGHSDDATAEAHAIYELQGRLEKDFRTFLKTNHESPFKSLMLWEWQIDASSKPGGQN
VVVTPVLHRAQIIIFVFKERVGTVTSEEIENARELSKYTRINILAFFPAYHPESSKINNTIGARDWANLKGLYDKLTEDW
SAEDSTSVTPCLPLYADIDDLKNIALEKLRDAMRDIIADIKCIKVPKHSTTYSSKRIIGYIKDISFDRRPVLIHMVEELD
KVLIEKFLSTEDSLKELPQAKHSSSIEERLAILGCVMGSRPTLGAFLCFAPSRLIIDKFSSCSLQVVRFKGVSRTSSGVE
KFSMHDNLLNLFDQGINWLTSEAHLGRQGRVGSTDRDDLEIPKIALREALANALVHRDYEDALNRDQPTRVEVFDNRIEI
TSFGTLPGSVNIDQLNQYSDTLRPVRRNPIIADIFQHITHVELNASGISRMRYAMQQALLPPPKIHIQNGAVVVCFTRPI
FIDSNTRQPIELRKRALIGGSLSGLDAYRTAAFAVCLRSGYFPVMMEHHPNTENDEDDAIRLSNTMVDYADIYIGILTNQ
YGYVPDTHDKSITEIEYYRVKARKEMPRLMFSLKQKTIENDTYENESSSQKQLNFIETVTRESLVHDVCSVDELQDKLKG
LIKVANNSPFEAKEYELRYQRALKTELGIISLLGTHALENIQVTLTDTFVSLRISDTWRTDMRWNPKAPYESLQEERIRN
PEEVMSLVFETCRILLVIGDPGSGKTTLLKHYALSCLENEHYTTLGFKERVLVFYLPLRELVKSGVGYDTLPANLFAWSE
KHSLGIAETVFFDWLHNRQTLLLFDGLDEISEPEQRIKACDWIDRVVTGFEKANVVVTSRYTGYRKGDGIELRSHHVRAD
IMDFSSEQQKEFLEKWFSSVLCSELRPGFKSLQEWTVEQKQKAAEKAATIIAFLEREENRSLRLLAAVPMLLQIMAILWK
ERHYLPKTRSELFNAAVNYLLDYRDRQKEISPLLSAEDARRVLMPVSLWMQEELQKDEADKALMQNEMQKHLKTLNKPPS
VEMFCANLIDRAGLLVAYGDKEYRFRHKLFREYMAGIQLEKKMHSSPGYLNTLVNNFGKDWWEEPLRFYISEVDADAFDA
FMGKLFDSEVSAMFNQKQQDLLITFIEEARQTKTDALQKKLLDSATTTNRQRYIMQCLKAIGTADALDAVRKFLDAPFEK
KAEVLDFSFEIAGDTEQLSLGSKRDRYGSKDTIISDKLGAHYILIKGGSFTFSLTKRQESVPDFYVAKYTVTNQHYRRFI
NYLDSKEAGYASILPVETYIKSLFDLAESINGFSDFIKGEKSLATRFRSFWDDDKKLNKDYQPVIEPSWYAARAYCLWLS
LLESDRRDTDLYCLPTEKEWEYAAGGKESRTYPWGNKKPSETLANYNNNEGSTTPSGRYPEGATLEGLHDMAGNVWEWTA
DLYNQDENWRSLRGGDYSTEAGALSCYARKDRDPSIKSYSIVGFRVIRSCKF

Sequences:

