| Definition | Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008600 |
| Length | 5,257,091 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 118478986
Identifier: 118478986
GI number: 118478986
Start: 3597345
End: 3600158
Strand: Reverse
Name: 118478986
Synonym: BALH_3393
Alternate gene names: NA
Gene position: 3600158-3597345 (Counterclockwise)
Preceding gene: 118478988
Following gene: 118478982
Centisome position: 68.48
GC content: 31.02
Gene sequence:
>2814_bases ATGTATTTTCAAGATATAGTGGGGGAAAAGATGAGATTAGAAAAACAATTAATAAAAAAGATGTATTATGAAACATTCCT AATGGAGAATGAAACAAAACCAACTCTTGACGTGCTTGGACAAGCTTATGTAAACGAAGAAAAAAATGAGATTTCTGATG GATCTTATATTCGTTTTGCGCAAGGTGAATTTTATTATCGCCATCAAGATTTTGAAGCAGCTATTTTTAAATGGGAGAAG GTTAGTAATGAATTAGCACCATGGGCACAAAAAAATATTGCAGATGCTTATTTCGAACTGAATCAATTATCAGTTGCTGA AAATGTTTATACTTCCATTACGACTGATAATAAAATATTGATGACTGAAATTAGATTACAATTACTTTCTCTTTACATAG AGCAAAATAATTTTGACTCAGCTTTCGCTGTTATTAAAGAAGCGGTTTCTTTAAATCCGGATTATCCGAATGTCACAAAA ATTGCCCGTTCCTTTTATGAGGAACAACAAGATTTTGATAGTGCAGTAGAGCTTGCTGTGAATGAGTTAATTCGAATAGA ATCTTATCCGTGGTTTGAGGTGTTAAAAGGATATATCGATAAAGGATTTACTAAACATATTTCACCAGATTATTTTTATG ATGCATTAGTTACATTAAATAATGTAGATCAAGTACAATTTACGCAAATGGTTTCATCACTTTGGAACAGTTATAGAAAT GAACAAAATTACTTATTATGGCTTAACACAATAAATGAATTTTTCTTACATATTGAAATACATTCGTCCGATATATGGAA CAAAATTTCTTCTCTTTACGAAGAAACGTACTTTGCATTAATTCAAGGGCAATATATGCTTAGACAATTACACGATATCA TTCCAAATTTGTTAACAAATTGGTTAAAGGTGGTCAATCCGTCTTATGCTGCATTTCCATCAGCAGCTGTATTGGCGTGG GATGAGATTTTTCCTTCCAAAATAGATTCAGCAAATGTAAAAAATGCGGAAAACTTACTGTCATATTCTATTAATCATGT GAATGGTTTAGAGTACAGTTTACATCTTTTTGAATCTATTACAGATTGGGCACAAAAGCATAATATAGAAATAGGTCAAC GATTTAGATGGTTAGTTGACGAACTTGCAGATTTAAGAACAAATCGTATTTTAGTAACAGGAACTTCAGGGAACGGAAAA ACTACATTTATCAACTCTATATTAGGAGAAAATATATTAGAAAAATCAATTTCAAATGTAGTAGTTTTAAAAAATGATGC TCACACAGAAATTAACGCCATAACAGATGCTGCAATTACAACAACGGAAGATATCTCTGATTATCATAATATGATGTCTC AGCACCATCAAACGTATAGAGATAGAGCATGTGTTGAATTTAAATTACCATGTAGATTTTTAAATGAAAATAAACTTACA TTTGTAGTTACACCTGGATTTAATAGGAATAATGACACTAGGGATGAGGTATTTGAATATCTAAATTCTGTGGATGAATT ATTGTTTGTACTGAATGCGGATTCACCGTTTACTGATAAAGAGCGTGATATTTTATTAAGCATTCAAGAACATACACCAA ATTTACAAATTCATTTCTTATTAAATAAAATCGATAACATTTACAGTGAAGCAGAAGTGAAAAGAGTATTACAAGATACA GCAGCGAGAATAAACACATATTTCCCGCAAGCGAGAATTTTTCCTTATTCTTCGTTATATACAAGTAGCCAACAATTAAC TGAGTTAACTGAGTTTATTCATTTTAACTTTAATCATAAAAATATTGATGCAGAACGTACTGAAAAGCTATTGTTCTTCA TCCGAAAAACAATTACATATCTTTTAAATAAACGTGTTGAAAAAGAAAACAATCTCGTGGATGCTATTAAGTGGAATGAA GATATGATAGTGAAACTAAATGGTAGTATTAATAATCTTACTGCATTTGAGAGGGAGAAAATTCATTTCATTACACAGTC ATATCGTACAATGAAAACGGAAATTACAAATGATCTTACTCAAAATATACCGAAGATATTACAGAGCTGTTCTGATTTAA TGAGTGAAGAAAGTGATTTCGGTCATATGGATAAGGAACTAAATAAAGCAATGAATGAAAGAGTGCATAAATATTTAGAA CAAACTGTATTACCTCATCTTGCTCTTTCTATGCAAAATTGGATTGCAACTTCTCATAATGAGCTCCTTCAAAGTCAGTC TTACTTAGAAGAGCTTAGTGAAGGACTTAATTCTTTATTTGGAGAAAATCGAATCCAGTTAGAATGTGACTTTAAAGTGC TTGACGATTGGCGCAGAGATGCTGACAGAATGACGACTAGCATACAAATGGATGAAGTAAATATTTTACGTCGATTTACG CCAGCGCAATTTTTACTGAAAAGTGCCGGTAAATTATTTGGAGTTCTTCCTAAAAATAAAATTATGCTGTATAACAAATA CAAACAGCATGTAGAAAATGAAGATTATACCGAGGTAACGGATTCTATTATGAAGAAATTTTTCTTGCAATTTGAGCTAT TTGAAAACACACAAGAGCGAGATATTCATATATTCTTTAGGAATCCATTTAACTGTTTGAAACAAACAGTAGAAAATATG CAATTAGAAATACAAGAAAAACAAGAGCTGTTACATAAGATGAAATCAAATCCTGAAGTCTATCATGACTCTATCATGCT CTTTGAACTGAGATTACGTCAATGTGAAGTGATTTTACATATAGGTGATGATTATACTTATGCAGATGTAACTTTAGAAG CAAGTGTAGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAATCTTACTTGAAAAATGAAAGGAAAATGAAATTTTCCAAAAGATATTCTTTGTTAAGATAAAAAGCATACATAAATAA AGTGTTGACATATCTTAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGTAAAATATATGAGATTTTTTATTTGAAATGGCATCACGTGTTAGAAGAGAATAAAAGGGAGCAACTGTAATGAGTTG CTCCCTTTTCATATTTAAAT
Product: TPR repeat-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: Tetratricopeptide Repeat Family Protein; Dynamin Family Protein
Number of amino acids: Translated: 937; Mature: 937
Protein sequence:
>937_residues MYFQDIVGEKMRLEKQLIKKMYYETFLMENETKPTLDVLGQAYVNEEKNEISDGSYIRFAQGEFYYRHQDFEAAIFKWEK VSNELAPWAQKNIADAYFELNQLSVAENVYTSITTDNKILMTEIRLQLLSLYIEQNNFDSAFAVIKEAVSLNPDYPNVTK IARSFYEEQQDFDSAVELAVNELIRIESYPWFEVLKGYIDKGFTKHISPDYFYDALVTLNNVDQVQFTQMVSSLWNSYRN EQNYLLWLNTINEFFLHIEIHSSDIWNKISSLYEETYFALIQGQYMLRQLHDIIPNLLTNWLKVVNPSYAAFPSAAVLAW DEIFPSKIDSANVKNAENLLSYSINHVNGLEYSLHLFESITDWAQKHNIEIGQRFRWLVDELADLRTNRILVTGTSGNGK TTFINSILGENILEKSISNVVVLKNDAHTEINAITDAAITTTEDISDYHNMMSQHHQTYRDRACVEFKLPCRFLNENKLT FVVTPGFNRNNDTRDEVFEYLNSVDELLFVLNADSPFTDKERDILLSIQEHTPNLQIHFLLNKIDNIYSEAEVKRVLQDT AARINTYFPQARIFPYSSLYTSSQQLTELTEFIHFNFNHKNIDAERTEKLLFFIRKTITYLLNKRVEKENNLVDAIKWNE DMIVKLNGSINNLTAFEREKIHFITQSYRTMKTEITNDLTQNIPKILQSCSDLMSEESDFGHMDKELNKAMNERVHKYLE QTVLPHLALSMQNWIATSHNELLQSQSYLEELSEGLNSLFGENRIQLECDFKVLDDWRRDADRMTTSIQMDEVNILRRFT PAQFLLKSAGKLFGVLPKNKIMLYNKYKQHVENEDYTEVTDSIMKKFFLQFELFENTQERDIHIFFRNPFNCLKQTVENM QLEIQEKQELLHKMKSNPEVYHDSIMLFELRLRQCEVILHIGDDYTYADVTLEASVE
Sequences:
>Translated_937_residues MYFQDIVGEKMRLEKQLIKKMYYETFLMENETKPTLDVLGQAYVNEEKNEISDGSYIRFAQGEFYYRHQDFEAAIFKWEK VSNELAPWAQKNIADAYFELNQLSVAENVYTSITTDNKILMTEIRLQLLSLYIEQNNFDSAFAVIKEAVSLNPDYPNVTK IARSFYEEQQDFDSAVELAVNELIRIESYPWFEVLKGYIDKGFTKHISPDYFYDALVTLNNVDQVQFTQMVSSLWNSYRN EQNYLLWLNTINEFFLHIEIHSSDIWNKISSLYEETYFALIQGQYMLRQLHDIIPNLLTNWLKVVNPSYAAFPSAAVLAW DEIFPSKIDSANVKNAENLLSYSINHVNGLEYSLHLFESITDWAQKHNIEIGQRFRWLVDELADLRTNRILVTGTSGNGK TTFINSILGENILEKSISNVVVLKNDAHTEINAITDAAITTTEDISDYHNMMSQHHQTYRDRACVEFKLPCRFLNENKLT FVVTPGFNRNNDTRDEVFEYLNSVDELLFVLNADSPFTDKERDILLSIQEHTPNLQIHFLLNKIDNIYSEAEVKRVLQDT AARINTYFPQARIFPYSSLYTSSQQLTELTEFIHFNFNHKNIDAERTEKLLFFIRKTITYLLNKRVEKENNLVDAIKWNE DMIVKLNGSINNLTAFEREKIHFITQSYRTMKTEITNDLTQNIPKILQSCSDLMSEESDFGHMDKELNKAMNERVHKYLE QTVLPHLALSMQNWIATSHNELLQSQSYLEELSEGLNSLFGENRIQLECDFKVLDDWRRDADRMTTSIQMDEVNILRRFT PAQFLLKSAGKLFGVLPKNKIMLYNKYKQHVENEDYTEVTDSIMKKFFLQFELFENTQERDIHIFFRNPFNCLKQTVENM QLEIQEKQELLHKMKSNPEVYHDSIMLFELRLRQCEVILHIGDDYTYADVTLEASVE >Mature_937_residues MYFQDIVGEKMRLEKQLIKKMYYETFLMENETKPTLDVLGQAYVNEEKNEISDGSYIRFAQGEFYYRHQDFEAAIFKWEK VSNELAPWAQKNIADAYFELNQLSVAENVYTSITTDNKILMTEIRLQLLSLYIEQNNFDSAFAVIKEAVSLNPDYPNVTK IARSFYEEQQDFDSAVELAVNELIRIESYPWFEVLKGYIDKGFTKHISPDYFYDALVTLNNVDQVQFTQMVSSLWNSYRN EQNYLLWLNTINEFFLHIEIHSSDIWNKISSLYEETYFALIQGQYMLRQLHDIIPNLLTNWLKVVNPSYAAFPSAAVLAW DEIFPSKIDSANVKNAENLLSYSINHVNGLEYSLHLFESITDWAQKHNIEIGQRFRWLVDELADLRTNRILVTGTSGNGK TTFINSILGENILEKSISNVVVLKNDAHTEINAITDAAITTTEDISDYHNMMSQHHQTYRDRACVEFKLPCRFLNENKLT FVVTPGFNRNNDTRDEVFEYLNSVDELLFVLNADSPFTDKERDILLSIQEHTPNLQIHFLLNKIDNIYSEAEVKRVLQDT AARINTYFPQARIFPYSSLYTSSQQLTELTEFIHFNFNHKNIDAERTEKLLFFIRKTITYLLNKRVEKENNLVDAIKWNE DMIVKLNGSINNLTAFEREKIHFITQSYRTMKTEITNDLTQNIPKILQSCSDLMSEESDFGHMDKELNKAMNERVHKYLE QTVLPHLALSMQNWIATSHNELLQSQSYLEELSEGLNSLFGENRIQLECDFKVLDDWRRDADRMTTSIQMDEVNILRRFT PAQFLLKSAGKLFGVLPKNKIMLYNKYKQHVENEDYTEVTDSIMKKFFLQFELFENTQERDIHIFFRNPFNCLKQTVENM QLEIQEKQELLHKMKSNPEVYHDSIMLFELRLRQCEVILHIGDDYTYADVTLEASVE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 110045; Mature: 110045
Theoretical pI: Translated: 4.77; Mature: 4.77
Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYFQDIVGEKMRLEKQLIKKMYYETFLMENETKPTLDVLGQAYVNEEKNEISDGSYIRFA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEE QGEFYYRHQDFEAAIFKWEKVSNELAPWAQKNIADAYFELNQLSVAENVYTSITTDNKIL CCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEH MTEIRLQLLSLYIEQNNFDSAFAVIKEAVSLNPDYPNVTKIARSFYEEQQDFDSAVELAV HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NELIRIESYPWFEVLKGYIDKGFTKHISPDYFYDALVTLNNVDQVQFTQMVSSLWNSYRN HHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC EQNYLLWLNTINEFFLHIEIHSSDIWNKISSLYEETYFALIQGQYMLRQLHDIIPNLLTN CCCEEEEEECCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WLKVVNPSYAAFPSAAVLAWDEIFPSKIDSANVKNAENLLSYSINHVNGLEYSLHLFESI HHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH TDWAQKHNIEIGQRFRWLVDELADLRTNRILVTGTSGNGKTTFINSILGENILEKSISNV HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCE VVLKNDAHTEINAITDAAITTTEDISDYHNMMSQHHQTYRDRACVEFKLPCRFLNENKLT EEEECCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEECCCCCEE FVVTPGFNRNNDTRDEVFEYLNSVDELLFVLNADSPFTDKERDILLSIQEHTPNLQIHFL EEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEH LNKIDNIYSEAEVKRVLQDTAARINTYFPQARIFPYSSLYTSSQQLTELTEFIHFNFNHK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC NIDAERTEKLLFFIRKTITYLLNKRVEKENNLVDAIKWNEDMIVKLNGSINNLTAFEREK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHH IHFITQSYRTMKTEITNDLTQNIPKILQSCSDLMSEESDFGHMDKELNKAMNERVHKYLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QTVLPHLALSMQNWIATSHNELLQSQSYLEELSEGLNSLFGENRIQLECDFKVLDDWRRD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHH ADRMTTSIQMDEVNILRRFTPAQFLLKSAGKLFGVLPKNKIMLYNKYKQHVENEDYTEVT HHHHHHHEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHEECCCCCEEEEEEHHHHHCCCCCHHHHH DSIMKKFFLQFELFENTQERDIHIFFRNPFNCLKQTVENMQLEIQEKQELLHKMKSNPEV HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH YHDSIMLFELRLRQCEVILHIGDDYTYADVTLEASVE HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEEEEEEEECCC >Mature Secondary Structure MYFQDIVGEKMRLEKQLIKKMYYETFLMENETKPTLDVLGQAYVNEEKNEISDGSYIRFA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEE QGEFYYRHQDFEAAIFKWEKVSNELAPWAQKNIADAYFELNQLSVAENVYTSITTDNKIL CCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEH MTEIRLQLLSLYIEQNNFDSAFAVIKEAVSLNPDYPNVTKIARSFYEEQQDFDSAVELAV HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NELIRIESYPWFEVLKGYIDKGFTKHISPDYFYDALVTLNNVDQVQFTQMVSSLWNSYRN HHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC EQNYLLWLNTINEFFLHIEIHSSDIWNKISSLYEETYFALIQGQYMLRQLHDIIPNLLTN CCCEEEEEECCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WLKVVNPSYAAFPSAAVLAWDEIFPSKIDSANVKNAENLLSYSINHVNGLEYSLHLFESI HHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH TDWAQKHNIEIGQRFRWLVDELADLRTNRILVTGTSGNGKTTFINSILGENILEKSISNV HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCE VVLKNDAHTEINAITDAAITTTEDISDYHNMMSQHHQTYRDRACVEFKLPCRFLNENKLT EEEECCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEECCCCCEE FVVTPGFNRNNDTRDEVFEYLNSVDELLFVLNADSPFTDKERDILLSIQEHTPNLQIHFL EEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEH LNKIDNIYSEAEVKRVLQDTAARINTYFPQARIFPYSSLYTSSQQLTELTEFIHFNFNHK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC NIDAERTEKLLFFIRKTITYLLNKRVEKENNLVDAIKWNEDMIVKLNGSINNLTAFEREK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHH IHFITQSYRTMKTEITNDLTQNIPKILQSCSDLMSEESDFGHMDKELNKAMNERVHKYLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QTVLPHLALSMQNWIATSHNELLQSQSYLEELSEGLNSLFGENRIQLECDFKVLDDWRRD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHH ADRMTTSIQMDEVNILRRFTPAQFLLKSAGKLFGVLPKNKIMLYNKYKQHVENEDYTEVT HHHHHHHEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHEECCCCCEEEEEEHHHHHCCCCCHHHHH DSIMKKFFLQFELFENTQERDIHIFFRNPFNCLKQTVENMQLEIQEKQELLHKMKSNPEV HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH YHDSIMLFELRLRQCEVILHIGDDYTYADVTLEASVE HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEEEEEEEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA