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The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 118480156

GI number: 118480156

Start: 4851872

End: 4853074

Strand: Reverse

Name: yfiS [H]

Synonym: BALH_4610

Alternate gene names: 118480156

Gene position: 4853074-4851872 (Counterclockwise)

Preceding gene: 118480157

Following gene: 118480155

Centisome position: 92.31

GC content: 36.08

Gene sequence:

>1203_bases
GTGAAACGTATGATTGAAAACAATTGGAAAATGAAAATTATATTATTTTTGACTGCTCAAACTATTTCGTTGTTCGGTTC
ATCTCTCGTGCAGTACGCAATTATATGGTATATCACCTTAACAACATCGTCAGGGTTAATGTTGACTATTTCAACTGTTT
GCGGTTTCCTACCACAAATTGCGATATCTTTGTTTGCAGGTGTTTGGATTGATCGTTATGACCGTAAAAAGATGATTATG
TTATCAGACGGGGTTATAGCGGTTGCTACGTTAGTTTTAGCGATTTTCTTTTTAACAGGATATAAAAGTATTTGGTTACT
TTTTATAGTACTACTCATTCGTTCAGCTGGGACAGGGGTACAAACGCCAGCTGTGAATGCATTAATTCCGCAAATTGTTC
CGAAAGATTATCTTATGAAAGTAAATGGGATCAATAGCAGTATTACATCTTTAATTATGTTTCTTTCTCCAGCAGCAAGT
GCTGCGATTCTTTCTATTGCCAGCATTGAAACAACATTTTTTATTGATGTTATGACAGCTATGATTGGAATTAGTATTAT
GTTTATCATCCAAGTGGAAGGACATGTGAATGTAGAGAGTAAGCAAAAATCCAATCTGCAAGGTATAAAAGAAGGTTTTG
TTTATTTAAGAGAAAATGTATTTATTAAAAGGCTACTCGTTTTATTAATCATTGTCATGATTTTAATAAGTCCAGCTGCC
TTTTTAACACCTTTAATGGTAACTCGTTCTTTCGGTGCAGAAATGTGGAGACTTACTGCTAGTGAGATGACTTTTAGTGC
GGGGGCAGCAGCTGGTGGAGTATTGATCGCGGCGTGGGGTGGCTTTCGTAATCGTATGCATACAACAGCGCTAGCTTGTG
CGTTATATGGACTGCTTATGATTGGATTAGGGATTGCACCAATATTTATTATGTATTTACTATTTAATTTTTTAATTGGT
ATAACAATGCCGTGCTTCAATACACCAGTTACCGTGTTATTACAGGAAAAAGTAGAACCTTCGATGCATGGGCGGATGTT
TAGTGTTGTACAAATCGCTAATTCATGCGCGCTTCCTTTAGGAATGATACTATTTGGCCCATTGGCTGATATGTTTCGTG
TAGAAATTTTATTAATTTATGCTGGGATATTCGTGCTGTTGTGTGCGATTTATGTTGTAGTAAGTAAGAGATTTGAAGTG
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGTTTAAGGGCAGCATTATACTCGTATCTCACGAAGCAAGTTTTTATCTTGATTGGGCAGATAGTATCTTTCATATAGAG
ACAGGATTAGTTAAGGGGGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATTCATGATTAAAAAGGTTTGTGAAGTGATTTAAGGTGCTTCATAAACCTTTTGTTTTAATTACAAATCAATAATCAT
TTATTGAAAAACGATAAAAA

Product: macrolide-efflux protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 400; Mature: 400

Protein sequence:

>400_residues
MKRMIENNWKMKIILFLTAQTISLFGSSLVQYAIIWYITLTTSSGLMLTISTVCGFLPQIAISLFAGVWIDRYDRKKMIM
LSDGVIAVATLVLAIFFLTGYKSIWLLFIVLLIRSAGTGVQTPAVNALIPQIVPKDYLMKVNGINSSITSLIMFLSPAAS
AAILSIASIETTFFIDVMTAMIGISIMFIIQVEGHVNVESKQKSNLQGIKEGFVYLRENVFIKRLLVLLIIVMILISPAA
FLTPLMVTRSFGAEMWRLTASEMTFSAGAAAGGVLIAAWGGFRNRMHTTALACALYGLLMIGLGIAPIFIMYLLFNFLIG
ITMPCFNTPVTVLLQEKVEPSMHGRMFSVVQIANSCALPLGMILFGPLADMFRVEILLIYAGIFVLLCAIYVVVSKRFEV