>Translated_1492_residues
MQVDNKKTQSSISEFPEDAFLIFIGHSDDATAEAHAIYELQGRLEKDFRTFLKTNHESPFKSLMLWEWQIDASSKPGGQN
VVVTPVLHRAQIIIFVFKERVGTVTSEEIENARELSKYTRINILAFFPAYHPESSKINNTIGARDWANLKGLYDKLTEDW
SAEDSTSVTPCLPLYADIDDLKNIALEKLRDAMRDIIADIKCIKVPKHSTTYSSKRIIGYIKDISFDRRPVLIHMVEELD
KVLIEKFLSTEDSLKELPQAKHSSSIEERLAILGCVMGSRPTLGAFLCFAPSRLIIDKFSSCSLQVVRFKGVSRTSSGVE
KFSMHDNLLNLFDQGINWLTSEAHLGRQGRVGSTDRDDLEIPKIALREALANALVHRDYEDALNRDQPTRVEVFDNRIEI
TSFGTLPGSVNIDQLNQYSDTLRPVRRNPIIADIFQHITHVELNASGISRMRYAMQQALLPPPKIHIQNGAVVVCFTRPI
FIDSNTRQPIELRKRALIGGSLSGLDAYRTAAFAVCLRSGYFPVMMEHHPNTENDEDDAIRLSNTMVDYADIYIGILTNQ
YGYVPDTHDKSITEIEYYRVKARKEMPRLMFSLKQKTIENDTYENESSSQKQLNFIETVTRESLVHDVCSVDELQDKLKG
LIKVANNSPFEAKEYELRYQRALKTELGIISLLGTHALENIQVTLTDTFVSLRISDTWRTDMRWNPKAPYESLQEERIRN
PEEVMSLVFETCRILLVIGDPGSGKTTLLKHYALSCLENEHYTTLGFKERVLVFYLPLRELVKSGVGYDTLPANLFAWSE
KHSLGIAETVFFDWLHNRQTLLLFDGLDEISEPEQRIKACDWIDRVVTGFEKANVVVTSRYTGYRKGDGIELRSHHVRAD
IMDFSSEQQKEFLEKWFSSVLCSELRPGFKSLQEWTVEQKQKAAEKAATIIAFLEREENRSLRLLAAVPMLLQIMAILWK
ERHYLPKTRSELFNAAVNYLLDYRDRQKEISPLLSAEDARRVLMPVSLWMQEELQKDEADKALMQNEMQKHLKTLNKPPS
VEMFCANLIDRAGLLVAYGDKEYRFRHKLFREYMAGIQLEKKMHSSPGYLNTLVNNFGKDWWEEPLRFYISEVDADAFDA
FMGKLFDSEVSAMFNQKQQDLLITFIEEARQTKTDALQKKLLDSATTTNRQRYIMQCLKAIGTADALDAVRKFLDAPFEK
KAEVLDFSFEIAGDTEQLSLGSKRDRYGSKDTIISDKLGAHYILIKGGSFTFSLTKRQESVPDFYVAKYTVTNQHYRRFI
NYLDSKEAGYASILPVETYIKSLFDLAESINGFSDFIKGEKSLATRFRSFWDDDKKLNKDYQPVIEPSWYAARAYCLWLS
LLESDRRDTDLYCLPTEKEWEYAAGGKESRTYPWGNKKPSETLANYNNNEGSTTPSGRYPEGATLEGLHDMAGNVWEWTA
DLYNQDENWRSLRGGDYSTEAGALSCYARKDRDPSIKSYSIVGFRVIRSCKF
>Mature_1492_residues
MQVDNKKTQSSISEFPEDAFLIFIGHSDDATAEAHAIYELQGRLEKDFRTFLKTNHESPFKSLMLWEWQIDASSKPGGQN
VVVTPVLHRAQIIIFVFKERVGTVTSEEIENARELSKYTRINILAFFPAYHPESSKINNTIGARDWANLKGLYDKLTEDW
SAEDSTSVTPCLPLYADIDDLKNIALEKLRDAMRDIIADIKCIKVPKHSTTYSSKRIIGYIKDISFDRRPVLIHMVEELD
KVLIEKFLSTEDSLKELPQAKHSSSIEERLAILGCVMGSRPTLGAFLCFAPSRLIIDKFSSCSLQVVRFKGVSRTSSGVE
KFSMHDNLLNLFDQGINWLTSEAHLGRQGRVGSTDRDDLEIPKIALREALANALVHRDYEDALNRDQPTRVEVFDNRIEI
TSFGTLPGSVNIDQLNQYSDTLRPVRRNPIIADIFQHITHVELNASGISRMRYAMQQALLPPPKIHIQNGAVVVCFTRPI
FIDSNTRQPIELRKRALIGGSLSGLDAYRTAAFAVCLRSGYFPVMMEHHPNTENDEDDAIRLSNTMVDYADIYIGILTNQ
YGYVPDTHDKSITEIEYYRVKARKEMPRLMFSLKQKTIENDTYENESSSQKQLNFIETVTRESLVHDVCSVDELQDKLKG
LIKVANNSPFEAKEYELRYQRALKTELGIISLLGTHALENIQVTLTDTFVSLRISDTWRTDMRWNPKAPYESLQEERIRN
PEEVMSLVFETCRILLVIGDPGSGKTTLLKHYALSCLENEHYTTLGFKERVLVFYLPLRELVKSGVGYDTLPANLFAWSE
KHSLGIAETVFFDWLHNRQTLLLFDGLDEISEPEQRIKACDWIDRVVTGFEKANVVVTSRYTGYRKGDGIELRSHHVRAD
IMDFSSEQQKEFLEKWFSSVLCSELRPGFKSLQEWTVEQKQKAAEKAATIIAFLEREENRSLRLLAAVPMLLQIMAILWK
ERHYLPKTRSELFNAAVNYLLDYRDRQKEISPLLSAEDARRVLMPVSLWMQEELQKDEADKALMQNEMQKHLKTLNKPPS
VEMFCANLIDRAGLLVAYGDKEYRFRHKLFREYMAGIQLEKKMHSSPGYLNTLVNNFGKDWWEEPLRFYISEVDADAFDA
FMGKLFDSEVSAMFNQKQQDLLITFIEEARQTKTDALQKKLLDSATTTNRQRYIMQCLKAIGTADALDAVRKFLDAPFEK
KAEVLDFSFEIAGDTEQLSLGSKRDRYGSKDTIISDKLGAHYILIKGGSFTFSLTKRQESVPDFYVAKYTVTNQHYRRFI
NYLDSKEAGYASILPVETYIKSLFDLAESINGFSDFIKGEKSLATRFRSFWDDDKKLNKDYQPVIEPSWYAARAYCLWLS
LLESDRRDTDLYCLPTEKEWEYAAGGKESRTYPWGNKKPSETLANYNNNEGSTTPSGRYPEGATLEGLHDMAGNVWEWTA
DLYNQDENWRSLRGGDYSTEAGALSCYARKDRDPSIKSYSIVGFRVIRSCKF

Specific function: Together with the serine/threonine kinase pknD, may play a role in the specific interactions with host proteins during intracellular growth [H]

COG id: COG5635

COG function: function code T; Predicted NTPase (NACHT family)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 protein kinase domain [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI194248087, Length=237, Percent_Identity=29.957805907173, Blast_Score=80, Evalue=1e-14,
Organism=Homo sapiens, GI194248088, Length=252, Percent_Identity=28.968253968254, Blast_Score=79, Evalue=3e-14,
Organism=Homo sapiens, GI257470977, Length=256, Percent_Identity=27.734375, Blast_Score=78, Evalue=5e-14,
Organism=Homo sapiens, GI226437577, Length=150, Percent_Identity=35.3333333333333, Blast_Score=77, Evalue=1e-13,
Organism=Drosophila melanogaster, GI20130397, Length=336, Percent_Identity=27.3809523809524, Blast_Score=82, Evalue=2e-15,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016187
- InterPro:   IPR011009
- InterPro:   IPR000719
- InterPro:   IPR017442
- InterPro:   IPR005532 [H]

Pfam domain/function: PF03781 DUF323; PF00069 Pkinase [H]

EC number: =2.7.11.1 [H]

Molecular weight: Translated: 171129; Mature: 171129

Theoretical pI: Translated: 6.13; Mature: 6.13

Prosite motif: PS50837 NACHT

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQVDNKKTQSSISEFPEDAFLIFIGHSDDATAEAHAIYELQGRLEKDFRTFLKTNHESPF
CCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
KSLMLWEWQIDASSKPGGQNVVVTPVLHRAQIIIFVFKERVGTVTSEEIENARELSKYTR
HHHEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECHHHHHEEEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
INILAFFPAYHPESSKINNTIGARDWANLKGLYDKLTEDWSAEDSTSVTPCLPLYADIDD
EEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHH
LKNIALEKLRDAMRDIIADIKCIKVPKHSTTYSSKRIIGYIKDISFDRRPVLIHMVEELD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
KVLIEKFLSTEDSLKELPQAKHSSSIEERLAILGCVMGSRPTLGAFLCFAPSRLIIDKFS
HHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHCCC
SCSLQVVRFKGVSRTSSGVEKFSMHDNLLNLFDQGINWLTSEAHLGRQGRVGSTDRDDLE
CCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
IPKIALREALANALVHRDYEDALNRDQPTRVEVFDNRIEITSFGTLPGSVNIDQLNQYSD
CHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHH
TLRPVRRNPIIADIFQHITHVELNASGISRMRYAMQQALLPPPKIHIQNGAVVVCFTRPI
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCEEEEEECEE
FIDSNTRQPIELRKRALIGGSLSGLDAYRTAAFAVCLRSGYFPVMMEHHPNTENDEDDAI
EEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEE
RLSNTMVDYADIYIGILTNQYGYVPDTHDKSITEIEYYRVKARKEMPRLMFSLKQKTIEN
EHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
DTYENESSSQKQLNFIETVTRESLVHDVCSVDELQDKLKGLIKVANNSPFEAKEYELRYQ
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
RALKTELGIISLLGTHALENIQVTLTDTFVSLRISDTWRTDMRWNPKAPYESLQEERIRN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCC
PEEVMSLVFETCRILLVIGDPGSGKTTLLKHYALSCLENEHYTTLGFKERVLVFYLPLRE
HHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHCCHHEEEHHHHH
LVKSGVGYDTLPANLFAWSEKHSLGIAETVFFDWLHNRQTLLLFDGLDEISEPEQRIKAC
HHHCCCCCCCCCCHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHCCHHHHHHHH
DWIDRVVTGFEKANVVVTSRYTGYRKGDGIELRSHHVRADIMDFSSEQQKEFLEKWFSSV
HHHHHHHHCHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
LCSELRPGFKSLQEWTVEQKQKAAEKAATIIAFLEREENRSLRLLAAVPMLLQIMAILWK
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERHYLPKTRSELFNAAVNYLLDYRDRQKEISPLLSAEDARRVLMPVSLWMQEELQKDEAD
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KALMQNEMQKHLKTLNKPPSVEMFCANLIDRAGLLVAYGDKEYRFRHKLFREYMAGIQLE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
KKMHSSPGYLNTLVNNFGKDWWEEPLRFYISEVDADAFDAFMGKLFDSEVSAMFNQKQQD
HHHCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
LLITFIEEARQTKTDALQKKLLDSATTTNRQRYIMQCLKAIGTADALDAVRKFLDAPFEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHH
KAEVLDFSFEIAGDTEQLSLGSKRDRYGSKDTIISDKLGAHYILIKGGSFTFSLTKRQES
HHHHHEEEEEECCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCC
VPDFYVAKYTVTNQHYRRFINYLDSKEAGYASILPVETYIKSLFDLAESINGFSDFIKGE
CCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCH
KSLATRFRSFWDDDKKLNKDYQPVIEPSWYAARAYCLWLSLLESDRRDTDLYCLPTEKEW
HHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCC
EYAAGGKESRTYPWGNKKPSETLANYNNNEGSTTPSGRYPEGATLEGLHDMAGNVWEWTA
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHH
DLYNQDENWRSLRGGDYSTEAGALSCYARKDRDPSIKSYSIVGFRVIRSCKF
HHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MQVDNKKTQSSISEFPEDAFLIFIGHSDDATAEAHAIYELQGRLEKDFRTFLKTNHESPF
CCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
KSLMLWEWQIDASSKPGGQNVVVTPVLHRAQIIIFVFKERVGTVTSEEIENARELSKYTR
HHHEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECHHHHHEEEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
INILAFFPAYHPESSKINNTIGARDWANLKGLYDKLTEDWSAEDSTSVTPCLPLYADIDD
EEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHH
LKNIALEKLRDAMRDIIADIKCIKVPKHSTTYSSKRIIGYIKDISFDRRPVLIHMVEELD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
KVLIEKFLSTEDSLKELPQAKHSSSIEERLAILGCVMGSRPTLGAFLCFAPSRLIIDKFS
HHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHCCC
SCSLQVVRFKGVSRTSSGVEKFSMHDNLLNLFDQGINWLTSEAHLGRQGRVGSTDRDDLE
CCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
IPKIALREALANALVHRDYEDALNRDQPTRVEVFDNRIEITSFGTLPGSVNIDQLNQYSD
CHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHH
TLRPVRRNPIIADIFQHITHVELNASGISRMRYAMQQALLPPPKIHIQNGAVVVCFTRPI
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCEEEEEECEE
FIDSNTRQPIELRKRALIGGSLSGLDAYRTAAFAVCLRSGYFPVMMEHHPNTENDEDDAI
EEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEE
RLSNTMVDYADIYIGILTNQYGYVPDTHDKSITEIEYYRVKARKEMPRLMFSLKQKTIEN
EHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
DTYENESSSQKQLNFIETVTRESLVHDVCSVDELQDKLKGLIKVANNSPFEAKEYELRYQ
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
RALKTELGIISLLGTHALENIQVTLTDTFVSLRISDTWRTDMRWNPKAPYESLQEERIRN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCC
PEEVMSLVFETCRILLVIGDPGSGKTTLLKHYALSCLENEHYTTLGFKERVLVFYLPLRE
HHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHCCHHEEEHHHHH
LVKSGVGYDTLPANLFAWSEKHSLGIAETVFFDWLHNRQTLLLFDGLDEISEPEQRIKAC
HHHCCCCCCCCCCHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHCCHHHHHHHH
DWIDRVVTGFEKANVVVTSRYTGYRKGDGIELRSHHVRADIMDFSSEQQKEFLEKWFSSV
HHHHHHHHCHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
LCSELRPGFKSLQEWTVEQKQKAAEKAATIIAFLEREENRSLRLLAAVPMLLQIMAILWK
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERHYLPKTRSELFNAAVNYLLDYRDRQKEISPLLSAEDARRVLMPVSLWMQEELQKDEAD
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KALMQNEMQKHLKTLNKPPSVEMFCANLIDRAGLLVAYGDKEYRFRHKLFREYMAGIQLE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
KKMHSSPGYLNTLVNNFGKDWWEEPLRFYISEVDADAFDAFMGKLFDSEVSAMFNQKQQD
HHHCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
LLITFIEEARQTKTDALQKKLLDSATTTNRQRYIMQCLKAIGTADALDAVRKFLDAPFEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHH
KAEVLDFSFEIAGDTEQLSLGSKRDRYGSKDTIISDKLGAHYILIKGGSFTFSLTKRQES
HHHHHEEEEEECCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCC
VPDFYVAKYTVTNQHYRRFINYLDSKEAGYASILPVETYIKSLFDLAESINGFSDFIKGE
CCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCH
KSLATRFRSFWDDDKKLNKDYQPVIEPSWYAARAYCLWLSLLESDRRDTDLYCLPTEKEW
HHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCC
EYAAGGKESRTYPWGNKKPSETLANYNNNEGSTTPSGRYPEGATLEGLHDMAGNVWEWTA
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHH
DLYNQDENWRSLRGGDYSTEAGALSCYARKDRDPSIKSYSIVGFRVIRSCKF
HHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCC

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Structure determination priority: 9.0

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Availability: NA

References: 10684935 [H]