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The map label for this gene is 118580080

Identifier: 118580080

GI number: 118580080

Start: 1776322

End: 1778061

Strand: Direct

Name: 118580080

Synonym: Ppro_1658

Alternate gene names: NA

Gene position: 1776322-1778061 (Clockwise)

Preceding gene: 118580079

Following gene: 118580081

Centisome position: 44.32

GC content: 44.14

Gene sequence:

>1740_bases
ATGAATCAGATATTGACAAAAGCTAAATGCATCATATTCCTCTCTCTTATAGTCCTAATTGCCTATTATCCGTCTCTGTT
TGTTCCACTTAATTCCGTTGATGATTCCGGTATGTACCTTCATCTACTCAATACAGATGCTTTTACATTAGAAGGCATGT
TTTTCCCAGGCCACACCGGCAGTTATTACCGTCCCTTTGTTCTCTTGTCATTCATGATGGATAAATACGTCTGGGGGCTT
GAAGAAAGCTTCATGCATCTGGAAAATATAGTATTTCATCTTGCTAATACACTACTGCTTTTTGCCGTTACGCGAAGGGC
ATGTTCGCTTCTGAAACAAACATCTTTATTCGTCCCGTTTGCAACGGCGCTTTTCTTTGCTATCCACCCGCTCAATACCG
AAGCAGTCAACTGGATCTCCGGTCGAACCGATCTGCTGGCCGGTTTTTTTCTGTTATTGGCAATGTATTCGATGCTAAAA
AATCCATTGACTTGGCCTTGTTCGTTATTGGCTGCCATCTTTATGCTTATGGCCTGCCTTGCGAAAGAAACTGCTATTTT
TTTCCTTCCGGCAGCATTACTTTTTCCTTTCTATCTTTCTTCGCACAAGGATGAAATTGTGCCAGTAAGCATAATAGTTC
GCAGAAACCTGCCTCATTTACTTCTATTCAGTGCTGCTGGTTCCGCATACTTTGTCTTCCGAGCGTTGGCCTTCGCAAAG
GGCGATCAGGGTGTGACTCGCGTCATGACGCATGTTGCCGGAGCCGAAAGCGCCGGGATGCTGACAAGCCTGCGGTTAGT
ATTCAAGTCTATCGGTTTTTATGCAAAAAAATTGCTATTGCCGTTTCCGCTGAATTTTGGAATAACCCATATTTCGGATC
TTTATCTTCCGCTGGGAGTGCTGGTCTTGGCTGGTGTCATCTGGCTTATGTCCCGACGGACATTACCCGCCTTTTTTGTG
ATCTGTGCTGGTGCTGTAGGCACCTCGGCTCTCATGATTCCATTGCTTCGCTTGACTTGGACGCCGCTGGGCGAACGGTA
TATGTATATTCCCTCAGCTTTTTTTTTGACAGGTTTGATGTTGACGGTCGGGCGCTGGGAGCAGCAGCATGTTCGCTTTC
GTACAGCATTGGTACTCTTAGCAAGTTGTCTTTTCGGCATAGCACTCTACGGTACAGTAACTCGAAATTTTCTCTGGCAG
AACAGTTTGGCATTATTTCAGGATACTTTGAAAAAATCTCCTAATTTTACTCCGGCTCAGAATGAAATTGCTAATGCATT
GTACGCTCAGGGGAGAAAACAGGAGGCTACAGTCATCTATAAATCTTTCACTGAGTCGGAAGGTCTTATTAACGCACAGT
ATGGTCTTAAAAATAAAGCTCTTGCGTTTATGAATGAAGGTAACTTTTCCGAGGCGCGAGATATATTGAGCCAATTGCTG
GCTAACCCGGGTAAGCATGAAGTCTCTATCTTGTTACAGGTGCTAGAACTCAACAAAATTCAGGTTGCAGCGGGCAAGGC
TACAATTAAAGGTGTGTATGCTGAATCAGTTGAAACCTTAACCCGCTTAATTGCGCTTACCGGCGATCCATTTTATTCAT
ATCGTTTAGGAATTGTTCATATGCAAATAGGTGAGCGCCAGAAAGCAATAGCGTCATTTAATGCCGTTGTACGAACCGCT
GCACCTACTGCGTATTACAGAAAACCGGCTGAAAAGCTGGCTAAAGAACTTGCTATGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTGCTGATTTTACTGGTACATGGACATCTATGTAATGTTTGAATAATTTAAACTTTAAAGCGGGATGTTTCGACATCCC
GCTTTTTTTGTGAGCATCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATCAAAAGCTTATATCAGATTGGTAGGGAAAACGTATGACTTCAATTATAGGTATAACTCTCAAGGGTATTTTCCGCGA
CCGGGTGTTTCAGGGCATCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Tetratricopeptide TPR_2 Repeat Protein; TPR Domain-Containing Protein; TPR Domain Protein

