| Definition | Pelobacter propionicus DSM 2379 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008609 |
| Length | 4,008,000 |
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The map label for this gene is 118579436
Identifier: 118579436
GI number: 118579436
Start: 1047545
End: 1053157
Strand: Direct
Name: 118579436
Synonym: Ppro_1001
Alternate gene names: NA
Gene position: 1047545-1053157 (Clockwise)
Preceding gene: 118579435
Following gene: 118579437
Centisome position: 26.14
GC content: 37.07
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGATATTGCTATGCAGTGACAGAGACCCATGAGCACAGTACTTGATATAGACAAATAATACTTGCCATGACCTCACTTAC CATCTCCATCAACCTCTTCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1870; Mature: 1869
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_1870_residues MSIDQLAHQLHDVFAASKKAYAVQDNDGYKTKYARLSPYTIRRMLQNKLSIMTYQMVNMSDVKWLCLDFDMPNQVIGEGA EPKKDLLKDLLQVVKGACVQLDALSISYLVEFSGNRGFHIWIILDRYISKAFGYEINTKIMELIDITEPFSVDLFPTTAK ISKEGIGKGVKLPCSCHVKSGCYSFLISNVYEADTINIYKNELNNTFIDSQISILNDLKRQNPKEIMNALGLSEQLVDRR SYDKFIKTSSITVTGDDEVSIDSVLNDLSGCSFLKAILKNYRLGLTEKERVIIVGLLSKIQSDNDPFFGNKLLEELFSRM PNYRPELTRKKLECLKLQPVTCEYLRHFRSDEKCSCLDGTKKSPIEHIRGVAIADNDPFAYEPMETEKVITAASKYTYQN DEVAMPTVLLKLEDMKGNNLEAVWHSVLHEVRPLKKFYTFRRQEEDKVRILITLTAKEKVLTKLAIKALHAFYYPGFSDC SYGYRFNYSLSNNNLFYPWLQQWNIFTKEIKNIVDDENAESMYVVKLDIKGFYSNIDREMLRIKLVDGPTDEIRVAFKSL GETEIDKIKVLASWFISICDATVEGKKGVPQGPAFARYLAELYLMDFDRFIERMVSGSLGRYFRYVDDVFVFVDTEAEAA SILAYATNFLKSLGLHLSHGKCFVGTIAQYKPEISRYFSRAKYVVDHAKLQTDHSGKITNAITTLFSLLRNDGDGGQINE SNLPFFLTHLSQHRLVHERLVKLEEYVLRMNRGRGSLFRNFFKRYIETTTNSLRHVDDLQALTGGLKREVFISSILSKII SGGDVSAYKNELRGVLTKYAMSQDLTVVEKELLGVIMLHDQDICDVEFLSKISPTLLSEIMQVPIAKNIPPAVVPYIAAR IVGLEATDFLRSAYSMVRTTKLENVVAYRELGATFLKKFINDMGANQPTDYKFEFIQSVDDAQKFHHLLAFFTVIVEDVE VTFEAIINVWHAFMYFLNNRQLDYGKKLDQDSWLVEWDKIELLPGKVTSLLTLSLTDGFVKGYNCELRLYEAFYKNIVIL MVVNEPSNGISIMEGISSPLAEVLERDKRLYLKWIIEGGKTVQPYPNKAVCISNILINDRLVLRKGNDYLVRVRRLDHVS ESLLSETGMVIHEEGQWDPGYQTFTFNFNAKKQTIEEILNGANSVLATVSELIKLKFGIESSCQRCFGSDAESYSSTGQF DEYISDSLSPLVPLALCDNHIFDITYKKVVSNSINGFLEIVFENMVTVNKPMYNLRYPFNFSSKDIVKKLVPPKLRSDKN AMLQYLKQMYIDKTMSYDDNNPYEVERAKISGIIRYKIGRKEIITSTDISGILYDYHSLFEHKDEKHKLLLKVTDIKISP DITSFIDIYKTIIVSINSFYSMAQDTDTIPKLPDLLFNDLTRIVVTVNGFIENGFDALPIAYNEGFLLKEALPLDLTWLN QCDITADKINVTFGIDETISFGAITLSADEASNLVMVMALGGKSIELSKFEIDTVELMISNQCFLAKHENELLVIVMSSS VMRTFEAISARALALSRTNEWELGHSRECYYNTFDVQDELYKSRSFNDALENLMSHLQCKDKSLMFSRIAEWLRLFNPED QKVLVEVIAAHRCISDEDITKFLRFLDDNASTPGVVIGSLKTSADFGGLYRLLADAAYPHARKLQLDSWPSRLIDRSLSI EELVVLNDVFISGNQVISALEKYYFLNHDPILAQDKNYHMIPGDNSLAFIEVVKNLKRITFFAAVCTETAQNEIKQFVEK WYKQEVGVIPEIIVDAALIIDIKSVQLDNNPNILTKYQGRFREMITKEKMSAIFEFNDDIPLKFYNDHKIPDTKNLLIRI KSVPKRVFKIFVLQPKDKSVKPLFNCIFEP >Mature_1869_residues SIDQLAHQLHDVFAASKKAYAVQDNDGYKTKYARLSPYTIRRMLQNKLSIMTYQMVNMSDVKWLCLDFDMPNQVIGEGAE PKKDLLKDLLQVVKGACVQLDALSISYLVEFSGNRGFHIWIILDRYISKAFGYEINTKIMELIDITEPFSVDLFPTTAKI SKEGIGKGVKLPCSCHVKSGCYSFLISNVYEADTINIYKNELNNTFIDSQISILNDLKRQNPKEIMNALGLSEQLVDRRS YDKFIKTSSITVTGDDEVSIDSVLNDLSGCSFLKAILKNYRLGLTEKERVIIVGLLSKIQSDNDPFFGNKLLEELFSRMP NYRPELTRKKLECLKLQPVTCEYLRHFRSDEKCSCLDGTKKSPIEHIRGVAIADNDPFAYEPMETEKVITAASKYTYQND EVAMPTVLLKLEDMKGNNLEAVWHSVLHEVRPLKKFYTFRRQEEDKVRILITLTAKEKVLTKLAIKALHAFYYPGFSDCS YGYRFNYSLSNNNLFYPWLQQWNIFTKEIKNIVDDENAESMYVVKLDIKGFYSNIDREMLRIKLVDGPTDEIRVAFKSLG ETEIDKIKVLASWFISICDATVEGKKGVPQGPAFARYLAELYLMDFDRFIERMVSGSLGRYFRYVDDVFVFVDTEAEAAS ILAYATNFLKSLGLHLSHGKCFVGTIAQYKPEISRYFSRAKYVVDHAKLQTDHSGKITNAITTLFSLLRNDGDGGQINES NLPFFLTHLSQHRLVHERLVKLEEYVLRMNRGRGSLFRNFFKRYIETTTNSLRHVDDLQALTGGLKREVFISSILSKIIS GGDVSAYKNELRGVLTKYAMSQDLTVVEKELLGVIMLHDQDICDVEFLSKISPTLLSEIMQVPIAKNIPPAVVPYIAARI VGLEATDFLRSAYSMVRTTKLENVVAYRELGATFLKKFINDMGANQPTDYKFEFIQSVDDAQKFHHLLAFFTVIVEDVEV TFEAIINVWHAFMYFLNNRQLDYGKKLDQDSWLVEWDKIELLPGKVTSLLTLSLTDGFVKGYNCELRLYEAFYKNIVILM VVNEPSNGISIMEGISSPLAEVLERDKRLYLKWIIEGGKTVQPYPNKAVCISNILINDRLVLRKGNDYLVRVRRLDHVSE SLLSETGMVIHEEGQWDPGYQTFTFNFNAKKQTIEEILNGANSVLATVSELIKLKFGIESSCQRCFGSDAESYSSTGQFD EYISDSLSPLVPLALCDNHIFDITYKKVVSNSINGFLEIVFENMVTVNKPMYNLRYPFNFSSKDIVKKLVPPKLRSDKNA MLQYLKQMYIDKTMSYDDNNPYEVERAKISGIIRYKIGRKEIITSTDISGILYDYHSLFEHKDEKHKLLLKVTDIKISPD ITSFIDIYKTIIVSINSFYSMAQDTDTIPKLPDLLFNDLTRIVVTVNGFIENGFDALPIAYNEGFLLKEALPLDLTWLNQ CDITADKINVTFGIDETISFGAITLSADEASNLVMVMALGGKSIELSKFEIDTVELMISNQCFLAKHENELLVIVMSSSV MRTFEAISARALALSRTNEWELGHSRECYYNTFDVQDELYKSRSFNDALENLMSHLQCKDKSLMFSRIAEWLRLFNPEDQ KVLVEVIAAHRCISDEDITKFLRFLDDNASTPGVVIGSLKTSADFGGLYRLLADAAYPHARKLQLDSWPSRLIDRSLSIE ELVVLNDVFISGNQVISALEKYYFLNHDPILAQDKNYHMIPGDNSLAFIEVVKNLKRITFFAAVCTETAQNEIKQFVEKW YKQEVGVIPEIIVDAALIIDIKSVQLDNNPNILTKYQGRFREMITKEKMSAIFEFNDDIPLKFYNDHKIPDTKNLLIRIK SVPKRVFKIFVLQPKDKSVKPLFNCIFEP
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 213741; Mature: 213609
Theoretical pI: Translated: 6.23; Mature: 6.23
Prosite motif: PS50878 RT_POL ; PS00173 XYLOSE_ISOMERASE_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSIDQLAHQLHDVFAASKKAYAVQDNDGYKTKYARLSPYTIRRMLQNKLSIMTYQMVNMS CCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCC DVKWLCLDFDMPNQVIGEGAEPKKDLLKDLLQVVKGACVQLDALSISYLVEFSGNRGFHI CCEEEEEECCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHEEEEEEEEECCCCCEEE WIILDRYISKAFGYEINTKIMELIDITEPFSVDLFPTTAKISKEGIGKGVKLPCSCHVKS EEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHH GCYSFLISNVYEADTINIYKNELNNTFIDSQISILNDLKRQNPKEIMNALGLSEQLVDRR HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHH SYDKFIKTSSITVTGDDEVSIDSVLNDLSGCSFLKAILKNYRLGLTEKERVIIVGLLSKI HHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHH QSDNDPFFGNKLLEELFSRMPNYRPELTRKKLECLKLQPVTCEYLRHFRSDEKCSCLDGT CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCC KKSPIEHIRGVAIADNDPFAYEPMETEKVITAASKYTYQNDEVAMPTVLLKLEDMKGNNL CCCCHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCEECCCCEECCEEEEEEECCCCCCH EAVWHSVLHEVRPLKKFYTFRRQEEDKVRILITLTAKEKVLTKLAIKALHAFYYPGFSDC 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