Sequences:

>Translated_400_residues
MKRMIENNWKMKIILFLTAQTISLFGSSLVQYAIIWYITLTTSSGLMLTISTVCGFLPQIAISLFAGVWIDRYDRKKMIM
LSDGVIAVATLVLAIFFLTGYKSIWLLFIVLLIRSAGTGVQTPAVNALIPQIVPKDYLMKVNGINSSITSLIMFLSPAAS
AAILSIASIETTFFIDVMTAMIGISIMFIIQVEGHVNVESKQKSNLQGIKEGFVYLRENVFIKRLLVLLIIVMILISPAA
FLTPLMVTRSFGAEMWRLTASEMTFSAGAAAGGVLIAAWGGFRNRMHTTALACALYGLLMIGLGIAPIFIMYLLFNFLIG
ITMPCFNTPVTVLLQEKVEPSMHGRMFSVVQIANSCALPLGMILFGPLADMFRVEILLIYAGIFVLLCAIYVVVSKRFEV
>Mature_400_residues
MKRMIENNWKMKIILFLTAQTISLFGSSLVQYAIIWYITLTTSSGLMLTISTVCGFLPQIAISLFAGVWIDRYDRKKMIM
LSDGVIAVATLVLAIFFLTGYKSIWLLFIVLLIRSAGTGVQTPAVNALIPQIVPKDYLMKVNGINSSITSLIMFLSPAAS
AAILSIASIETTFFIDVMTAMIGISIMFIIQVEGHVNVESKQKSNLQGIKEGFVYLRENVFIKRLLVLLIIVMILISPAA
FLTPLMVTRSFGAEMWRLTASEMTFSAGAAAGGVLIAAWGGFRNRMHTTALACALYGLLMIGLGIAPIFIMYLLFNFLIG
ITMPCFNTPVTVLLQEKVEPSMHGRMFSVVQIANSCALPLGMILFGPLADMFRVEILLIYAGIFVLLCAIYVVVSKRFEV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44011; Mature: 44011

Theoretical pI: Translated: 9.63; Mature: 9.63

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
5.8 %Met     (Translated Protein)
7.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
5.8 %Met     (Mature Protein)
7.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKRMIENNWKMKIILFLTAQTISLFGSSLVQYAIIWYITLTTSSGLMLTISTVCGFLPQI
CCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHH
AISLFAGVWIDRYDRKKMIMLSDGVIAVATLVLAIFFLTGYKSIWLLFIVLLIRSAGTGV
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
QTPAVNALIPQIVPKDYLMKVNGINSSITSLIMFLSPAASAAILSIASIETTFFIDVMTA
CCCCHHHHHHHHCCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MIGISIMFIIQVEGHVNVESKQKSNLQGIKEGFVYLRENVFIKRLLVLLIIVMILISPAA
HHHHHEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
FLTPLMVTRSFGAEMWRLTASEMTFSAGAAAGGVLIAAWGGFRNRMHTTALACALYGLLM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLGIAPIFIMYLLFNFLIGITMPCFNTPVTVLLQEKVEPSMHGRMFSVVQIANSCALPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
GMILFGPLADMFRVEILLIYAGIFVLLCAIYVVVSKRFEV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKRMIENNWKMKIILFLTAQTISLFGSSLVQYAIIWYITLTTSSGLMLTISTVCGFLPQI
CCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHH
AISLFAGVWIDRYDRKKMIMLSDGVIAVATLVLAIFFLTGYKSIWLLFIVLLIRSAGTGV
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
QTPAVNALIPQIVPKDYLMKVNGINSSITSLIMFLSPAASAAILSIASIETTFFIDVMTA
CCCCHHHHHHHHCCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MIGISIMFIIQVEGHVNVESKQKSNLQGIKEGFVYLRENVFIKRLLVLLIIVMILISPAA
HHHHHEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
FLTPLMVTRSFGAEMWRLTASEMTFSAGAAAGGVLIAAWGGFRNRMHTTALACALYGLLM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLGIAPIFIMYLLFNFLIGITMPCFNTPVTVLLQEKVEPSMHGRMFSVVQIANSCALPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
GMILFGPLADMFRVEILLIYAGIFVLLCAIYVVVSKRFEV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]