Number of amino acids: Translated: 579; Mature: 579

Protein sequence:

>579_residues
MNQILTKAKCIIFLSLIVLIAYYPSLFVPLNSVDDSGMYLHLLNTDAFTLEGMFFPGHTGSYYRPFVLLSFMMDKYVWGL
EESFMHLENIVFHLANTLLLFAVTRRACSLLKQTSLFVPFATALFFAIHPLNTEAVNWISGRTDLLAGFFLLLAMYSMLK
NPLTWPCSLLAAIFMLMACLAKETAIFFLPAALLFPFYLSSHKDEIVPVSIIVRRNLPHLLLFSAAGSAYFVFRALAFAK
GDQGVTRVMTHVAGAESAGMLTSLRLVFKSIGFYAKKLLLPFPLNFGITHISDLYLPLGVLVLAGVIWLMSRRTLPAFFV
ICAGAVGTSALMIPLLRLTWTPLGERYMYIPSAFFLTGLMLTVGRWEQQHVRFRTALVLLASCLFGIALYGTVTRNFLWQ
NSLALFQDTLKKSPNFTPAQNEIANALYAQGRKQEATVIYKSFTESEGLINAQYGLKNKALAFMNEGNFSEARDILSQLL
ANPGKHEVSILLQVLELNKIQVAAGKATIKGVYAESVETLTRLIALTGDPFYSYRLGIVHMQIGERQKAIASFNAVVRTA
APTAYYRKPAEKLAKELAM

Sequences:

>Translated_579_residues
MNQILTKAKCIIFLSLIVLIAYYPSLFVPLNSVDDSGMYLHLLNTDAFTLEGMFFPGHTGSYYRPFVLLSFMMDKYVWGL
EESFMHLENIVFHLANTLLLFAVTRRACSLLKQTSLFVPFATALFFAIHPLNTEAVNWISGRTDLLAGFFLLLAMYSMLK
NPLTWPCSLLAAIFMLMACLAKETAIFFLPAALLFPFYLSSHKDEIVPVSIIVRRNLPHLLLFSAAGSAYFVFRALAFAK
GDQGVTRVMTHVAGAESAGMLTSLRLVFKSIGFYAKKLLLPFPLNFGITHISDLYLPLGVLVLAGVIWLMSRRTLPAFFV
ICAGAVGTSALMIPLLRLTWTPLGERYMYIPSAFFLTGLMLTVGRWEQQHVRFRTALVLLASCLFGIALYGTVTRNFLWQ
NSLALFQDTLKKSPNFTPAQNEIANALYAQGRKQEATVIYKSFTESEGLINAQYGLKNKALAFMNEGNFSEARDILSQLL
ANPGKHEVSILLQVLELNKIQVAAGKATIKGVYAESVETLTRLIALTGDPFYSYRLGIVHMQIGERQKAIASFNAVVRTA
APTAYYRKPAEKLAKELAM
>Mature_579_residues
MNQILTKAKCIIFLSLIVLIAYYPSLFVPLNSVDDSGMYLHLLNTDAFTLEGMFFPGHTGSYYRPFVLLSFMMDKYVWGL
EESFMHLENIVFHLANTLLLFAVTRRACSLLKQTSLFVPFATALFFAIHPLNTEAVNWISGRTDLLAGFFLLLAMYSMLK
NPLTWPCSLLAAIFMLMACLAKETAIFFLPAALLFPFYLSSHKDEIVPVSIIVRRNLPHLLLFSAAGSAYFVFRALAFAK
GDQGVTRVMTHVAGAESAGMLTSLRLVFKSIGFYAKKLLLPFPLNFGITHISDLYLPLGVLVLAGVIWLMSRRTLPAFFV
ICAGAVGTSALMIPLLRLTWTPLGERYMYIPSAFFLTGLMLTVGRWEQQHVRFRTALVLLASCLFGIALYGTVTRNFLWQ
NSLALFQDTLKKSPNFTPAQNEIANALYAQGRKQEATVIYKSFTESEGLINAQYGLKNKALAFMNEGNFSEARDILSQLL
ANPGKHEVSILLQVLELNKIQVAAGKATIKGVYAESVETLTRLIALTGDPFYSYRLGIVHMQIGERQKAIASFNAVVRTA
APTAYYRKPAEKLAKELAM

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Caenorhabditis elegans, GI17560436, Length=141, Percent_Identity=34.7517730496454, Blast_Score=75, Evalue=1e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64510; Mature: 64510

Theoretical pI: Translated: 9.72; Mature: 9.72

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNQILTKAKCIIFLSLIVLIAYYPSLFVPLNSVDDSGMYLHLLNTDAFTLEGMFFPGHTG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCCC
SYYRPFVLLSFMMDKYVWGLEESFMHLENIVFHLANTLLLFAVTRRACSLLKQTSLFVPF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ATALFFAIHPLNTEAVNWISGRTDLLAGFFLLLAMYSMLKNPLTWPCSLLAAIFMLMACL
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AKETAIFFLPAALLFPFYLSSHKDEIVPVSIIVRRNLPHLLLFSAAGSAYFVFRALAFAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHC
GDQGVTRVMTHVAGAESAGMLTSLRLVFKSIGFYAKKLLLPFPLNFGITHISDLYLPLGV
CCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LVLAGVIWLMSRRTLPAFFVICAGAVGTSALMIPLLRLTWTPLGERYMYIPSAFFLTGLM
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHH
LTVGRWEQQHVRFRTALVLLASCLFGIALYGTVTRNFLWQNSLALFQDTLKKSPNFTPAQ
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
NEIANALYAQGRKQEATVIYKSFTESEGLINAQYGLKNKALAFMNEGNFSEARDILSQLL
HHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEHHCCCCCCEEECCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
ANPGKHEVSILLQVLELNKIQVAAGKATIKGVYAESVETLTRLIALTGDPFYSYRLGIVH
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEE
MQIGERQKAIASFNAVVRTAAPTAYYRKPAEKLAKELAM
EECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNQILTKAKCIIFLSLIVLIAYYPSLFVPLNSVDDSGMYLHLLNTDAFTLEGMFFPGHTG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCCC
SYYRPFVLLSFMMDKYVWGLEESFMHLENIVFHLANTLLLFAVTRRACSLLKQTSLFVPF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ATALFFAIHPLNTEAVNWISGRTDLLAGFFLLLAMYSMLKNPLTWPCSLLAAIFMLMACL
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AKETAIFFLPAALLFPFYLSSHKDEIVPVSIIVRRNLPHLLLFSAAGSAYFVFRALAFAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHC
GDQGVTRVMTHVAGAESAGMLTSLRLVFKSIGFYAKKLLLPFPLNFGITHISDLYLPLGV
CCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LVLAGVIWLMSRRTLPAFFVICAGAVGTSALMIPLLRLTWTPLGERYMYIPSAFFLTGLM
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHH
LTVGRWEQQHVRFRTALVLLASCLFGIALYGTVTRNFLWQNSLALFQDTLKKSPNFTPAQ
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
NEIANALYAQGRKQEATVIYKSFTESEGLINAQYGLKNKALAFMNEGNFSEARDILSQLL
HHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEHHCCCCCCEEECCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
ANPGKHEVSILLQVLELNKIQVAAGKATIKGVYAESVETLTRLIALTGDPFYSYRLGIVH
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEE
MQIGERQKAIASFNAVVRTAAPTAYYRKPAEKLAKELAM
EECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA